História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Real, Lucas Pascual
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/150594
Resumo: A fragata comum Fregata magnificens é uma ave marinha distribuída principalmente ao longo da costa Pacífica e Atlântica das Américas. Um estudo anterior usando dados genéticos demonstrou que as populações Brasileiras e Caribenhas estão isoladas, representando “linhagens” independentes, e que a população Brasileira tem uma diversidade genética e tamanho populacional efetivo menor comparado às populações pertencentes à linhagem do Caribe. Entretanto, diversos detalhes sobre a história demográfica da linhagem Brasileira permanecem elusivos. Nesse estudo, utilizamos um conjunto de marcadores microssatélites previamente publicados para compreender melhor a história demográfica das populações Brasileiras de Fregata magnificens. Mais especificamente, pergunta-se quando a redução de tamanho populacional teria ocorrido, e se há evidência de efeitos gargalo-de-garrafa recentes nas colônias reprodutivas do Brasil. A análise de computação Bayesiana aproximada mostrou que a divergência entre as linhagens Brasileira e Caribenha é recente (menor do que 18.000 anos atrás), e que a redução no tamanho populacional da linhagem Brasileira data desse momento. Ainda, não foram encontradas evidências de reduções mais recentes no tamanho das populações Brasileiras. Portanto, as diferenças na diversidade genética entre essas populações devem ser devidas à uma população efetiva relativamente pequena (de aproximadamente 450 indivíduos) que colonizou o Brasil, levando a população a um maior endocruzamento. A população Brasileira de Fregata magnificens pode requerer uma atenção especial do ponto de vista conservacionista para manter sua diversidade genética e garantir a preservação da espécie.
id UFRGS-2_d70ec32d6a924a22e8a1233ad8a30ee0
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/150594
network_acronym_str UFRGS-2
network_name_str Repositório Institucional da UFRGS
repository_id_str
spelling Real, Lucas PascualFagundes, Nelson Jurandi Rosa2017-01-12T02:18:56Z2016http://hdl.handle.net/10183/150594001006258A fragata comum Fregata magnificens é uma ave marinha distribuída principalmente ao longo da costa Pacífica e Atlântica das Américas. Um estudo anterior usando dados genéticos demonstrou que as populações Brasileiras e Caribenhas estão isoladas, representando “linhagens” independentes, e que a população Brasileira tem uma diversidade genética e tamanho populacional efetivo menor comparado às populações pertencentes à linhagem do Caribe. Entretanto, diversos detalhes sobre a história demográfica da linhagem Brasileira permanecem elusivos. Nesse estudo, utilizamos um conjunto de marcadores microssatélites previamente publicados para compreender melhor a história demográfica das populações Brasileiras de Fregata magnificens. Mais especificamente, pergunta-se quando a redução de tamanho populacional teria ocorrido, e se há evidência de efeitos gargalo-de-garrafa recentes nas colônias reprodutivas do Brasil. A análise de computação Bayesiana aproximada mostrou que a divergência entre as linhagens Brasileira e Caribenha é recente (menor do que 18.000 anos atrás), e que a redução no tamanho populacional da linhagem Brasileira data desse momento. Ainda, não foram encontradas evidências de reduções mais recentes no tamanho das populações Brasileiras. Portanto, as diferenças na diversidade genética entre essas populações devem ser devidas à uma população efetiva relativamente pequena (de aproximadamente 450 indivíduos) que colonizou o Brasil, levando a população a um maior endocruzamento. A população Brasileira de Fregata magnificens pode requerer uma atenção especial do ponto de vista conservacionista para manter sua diversidade genética e garantir a preservação da espécie.The magnificent frigatebird Fregata magnificens is a seabird mainly distributed off the Pacific and Atlantic coast of America. A previous study using genetic data showed that Brazilian and Caribbean populations are isolated, representing independent “lineages”, and that the Brazilian population have lower genetic diversity and effective population size compared to populations belonging to the Caribbean lineage. However, several details of the demographic history of the Brazilian lineage remain elusive. In this study, we used a previously published set of microsatellite markers to gain insight on the demographic history of Brazilian populations of Fregata magnificens. More specifically, we ask when population size reduction occurred and if there is evidence of recent population bottlenecks in breeding colonies off Brazil. Approximate Bayesian Computation analysis found that the divergence between Brazilian and Caribbean lineages was recent (less than 18,000 years ago), and that population size reduction in the Brazilian lineage dates back to this moment. Moreover, we found no evidence of further population size reductions in the Brazilian populations. Therefore, differences in genetic diversity may be due to a relatively small effective population size that colonized Brazil (around 450 individuals), leading the population to higher inbreeding. The Brazilian population of Fregata magnificens may require special attention from the conservation point of view in order to maintain its genetic diversity and ensure the preservation of this species.application/pdfengFregata magnificensHistória demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximadainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de BiociênciasPorto Alegre, BR-RS2016Ciências Biológicas: Bachareladograduaçãoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL001006258.pdf001006258.pdfTexto completo (inglês)application/pdf450031http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/150594/1/001006258.pdf62cebcdd7bc107f2882a8ce455637b6dMD51TEXT001006258.pdf.txt001006258.pdf.txtExtracted Texttext/plain34907http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/150594/2/001006258.pdf.txt52aed9b46c62b4a492ddda5cce9bc836MD52THUMBNAIL001006258.pdf.jpg001006258.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1142http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/150594/3/001006258.pdf.jpg34f6ac7e747040c37309393ccdd35510MD5310183/1505942021-05-07 04:34:14.594909oai:www.lume.ufrgs.br:10183/150594Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2021-05-07T07:34:14Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada
title História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada
spellingShingle História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada
Real, Lucas Pascual
Fregata magnificens
title_short História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada
title_full História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada
title_fullStr História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada
title_full_unstemmed História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada
title_sort História demográfica das populações de fragata-comum (Fregata magnificens) da costa do Brasil : uma abordagem usando marcadores genéticos microssatélites e computação Bayesiana aproximada
author Real, Lucas Pascual
author_facet Real, Lucas Pascual
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Real, Lucas Pascual
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Fagundes, Nelson Jurandi Rosa
contributor_str_mv Fagundes, Nelson Jurandi Rosa
dc.subject.por.fl_str_mv Fregata magnificens
topic Fregata magnificens
description A fragata comum Fregata magnificens é uma ave marinha distribuída principalmente ao longo da costa Pacífica e Atlântica das Américas. Um estudo anterior usando dados genéticos demonstrou que as populações Brasileiras e Caribenhas estão isoladas, representando “linhagens” independentes, e que a população Brasileira tem uma diversidade genética e tamanho populacional efetivo menor comparado às populações pertencentes à linhagem do Caribe. Entretanto, diversos detalhes sobre a história demográfica da linhagem Brasileira permanecem elusivos. Nesse estudo, utilizamos um conjunto de marcadores microssatélites previamente publicados para compreender melhor a história demográfica das populações Brasileiras de Fregata magnificens. Mais especificamente, pergunta-se quando a redução de tamanho populacional teria ocorrido, e se há evidência de efeitos gargalo-de-garrafa recentes nas colônias reprodutivas do Brasil. A análise de computação Bayesiana aproximada mostrou que a divergência entre as linhagens Brasileira e Caribenha é recente (menor do que 18.000 anos atrás), e que a redução no tamanho populacional da linhagem Brasileira data desse momento. Ainda, não foram encontradas evidências de reduções mais recentes no tamanho das populações Brasileiras. Portanto, as diferenças na diversidade genética entre essas populações devem ser devidas à uma população efetiva relativamente pequena (de aproximadamente 450 indivíduos) que colonizou o Brasil, levando a população a um maior endocruzamento. A população Brasileira de Fregata magnificens pode requerer uma atenção especial do ponto de vista conservacionista para manter sua diversidade genética e garantir a preservação da espécie.
publishDate 2016
dc.date.issued.fl_str_mv 2016
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2017-01-12T02:18:56Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/150594
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 001006258
url http://hdl.handle.net/10183/150594
identifier_str_mv 001006258
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Repositório Institucional da UFRGS
collection Repositório Institucional da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/150594/1/001006258.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/150594/2/001006258.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/150594/3/001006258.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 62cebcdd7bc107f2882a8ce455637b6d
52aed9b46c62b4a492ddda5cce9bc836
34f6ac7e747040c37309393ccdd35510
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1815447185185046528