Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Lins, Paulo Roberto Branco
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/25868
Resumo: Variações no nível de expressão gênica estão entre as principais causas da diversidade fenotípica nos organismos, incluindo o desenvolvimento de patologias e a resposta aos fármacos em humanos. Os RNAs não codificantes (ncRNAs) desempenham um papel importante no complexo mecanismo das redes regulatórias. Embora ainda não completamente compreendidos, dois representantes dos ncRNAs despontam em pesquisas recentes como protagonistas no desenvolvimento de quadros clínicos. São eles os microRNAs (miRNAs) e os RNAs não codificantes intergênicos longos (lincRNAs). Assim, o presente trabalho integrou dados públicos para catalogar o vasto panorama dos efeitos regulatórios dos miRNAs e dos lincRNAs no genoma humano. Através de uma análise de expression Quantitative Trait Loci (eQTL) foram identificadas variações que tivessem efeito putativo na expressão gênica. Redes de associação também foram criadas relacionando os resultados da análise eQTL com tratos de relevância clínica e/ou farmacológica. Por meio dessa, foram reveladas associações que podem continuar despertando o interesse de novos estudos envolvendo o tema. Distúrbios mentais e coronários, além do câncer, foram os tratos com maior evidência nos resultados do estudo.
id UFRN_43735886376a4447756627af92fe18b5
oai_identifier_str oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/25868
network_acronym_str UFRN
network_name_str Repositório Institucional da UFRN
repository_id_str
spelling Lins, Paulo Roberto BrancoSouza, Sandro José deFiguerola, Wilfredo BlancoKurtz, Guilherme SuarezBarrera, Júnior2018-09-17T21:11:45Z2018-09-17T21:11:45Z2018-07-19LINS, Paulo Roberto Branco. Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL. 2018. 55f. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto Metrópole Digital, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2018.https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/25868Variações no nível de expressão gênica estão entre as principais causas da diversidade fenotípica nos organismos, incluindo o desenvolvimento de patologias e a resposta aos fármacos em humanos. Os RNAs não codificantes (ncRNAs) desempenham um papel importante no complexo mecanismo das redes regulatórias. Embora ainda não completamente compreendidos, dois representantes dos ncRNAs despontam em pesquisas recentes como protagonistas no desenvolvimento de quadros clínicos. São eles os microRNAs (miRNAs) e os RNAs não codificantes intergênicos longos (lincRNAs). Assim, o presente trabalho integrou dados públicos para catalogar o vasto panorama dos efeitos regulatórios dos miRNAs e dos lincRNAs no genoma humano. Através de uma análise de expression Quantitative Trait Loci (eQTL) foram identificadas variações que tivessem efeito putativo na expressão gênica. Redes de associação também foram criadas relacionando os resultados da análise eQTL com tratos de relevância clínica e/ou farmacológica. Por meio dessa, foram reveladas associações que podem continuar despertando o interesse de novos estudos envolvendo o tema. Distúrbios mentais e coronários, além do câncer, foram os tratos com maior evidência nos resultados do estudo.Variations in the level of gene expression are among the main causes of phenotypic diversity in organisms, including the development of pathologies and response to drugs in humans. Non-coding RNAs (ncRNAs) play an important role in the complex mechanism of regulatory networks. Although not yet fully understood, two representatives of the ncRNAs emerge in recent researches as protagonists in the development of clinical conditions. They are the microRNAs (miRNAs) and the long intergenic non-coding RNAs (lincRNAs). Thus, the present work integrated public data to catalog the vast landscape of the regulatory effects of miRNAs and lincRNAs in the human genome. Through expression Quantitative Trait Loci (eQTL) analysis, variations that had a putative effect on gene expression were identified. Association networks were also created relating the eQTL analysis results to traits of clinical and/or pharmacological relevance. Through this, associations that may continue to arouse the interest of new studies involving the theme were revealed. Mental and coronary disorders, in addition to cancer, were the most evidenced traits in the study results.porCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: BIOINFORMÁTICAExpressão gênicamiRNAlincRNARedes de associaçãoPolimorfismoDescobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTLinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICAUFRNBrasilinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALDescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdfapplication/pdf16842839https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/25868/1/DescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdff03ade352f67fa1d688c5835cbabf988MD51TEXTDescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf.txtDescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf.txtExtracted texttext/plain68664https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/25868/2/DescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf.txtdec9b4ea1da8994bf41fa83770dce101MD52THUMBNAILDescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf.jpgDescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2682https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/25868/3/DescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf.jpg4cdaad201b58f9362491353ce07e75d4MD53123456789/258682019-01-30 02:09:43.808oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/25868Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2019-01-30T05:09:43Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
title Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
spellingShingle Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
Lins, Paulo Roberto Branco
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: BIOINFORMÁTICA
Expressão gênica
miRNA
lincRNA
Redes de associação
Polimorfismo
title_short Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
title_full Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
title_fullStr Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
title_full_unstemmed Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
title_sort Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL
author Lins, Paulo Roberto Branco
author_facet Lins, Paulo Roberto Branco
author_role author
dc.contributor.authorID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.advisorID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.advisor-co1ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees1.none.fl_str_mv Figuerola, Wilfredo Blanco
dc.contributor.referees1ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees2.none.fl_str_mv Kurtz, Guilherme Suarez
dc.contributor.referees2ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.author.fl_str_mv Lins, Paulo Roberto Branco
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Souza, Sandro José de
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Barrera, Júnior
contributor_str_mv Souza, Sandro José de
Barrera, Júnior
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: BIOINFORMÁTICA
topic CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS: BIOINFORMÁTICA
Expressão gênica
miRNA
lincRNA
Redes de associação
Polimorfismo
dc.subject.por.fl_str_mv Expressão gênica
miRNA
lincRNA
Redes de associação
Polimorfismo
description Variações no nível de expressão gênica estão entre as principais causas da diversidade fenotípica nos organismos, incluindo o desenvolvimento de patologias e a resposta aos fármacos em humanos. Os RNAs não codificantes (ncRNAs) desempenham um papel importante no complexo mecanismo das redes regulatórias. Embora ainda não completamente compreendidos, dois representantes dos ncRNAs despontam em pesquisas recentes como protagonistas no desenvolvimento de quadros clínicos. São eles os microRNAs (miRNAs) e os RNAs não codificantes intergênicos longos (lincRNAs). Assim, o presente trabalho integrou dados públicos para catalogar o vasto panorama dos efeitos regulatórios dos miRNAs e dos lincRNAs no genoma humano. Através de uma análise de expression Quantitative Trait Loci (eQTL) foram identificadas variações que tivessem efeito putativo na expressão gênica. Redes de associação também foram criadas relacionando os resultados da análise eQTL com tratos de relevância clínica e/ou farmacológica. Por meio dessa, foram reveladas associações que podem continuar despertando o interesse de novos estudos envolvendo o tema. Distúrbios mentais e coronários, além do câncer, foram os tratos com maior evidência nos resultados do estudo.
publishDate 2018
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2018-09-17T21:11:45Z
dc.date.available.fl_str_mv 2018-09-17T21:11:45Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2018-07-19
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv LINS, Paulo Roberto Branco. Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL. 2018. 55f. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto Metrópole Digital, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2018.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/25868
identifier_str_mv LINS, Paulo Roberto Branco. Descobrindo redes de associação envolvendo miRNAs e lincRNAs humanos através de uma análise de eQTL. 2018. 55f. Dissertação (Mestrado em Bioinformática) - Instituto Metrópole Digital, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2018.
url https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/25868
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.program.fl_str_mv PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRN
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRN
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron:UFRN
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron_str UFRN
institution UFRN
reponame_str Repositório Institucional da UFRN
collection Repositório Institucional da UFRN
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/25868/1/DescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/25868/2/DescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/25868/3/DescobrindoRedesassociacao_Lins_2018.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv f03ade352f67fa1d688c5835cbabf988
dec9b4ea1da8994bf41fa83770dce101
4cdaad201b58f9362491353ce07e75d4
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1802117698055831552

Registros relacionados