Mecanismos de ação antibacteriana de inibidores de tripsina: uma revisão sistemática e um estudo por simulação computacional de dinâmica molecular com membranas de bactérias

• Autor(a) principal: Nascimento, Amanda Maria de Souza
• Data de Publicação: 2021
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
• Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/45313
• topic: Antibacterianos; Peptídeo antimicrobiano; Cultura bacteriana; Revisão sistemática; Simulação computacional

O conhecimento de novos compostos antimicrobianos capazes de atuar contra microrganismos merece atenção na atualidade. Diversas moléculas têm sido estudadas por suas atividades antibacterianas e, dentre elas, estão os inibidores de tripsina, com destaque para o inibidor de tripsina purificado de sementes de tamarindo (ITTp). O presente trabalho objetivou apresentar os mecanismos de ação antibacteriana de inibidores de tripsina por meio de uma revisão sistemática (RS) e um estudo in silico de simulação de dinâmica molecular (DM). Para a revisão, reuniu-se estudos publicados na literatura, visando responder à pergunta: quais são os mecanismos de ação antibacteriana dos peptídeos e proteínas inibidores de tripsina? Inicialmente, foi elaborado e registrado, no Registro Prospectivo Internacional de Revisões Sistemáticas (PROSPERO), um protocolo de RS sob número: CRD42020189069. Dessa forma, a lista de verificação Preferred Reporting Items Checklist for Systematic Review and Meta-Analysis Protocols (PRISMA-P) foi utilizada para delinear o protocolo e PRISMA para a revisão sistemática. Os artigos foram selecionados de acordo com critérios de elegibilidade, conforme o PICOS (população, intervenção, controle, resultados e tipos de estudos). As bases de dados utilizadas foram PubMed, ScienceDirect, Scopus, Web of Science, BVS e EMBASE. Foram incluídos artigos originais resultantes de estudos com ratos e/ou camundongos, estudos in vitro (cultura bacteriana) e em células, que descreveram os tratamentos, efeitos e os mecanismos antibacterianos de peptídeos ou proteínas do tipo inibidores de tripsina. Os artigos foram selecionados e os dados foram extraídos por dois revisores independentes. A avaliação da qualidade metodológica foi realizada por meio da ferramenta OHAT (Office of Health Assessment and Translation). Na RS, foram resgatados 2382 artigos, sendo, ao final da busca, 17 elegíveis para a revisão. Constatou-se que grande parte dos inibidores de tripsina foram capazes de gerar efeito bacteriostático ou bactericida, dependendo das concentrações utilizadas. Foi visto que apenas quatro estudos se aprofundaram no mecanismo diretamente na membrana das bactérias, em três estudos os autores utilizaram S. aureus, E. coli. Um quarto estudo avaliou a ação antibacteriana sobre as proteases endógenas extraídas das próprias bactérias (S. enterica e S. aureus). Para o estudo de simulação de DM, utilizou-se o modelo número 56, na conformação número 287 do ITTp (ITTp 56/287) e o modelo de bicamada lipídica gerado pelo servidor CHARMM-GUI, para avaliar o comportamento estrutural e as interações por simulações de DM foram realizadas usando o pacote Gromacs 5.1.2. Foi observada maior interação do ITTp 56/287 com a membrana GP, apresentando energia potencial de interação (EPI) de –1094.97 kcal.mol1 quando comparada à interação com a membrana Gram-negativa (GN), -444.337 kcal.mol1. Foi possível identificar que, na interação ITTp 56/287-GP, os resíduos de aminoácidos de arginina apresentaram maior EPI, enquanto na interação ITTp 56/287-GN, foram com os resíduos de glutamina. Este estudo primeiramente esclarece e sistematiza a ação antibacteriana dos inibidores de tripsina, sendo de grande relevância e gerando informações para possíveis pesquisas futuras sobre essas vias. Adicionalmente, o estudo por simulação de DM aponta o ITTp como candidato para futuros estudos que o consolide como uma opção no tratamento mais eficaz de infecções bacterianas.