Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sousa, Denise Maria Cunha de
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/18133
Resumo: Dengue is considered as the most important arthropod-borne viral disease throughout the world due to the high number of people at risk to be infected, mainly in tropical and subtropical regions of the planet. The etiologic agent is Dengue Virus (DENV), it is a single positive-stranded RNA virus of the family Flavivirus, genus Flaviviridae. Four serotypes are known, DENV-1, DENV-2, DENV-3 and DENV-4. One of the most important characteristic of these viruses is the genetic variability, which demands phylogenetic and evolutionary studies to understand key aspects like: epidemiology, virulence, migration patterns and antigenic characteristics. The objective of this study is the genetic characterization of dengue viruses circulating in the state of Rio Grande does Norte from January 2010 to December 2012. The complete E gene (1485 pb) of DENV1, 2 e 4 from Brazilian (Rio Grande do Norte) patients was sequenced. Phylogenetic analysis was performed using MEGA 5.2 software, Tamura-Nei model and Neighbor-Joining trees were inferred for the datasets. In Brazil, there is just one DENV-1 genotype (genotype V), one DENV-2 genotype (Asian/American) and two DENV-4 genotypes (genotypes I and II). Brazilian strains of DENV-1 are subdivided in two different lineages (BR-I and BR-II), the Brazilian strains of DENV-2 are subdivided in four lineages (BRI-IV) and genotype II of DENV-4 is subdivided in three Brazilian lineages (BRI-III). The viruses isolated in RN belong to lineage BR-II (DENV-1), BR-IV (DENV-2) and BR-III (DENV-4).The Caribbean and near Latin American countries are the main source of these viruses to Brazil. Amino acids substitutions were detected in three domains of E protein, this makes clear the necessity of studies that associate epidemiological and molecular data to better understand the effects of these mutations. This is the first study about genetic characterization and evolution of Dengue viruses in Rio Grande do Norte, Brazil
id UFRN_2b5423307a83b3efa69da2cecae0dff1
oai_identifier_str oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/18133
network_acronym_str UFRN
network_name_str Repositório Institucional da UFRN
repository_id_str
spelling Sousa, Denise Maria Cunha dehttp://lattes.cnpq.br/6311818981226761http://lattes.cnpq.br/6430774978643765Fernandes, José Veríssimohttp://lattes.cnpq.br/7078820975978056Nogueira, Rita Maria Ribeirohttp://lattes.cnpq.br/9749453000493825Araújo, Joselio Maria Galvão de2014-12-17T15:49:14Z2014-12-102014-12-17T15:49:14Z2014-02-21SOUSA, Denise Maria Cunha de. Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte. 2014. 97 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2014.https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/18133Dengue is considered as the most important arthropod-borne viral disease throughout the world due to the high number of people at risk to be infected, mainly in tropical and subtropical regions of the planet. The etiologic agent is Dengue Virus (DENV), it is a single positive-stranded RNA virus of the family Flavivirus, genus Flaviviridae. Four serotypes are known, DENV-1, DENV-2, DENV-3 and DENV-4. One of the most important characteristic of these viruses is the genetic variability, which demands phylogenetic and evolutionary studies to understand key aspects like: epidemiology, virulence, migration patterns and antigenic characteristics. The objective of this study is the genetic characterization of dengue viruses circulating in the state of Rio Grande does Norte from January 2010 to December 2012. The complete E gene (1485 pb) of DENV1, 2 e 4 from Brazilian (Rio Grande do Norte) patients was sequenced. Phylogenetic analysis was performed using MEGA 5.2 software, Tamura-Nei model and Neighbor-Joining trees were inferred for the datasets. In Brazil, there is just one DENV-1 genotype (genotype V), one DENV-2 genotype (Asian/American) and two DENV-4 genotypes (genotypes I and II). Brazilian strains of DENV-1 are subdivided in two different lineages (BR-I and BR-II), the Brazilian strains of DENV-2 are subdivided in four lineages (BRI-IV) and genotype II of DENV-4 is subdivided in three Brazilian lineages (BRI-III). The viruses isolated in RN belong to lineage BR-II (DENV-1), BR-IV (DENV-2) and BR-III (DENV-4).The Caribbean and near Latin American countries are the main source of these viruses to Brazil. Amino acids substitutions were detected in three domains of E protein, this makes clear the necessity of studies that associate epidemiological and molecular data to better understand the effects of these mutations. This is the first study about genetic characterization and evolution of Dengue viruses in Rio Grande do Norte, BrazilA dengue é considerada a doença transmitida por artrópodes mais importante do mundo devido ao elevado número de pessoas que correm o risco de contraí-la, principalmente em regiões tropicais e sub-tropicais do planeta. O agente etiológico da doença é o vírus dengue (DENV), um vírus de RNA fita simples e polaridade positiva, pertencente à família Flavivridae e ao gênero Flavivirus. São conhecidos quatro sorotipos distintos: DENV-1, DENV-2, DENV-3 E DENV-4. Uma das suas principais características é a elevada variabilidade genética que torna clara a necessidade da realização de estudos filogenéticos e evolutivos com o objetivo de compreender aspectos essenciais como: epidemiologia, virulência, padrões de migração e características antigênicas. O objetivo deste estudo foi realizar a caracterização genética dos vírus dengue circulantes no estado do Rio Grande do Norte durante o período de Janeiro de 2010 a Dezembro de 2012. Realizou-se o sequenciamento do gene do envelope (1485pb) dos sorotipos DENV-1 (N=6), DENV-2 (N=6) e DENV-4 (N=4) isolados de casos clínicos de diferentes municípios do estado do Rio Grande do Norte. A análise filogenética foi realizada utilizando o programa Mega v5.2, método de Neighbor-Joining e modelo Tamura-Nei. No Brasil, foi constada a circulação de apenas um genótipo de DENV-1 (genótipo V), um genótipo DENV-2 (asiático/americano) e dois genótipos de DENV-4 (genótipos I e II) no Brasil. As cepas brasileiras de DENV-1 estão dividas em duas linhagens temporalmente distintas (BR-I e BR-II), as cepas brasileiras de DENV-2 estão subdividas em quatro linhagens (BRI-IV) e o genótipo II de DENV-4 apresentou três linhagens de cepas brasileiras (LI-III). Os vírus isolados no Rio Grande do Norte pertencem a linhagem BR-II (DENV-1), BR-IV (DENV-2) e BR-III (DENV-4). A fonte de importação destes vírus para o Brasil é principalmente o Caribe e países próximos da América Latina. Foram detectadas substituições de aminoácidos ao longo dos três domínios da proteína E, tornando clara a necessidade da realização de estudos que associem dados epidemiológicos e moleculares para melhor compreensão dos efeitos dessas mutações. Este é o primeiro estudo sobre caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte, BrasilCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorapplication/pdfporUniversidade Federal do Rio Grande do NortePrograma de Pós-Graduação em Sistemática e EvoluçãoUFRNBRCiências BiológicasFilogenia. DENV. Aedes aegypti. BrasilPhylogeny. DENV. Aedes aegypti. BrazilCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIACaracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norteinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALDeniseMCS_DISSERT.pdfDeniseMCS_DISSERT.pdfapplication/pdf1722206https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/18133/1/DeniseMCS_DISSERT.pdf7b20a457ee1f598ce098a2f310d5caa6MD51TEXTDeniseMCS_DISSERT.pdf.txtDeniseMCS_DISSERT.pdf.txtExtracted texttext/plain251750https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/18133/6/DeniseMCS_DISSERT.pdf.txt35a8d332cc8e0cc2de4e6c684fa4e139MD56THUMBNAILDeniseMCS_DISSERT.pdf.jpgDeniseMCS_DISSERT.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5439https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/18133/7/DeniseMCS_DISSERT.pdf.jpgf778e1b8f62beaf930a3459e8d10fa4bMD57123456789/181332017-11-04 14:48:00.469oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/18133Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2017-11-04T17:48Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false
dc.title.por.fl_str_mv Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte
title Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte
spellingShingle Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte
Sousa, Denise Maria Cunha de
Filogenia. DENV. Aedes aegypti. Brasil
Phylogeny. DENV. Aedes aegypti. Brazil
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIA
title_short Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte
title_full Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte
title_fullStr Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte
title_full_unstemmed Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte
title_sort Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte
author Sousa, Denise Maria Cunha de
author_facet Sousa, Denise Maria Cunha de
author_role author
dc.contributor.authorID.por.fl_str_mv
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6311818981226761
dc.contributor.advisorID.por.fl_str_mv
dc.contributor.advisorLattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6430774978643765
dc.contributor.referees1.pt_BR.fl_str_mv Fernandes, José Veríssimo
dc.contributor.referees1ID.por.fl_str_mv
dc.contributor.referees1Lattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7078820975978056
dc.contributor.referees2.pt_BR.fl_str_mv Nogueira, Rita Maria Ribeiro
dc.contributor.referees2ID.por.fl_str_mv
dc.contributor.referees2Lattes.por.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9749453000493825
dc.contributor.author.fl_str_mv Sousa, Denise Maria Cunha de
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Araújo, Joselio Maria Galvão de
contributor_str_mv Araújo, Joselio Maria Galvão de
dc.subject.por.fl_str_mv Filogenia. DENV. Aedes aegypti. Brasil
topic Filogenia. DENV. Aedes aegypti. Brasil
Phylogeny. DENV. Aedes aegypti. Brazil
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIA
dc.subject.eng.fl_str_mv Phylogeny. DENV. Aedes aegypti. Brazil
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ECOLOGIA
description Dengue is considered as the most important arthropod-borne viral disease throughout the world due to the high number of people at risk to be infected, mainly in tropical and subtropical regions of the planet. The etiologic agent is Dengue Virus (DENV), it is a single positive-stranded RNA virus of the family Flavivirus, genus Flaviviridae. Four serotypes are known, DENV-1, DENV-2, DENV-3 and DENV-4. One of the most important characteristic of these viruses is the genetic variability, which demands phylogenetic and evolutionary studies to understand key aspects like: epidemiology, virulence, migration patterns and antigenic characteristics. The objective of this study is the genetic characterization of dengue viruses circulating in the state of Rio Grande does Norte from January 2010 to December 2012. The complete E gene (1485 pb) of DENV1, 2 e 4 from Brazilian (Rio Grande do Norte) patients was sequenced. Phylogenetic analysis was performed using MEGA 5.2 software, Tamura-Nei model and Neighbor-Joining trees were inferred for the datasets. In Brazil, there is just one DENV-1 genotype (genotype V), one DENV-2 genotype (Asian/American) and two DENV-4 genotypes (genotypes I and II). Brazilian strains of DENV-1 are subdivided in two different lineages (BR-I and BR-II), the Brazilian strains of DENV-2 are subdivided in four lineages (BRI-IV) and genotype II of DENV-4 is subdivided in three Brazilian lineages (BRI-III). The viruses isolated in RN belong to lineage BR-II (DENV-1), BR-IV (DENV-2) and BR-III (DENV-4).The Caribbean and near Latin American countries are the main source of these viruses to Brazil. Amino acids substitutions were detected in three domains of E protein, this makes clear the necessity of studies that associate epidemiological and molecular data to better understand the effects of these mutations. This is the first study about genetic characterization and evolution of Dengue viruses in Rio Grande do Norte, Brazil
publishDate 2014
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2014-12-17T15:49:14Z
dc.date.available.fl_str_mv 2014-12-10
2014-12-17T15:49:14Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2014-02-21
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SOUSA, Denise Maria Cunha de. Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte. 2014. 97 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2014.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/18133
identifier_str_mv SOUSA, Denise Maria Cunha de. Caracterização genética e evolução dos vírus dengue no Estado do Rio Grande do Norte. 2014. 97 f. Dissertação (Mestrado em Ciências Biológicas) - Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2014.
url https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/18133
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio Grande do Norte
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Sistemática e Evolução
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRN
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Ciências Biológicas
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio Grande do Norte
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRN
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron:UFRN
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron_str UFRN
institution UFRN
reponame_str Repositório Institucional da UFRN
collection Repositório Institucional da UFRN
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/18133/1/DeniseMCS_DISSERT.pdf
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/18133/6/DeniseMCS_DISSERT.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/18133/7/DeniseMCS_DISSERT.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 7b20a457ee1f598ce098a2f310d5caa6
35a8d332cc8e0cc2de4e6c684fa4e139
f778e1b8f62beaf930a3459e8d10fa4b
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1802117776211443712

Registros relacionados