Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Araújo, Roniel de Lima
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRN
Texto Completo: https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/47229
Resumo: Neste trabalho, apresentaremos um estudo das propriedades estruturais, eletrˆonicas, ´opticas, vibracionais e termodinˆamicas dos cristais de dopamina, l-dopa, noradrenalina e adrenalina, atrav´es de simula¸c˜oes computacionais no formalismo DFT (Density Functional Theory), onde foi usado a aproxima¸c˜ao do gradiente generalizado (GGA-PBE) e o funcional h´ıbrido HSE06. A partir dos dados experimentais das quatro estruturas cristalinas foram realizados a otimiza¸c˜ao da geometria cristalina, c´alculo da densidade de estados e estrutura de bandas, absor¸c˜ao ´optica, fun¸c˜ao diel´etrica, ´ındice de refra¸c˜ao, condutividade ´optica, refletividade, fun¸c˜ao perda, espectro infravermelho e Raman e tamb´em temperatura de Debye, entalpia, energia livre, T*entropia e capacidade t´ermica. Os novos parˆametros de rede encontrados apresentaram uma boa concordˆancia com os valores experimentais. Atrav´es do funcional GGA-PBE (HSE06), encontramos que: a dopamina apresenta um band gap indireto E = 3, 8 eV (4,70 eV), para noradrenalina obtivemos um band gap indireto E = 3, 48 eV (4,40 eV), para adrenalina foi encontrado um band gap indireto E = 3, 53 eV (4,60 eV) e um band gap direto E = 3, 09 eV (3,60 eV) foi obtido para o cristal da l-dopa. A an´alise das densidades de estados eletrˆonicos permitiu identificar as contribui¸c˜oes por ´atomo para os estados das bandas de valˆencia e de condu¸c˜ao. Nas propriedades ´opticas ´e poss´ıvel observar uma absor¸c˜ao da luz na regi˜ao ultravioleta, e uma maior sensibilidade na absor¸c˜ao da radia¸c˜ao polarizada na dire¸c˜ao 100, para a dopamina, noradrenalina e l-dopa, enquanto que a adrenalina apresenta uma maior absor¸c˜ao da luz polarizada com a dire¸c˜ao de polariza¸c˜ao 001. Os espectros IR e Raman foram calculados e os modos de vibra¸c˜ao analisados. A capacidade t´ermica em temperatura ambiente encontrada foi: 210.01 cal/cell.K, 121 cal/cell.K, 182 cal/cell.K e 103 cal/cell.K, para dopamina, l-dopa, noradrenalina e adrenalina, respectivamente.
id UFRN_ce387a863de3a8f8dbd94703de8936b3
oai_identifier_str oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/47229
network_acronym_str UFRN
network_name_str Repositório Institucional da UFRN
repository_id_str
spelling Araújo, Roniel de Limahttps://orcid.org/0000-0002-3021-9439http://lattes.cnpq.br/2036449171182051https://orcid.org/0000-0002-4528-9878http://lattes.cnpq.br/9579151361576173Barboza, Carlos Antôniohttp://lattes.cnpq.br/6129886378495626Macedo Filho, Antônio deAnselmo, Dory Helio Aires de Limahttps://orcid.org/0000-0003-0180-9189http://lattes.cnpq.br/0554474279738500Albuquerque, Eudenilson Lins dehttps://orcid.org/0000-0002-1022-1048http://lattes.cnpq.br/3594651355252245Silva, Luciano Rodrigues dahttps://orcid.org/0000-0002-6875-1965http://lattes.cnpq.br/5182830756789229Lyra, Marcelo LeiteFulco, Umberto Laino2022-05-19T22:20:28Z2022-05-19T22:20:28Z2022-02-18ARAÚJO, Roniel de Lima. Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores. 2022. 106f. Tese (Doutorado em Física) - Centro de Ciências Exatas e da Terra, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2022.https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/47229Neste trabalho, apresentaremos um estudo das propriedades estruturais, eletrˆonicas, ´opticas, vibracionais e termodinˆamicas dos cristais de dopamina, l-dopa, noradrenalina e adrenalina, atrav´es de simula¸c˜oes computacionais no formalismo DFT (Density Functional Theory), onde foi usado a aproxima¸c˜ao do gradiente generalizado (GGA-PBE) e o funcional h´ıbrido HSE06. A partir dos dados experimentais das quatro estruturas cristalinas foram realizados a otimiza¸c˜ao da geometria cristalina, c´alculo da densidade de estados e estrutura de bandas, absor¸c˜ao ´optica, fun¸c˜ao diel´etrica, ´ındice de refra¸c˜ao, condutividade ´optica, refletividade, fun¸c˜ao perda, espectro infravermelho e Raman e tamb´em temperatura de Debye, entalpia, energia livre, T*entropia e capacidade t´ermica. Os novos parˆametros de rede encontrados apresentaram uma boa concordˆancia com os valores experimentais. Atrav´es do funcional GGA-PBE (HSE06), encontramos que: a dopamina apresenta um band gap indireto E = 3, 8 eV (4,70 eV), para noradrenalina obtivemos um band gap indireto E = 3, 48 eV (4,40 eV), para adrenalina foi encontrado um band gap indireto E = 3, 53 eV (4,60 eV) e um band gap direto E = 3, 09 eV (3,60 eV) foi obtido para o cristal da l-dopa. A an´alise das densidades de estados eletrˆonicos permitiu identificar as contribui¸c˜oes por ´atomo para os estados das bandas de valˆencia e de condu¸c˜ao. Nas propriedades ´opticas ´e poss´ıvel observar uma absor¸c˜ao da luz na regi˜ao ultravioleta, e uma maior sensibilidade na absor¸c˜ao da radia¸c˜ao polarizada na dire¸c˜ao 100, para a dopamina, noradrenalina e l-dopa, enquanto que a adrenalina apresenta uma maior absor¸c˜ao da luz polarizada com a dire¸c˜ao de polariza¸c˜ao 001. Os espectros IR e Raman foram calculados e os modos de vibra¸c˜ao analisados. A capacidade t´ermica em temperatura ambiente encontrada foi: 210.01 cal/cell.K, 121 cal/cell.K, 182 cal/cell.K e 103 cal/cell.K, para dopamina, l-dopa, noradrenalina e adrenalina, respectivamente.In this work, we will present a study of the structural, electronic, optical, vibrational and thermodynamic properties of the dopamine, l-dopa, noradrenaline and adrenaline crystals, through computer simulations in the DFT formalism (Density Functional Theory), where the generalized gradient approximation (GGA-PBE) and the hybrid functional HSE06 were used. From the experimental data of the four crystal structures, the optimization of the crystal geometry, calculation of the density of states and band structure, optical absorption, dielectric function, refractive index, optical conductivity, reflectivity, loss function, infrared and Raman spectrum and also Debye temperature, enthalpy, free energy, T*entropy and heat capacity were performed. The new lattice parameters found showed good agreement with the experimental values. Through the functional GGA-PBE (HSE06), we found that: dopamine presented an indirect band gap E = 3.8 eV (4.70 eV), for noradrenaline we obtained an indirect band gap E = 3.48 eV (4.40 eV), for adrenaline an indirect band gap E = 3.53eV (4.60 eV) and a direct band gap E = 3.09 eV (3.60 eV) was obtained for the l-dopa crystal. The analysis of the densities of electronic states made it possible to identify the contributions per atom to the states of the valence and conduction bands. In the optical properties, it is possible to observe an absorption of light in the ultraviolet region, and a greater sensitivity in the absorption of polarized radiation in the 100 direction, for dopamine, noradrenaline, and l-dopa, while adrenaline presents a greater absorption of polarized light with the polarization direction 001. IR and Raman spectra were calculated, and vibration modes analyzed. The thermal capacity at room temperature found was: 210.01 cal/cell.K, 121 cal/cell.K, 182 cal/cell.K and 103 cal/cell.K, for dopamine, l-dopa, noradrenaline and adrenaline, respectively.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESUniversidade Federal do Rio Grande do NortePROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM FÍSICAUFRNBrasilFísicaDFTNeurotransmissoresLevodopaBiofísicaPropriedades ópticas e eletrônicasTermodinâmicaEstudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissoresinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFRNinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)instacron:UFRNORIGINALEstudopropriedadesopticoeletronicas_Araujo_2022.pdfapplication/pdf7169717https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/47229/1/Estudopropriedadesopticoeletronicas_Araujo_2022.pdf906b501a94608cca2d14bfb52e9a8cfdMD51123456789/472292022-05-19 19:21:25.392oai:https://repositorio.ufrn.br:123456789/47229Repositório de PublicaçõesPUBhttp://repositorio.ufrn.br/oai/opendoar:2022-05-19T22:21:25Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores
title Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores
spellingShingle Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores
Araújo, Roniel de Lima
Física
DFT
Neurotransmissores
Levodopa
Biofísica
Propriedades ópticas e eletrônicas
Termodinâmica
title_short Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores
title_full Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores
title_fullStr Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores
title_full_unstemmed Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores
title_sort Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores
author Araújo, Roniel de Lima
author_facet Araújo, Roniel de Lima
author_role author
dc.contributor.authorID.pt_BR.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0002-3021-9439
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/2036449171182051
dc.contributor.advisorID.pt_BR.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0002-4528-9878
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9579151361576173
dc.contributor.referees1.none.fl_str_mv Macedo Filho, Antônio de
dc.contributor.referees2.none.fl_str_mv Anselmo, Dory Helio Aires de Lima
dc.contributor.referees2ID.pt_BR.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0003-0180-9189
dc.contributor.referees2Lattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0554474279738500
dc.contributor.referees3.none.fl_str_mv Albuquerque, Eudenilson Lins de
dc.contributor.referees3ID.pt_BR.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0002-1022-1048
dc.contributor.referees3Lattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3594651355252245
dc.contributor.referees4.none.fl_str_mv Silva, Luciano Rodrigues da
dc.contributor.referees4ID.pt_BR.fl_str_mv https://orcid.org/0000-0002-6875-1965
dc.contributor.referees4Lattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/5182830756789229
dc.contributor.referees5.none.fl_str_mv Lyra, Marcelo Leite
dc.contributor.author.fl_str_mv Araújo, Roniel de Lima
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Barboza, Carlos Antônio
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6129886378495626
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Fulco, Umberto Laino
contributor_str_mv Barboza, Carlos Antônio
Fulco, Umberto Laino
dc.subject.por.fl_str_mv Física
DFT
Neurotransmissores
Levodopa
Biofísica
Propriedades ópticas e eletrônicas
Termodinâmica
topic Física
DFT
Neurotransmissores
Levodopa
Biofísica
Propriedades ópticas e eletrônicas
Termodinâmica
description Neste trabalho, apresentaremos um estudo das propriedades estruturais, eletrˆonicas, ´opticas, vibracionais e termodinˆamicas dos cristais de dopamina, l-dopa, noradrenalina e adrenalina, atrav´es de simula¸c˜oes computacionais no formalismo DFT (Density Functional Theory), onde foi usado a aproxima¸c˜ao do gradiente generalizado (GGA-PBE) e o funcional h´ıbrido HSE06. A partir dos dados experimentais das quatro estruturas cristalinas foram realizados a otimiza¸c˜ao da geometria cristalina, c´alculo da densidade de estados e estrutura de bandas, absor¸c˜ao ´optica, fun¸c˜ao diel´etrica, ´ındice de refra¸c˜ao, condutividade ´optica, refletividade, fun¸c˜ao perda, espectro infravermelho e Raman e tamb´em temperatura de Debye, entalpia, energia livre, T*entropia e capacidade t´ermica. Os novos parˆametros de rede encontrados apresentaram uma boa concordˆancia com os valores experimentais. Atrav´es do funcional GGA-PBE (HSE06), encontramos que: a dopamina apresenta um band gap indireto E = 3, 8 eV (4,70 eV), para noradrenalina obtivemos um band gap indireto E = 3, 48 eV (4,40 eV), para adrenalina foi encontrado um band gap indireto E = 3, 53 eV (4,60 eV) e um band gap direto E = 3, 09 eV (3,60 eV) foi obtido para o cristal da l-dopa. A an´alise das densidades de estados eletrˆonicos permitiu identificar as contribui¸c˜oes por ´atomo para os estados das bandas de valˆencia e de condu¸c˜ao. Nas propriedades ´opticas ´e poss´ıvel observar uma absor¸c˜ao da luz na regi˜ao ultravioleta, e uma maior sensibilidade na absor¸c˜ao da radia¸c˜ao polarizada na dire¸c˜ao 100, para a dopamina, noradrenalina e l-dopa, enquanto que a adrenalina apresenta uma maior absor¸c˜ao da luz polarizada com a dire¸c˜ao de polariza¸c˜ao 001. Os espectros IR e Raman foram calculados e os modos de vibra¸c˜ao analisados. A capacidade t´ermica em temperatura ambiente encontrada foi: 210.01 cal/cell.K, 121 cal/cell.K, 182 cal/cell.K e 103 cal/cell.K, para dopamina, l-dopa, noradrenalina e adrenalina, respectivamente.
publishDate 2022
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-05-19T22:20:28Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-05-19T22:20:28Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2022-02-18
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv ARAÚJO, Roniel de Lima. Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores. 2022. 106f. Tese (Doutorado em Física) - Centro de Ciências Exatas e da Terra, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2022.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/47229
identifier_str_mv ARAÚJO, Roniel de Lima. Estudo das propriedades óptico-eletrônicas de neurotransmissores. 2022. 106f. Tese (Doutorado em Física) - Centro de Ciências Exatas e da Terra, Universidade Federal do Rio Grande do Norte, Natal, 2022.
url https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/47229
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio Grande do Norte
dc.publisher.program.fl_str_mv PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM FÍSICA
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRN
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal do Rio Grande do Norte
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRN
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron:UFRN
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
instacron_str UFRN
institution UFRN
reponame_str Repositório Institucional da UFRN
collection Repositório Institucional da UFRN
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufrn.br/bitstream/123456789/47229/1/Estudopropriedadesopticoeletronicas_Araujo_2022.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 906b501a94608cca2d14bfb52e9a8cfd
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRN - Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1814833017665880064