Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Mota, Kyvia Bezerra
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/22233
Resumo: Essa tese trata de duas pesquisas com diferentes naturezas conceituais no campo da modelagem molecular, porém baseadas em semelhantes princípios teóricos da física quântica e da química computacional. No primeiro estudo, as estabilidades dos sistemas ERα-OHT (Receptor α de Estrógeno-Hidroxitamoxifeno), ERα-RAL (Receptor α de Estrógeno-Raloxifeno) e Integrina αvβ3-Cilengitide foram determinadas em termos energéticos a partir da técnica de fracionamento molecular com capuzes conjugados (MFCC) e no escopo da teoria do funcional da densidade (DFT) seguindo o esquema GGA-PBE-Grimme para calcular a interação energias dos sistemas estudados. No primeiro estudo, foi possível predizer a relevância individual dos aminoácidos Glu, Asp, Arg, Lys no sistema com o Tamoxifeno e Glu, Asp e Lys com o Raloxifeno. Para isso ser possível, as forças de atração e repulsão dos resíduos que compõem os sistemas foram calculadas. Cada um desses resíduos apresentou uma energia de interação que variou dependendo da natureza química da sua cadeia lateral, do ambiente de microsolvatação que o envolve e dos contatos intermoleculares que estabelece. O estudo pioneiro da estabilidade conformacional em termos energéticos de uma região livre de aminoácidos incitará pesquisas centradas no desenvolvimento e síntese de novos antagonistas utilizados no tratamento de diversas patologias comuns na população geral. No segundo estudo, foram determinadas as propriedades energéticas do sistema Integrina αVβ3-Cilengitide, cuja estrutura cristalográfica apresenta cátions Mn+2. Observou-se a importâncias dos aminoácidos Ser, Asp, Leu, Arg, Lys, Ala e Pro na interaçao da integrina com o fragmento RGD (R: arginina; G: glicina; D: ácido aspártico) do cilengitide. A importância da integrina com o fragmento RGD no mecanismo de adesão de diversas células envolvidas nas doenças cancerígenas e também na implantação embrionária permitirá o desenvolvimento de novas terapias impactantes na sobrevida de pacientes portadores de diversas neoplasias e na reprodução humana.
id UFRN_536e169e282894d27c7f779074dbea8a
oai_identifier_str oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/22233
network_acronym_str UFRN
network_name_str Repositório Institucional da UFRN
repository_id_str
spelling Mota, Kyvia Bezerrahttp://lattes.cnpq.br/6175130067753726http://lattes.cnpq.br/9579151361576173Andrade Neto, Valter Ferreira dehttp://lattes.cnpq.br/4863082845974813Gavioli, Elaine Cristinahttp://lattes.cnpq.br/1759328747578795Albuquerque, Eudenilson Lins dehttp://lattes.cnpq.br/3594651355252245Galvão, Douglas Soareshttp://lattes.cnpq.br/9138028556380501Moura, Francisco Anacleto Barros Fidelis dehttp://lattes.cnpq.br/20516161304906282017-03-13T23:39:17Z2017-03-13T23:39:17Z2016-10-07MOTA, Kyvia Bezerra. Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide. 2016. 124f. Tese (Doutorado em Desenvolvimento e Inovação Tecnológica em Medicamentos) - Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2016.https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/22233Essa tese trata de duas pesquisas com diferentes naturezas conceituais no campo da modelagem molecular, porém baseadas em semelhantes princípios teóricos da física quântica e da química computacional. No primeiro estudo, as estabilidades dos sistemas ERα-OHT (Receptor α de Estrógeno-Hidroxitamoxifeno), ERα-RAL (Receptor α de Estrógeno-Raloxifeno) e Integrina αvβ3-Cilengitide foram determinadas em termos energéticos a partir da técnica de fracionamento molecular com capuzes conjugados (MFCC) e no escopo da teoria do funcional da densidade (DFT) seguindo o esquema GGA-PBE-Grimme para calcular a interação energias dos sistemas estudados. No primeiro estudo, foi possível predizer a relevância individual dos aminoácidos Glu, Asp, Arg, Lys no sistema com o Tamoxifeno e Glu, Asp e Lys com o Raloxifeno. Para isso ser possível, as forças de atração e repulsão dos resíduos que compõem os sistemas foram calculadas. Cada um desses resíduos apresentou uma energia de interação que variou dependendo da natureza química da sua cadeia lateral, do ambiente de microsolvatação que o envolve e dos contatos intermoleculares que estabelece. O estudo pioneiro da estabilidade conformacional em termos energéticos de uma região livre de aminoácidos incitará pesquisas centradas no desenvolvimento e síntese de novos antagonistas utilizados no tratamento de diversas patologias comuns na população geral. No segundo estudo, foram determinadas as propriedades energéticas do sistema Integrina αVβ3-Cilengitide, cuja estrutura cristalográfica apresenta cátions Mn+2. Observou-se a importâncias dos aminoácidos Ser, Asp, Leu, Arg, Lys, Ala e Pro na interaçao da integrina com o fragmento RGD (R: arginina; G: glicina; D: ácido aspártico) do cilengitide. A importância da integrina com o fragmento RGD no mecanismo de adesão de diversas células envolvidas nas doenças cancerígenas e também na implantação embrionária permitirá o desenvolvimento de novas terapias impactantes na sobrevida de pacientes portadores de diversas neoplasias e na reprodução humana.This thesis deals with two researches with different conceptual nature in the field of molecular modeling based on similar theoretical principles of quantum physics and computational chemistry. In the first study the stabilities of ERα-OHT (Receptor α Estrogen co-crystalyzed with Hydroxytamoxifen), ERα-RAL (α-Estrogen Receptor co-crystalyzed with Raloxifene) and integrin αvβ3 co-crystalyzed with cilengitide systems were determined in terms of energy from the Molecular Fractionation Technique Caps Conjugates (MFCC), and the scope of the Density Functional Theory (DFT) following GGA-PBE-Grimme scheme for calculating the interaction energy of the systems studied. In the first study, it was possible to predict the relevance of individual amino acids Glu, Asp, Arg, Lys in the system with Tamoxifen and Glu, Asp and Lys in Raloxifene system. For this to be possible, the attraction and repulsion forces of the residues that comprise the systems were calculated. Each of these residues had an energy of interaction that varied depending on the chemical nature of the side chain, the microsolvation environment that surrounds and intermolecular contacts establishing. The pioneer study of conformational stability in terms of energy of free amino acid region will encourage research focusing on the development and synthesis of new antagonists used in the treatment of several common diseases in the general population. In the second study, we determined the energetic properties of Integrin αVβ3-cilengitide system, whose crystallographic structure has Mn+2 cations. It was noted the importance of amino acids Ser, Asp, Leu, Arg, Lys, Ala and Pro in integrin interaction with the RGD fragment (R: arginine; G: glycine; D: aspartic acid) of cilengitide. The importance of integrin with the RGD fragment in the adhesion mechanism of various cells involved in cancers and in embryo implantation allows the development of new therapies impacting on survival of patients with various forms of neoplasms and in human reproduction.porCNPQ::CIENCIAS DA SAUDE: DESENVOLVIMENTO E INOVAÇÃO TECNOLÓGICA EM MEDICAMENTOSModelagem molecularEnergias de interaçãoTeoria do funcional da densidadeFracionamento molecular com capuzes conjugadosERα-OHTERα-RALIntegrina αVβ3-RGDCilengitideAnálise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitideinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisPROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM DESENVOLVIMENTO E INOVAÇÃO TECNOLÓGICA EM MEDICAMENTOSUFRNBrasilinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALAnáliseEnergéticaInsilico_Mota_2016.pdfAnáliseEnergéticaInsilico_Mota_2016.pdfapplication/pdf5207109https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/1/An%c3%a1liseEnerg%c3%a9ticaInsilico_Mota_2016.pdf412aafc3647114827f40b4d6f281b223MD51TEXTKyviaBezerraMota_TESE.pdf.txtKyviaBezerraMota_TESE.pdf.txtExtracted texttext/plain262346https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/4/KyviaBezerraMota_TESE.pdf.txt8e91fe18fc00c50ed711128d31254915MD54AnáliseEnergéticaInsilico_Mota_2016.pdf.txtAnáliseEnergéticaInsilico_Mota_2016.pdf.txtExtracted texttext/plain261833https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/6/An%c3%a1liseEnerg%c3%a9ticaInsilico_Mota_2016.pdf.txt1bb8abe1d97f3f89dfaff392e2f1ff68MD56THUMBNAILKyviaBezerraMota_TESE.pdf.jpgKyviaBezerraMota_TESE.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg2729https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/5/KyviaBezerraMota_TESE.pdf.jpg98b9271e90cd362cbf9567def0fc5815MD55AnáliseEnergéticaInsilico_Mota_2016.pdf.jpgAnáliseEnergéticaInsilico_Mota_2016.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1282https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/7/An%c3%a1liseEnerg%c3%a9ticaInsilico_Mota_2016.pdf.jpg811b6b57673d1523139b1a070987358bMD57123456789/222332019-05-26 02:46:26.85oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/22233Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2019-05-26T05:46:26Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide
title Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide
spellingShingle Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide
Mota, Kyvia Bezerra
CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE: DESENVOLVIMENTO E INOVAÇÃO TECNOLÓGICA EM MEDICAMENTOS
Modelagem molecular
Energias de interação
Teoria do funcional da densidade
Fracionamento molecular com capuzes conjugados
ERα-OHT
ERα-RAL
Integrina αVβ3-RGD
Cilengitide
title_short Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide
title_full Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide
title_fullStr Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide
title_full_unstemmed Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide
title_sort Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide
author Mota, Kyvia Bezerra
author_facet Mota, Kyvia Bezerra
author_role author
dc.contributor.authorID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.authorLattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6175130067753726
dc.contributor.advisorID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.advisorLattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9579151361576173
dc.contributor.referees1.none.fl_str_mv Andrade Neto, Valter Ferreira de
dc.contributor.referees1ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees1Lattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4863082845974813
dc.contributor.referees2.none.fl_str_mv Gavioli, Elaine Cristina
dc.contributor.referees2ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees2Lattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1759328747578795
dc.contributor.referees3.none.fl_str_mv Albuquerque, Eudenilson Lins de
dc.contributor.referees3ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees3Lattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3594651355252245
dc.contributor.referees4.none.fl_str_mv Galvão, Douglas Soares
dc.contributor.referees4ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees4Lattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9138028556380501
dc.contributor.referees5.none.fl_str_mv Moura, Francisco Anacleto Barros Fidelis de
dc.contributor.referees5ID.pt_BR.fl_str_mv
dc.contributor.referees5Lattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/2051616130490628
dc.contributor.author.fl_str_mv Mota, Kyvia Bezerra
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE: DESENVOLVIMENTO E INOVAÇÃO TECNOLÓGICA EM MEDICAMENTOS
topic CNPQ::CIENCIAS DA SAUDE: DESENVOLVIMENTO E INOVAÇÃO TECNOLÓGICA EM MEDICAMENTOS
Modelagem molecular
Energias de interação
Teoria do funcional da densidade
Fracionamento molecular com capuzes conjugados
ERα-OHT
ERα-RAL
Integrina αVβ3-RGD
Cilengitide
dc.subject.por.fl_str_mv Modelagem molecular
Energias de interação
Teoria do funcional da densidade
Fracionamento molecular com capuzes conjugados
ERα-OHT
ERα-RAL
Integrina αVβ3-RGD
Cilengitide
description Essa tese trata de duas pesquisas com diferentes naturezas conceituais no campo da modelagem molecular, porém baseadas em semelhantes princípios teóricos da física quântica e da química computacional. No primeiro estudo, as estabilidades dos sistemas ERα-OHT (Receptor α de Estrógeno-Hidroxitamoxifeno), ERα-RAL (Receptor α de Estrógeno-Raloxifeno) e Integrina αvβ3-Cilengitide foram determinadas em termos energéticos a partir da técnica de fracionamento molecular com capuzes conjugados (MFCC) e no escopo da teoria do funcional da densidade (DFT) seguindo o esquema GGA-PBE-Grimme para calcular a interação energias dos sistemas estudados. No primeiro estudo, foi possível predizer a relevância individual dos aminoácidos Glu, Asp, Arg, Lys no sistema com o Tamoxifeno e Glu, Asp e Lys com o Raloxifeno. Para isso ser possível, as forças de atração e repulsão dos resíduos que compõem os sistemas foram calculadas. Cada um desses resíduos apresentou uma energia de interação que variou dependendo da natureza química da sua cadeia lateral, do ambiente de microsolvatação que o envolve e dos contatos intermoleculares que estabelece. O estudo pioneiro da estabilidade conformacional em termos energéticos de uma região livre de aminoácidos incitará pesquisas centradas no desenvolvimento e síntese de novos antagonistas utilizados no tratamento de diversas patologias comuns na população geral. No segundo estudo, foram determinadas as propriedades energéticas do sistema Integrina αVβ3-Cilengitide, cuja estrutura cristalográfica apresenta cátions Mn+2. Observou-se a importâncias dos aminoácidos Ser, Asp, Leu, Arg, Lys, Ala e Pro na interaçao da integrina com o fragmento RGD (R: arginina; G: glicina; D: ácido aspártico) do cilengitide. A importância da integrina com o fragmento RGD no mecanismo de adesão de diversas células envolvidas nas doenças cancerígenas e também na implantação embrionária permitirá o desenvolvimento de novas terapias impactantes na sobrevida de pacientes portadores de diversas neoplasias e na reprodução humana.
publishDate 2016
dc.date.issued.fl_str_mv 2016-10-07
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2017-03-13T23:39:17Z
dc.date.available.fl_str_mv 2017-03-13T23:39:17Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv MOTA, Kyvia Bezerra. Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide. 2016. 124f. Tese (Doutorado em Desenvolvimento e Inovação Tecnológica em Medicamentos) - Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2016.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/22233
identifier_str_mv MOTA, Kyvia Bezerra. Análise energética in silico das interações: ERα-Tamoxifeno, ERα- Raloxifeno e Integrina αVβ3-Cilengitide. 2016. 124f. Tese (Doutorado em Desenvolvimento e Inovação Tecnológica em Medicamentos) - Centro de Ciências da Saúde, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2016.
url https://repositorio.ufrn.br/jspui/handle/123456789/22233
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.program.fl_str_mv PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM DESENVOLVIMENTO E INOVAÇÃO TECNOLÓGICA EM MEDICAMENTOS
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRN
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRN
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron:UFRN
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron_str UFRN
institution UFRN
reponame_str Repositório Institucional da UFRN
collection Repositório Institucional da UFRN
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/1/An%c3%a1liseEnerg%c3%a9ticaInsilico_Mota_2016.pdf
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/4/KyviaBezerraMota_TESE.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/6/An%c3%a1liseEnerg%c3%a9ticaInsilico_Mota_2016.pdf.txt
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/5/KyviaBezerraMota_TESE.pdf.jpg
https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/22233/7/An%c3%a1liseEnerg%c3%a9ticaInsilico_Mota_2016.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 412aafc3647114827f40b4d6f281b223
8e91fe18fc00c50ed711128d31254915
1bb8abe1d97f3f89dfaff392e2f1ff68
98b9271e90cd362cbf9567def0fc5815
811b6b57673d1523139b1a070987358b
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1802117872361668608