Dissecção virtual e morfometria do girino Thoropa miliaris usando o algoritmo de recuperação de fase em imagens 3D obtidas com luz síncrotron

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Gabriel Fidalgo Queiróz da
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRJ
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11422/13326
Resumo: O uso de anfíbios como modelos experimentais tem grande aplicação na Biologia. Estudos da história natural de anfíbios identificaram claramente atributos que os tornam adequados para manipulações experimentais, mostrando resultados sobre sua diversidade e dados sobre sistemas ecológicos como um todo. A utilização de girinos em pesquisas científicas possui certa importância, que ocorre devido ao fato de, aproximadamente, 75% das espécies anfíbias catalogadas possuírem esse estágio larval de maneira análoga entre si. O objetivo deste trabalho foi apresentar a primeira investigação não invasiva e de alta resolução da morfometria de girinos da espécie anfíbia brasileira Thoropa miliaris, usando microtomografia com luz síncrotron, onde foi criado um protocolo para aquisição de imagens dessas amostras em meio líquido. Foram utilizadas as linhas IMX, no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, e SYRMEP, no síncrotron Elettra, ambas por possuírem características notáveis para aplicações biomédicas. Para a melhor visualização das estruturas internas do animal, foi utilizada a técnica de contraste de fase em linha e um algoritmo de recuperação de fase foi empregado em conjunto com o algoritmo de reconstrução por retroprojeção filtrada. O uso dessas técnicas de imageamento e reconstrução possibilitou o acesso a informações sobre a morfologia e desenvolvimento das estruturas internas do Thoropa miliaris, fornecendo dados referentes ao seu desenvolvimento, a partir da observação desses tecidos.
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O objetivo deste trabalho foi apresentar a primeira investigação não invasiva e de alta resolução da morfometria de girinos da espécie anfíbia brasileira Thoropa miliaris, usando microtomografia com luz síncrotron, onde foi criado um protocolo para aquisição de imagens dessas amostras em meio líquido. Foram utilizadas as linhas IMX, no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron, e SYRMEP, no síncrotron Elettra, ambas por possuírem características notáveis para aplicações biomédicas. Para a melhor visualização das estruturas internas do animal, foi utilizada a técnica de contraste de fase em linha e um algoritmo de recuperação de fase foi empregado em conjunto com o algoritmo de reconstrução por retroprojeção filtrada. O uso dessas técnicas de imageamento e reconstrução possibilitou o acesso a informações sobre a morfologia e desenvolvimento das estruturas internas do Thoropa miliaris, fornecendo dados referentes ao seu desenvolvimento, a partir da observação desses tecidos.The use of amphibians as experimental models has great application in Biology. Studies of the natural history of amphibians have clearly identified attributes that make them suitable for experimental manipulations, showing results on their diversity and data on ecological systems. The use of tadpoles in scientific research is very important because approximately 75% of the cataloged amphibian species have this larval stage in an analogous way. The objective of this work was to present the first non-invasive and highresolution morphometric analysis of tadpoles of the Brazilian amphibian Thoropa miliaris, using synchrotron microtomography, where a protocol was created to acquire images of these samples in a liquid solution. It was used the IMX beamline, in the Brazilian Synchrotron Light Laboratory, and SYRMEP beamline, in the Elettra Synchrotron (Italy), both of which have remarkable characteristics for biomedical applications. In order to better visualize the internal structures of the animal, the in-line phase-contrast technique was used, where the phase-retrieval algorithm was used together with the filtered backprojection reconstruction algorithm. The use of these imaging and reconstruction techniques allowed access to information on the morphology and development of the internal structures of Thoropa miliaris, providing data regarding their development, from the observation of these tissues.Submitted by Moreno Barros (moreno@ct.ufrj.br) on 2020-10-23T21:54:38Z No. of bitstreams: 1 GabrielFidalgoQueirozDaSilva.pdf: 5011866 bytes, checksum: 6f861335ffc6cbfb39a754b6daa4f3d0 (MD5)Made available in DSpace on 2020-10-23T21:54:38Z (GMT). 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