Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2022 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRJ |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/11422/18205 |
Resumo: | O vírus da hepatite D (HDV) é um vírus defectivo dependente do vírus da hepatite B (HBV) para realizar seu ciclo replicativo. A infecção HBV-HDV pode ocorrer simultaneamente (coinfecção), ou quando um portador crônico do HBV é infectado posteriormente com o HDV (superinfecção). A superinfecção é a forma mais grave de hepatite viral crônica, devido a sua rápida progressão para cirrose e hepatocarcinoma e, consequentemente, ao alto risco de óbito. A divisão genotípica do HDV ainda não é um consenso entre os pesquisadores e novas propostas de classificação vêm surgindo à medida que novos dados genômicos são disponibilizados na literatura. Atualmente, o HDV é dividido em 8 genótipos, que possuem distintas distribuições geográficas ao redor do mundo. No Brasil prevalecem os genótipos 1 e 3, porém, estudos que abordam o genoma completo de variantes circulantes no Brasil são escassos, o que gera dificuldades na vigilância epidemiológica do HDV no país. Dessa forma, o presente estudo busca compreender a variabilidade genética viral e contribuir com novos dados de epidemiologia molecular do HDV no Brasil. Para isso, foram selecionadas 40 amostras de soro reagentes para o anticorpo anti-HDV, obtidas no Brasil entre 2013 e 2015. Dessas 40 amostras, 11 tiveram o RNA do HDV detectado e extraído para a amplificação por RT-PCR de dois fragmentos sobrepostos, a fim de cobrir o genoma viral completo. Os produtos amplificados foram submetidos ao sequenciamento nucleotídico pelo método de Sanger, seguido de análise filogenética. As análises filogenéticas indicaram a presença de 3 genótipos do HDV, sendo o HDV-3, considerado endêmico na região Norte do país, encontrado na maioria das amostras (9/11; 81,8%). As outras duas amostras foram classificadas nos genótipos 5 (1/11; 9,1%) e 8 (1/11; 9,1%), geralmente de circulação restrita ao continente africano. Tais genótipos, tendo sido raramente reportados no Brasil, demonstram a importância da contínua vigilância epidemiológica para o monitoramento das variantes virais e o alto potencial de disseminação do HDV pelo país. |
id |
UFRJ_eebbeed009a72dbd681ebb76f6382f5d |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:pantheon.ufrj.br:11422/18205 |
network_acronym_str |
UFRJ |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFRJ |
repository_id_str |
|
spelling |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no BrasilVírus delta da hepatiteMonitoramento epidemiológicoSequenciamento completo do genomaHepatitis delta virusEpidemiological monitoringWhole genome sequencingCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIACNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIAO vírus da hepatite D (HDV) é um vírus defectivo dependente do vírus da hepatite B (HBV) para realizar seu ciclo replicativo. A infecção HBV-HDV pode ocorrer simultaneamente (coinfecção), ou quando um portador crônico do HBV é infectado posteriormente com o HDV (superinfecção). A superinfecção é a forma mais grave de hepatite viral crônica, devido a sua rápida progressão para cirrose e hepatocarcinoma e, consequentemente, ao alto risco de óbito. A divisão genotípica do HDV ainda não é um consenso entre os pesquisadores e novas propostas de classificação vêm surgindo à medida que novos dados genômicos são disponibilizados na literatura. Atualmente, o HDV é dividido em 8 genótipos, que possuem distintas distribuições geográficas ao redor do mundo. No Brasil prevalecem os genótipos 1 e 3, porém, estudos que abordam o genoma completo de variantes circulantes no Brasil são escassos, o que gera dificuldades na vigilância epidemiológica do HDV no país. Dessa forma, o presente estudo busca compreender a variabilidade genética viral e contribuir com novos dados de epidemiologia molecular do HDV no Brasil. Para isso, foram selecionadas 40 amostras de soro reagentes para o anticorpo anti-HDV, obtidas no Brasil entre 2013 e 2015. Dessas 40 amostras, 11 tiveram o RNA do HDV detectado e extraído para a amplificação por RT-PCR de dois fragmentos sobrepostos, a fim de cobrir o genoma viral completo. Os produtos amplificados foram submetidos ao sequenciamento nucleotídico pelo método de Sanger, seguido de análise filogenética. As análises filogenéticas indicaram a presença de 3 genótipos do HDV, sendo o HDV-3, considerado endêmico na região Norte do país, encontrado na maioria das amostras (9/11; 81,8%). As outras duas amostras foram classificadas nos genótipos 5 (1/11; 9,1%) e 8 (1/11; 9,1%), geralmente de circulação restrita ao continente africano. Tais genótipos, tendo sido raramente reportados no Brasil, demonstram a importância da contínua vigilância epidemiológica para o monitoramento das variantes virais e o alto potencial de disseminação do HDV pelo país.Universidade Federal do Rio de JaneiroBrasilInstituto de Microbiologia Paulo de GóesUFRJMello, Francisco Campello do Amaralhttp://lattes.cnpq.br/1337703974796860Angelice, Giovana PaulaNico, DirleiRomanos, Maria Teresa VillelaDomitrovic, TatianaSantos, Gabriel Valente dos2022-08-05T18:44:01Z2023-12-21T03:00:22Z2022-06-08info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisSANTOS, G. V. dos. (2022). Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil [Trabalho de Conclusão de Curso, Universidade Federal do Rio de Janeiro]. Repositório Institucional Pantheon.http://hdl.handle.net/11422/18205porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRJinstname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)instacron:UFRJ2023-12-21T03:00:22Zoai:pantheon.ufrj.br:11422/18205Repositório InstitucionalPUBhttp://www.pantheon.ufrj.br/oai/requestpantheon@sibi.ufrj.bropendoar:2023-12-21T03:00:22Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)false |
dc.title.none.fl_str_mv |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil |
title |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil |
spellingShingle |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil Santos, Gabriel Valente dos Vírus delta da hepatite Monitoramento epidemiológico Sequenciamento completo do genoma Hepatitis delta virus Epidemiological monitoring Whole genome sequencing CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA |
title_short |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil |
title_full |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil |
title_fullStr |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil |
title_full_unstemmed |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil |
title_sort |
Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil |
author |
Santos, Gabriel Valente dos |
author_facet |
Santos, Gabriel Valente dos |
author_role |
author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Mello, Francisco Campello do Amaral http://lattes.cnpq.br/1337703974796860 Angelice, Giovana Paula Nico, Dirlei Romanos, Maria Teresa Villela Domitrovic, Tatiana |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Santos, Gabriel Valente dos |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Vírus delta da hepatite Monitoramento epidemiológico Sequenciamento completo do genoma Hepatitis delta virus Epidemiological monitoring Whole genome sequencing CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA |
topic |
Vírus delta da hepatite Monitoramento epidemiológico Sequenciamento completo do genoma Hepatitis delta virus Epidemiological monitoring Whole genome sequencing CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::IMUNOLOGIA |
description |
O vírus da hepatite D (HDV) é um vírus defectivo dependente do vírus da hepatite B (HBV) para realizar seu ciclo replicativo. A infecção HBV-HDV pode ocorrer simultaneamente (coinfecção), ou quando um portador crônico do HBV é infectado posteriormente com o HDV (superinfecção). A superinfecção é a forma mais grave de hepatite viral crônica, devido a sua rápida progressão para cirrose e hepatocarcinoma e, consequentemente, ao alto risco de óbito. A divisão genotípica do HDV ainda não é um consenso entre os pesquisadores e novas propostas de classificação vêm surgindo à medida que novos dados genômicos são disponibilizados na literatura. Atualmente, o HDV é dividido em 8 genótipos, que possuem distintas distribuições geográficas ao redor do mundo. No Brasil prevalecem os genótipos 1 e 3, porém, estudos que abordam o genoma completo de variantes circulantes no Brasil são escassos, o que gera dificuldades na vigilância epidemiológica do HDV no país. Dessa forma, o presente estudo busca compreender a variabilidade genética viral e contribuir com novos dados de epidemiologia molecular do HDV no Brasil. Para isso, foram selecionadas 40 amostras de soro reagentes para o anticorpo anti-HDV, obtidas no Brasil entre 2013 e 2015. Dessas 40 amostras, 11 tiveram o RNA do HDV detectado e extraído para a amplificação por RT-PCR de dois fragmentos sobrepostos, a fim de cobrir o genoma viral completo. Os produtos amplificados foram submetidos ao sequenciamento nucleotídico pelo método de Sanger, seguido de análise filogenética. As análises filogenéticas indicaram a presença de 3 genótipos do HDV, sendo o HDV-3, considerado endêmico na região Norte do país, encontrado na maioria das amostras (9/11; 81,8%). As outras duas amostras foram classificadas nos genótipos 5 (1/11; 9,1%) e 8 (1/11; 9,1%), geralmente de circulação restrita ao continente africano. Tais genótipos, tendo sido raramente reportados no Brasil, demonstram a importância da contínua vigilância epidemiológica para o monitoramento das variantes virais e o alto potencial de disseminação do HDV pelo país. |
publishDate |
2022 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2022-08-05T18:44:01Z 2022-06-08 2023-12-21T03:00:22Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
format |
bachelorThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
SANTOS, G. V. dos. (2022). Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil [Trabalho de Conclusão de Curso, Universidade Federal do Rio de Janeiro]. Repositório Institucional Pantheon. http://hdl.handle.net/11422/18205 |
identifier_str_mv |
SANTOS, G. V. dos. (2022). Caracterização molecular do genoma completo do vírus da hepatite D e genotipagem de estirpes circulantes no Brasil [Trabalho de Conclusão de Curso, Universidade Federal do Rio de Janeiro]. Repositório Institucional Pantheon. |
url |
http://hdl.handle.net/11422/18205 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal do Rio de Janeiro Brasil Instituto de Microbiologia Paulo de Góes UFRJ |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal do Rio de Janeiro Brasil Instituto de Microbiologia Paulo de Góes UFRJ |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFRJ instname:Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) instacron:UFRJ |
instname_str |
Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) |
instacron_str |
UFRJ |
institution |
UFRJ |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFRJ |
collection |
Repositório Institucional da UFRJ |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFRJ - Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) |
repository.mail.fl_str_mv |
pantheon@sibi.ufrj.br |
_version_ |
1815456035035414528 |