Análise em nível de gene e transcrito revelam alterações sexo-específicas no córtex pré-frontal no transtorno depressivo maior

• Autor(a) principal: Fernandes, Vítor Gabriel Saldanha
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
• Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/57331
• topic: Transtorno depressivo maior; Análise Transcricional; Expressão Gênica; Uso de Transcritos; Biologia de Sistemas

O transtorno depressivo maior (MDD) é considerado a principal causa de incapacidade no mundo. O sexo é um fator importante da heterogeneidade sintomática e biológica no transtorno; no entanto, essa investigação sexo-específica do MDD é recente e os mecanismos regulatórios ainda não são claros. Portanto, além da metodologia usual em nível de gene, os métodos em nível de isoforma podem desvendar mecanismos de expressão gênica diferencial importantes para explicar a fisiopatologia do MDD. Para investigar esse dimorfismo, analisamos um conjunto de dados humanos de pacientes controle e com MDD, que consiste no sequenciamento de RNA total isolado de 265 amostras post-mortem, compreendendo seis regiões cerebrais de ambos os sexos. A avaliação da expressão em nível de transcrição foi realizada pela análise da expressão diferencial de transcritos (DTE) e pela análise do uso diferencial de transcritos (DTU), enquanto a avaliação global do gene foi feita pela análise de expressão gênica diferencial (DGE). Foram observados 624, 623 e 184 genes alterados nas análises de DGE, DTE e DTU, respectivamente, totalizando 1.335 genes alterados transcricionalmente (TAG) únicos. Esses TAGs são majoritariamente exclusivos de cada região (80%) e concentrados no córtex pré-frontal, sendo apenas 52 compartilhados por ambos os sexos. Esse resultado mostra que o MDD é um transtorno específico para sexo e região, mesmo quando considera-se a expressão em nível de transcrito. Para concluir, mostramos a importância da combinação de abordagens de nível de gene e transcrito, além de relatarmos um novo conjunto de genes implicados na patologia, como AIG1 e DDX39B.