Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRJ |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11422/18622 |
Resumo: | Introdução: Os complexos de paládio (Pd) passaram a ser vistos como uma alternativa para o tratamento do câncer devido aos diversos efeitos adversos da cisplatina. Contrariando as expectativas iniciais, os complexos de Pd apresentam-se como compostos promissores, visto que apresentam menos efeitos adversos e desempenham atividade antitumoral significativa. Os métodos in silico podem ser empregados no planejamento de fármacos, visando minimizar custos e tornar o processo menos demorado. Os cálculos computacionais permitem a obtenção de propriedades físico-químicas que fornecem informações referentes a estrutura analisada e, consequentemente, sobre sua atividade, otimizando o processo de busca por novos fármacos e auxiliando os procedimentos experimentais indicando moléculas promissoras. Objetivo: O trabalho visa o estudo computacional de complexos de Pd(II) com atividade antitumoral, envolvendo análise de propriedades físico-químicas, e suas relações com a atividade. Metodologia: Inicialmente, um protocolo computacional para a previsão da energia livre de Gibbs de ativação (ΔG a ) para a reação de aquação do complexo [Pd(dien)Cl] + foi construído utilizando o programa ORCA 4.1.2. Um conjunto de 29 protocolos computacionais foram testados, considerando o nível DFT B3LYP, 14 funções de base para o Pd (PDBS), 4 funções de base para os ligantes (LBS), os efeitos do solvente através da aproximação implícita CPCM e relativísticos por meio do método DKH2. Posteriormente, um protocolo computacional foi selecionado para o estudo de propriedades tais como logaritmo do coeficiente de partição (log P), ε HOMO , ε LUMO , Δε (gap de energia) etc. visando a correlação com a atividade biológica (CC 50 ) de um conjunto de sete compostos de Pd(II) contra a linhagem celular K562, utilizando o programa GAUSSIAN 16 Rev. C.01. Resultados e Discussão: Os resultados mostraram que a inclusão dos efeitos do solvente na previsão de ∆ é de fundamental importância. No geral, os desvios relativos (DR) em relação ao valor experimental de ∆ variaram entre 1,4% e 25,9%, com o protocolo B3LYP/Paschoal-DZP/def2-SVP/CPCM, que apresentou um DR de 1,6% e um menor custo computacional, sendo selecionado para o estudo das propriedades dos demais compostos de Pd(II). Em relação as propriedades físico-químicas, observou-se que, de maneira geral, grupos mais lipofílicos auxiliam na atividade citotóxica. O log P apresentou uma fraca correlação com CC 50 (R 2 = 0,3788), enquanto os parâmetros eletrônicos apresentaram uma forte correlação com CC 50 , apresentando R 2 igual a 0,9912 (ε HOMO ), 0,9700 (ε LUMO ) e 0,9852 (Δε). Conclusão: O presente trabalho mostrou que a inclusão do efeito do solvente e uma boa relação PDBS/LBS é essencial para a correta descrição dos complexos de Pd(II), com protocolo B3LYP/Paschoal/DZP/def2-SVP/CPCM sendo uma excelente alternativa para o estudo de compostos de Pd(II). Além disso, a avaliação das propriedades físico-químicas mostra um forte indicativo de correlação com a atividade biológica, no entanto, para maiores confirmações faz-se necessário um estudo considerando um maior número de complexos. |
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Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoralCâncerTeoria do funcional de densidade (DFT)Propriedades físico-químicasDensity functional theoryPhysico-chemical propertiesCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::FARMACIAIntrodução: Os complexos de paládio (Pd) passaram a ser vistos como uma alternativa para o tratamento do câncer devido aos diversos efeitos adversos da cisplatina. Contrariando as expectativas iniciais, os complexos de Pd apresentam-se como compostos promissores, visto que apresentam menos efeitos adversos e desempenham atividade antitumoral significativa. Os métodos in silico podem ser empregados no planejamento de fármacos, visando minimizar custos e tornar o processo menos demorado. Os cálculos computacionais permitem a obtenção de propriedades físico-químicas que fornecem informações referentes a estrutura analisada e, consequentemente, sobre sua atividade, otimizando o processo de busca por novos fármacos e auxiliando os procedimentos experimentais indicando moléculas promissoras. Objetivo: O trabalho visa o estudo computacional de complexos de Pd(II) com atividade antitumoral, envolvendo análise de propriedades físico-químicas, e suas relações com a atividade. Metodologia: Inicialmente, um protocolo computacional para a previsão da energia livre de Gibbs de ativação (ΔG a ) para a reação de aquação do complexo [Pd(dien)Cl] + foi construído utilizando o programa ORCA 4.1.2. Um conjunto de 29 protocolos computacionais foram testados, considerando o nível DFT B3LYP, 14 funções de base para o Pd (PDBS), 4 funções de base para os ligantes (LBS), os efeitos do solvente através da aproximação implícita CPCM e relativísticos por meio do método DKH2. Posteriormente, um protocolo computacional foi selecionado para o estudo de propriedades tais como logaritmo do coeficiente de partição (log P), ε HOMO , ε LUMO , Δε (gap de energia) etc. visando a correlação com a atividade biológica (CC 50 ) de um conjunto de sete compostos de Pd(II) contra a linhagem celular K562, utilizando o programa GAUSSIAN 16 Rev. C.01. Resultados e Discussão: Os resultados mostraram que a inclusão dos efeitos do solvente na previsão de ∆ é de fundamental importância. No geral, os desvios relativos (DR) em relação ao valor experimental de ∆ variaram entre 1,4% e 25,9%, com o protocolo B3LYP/Paschoal-DZP/def2-SVP/CPCM, que apresentou um DR de 1,6% e um menor custo computacional, sendo selecionado para o estudo das propriedades dos demais compostos de Pd(II). Em relação as propriedades físico-químicas, observou-se que, de maneira geral, grupos mais lipofílicos auxiliam na atividade citotóxica. O log P apresentou uma fraca correlação com CC 50 (R 2 = 0,3788), enquanto os parâmetros eletrônicos apresentaram uma forte correlação com CC 50 , apresentando R 2 igual a 0,9912 (ε HOMO ), 0,9700 (ε LUMO ) e 0,9852 (Δε). Conclusão: O presente trabalho mostrou que a inclusão do efeito do solvente e uma boa relação PDBS/LBS é essencial para a correta descrição dos complexos de Pd(II), com protocolo B3LYP/Paschoal/DZP/def2-SVP/CPCM sendo uma excelente alternativa para o estudo de compostos de Pd(II). Além disso, a avaliação das propriedades físico-químicas mostra um forte indicativo de correlação com a atividade biológica, no entanto, para maiores confirmações faz-se necessário um estudo considerando um maior número de complexos.Universidade Federal do Rio de JaneiroBrasilInstituto de Ciências FarmacêuticasUFRJPaschoal, Diego Fernando da Silvahttp://lattes.cnpq.br/281434889710369512420569717http://lattes.cnpq.br/4719820493553147Barth, Thiagohttp://lattes.cnpq.br/2954810429809063Novato, Willian Tássio Gomeshttp://lattes.cnpq.br/7402297829650438Souza, Catherine Rodrigues Siqueira de2022-09-14T16:47:04Z2023-12-21T03:01:05Z2022-08-04info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisSOUZA, Catherine Rodrigues Siqueira de. Estudo computacional de propriedades físico-químicas de complexos de paládio com potencial antitumoral. 2022. 50 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Farmácia) - Instituto de Ciências Farmacêuticas, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Macaé, 2022.http://hdl.handle.net/11422/18622porinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJ2023-12-21T03:01:05Zoai:pantheon.ufrj.br:11422/18622Repositório InstitucionalPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestpantheon@sibi.ufrj.bropendoar:2023-12-21T03:01:05Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false |
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