Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Souza, Catherine Rodrigues Siqueira de
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRJ
Texto Completo: http://hdl.handle.net/11422/18622
Resumo: Introdução: Os complexos de paládio (Pd) passaram a ser vistos como uma alternativa para o tratamento do câncer devido aos diversos efeitos adversos da cisplatina. Contrariando as expectativas iniciais, os complexos de Pd apresentam-se como compostos promissores, visto que apresentam menos efeitos adversos e desempenham atividade antitumoral significativa. Os métodos in silico podem ser empregados no planejamento de fármacos, visando minimizar custos e tornar o processo menos demorado. Os cálculos computacionais permitem a obtenção de propriedades físico-químicas que fornecem informações referentes a estrutura analisada e, consequentemente, sobre sua atividade, otimizando o processo de busca por novos fármacos e auxiliando os procedimentos experimentais indicando moléculas promissoras. Objetivo: O trabalho visa o estudo computacional de complexos de Pd(II) com atividade antitumoral, envolvendo análise de propriedades físico-químicas, e suas relações com a atividade. Metodologia: Inicialmente, um protocolo computacional para a previsão da energia livre de Gibbs de ativação (ΔG a ) para a reação de aquação do complexo [Pd(dien)Cl] + foi construído utilizando o programa ORCA 4.1.2. Um conjunto de 29 protocolos computacionais foram testados, considerando o nível DFT B3LYP, 14 funções de base para o Pd (PDBS), 4 funções de base para os ligantes (LBS), os efeitos do solvente através da aproximação implícita CPCM e relativísticos por meio do método DKH2. Posteriormente, um protocolo computacional foi selecionado para o estudo de propriedades tais como logaritmo do coeficiente de partição (log P), ε HOMO , ε LUMO , Δε (gap de energia) etc. visando a correlação com a atividade biológica (CC 50 ) de um conjunto de sete compostos de Pd(II) contra a linhagem celular K562, utilizando o programa GAUSSIAN 16 Rev. C.01. Resultados e Discussão: Os resultados mostraram que a inclusão dos efeitos do solvente na previsão de ∆ é de fundamental importância. No geral, os desvios relativos (DR) em relação ao valor experimental de ∆ variaram entre 1,4% e 25,9%, com o protocolo B3LYP/Paschoal-DZP/def2-SVP/CPCM, que apresentou um DR de 1,6% e um menor custo computacional, sendo selecionado para o estudo das propriedades dos demais compostos de Pd(II). Em relação as propriedades físico-químicas, observou-se que, de maneira geral, grupos mais lipofílicos auxiliam na atividade citotóxica. O log P apresentou uma fraca correlação com CC 50 (R 2 = 0,3788), enquanto os parâmetros eletrônicos apresentaram uma forte correlação com CC 50 , apresentando R 2 igual a 0,9912 (ε HOMO ), 0,9700 (ε LUMO ) e 0,9852 (Δε). Conclusão: O presente trabalho mostrou que a inclusão do efeito do solvente e uma boa relação PDBS/LBS é essencial para a correta descrição dos complexos de Pd(II), com protocolo B3LYP/Paschoal/DZP/def2-SVP/CPCM sendo uma excelente alternativa para o estudo de compostos de Pd(II). Além disso, a avaliação das propriedades físico-químicas mostra um forte indicativo de correlação com a atividade biológica, no entanto, para maiores confirmações faz-se necessário um estudo considerando um maior número de complexos.
id UFRJ_d18f9cce5def5f5f391beb57fda520ce
oai_identifier_str oai:pantheon.ufrj.br:11422/18622
network_acronym_str UFRJ
network_name_str Repositório Institucional da UFRJ
repository_id_str
spelling Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoralCâncerTeoria do funcional de densidade (DFT)Propriedades físico-químicasDensity functional theoryPhysico-chemical propertiesCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIAIntrodução: Os complexos de paládio (Pd) passaram a ser vistos como uma alternativa para o tratamento do câncer devido aos diversos efeitos adversos da cisplatina. Contrariando as expectativas iniciais, os complexos de Pd apresentam-se como compostos promissores, visto que apresentam menos efeitos adversos e desempenham atividade antitumoral significativa. Os métodos in silico podem ser empregados no planejamento de fármacos, visando minimizar custos e tornar o processo menos demorado. Os cálculos computacionais permitem a obtenção de propriedades físico-químicas que fornecem informações referentes a estrutura analisada e, consequentemente, sobre sua atividade, otimizando o processo de busca por novos fármacos e auxiliando os procedimentos experimentais indicando moléculas promissoras. Objetivo: O trabalho visa o estudo computacional de complexos de Pd(II) com atividade antitumoral, envolvendo análise de propriedades físico-químicas, e suas relações com a atividade. Metodologia: Inicialmente, um protocolo computacional para a previsão da energia livre de Gibbs de ativação (ΔG a ) para a reação de aquação do complexo [Pd(dien)Cl] + foi construído utilizando o programa ORCA 4.1.2. Um conjunto de 29 protocolos computacionais foram testados, considerando o nível DFT B3LYP, 14 funções de base para o Pd (PDBS), 4 funções de base para os ligantes (LBS), os efeitos do solvente através da aproximação implícita CPCM e relativísticos por meio do método DKH2. Posteriormente, um protocolo computacional foi selecionado para o estudo de propriedades tais como logaritmo do coeficiente de partição (log P), ε HOMO , ε LUMO , Δε (gap de energia) etc. visando a correlação com a atividade biológica (CC 50 ) de um conjunto de sete compostos de Pd(II) contra a linhagem celular K562, utilizando o programa GAUSSIAN 16 Rev. C.01. Resultados e Discussão: Os resultados mostraram que a inclusão dos efeitos do solvente na previsão de ∆ é de fundamental importância. No geral, os desvios relativos (DR) em relação ao valor experimental de ∆ variaram entre 1,4% e 25,9%, com o protocolo B3LYP/Paschoal-DZP/def2-SVP/CPCM, que apresentou um DR de 1,6% e um menor custo computacional, sendo selecionado para o estudo das propriedades dos demais compostos de Pd(II). Em relação as propriedades físico-químicas, observou-se que, de maneira geral, grupos mais lipofílicos auxiliam na atividade citotóxica. O log P apresentou uma fraca correlação com CC 50 (R 2 = 0,3788), enquanto os parâmetros eletrônicos apresentaram uma forte correlação com CC 50 , apresentando R 2 igual a 0,9912 (ε HOMO ), 0,9700 (ε LUMO ) e 0,9852 (Δε). Conclusão: O presente trabalho mostrou que a inclusão do efeito do solvente e uma boa relação PDBS/LBS é essencial para a correta descrição dos complexos de Pd(II), com protocolo B3LYP/Paschoal/DZP/def2-SVP/CPCM sendo uma excelente alternativa para o estudo de compostos de Pd(II). Além disso, a avaliação das propriedades físico-químicas mostra um forte indicativo de correlação com a atividade biológica, no entanto, para maiores confirmações faz-se necessário um estudo considerando um maior número de complexos.Universidade Federal do Rio de JaneiroBrasilInstituto de Ciências FarmacêuticasUFRJPaschoal, Diego Fernando da Silvahttp://lattes.cnpq.br/281434889710369512420569717http://lattes.cnpq.br/4719820493553147Barth, Thiagohttp://lattes.cnpq.br/2954810429809063Novato, Willian Tássio Gomeshttp://lattes.cnpq.br/7402297829650438Souza, Catherine Rodrigues Siqueira de2022-09-14T16:47:04Z2023-12-21T03:01:05Z2022-08-04info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisSOUZA, Catherine Rodrigues Siqueira de. Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral. 2022. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Farmácia) - Instituto de Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Macaé, 2022.http://hdl.handle.net/11422/18622porinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJ2023-12-21T03:01:05Zoai:pantheon.ufrj.br:11422/18622Repositório InstitucionalPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestpantheon@sibi.ufrj.bropendoar:2023-12-21T03:01:05Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false
dc.title.none.fl_str_mv Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
title Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
spellingShingle Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
Souza, Catherine Rodrigues Siqueira de
Câncer
Teoria do funcional de densidade (DFT)
Propriedades físico-químicas
Density functional theory
Physico-chemical properties
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
title_short Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
title_full Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
title_fullStr Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
title_full_unstemmed Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
title_sort Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
author Souza, Catherine Rodrigues Siqueira de
author_facet Souza, Catherine Rodrigues Siqueira de
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Paschoal, Diego Fernando da Silva
http://lattes.cnpq.br/2814348897103695
12420569717
http://lattes.cnpq.br/4719820493553147
Barth, Thiago
http://lattes.cnpq.br/2954810429809063
Novato, Willian Tássio Gomes
http://lattes.cnpq.br/7402297829650438
dc.contributor.author.fl_str_mv Souza, Catherine Rodrigues Siqueira de
dc.subject.por.fl_str_mv Câncer
Teoria do funcional de densidade (DFT)
Propriedades físico-químicas
Density functional theory
Physico-chemical properties
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
topic Câncer
Teoria do funcional de densidade (DFT)
Propriedades físico-químicas
Density functional theory
Physico-chemical properties
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIA
description Introdução: Os complexos de paládio (Pd) passaram a ser vistos como uma alternativa para o tratamento do câncer devido aos diversos efeitos adversos da cisplatina. Contrariando as expectativas iniciais, os complexos de Pd apresentam-se como compostos promissores, visto que apresentam menos efeitos adversos e desempenham atividade antitumoral significativa. Os métodos in silico podem ser empregados no planejamento de fármacos, visando minimizar custos e tornar o processo menos demorado. Os cálculos computacionais permitem a obtenção de propriedades físico-químicas que fornecem informações referentes a estrutura analisada e, consequentemente, sobre sua atividade, otimizando o processo de busca por novos fármacos e auxiliando os procedimentos experimentais indicando moléculas promissoras. Objetivo: O trabalho visa o estudo computacional de complexos de Pd(II) com atividade antitumoral, envolvendo análise de propriedades físico-químicas, e suas relações com a atividade. Metodologia: Inicialmente, um protocolo computacional para a previsão da energia livre de Gibbs de ativação (ΔG a ) para a reação de aquação do complexo [Pd(dien)Cl] + foi construído utilizando o programa ORCA 4.1.2. Um conjunto de 29 protocolos computacionais foram testados, considerando o nível DFT B3LYP, 14 funções de base para o Pd (PDBS), 4 funções de base para os ligantes (LBS), os efeitos do solvente através da aproximação implícita CPCM e relativísticos por meio do método DKH2. Posteriormente, um protocolo computacional foi selecionado para o estudo de propriedades tais como logaritmo do coeficiente de partição (log P), ε HOMO , ε LUMO , Δε (gap de energia) etc. visando a correlação com a atividade biológica (CC 50 ) de um conjunto de sete compostos de Pd(II) contra a linhagem celular K562, utilizando o programa GAUSSIAN 16 Rev. C.01. Resultados e Discussão: Os resultados mostraram que a inclusão dos efeitos do solvente na previsão de ∆ é de fundamental importância. No geral, os desvios relativos (DR) em relação ao valor experimental de ∆ variaram entre 1,4% e 25,9%, com o protocolo B3LYP/Paschoal-DZP/def2-SVP/CPCM, que apresentou um DR de 1,6% e um menor custo computacional, sendo selecionado para o estudo das propriedades dos demais compostos de Pd(II). Em relação as propriedades físico-químicas, observou-se que, de maneira geral, grupos mais lipofílicos auxiliam na atividade citotóxica. O log P apresentou uma fraca correlação com CC 50 (R 2 = 0,3788), enquanto os parâmetros eletrônicos apresentaram uma forte correlação com CC 50 , apresentando R 2 igual a 0,9912 (ε HOMO ), 0,9700 (ε LUMO ) e 0,9852 (Δε). Conclusão: O presente trabalho mostrou que a inclusão do efeito do solvente e uma boa relação PDBS/LBS é essencial para a correta descrição dos complexos de Pd(II), com protocolo B3LYP/Paschoal/DZP/def2-SVP/CPCM sendo uma excelente alternativa para o estudo de compostos de Pd(II). Além disso, a avaliação das propriedades físico-químicas mostra um forte indicativo de correlação com a atividade biológica, no entanto, para maiores confirmações faz-se necessário um estudo considerando um maior número de complexos.
publishDate 2022
dc.date.none.fl_str_mv 2022-09-14T16:47:04Z
2022-08-04
2023-12-21T03:01:05Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv SOUZA, Catherine Rodrigues Siqueira de. Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral. 2022. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Farmácia) - Instituto de Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Macaé, 2022.
http://hdl.handle.net/11422/18622
identifier_str_mv SOUZA, Catherine Rodrigues Siqueira de. Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral. 2022. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Farmácia) - Instituto de Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Macaé, 2022.
url http://hdl.handle.net/11422/18622
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
eu_rights_str_mv embargoedAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio de Janeiro
Brasil
Instituto de Ciências Farmacêuticas
UFRJ
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio de Janeiro
Brasil
Instituto de Ciências Farmacêuticas
UFRJ
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRJ
instname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
instacron:UFRJ
instname_str Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
instacron_str UFRJ
institution UFRJ
reponame_str Repositório Institucional da UFRJ
collection Repositório Institucional da UFRJ
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
repository.mail.fl_str_mv pantheon@sibi.ufrj.br
_version_ 1815456035410804736