Análises comparativas in silico de possíveis funções moonlighting da enzima glicolítica enolase em interatomas de quatro espécies

• Autor(a) principal: Paludo, Gabriela Prado
• Data de Publicação: 2014
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/255439
• topic: Echinococcus granulosus; Fosfopiruvato hidratase

Enzimas glicolíticas, como a enolase, têm sido descritas como proteínas multifuncionais complexas, podendo desempenhar funções não glicolíticas, ditas moonlighting. Porém, pouco se sabe sobre estas funções, especialmente em parasitos. Em Echinococcus granulosus, o agente causador da hidatidose cística, uma isoforma da enolase (EgEno1) está entre as proteínas intracelulares detectadas nos produtos de excreção/secreção e entre componentes de interface parasito-hospedeiro. Estas localizações ectópicas são indicativas de que a EgEno1 poderia estar desempenhando funções moonlighting, tornando esta proteína um atraente alvo para estudos. Em Homo sapiens, a enolase α é a isoforma predominantemente expressa em todo o organismo e é a ortóloga da EgEno1. Além de sua atividade catalítica clássica, a enolase α tem sido descrita em outros processos funcionais como modulação imunológica e na sensibilidade de células tumorais à drogas. Embora a multifuncionalidade da enolase seja cada vez mais evidente, ainda não está claro se estas funções são evolutivamente conservadas ou não, sendo esse o alvo deste estudo. Uma das estratégias que tem sido utilizada para investigar funções moonlighting é o uso de ferramentas de biologia de sistemas, as quais permitem a predição de funções/interações de proteínas através do estudo de redes biológicas. Assim, redes de interação proteína-proteína (PPI) foram projetadas com a ferramenta STRING para H. sapiens, Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans e Saccharomyces cerevisiae. As análises das redes foram realizadas no software Cytoscape (versão 2.8.2) através dos plug-ins: AllegroMCODE, para análises de modularidade; CentiScaPe, para análises de centralidade; e BiNGO, para o enriquecimento funcional. As proteínas de interação com a enolase, comuns a todas as redes projetadas, foram identificadas e classificadas funcionalmente conforme os termos do banco de dados Gene Ontology usando a ferramenta Blast2GO. Anotações do Eukaryotic Orthologous Groups (KOG) foram também atribuídas às proteínas identificadas com base em buscas por similaridade. Adicionalmente, dados de proteínas de interação com a EgEno1 em E. granulosus foram comparados aos dados das redes de PPI. Foram identificadas 14 proteínas de interação com a EgEno1 em E. granulosus, das quais apenas duas preditas nas redes de PPI. As demais, sem predição in silico, sugerem funções moonlighting específicas da EgEno1 que podem estar associadas a interações parasito-hospedeiro.