Determinação do limite mínimo de detecção da técnica de Nested-PCR para os poliomavírus JC e BK

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Vieira, Aline dos Santos
Data de Publicação: 2014
Outros Autores: Machado, Alice Beatriz Mombach Pinheiro, Coitinho, Adriana Simon, Paris, Fernanda de
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/158323
Resumo: Introdução: Os poliomavírus (JCV e BKV) causam infecções principalmente em adultos imunocomprometidos. Um diagnóstico sensível e específico é de fundamental importância para os pacientes portadores de JCV e BKV. Atualmente alguns laboratórios têm utilizado a técnica de PCR para a detecção do material genético destes vírus em amostras clínicas. Assim, o objetivo deste estudo é determinar o limite mínimo de detecção da técnica de nested-PCR para os poliomavírus JC e BK. Métodos: Diluições seriadas (100 cópias/mL; 50 cópias/mL; 25 cópias/mL; 10 cópias/mL; 5 cópias/mL e 1 cópia/mL) de controles positivos comerciais de JCV e BKV com concentrações conhecidas foram submetidas à técnica de nested-PCR semi-duplex. Todas as diluições foram testadas 11 vezes para determinação do limite mínimo de detecção. Resultados: O limite mínimo de detecção da reação de nested-PCR para os vírus JC e BK foi de 25 cópias/mL para ambos, com 100% de positividade das diluições testadas na reação de PCR. Ainda, pudemos observar que resultados positivos fracos foram obtidos nas diluições de 1, 5 e 10 cópias/mL em algumas das repetições realizadas. As diluições de 25, 50 e 100 cópias/mL sempre obtiveram resultado francamente positivo. Conclusões: Estes valores são semelhantes aos relatados em outros estudos, contribuindo para a indicação desta reação de PCR para potenciais fins diagnósticos.
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spelling Vieira, Aline dos SantosMachado, Alice Beatriz Mombach PinheiroCoitinho, Adriana SimonParis, Fernanda de2017-05-23T02:26:26Z20142357-9730http://hdl.handle.net/10183/158323000946550Introdução: Os poliomavírus (JCV e BKV) causam infecções principalmente em adultos imunocomprometidos. Um diagnóstico sensível e específico é de fundamental importância para os pacientes portadores de JCV e BKV. Atualmente alguns laboratórios têm utilizado a técnica de PCR para a detecção do material genético destes vírus em amostras clínicas. Assim, o objetivo deste estudo é determinar o limite mínimo de detecção da técnica de nested-PCR para os poliomavírus JC e BK. Métodos: Diluições seriadas (100 cópias/mL; 50 cópias/mL; 25 cópias/mL; 10 cópias/mL; 5 cópias/mL e 1 cópia/mL) de controles positivos comerciais de JCV e BKV com concentrações conhecidas foram submetidas à técnica de nested-PCR semi-duplex. Todas as diluições foram testadas 11 vezes para determinação do limite mínimo de detecção. Resultados: O limite mínimo de detecção da reação de nested-PCR para os vírus JC e BK foi de 25 cópias/mL para ambos, com 100% de positividade das diluições testadas na reação de PCR. Ainda, pudemos observar que resultados positivos fracos foram obtidos nas diluições de 1, 5 e 10 cópias/mL em algumas das repetições realizadas. As diluições de 25, 50 e 100 cópias/mL sempre obtiveram resultado francamente positivo. Conclusões: Estes valores são semelhantes aos relatados em outros estudos, contribuindo para a indicação desta reação de PCR para potenciais fins diagnósticos.Introduction: Polyomaviruses (BKV and JCV) cause infection mainly in immunocompromised adults. A sensitive and specific diagnosis tool is fundamental to demonstrate the BKV and JCV infections. Nowadays many laboratories are using a PCR technique for detecting polyomaviruses genome in clinical samples. In this context, the purpose of this study is to determine the threshold of detection of the nested-PCR for polyomaviruses JC and BK. Methods: Serial dilutions of the samples of BKV and JCV of known concentration (100 copies/mL, 50 copies/mL, 25 copies/mL, 10 copies/mL, 5 copies/mL, and 1 copy/ml) were subjected to the technique of nested-PCR. All dilutions were tested 11 times to determine the minimum detection limit. Results: The minimum detection limit of the nested-PCR for JC and BK viruses was 25 copies/mL. This dilution (25 copies/mL) showed 100% PCR positive reaction. Furthermore, we found that weak positive results were obtained at dilutions of 1,5 and 10 copies/mL in some repetitions. Dilutions of 25, 50, and 100 copies/mL always had very positive results. Conclusions: These values are similar to those reported in other studies, contributing to the indication of this PCR for potential diagnostic purposes.application/pdfporClinical and biomedical research. Porto Alegre. Vol. 34, n. 3 (jul./set. 2014), p. 260-265PolyomavirusVírus JCReação em cadeia da polimeraseLimite de detecçãoVirosesJCVBKVNested-PCRMinimum detection limitDeterminação do limite mínimo de detecção da técnica de Nested-PCR para os poliomavírus JC e BKAssessment of minimum detection limit of Nested-PCR for JC and BK polyomaviruses info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/otherinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL000946550.pdf000946550.pdfTexto completoapplication/pdf751575http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/158323/1/000946550.pdfc7f610d4cab56a3643af66f944a47d16MD51TEXT000946550.pdf.txt000946550.pdf.txtExtracted Texttext/plain24180http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/158323/2/000946550.pdf.txt309cc4bd59f4c1f27178622ad2492e78MD52THUMBNAIL000946550.pdf.jpg000946550.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1858http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/158323/3/000946550.pdf.jpg12c6a8f7fee8159acedc8a27ea413153MD5310183/1583232019-01-11 04:08:07.958499oai:www.lume.ufrgs.br:10183/158323Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2019-01-11T06:08:07Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
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