Revisão da análise filogenética dos segmentos L, M e S do vírus Oropouche

• Autor(a) principal: Pimentel, Alexa Lemos dos Santos
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
• Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/43198
• topic: vírus Oropouche; árvore filogenética; análise filogenética

O vírus Oropouche (OROV) é um dos mais importantes arbovírus causadores de doenças zoonóticas circulantes no Brasil, sendo encontrado também em outros países da América do Sul e Central, como Peru e Panamá. Pertence à família Bunyaviridae, gênero Orthobunyavirus, possui genoma de RNA de fita simples dividido em três segmentos designados L, M e S (Grande, Médio e Pequeno). Este vírus é o agente etiológico da Febre do Oropouche (FO), uma doença aguda, em geral autolimitada com aspectos clínicos semelhantes a outras arboviroses,mas em alguns casos, pode apresentar mais grave com quadro de meningite ou meningoencefalite. O presente estudo tem como objetivo realizar a análise filogenética dos segmentos L, M e S do OROV. Para isso, sequências do OROV foram coletadas do GenBank, sendo excluídas da análise aquelas sem definição do ano de coleta ou sem informações do segmento sequenciado. Após a aplicação desses critérios, foram selecionadas para a análise, 56, 56 e 52 sequências dos segmentos L, M e S, respectivamente. O segmento S foi o que permitiu a melhor classificação de genótipos, sendo o genótipo I composto por sequências de amostras do vírus circulantes em Trinidad e Tobago e Brasil, de 1955 a 2012, isoladas das espécies Homo sapiens, Culex quinquefasciatus, Bradypus tridactylus. O genótipo II consiste em sequências de amostras do vírus circulantes no Brasil, Peru e Equador de 1973 a 2016, isoladas das espécies Homo sapiens e Culicoides paraensis. O genótipo III é composto por sequências de amostras do vírus circulantes no Brasil e Panamá de 1990 a 2000, isolados das espécies Homo sapiens e Callithrix sp. O genótipo IV consiste em um isolado do ano 1980 isolado da espécie Homo sapiens. Em conclusão, esse estudo permitiu uma melhor compreensão das linhagens circulantes do OROV no Brasil e fornece dados para o desenvolvimento de futuros protocolos para o diagnóstico molecular desse vírus no Brasil.