Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Holmström, Thérèsse Camille Nascimento
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRRJ
Texto Completo: https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/17637
Resumo: Ao longo das últimas décadas, múltiplos fatores como o estreitamento da relação entre humanos e animais de estimação, as mudanças ambientais decorrentes da urbanização de áreas periurbanas e rurais, a significativa intensificação da produção animal, acarretaram uma significativa mudança na dinâmica homem-animal com consequente aumento da circulação de patógenos bacterianos entre humanos e animais e a emergência e reemergência de doenças. A identificação de bactérias emergentes na rotina do diagnóstico veterinário tem se apresentado como um grande desafio, uma vez que, geralmente, estes patógenos não possuem estudos de referência a partir das amostras oriundas do ambiente animal, e por vezes, metodologias desenvolvidas para amostras de origem humana não se mostram efetivas para sua identificação. Outro aspecto associado a tal emergência é a circulação de genes de resistência apontando para a importância de caracterizar a resistência antimicrobiana de espécies bacterianas oriundas de diferentes ambientes animais. Neste trabalho foram caracterizadas espécies bacterianas e seu respectivo perfil de resistência oriundas de animais silvestres, produção avícola e amostras laboratoriais clínicas de diferentes espécies. Amostras oriundas de diferentes espécies de animais selvagens, como maritacas, jabutis, cachorro do mato e mão pelada, forneceram 103 cepas da família Enterobacterales, 28 Staphylococcus spp., 2 Streptococcus spp. e 1 Enterococcus spp. Uma cepa de Pantoea dispersa isolada de maritaca foi detectada albergando o gene de resistência à colistina mcr-9. A partir das amostras de jabuti, foram detectadas 2 amostras apresentando o gene de resistência blaTEM, 1 apresentou o gene blaCTX e 1 apresentou ambos os genes. Dentre as amostras da produção avícola os isolados de Enteobacterales revelaram 45,45% (20/44) de cepas produtoras de ESBL, sendo 35% (9/20) blaSHV, 20% (4/20) blaCTX-M, 15% (3/20) blaTEM, 10% (2/20) apresentando os genes blaSHV e blaCTX, e 10% (2/20) apresentando blaSHV e blaTEM, simultaneamente. Dentre as 51 cepas de Enterococcus spp, 1 cepa de E. faecium oriunda de cloaca de pinto foi identificado o gene vanB e em 1 cepa de E. faecalis de frango adulto foram identificados vanA e vanB, simultaneamente. Destas mesmas 51 cepas 23,53% (12/51) apresentaram resistência a estreptomicina. Dentre as 25 cepas de Staphylococcus spp. foi detectado 1 isolado com o gene mecA. A cama de maravalha utilizada pelos animais da avicultura também foi avaliada e foi detectado 1 amostra positiva para o gene blaVIM. As 35 cepas de Acinetobacter spp. foram identificadas por análise proteômica, genotípica e sequenciamento. Para avaliar a diferença entre as técnicas foi utilizado o teste de Kappa entre MALDI-TOF e PCR, MALDI-TOF e rpoB, PCR e rpoB, e entre as três técnicas. O perfil de resistência dessas amostras também foi avaliado, sendo 54,28% (19/35) classificadas como MDR, 51,42% (18/35) apresentaram 1 ou mais genes de ESBL, sendo 4 cepas com gene blaCTX, 1 cepa com blaSHV, 9 cepas com blaTEM, 3 cepas com blaCTX e blaTEM e 1 cepa com blaSHV e blaTEM. O presente trabalho buscou identificar bactérias e detectar genes de resistência em diferentes ambientes veterinários. Este é um grande desafio principalmente porque há poucos trabalhos e ausência de padrões de análise fenotípica sobre isolados de origem animal. O papel do animal silvestre, de produção ou de companhia tem relevante participação na disseminação de genes de resistência no ambiente, enfatizando a Saúde Única e gerando um alerta quanto ao foco de novos estudos para entender e avaliar ambientes veterinários.
id UFRRJ-1_215d1744da3578651b0e15ef9368f741
oai_identifier_str oai:rima.ufrrj.br:20.500.14407/17637
network_acronym_str UFRRJ-1
network_name_str Repositório Institucional da UFRRJ
repository_id_str
spelling Holmström, Thérèsse Camille NascimentoSouza, Miliane Moreira Soares dehttp://lattes.cnpq.br/0865211214618618Coelho, Irene da Silvahttp://lattes.cnpq.br/2191695584157582Melo, Dayanne Araujo dehttp://lattes.cnpq.br/1205965922491865Soares, Lidiane de Castrohttp://lattes.cnpq.br/7426431710199990Souza, Miliane Moreira Soares dehttp://lattes.cnpq.br/0865211214618618Maboni, Grazielihttp://lattes.cnpq.br/9416154230640250Anzai, Eleine Kurokihttp://lattes.cnpq.br/6430630810174173Souza, Cláudio Marcos Rocha dehttp://lattes.cnpq.br/7903354651687538http://lattes.cnpq.br/82220638918346622024-07-17T14:57:52Z2024-07-17T14:57:52Z2022-03-22HOLMSTRÖM, Thérèsse Camille Nascimento. Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única. 2022. 109 f. Tese (Doutorado em Ciências Veterinárias) - Instituto de Veterinária, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, 2022.https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/17637Ao longo das últimas décadas, múltiplos fatores como o estreitamento da relação entre humanos e animais de estimação, as mudanças ambientais decorrentes da urbanização de áreas periurbanas e rurais, a significativa intensificação da produção animal, acarretaram uma significativa mudança na dinâmica homem-animal com consequente aumento da circulação de patógenos bacterianos entre humanos e animais e a emergência e reemergência de doenças. A identificação de bactérias emergentes na rotina do diagnóstico veterinário tem se apresentado como um grande desafio, uma vez que, geralmente, estes patógenos não possuem estudos de referência a partir das amostras oriundas do ambiente animal, e por vezes, metodologias desenvolvidas para amostras de origem humana não se mostram efetivas para sua identificação. Outro aspecto associado a tal emergência é a circulação de genes de resistência apontando para a importância de caracterizar a resistência antimicrobiana de espécies bacterianas oriundas de diferentes ambientes animais. Neste trabalho foram caracterizadas espécies bacterianas e seu respectivo perfil de resistência oriundas de animais silvestres, produção avícola e amostras laboratoriais clínicas de diferentes espécies. Amostras oriundas de diferentes espécies de animais selvagens, como maritacas, jabutis, cachorro do mato e mão pelada, forneceram 103 cepas da família Enterobacterales, 28 Staphylococcus spp., 2 Streptococcus spp. e 1 Enterococcus spp. Uma cepa de Pantoea dispersa isolada de maritaca foi detectada albergando o gene de resistência à colistina mcr-9. A partir das amostras de jabuti, foram detectadas 2 amostras apresentando o gene de resistência blaTEM, 1 apresentou o gene blaCTX e 1 apresentou ambos os genes. Dentre as amostras da produção avícola os isolados de Enteobacterales revelaram 45,45% (20/44) de cepas produtoras de ESBL, sendo 35% (9/20) blaSHV, 20% (4/20) blaCTX-M, 15% (3/20) blaTEM, 10% (2/20) apresentando os genes blaSHV e blaCTX, e 10% (2/20) apresentando blaSHV e blaTEM, simultaneamente. Dentre as 51 cepas de Enterococcus spp, 1 cepa de E. faecium oriunda de cloaca de pinto foi identificado o gene vanB e em 1 cepa de E. faecalis de frango adulto foram identificados vanA e vanB, simultaneamente. Destas mesmas 51 cepas 23,53% (12/51) apresentaram resistência a estreptomicina. Dentre as 25 cepas de Staphylococcus spp. foi detectado 1 isolado com o gene mecA. A cama de maravalha utilizada pelos animais da avicultura também foi avaliada e foi detectado 1 amostra positiva para o gene blaVIM. As 35 cepas de Acinetobacter spp. foram identificadas por análise proteômica, genotípica e sequenciamento. Para avaliar a diferença entre as técnicas foi utilizado o teste de Kappa entre MALDI-TOF e PCR, MALDI-TOF e rpoB, PCR e rpoB, e entre as três técnicas. O perfil de resistência dessas amostras também foi avaliado, sendo 54,28% (19/35) classificadas como MDR, 51,42% (18/35) apresentaram 1 ou mais genes de ESBL, sendo 4 cepas com gene blaCTX, 1 cepa com blaSHV, 9 cepas com blaTEM, 3 cepas com blaCTX e blaTEM e 1 cepa com blaSHV e blaTEM. O presente trabalho buscou identificar bactérias e detectar genes de resistência em diferentes ambientes veterinários. Este é um grande desafio principalmente porque há poucos trabalhos e ausência de padrões de análise fenotípica sobre isolados de origem animal. O papel do animal silvestre, de produção ou de companhia tem relevante participação na disseminação de genes de resistência no ambiente, enfatizando a Saúde Única e gerando um alerta quanto ao foco de novos estudos para entender e avaliar ambientes veterinários.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESOver the last decades, multiple factors such as the strengthening of the relationship between humans and pets, environmental changes resulting from the urbanization of peri-urban and rural areas, the significant intensification of animal production have led to a significant change in the human-animal dynamics with consequently increased circulation of bacterial pathogens between humans and animals and the emergence and re-emergence of diseases. Identifying emerging bacteria in the routine of veterinary diagnosis has been presented as a great challenge. Generally, these pathogens do not have reference studies from samples from the animal environment, and sometimes methodologies developed for samples of human origin are not effective for its identification. Another aspect associated with this emergence is the circulation of resistance genes, pointing to the importance of characterizing the antimicrobial resistance of bacterial species from different animal environments. This work characterized bacterial species and their respective resistance profile from wild animals, poultry production, and clinical laboratory samples of different species. Samples from different wild animal species, such as maritacas, jabutism, cachorro do mato and mão pelada, provided 103 isolates of the Enterobacterales family, 28 Staphylococcus spp, 2 Streptococcus spp and 1 Enterococcus spp. A strain of Pantoea dispersa isolated from maritaca was detected harboring the colistin resistance gene mcr-9. From the tortoise samples, 2 samples were detected presenting the blaTEM resistance gene, 1 presented the blaCTX gene and 1 presented both genes. Among the samples of poultry production, Enteobacterales strains revealed 45.45% (20/44) of ESBL-producing strains, with 35% (9/20) blaSHV, 20% (4/20) blaCTX-M, 15% (3/20) blaTEM, 10% (2/20) showing the blaSHV and blaCTX genes, and 10% (2/20) showing blaSHV and blaTEM, simultaneously. Among the 51 strains of Enterococcus spp (51 strains), 1 strain of E. faecium from chick cloaca was identified with the vanB gene and in 1 strain of E. faecalis from adult chicken, vanA and vanB were identified simultaneously. Of these same 51 strains, 23.53% (12/51) showed resistance to streptomycin. Among the 25 strains of Staphylococcus spp. 1 isolate with the mecA gene was detected. The poultry litter was also evaluated and 01 positive sample for the blaVIM gene was detected. The 35 strains of Acinetobacter spp. were identified by proteomic, genotypic and sequencing analysis, to assess the difference between the techniques, the Kappa test was used to compare MALDI-TOF and PCR, MALDI-TOF and rpoB, PCR and rpoB, and between the three techniques. The resistance profile of these samples was also evaluated, with 54.28% (19/35) classified as MDR, 51.42% (18/35) had 01 or more ESBL genes, with 04 strains with the blaCTX gene, 01 strain with blaSHV, 09 strains with blaTEM, 03 strains with blaCTX and blaTEM and 01 strain with blaSHV and blaTEM. The present work sought to identify bacteria and detect resistance genes in different veterinary environments. This is a big challenge mainly because there are still few works and phenotypic analysis standards on animal themes. The role of wild, production, or companion animal has great participation in disseminating resistance gene in the environment, emphasizing One Health and generating an alert as to the focus of new studies to understand and evaluate veterinary environments.porUniversidade Federal Rural do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Ciências VeterináriasUFRRJBrasilInstituto de VeterináriaMedicina Veterináriagenes de resistênciapatógenos bacterianosSaúde Únicabacterial pathogensresistance genesOne HealthDesafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde únicainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisAARESTRUP, Frank Moller et al. Glycopeptide susceptibility among Danish Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis isolates of animal and human origin and PCR identification of genes within the VanA cluster. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 40, n. 8, p. 1938-1940, 1996. ADZITEY, Frederick; HUDA, Nurul; ALI, Gulam Rusul Rahmat. Molecular techniques for detecting and typing of bacteria, advantages and application to foodborne pathogens isolated from ducks. 3 Biotech, v. 3, n. 2, p. 97-107, 2013. Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA) - Nota Técnica no 1/2013. Medidas para identificação, prevenção e controle de infecções relacionadas à assistência à saúde por microrganismos multirresistentes. Brasília, DF, 2013 AGHAPOUR, Zahra et al. Molecular mechanisms related to colistin resistance in Enterobacteriaceae. Infection and drug resistance, v. 12, p. 965, 2019. AGHAPOUR, Zahra et al. Genes involved in colistin resistance of gram-negative isolates in the northwest of Iran. Gene Reports, v. 14, p. 81-86, 2019. AHMED, Mohamed O.; BAPTISTE, Keith E. Vancomycin-resistant enterococci: a review of antimicrobial resistance mechanisms and perspectives of human and animal health. Microbial Drug Resistance, v. 24, n. 5, p. 590-606, 2018. ALBORNOZ, Luis Antonio Llanco; NAKANO, Viviane; AVILA-CAMPOS, Mario Julio. Clostridium perfringens e a enterite necrótica em frangos: principais fatores de virulência, genéticos e moleculares. Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science, v. 51, n. 3, p. 178-193, 2014. ALEXANDRINO, Samantha Leandro de Sousa Andrade et al. Microbiota intestinal e os fatores que influenciam na avicultura. Research, Society and Development, v. 9, n. 6, p. e87963098- e87963098, 2020. ALÓS, Juan-Ignacio. Resistencia bacteriana a los antibióticos: una crisis global. Enfermedades infecciosas y microbiología clínica, v. 33, n. 10, p. 692-699, 2015. ALTMAN, D.G. (1991). Practical statistics for medical research. New York: Chapman and Hall. ALVAREZ-VEGA, Marco et al. Multidrug-resistant Acinetobacter meningitis in neurosurgical patients with intraventricular catheters: assessment of different treatments—authors’ response. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, v. 75, n. 3, p. 783-784, 2020. APOSTOLAKOS, Ilias et al. High-resolution characterisation of ESBL/pAmpC-producing Escherichia coli isolated from the broiler production pyramid. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-12, 2020. ARGUDÍN, M. Angeles et al. Genetic diversity among Staphylococcus aureus isolates showing oxacillin and/or cefoxitin resistance not linked to the presence of mec genes. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 62, n. 7, p. e00091-18, 2018. ARIAS, Mônica V. Bahr et al. Estudo da ocorrência de infecção hospitalar em cães e gatos em um centro cirúrgico veterinário universitário. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 33, p. 771- 779, 2013. ASAI, Nobuhiro et al. Pantoea dispersa bacteremia in an immunocompetent patient: a case report and review of the literature. Journal of medical case reports, v. 13, n. 1, p. 1-5, 2019. AYOUB MOUBARECK, Carole; HAMMOUDI HALAT, Dalal. Insights into Acinetobacter baumannii: a review of microbiological, virulence, and resistance traits in a threatening nosocomial pathogen. Antibiotics, v. 9, n. 3, p. 119, 2020. AZEVEDO, Alessandra Lages Oliveira et al. Perfil de susceptibilidade aos carbapenêmicos de bacilos Gram-negativos fermentadores da glicose isolados de hemoculturas. Rev. bras. anal. clin, p. 255-259, 2020. 76 BARBER, M.1961. Methicillin resistant staphylococci. J. Clin. Pathol.14:385–393BARBOSA, Nei André Arruda et al. Digestibilidade ileal de frangos de corte alimentados com dietas suplementadas com enzimas exógenas. Comunicata Scientiae, v. 5, n. 4, p. 361-369, 2014. BARON, Sophie et al. Molecular mechanisms of polymyxin resistance: knowns and unknowns. International journal of antimicrobial agents, v. 48, n. 6, p. 583-591, 2016. BEZERRA, W. G. A. et al. Antibióticos no setor avícola: uma revisão sobre a resistência microbiana. Archivos de zootecnia, v. 66, n. 254, p. 301-307, 2017. BRESSLAU, Suzana; COORDENADORA, C. P. R. A. Plano de Ação Nacional para Prevenção e Controle da Resistência aos Antimicrobianos. 2017. BORDIER, Marion et al. Characteristics of one health surveillance systems: a systematic literature review. Preventive veterinary medicine, v. 181, p. 104560, 2020. BOROWIAK, Maria et al. Development of a novel mcr-6 to mcr-9 multiplex PCR and assessment of mcr-1 to mcr-9 occurrence in colistin-resistant Salmonella enterica isolates from environment, feed, animals and food (2011–2018) in Germany. Frontiers in microbiology, v. 11, p. 80, 2020. BRASIL. Ministério do Meio Ambiente. Biomas. 2022. Disponível em: https://antigo.mma.gov.br/biomas.html#:~:text=O%20Brasil%20%C3%A9%20formado%20p or,de%20vegeta%C3%A7%C3%A3o%20e%20de%20fauna. Acesso em: janeiro de 2022 BRASIL, Ministério da Pecuário, Agricultura e Abastecimento. Exportações do agronegócio batem recorde para setembro, com US$ 10,1 bilhões. 2021 Disponível em: https://www.gov.br/pt-br/noticias/agricultura-e-pecuaria/2021/10/exportacoes-do- agronegocio-batem-recorde-para-setembro-com-us-10-1-bilhoes Acesso em: novembro de 2021 BRASIL, Ministério da Pecuário, Agricultura e Abastecimento. IN 45 de 22 de outubro de 2016. Proibir, em todo o território nacional, a importação e a fabricação da substância antimicrobiana sulfato de colistina, com a finalidade de aditivo zootécnico melhorador de desempenho na alimentação animal, na forma desta Instrução Normativa. Disponível em: https://www.in.gov.br/materia/-/asset_publisher/Kujrw0TZC2Mb/content/id/22078290/do1- 2016-11-30-instrucao-normativa-n-45-de-22-de-novembro-de-2016-22078259 Acesso em: 22 de outubro de 2021 BRASIL, Ministério da Pecuário, Agricultura e Abastecimento. Portaria número 171, de 13 de dezembro de 2018 Disponível em: http://www.in.gov.br/materia//asset_publisher/Kujrw0TZC2Mb/content/id/55878469/do12011 219-portaria-n-171-de-13-de-dezembro-de-2018-55878239 Acesso em: 22 de outubro de 2021 BUSH K, JACOBY GA, MEDEIROS AA. A functional classification scheme for β-lactamases and its correlation with molecular structure. Antimicrob Agents Chemother 1995; 39: 1211- 33 BUSS, Paulo M. et al. Cadernos CRIS-Fiocruz: Saúde Global e Diplomacia da Saúde-Informe 17-Setembro/Outubro-2021. 2021. BUYUKCANGAZ, ESRA et al Molecular typing os Staphylococcus aureus and methicillin- resistant S. aureus (MRSA) isolated from animals and retail meat in North Dakota, United States. Foodborne pathogens and disease, v.10, n.7, p.608-617. 2013 CALISTRI, P. et al. The components of ‘one world–one health’approach. Transboundary and emerging diseases, v. 60, p. 4-13, 2013. CARROLL, Laura M. et al. Identification of novel mobilized colistin resistance gene mcr-9 in a multidrug-resistant, colistin-susceptible Salmonella enterica serotype Typhimurium isolate. MBio, v. 10, n. 3, p. e00853-19, 2019. CELI, P.; VERLHAC, V.; PÉREZ C. E.; SCHMEISSER, J.&KLUENTER, A. M. 2019. Biomarcadores da funcionalidade gastrointestinal na nutrição e saúde animal. Rev. Ciência e 77 Tecnologia de Ração Animal. 250:9-31. doi: https://doi.org/10.1016/j.anifeedsci.2018.07.012. Acesso em: 09 de janeiro de 2022 CEPEA. Centro de Economia Aplicada em Estudos Aplicado. PIB do Agronegócio Brasileiro. 2021. Disponível EM: https://www.cepea.esalq.usp.br/br/pib-do-agronegocio-brasileiro.aspx Acesso em:| novembro de 2021 CERON, K., CARVALHO, P. S., MÖCKLINGHOFF, L., & SANTANA, D. J Diurnal feeding behaviour of crab-eating raccoon upon a paradoxal frog, with a review of its diet. Acta Biológica Colombiana, v. 25, n. 2, p. 359-367, 2020. CHEN, TE-LI, LEE, YI-TZU, KUO, SHU-CHEN, YANG, SU-PEN, FUNG, CHANG- PHONE, LEE SHOU-DONG. Rapid identification of Acinetobacter baumannii, Acinetobacter nosocomialis and Acinetobacter pittii with a multiplex PCR assay. Journal of Medical Microbiology, 63, 1154–1159 DOI 10.1099/jmm.0.071712-0, 2014. CHEN, Lu et al. Comparison of clinical manifestations and antibiotic resistances among three genospecies of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex. PloS one, v. 13, n. 2, p. e0191748, 2018. CHERAZARD, Regine et al. Antimicrobial resistant Streptococcus pneumoniae: prevalence, mechanisms, and clinical implications. American journal of therapeutics, v. 24, n. 3, p. e361- e369, 2017. CLARK, N. C., COOKSEY, R. C., HILL, B. C., SWENSON, J. M., & TENOVER, F. C Characterization of glycopeptide-resistant enterococci from US hospitals. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 37, n. 11, p. 2311-2317, 1993. COLLIGNON, Peter J.; MCEWEN, Scott A. One health—its importance in helping to better control antimicrobial resistance. Tropical medicine and infectious disease, v. 4, n. 1, p. 22, 2019 CORMICAN, Martin G.; MARSHALL, Steven A.; JONES, Ronald N. Detection of extended- spectrum β-lactamase (ESBL)-producing strains by the Etest ESBL screen. Journal of Clinical Microbiology, v. 34, n. 8, p. 1880-1884, 1996. COSGAYA C, MAR ́I-ALMIRALL M, VAN ASSCHE A et al. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus– Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66(10), 4105–4111 (2016). CHRISTOFOLI, Marcela et al. Microbiota intestinal benéfica e prejudicial na avicultura: Revisão. Research, Society and Development, v. 9, n. 7, p. e43973667-e43973667, 2020. CUNHA, M.P.V. et al. Caracterização de APEC (avian pathogenic Escherichia coli) multivirulentas e multirresistentes. Revista de Educação Continuada em Medicina Veterinária e Zootecnica do CRMV-SP, v. 13, n.12. 2015. DAME-KOREVAAR, Anita et al. Transmission routes of ESBL/pAmpC producing bacteria in the broiler production pyramid, a literature review. Preventive veterinary medicine, v. 162, p. 136-150, 2019. DA SILVA DAVID, Maria Tereza Santos. O impacto do uso indiscriminado de antibióticos na pandemia do COVID-19. PANDEMIA: Caminhos para Aprendizagem [S. l.]: Pedro & João Editores, p. 165, 2021.) DA SILVEIRA ROSINA, Laís et al. OCORRÊNCIA DE Salmonella sp. NA CLOACA DE RÉPTEIS DE COMPANHIA. Revista de Medicina Veterinária do UNIFESO, v. 1, n. 01, 2021. DA SILVA, Elidiomar Ribeiro; COELHO, Luci Boa Nova. Sobre incursões da fauna silvestre a áreas urbanas durante a pandemia do novo coronavírus. Revista A Bruxa, v. 4, n. 2, p. 1-13, 2020. 78 DA SILVA, Raphael Paiva Paschoal; MANÇANO, Stella Maria Casas Novas; PICÃO, Renata Cristina. Cronologia da emergência global de carbapenemases em bacilos gram-negativos. Revista Saber Digital, v. 10, n. 2, p. 43-61, 2018. DA SILVA, Gabriela Jorge. Resistência à colistina e sua disseminação: implicações em saúde pública. Revista Portuguesa de Farmacoterapia, v. 10, n. 1, p. 47-52, 2018. DA SILVA MC, DE SOUSA RM, PADILHA KG. Patient destination after discharge from intensive care units: wards or intermediate care units? Rev Lat Am Enfermagem. 2010 DE ANDRADE FRANCO, Marcos Bevilacqua; DE ANDRADE FRANCO, Jose Luiz; CUNHA, Andre A. Ecoturismo, Conservação da Natureza e Deep Ecology: uma Reflexão sobre o Turismo como Experiência de Ampliação da Consciência. Environmental Science, v. 10, n. 2, 2021. DE CARVALHO, Juliana Jeanne Vieira et al. Bactérias multirresistentes e seus impactos na saúde pública: Uma responsabilidade social. Research, Society and Development, v. 10, n. 6, p. e58810616303-e58810616303, 2021. DE FREITAS, Maria Helena Dantas; RODRIGUES, Márcio Nogueira. Osteomielite no membro pélvico de felino secundária à infecção bacteriana: Relato de caso. PUBVET, v. 14, p. 163, 2019. DE MAGALHAES, Walkyria Biondi Lopes; CORDEIRO, Lara Celeste; COUTO, João Pedro Piccolo. ANTROPOMORFIZAÇÃO DOS ANIMAIS NAS REDES SOCIAIS E O TRÁFICO DE ANIMAIS SILVESTRES. Revista Multidisciplinar de Educação e Meio Ambiente, v. 2, n. 3, p. 50-50, 2021. DE MELO, Dayanne A. et al. Accuracy of PCR universal primer for methicillin-resistant Staphylococcus and comparison of different phenotypic screening assays. Brazilian Journal of Microbiology, v. 51, n. 1, p. 403-407, 2020. DE OLIVEIRA FEITOSA, THIAGO JORDÃO C. E., DE SOUZA, R. G., LIMA, C. D. S., DE CARVALHO GURGEL, A., DE OLIVEIRA, L. L. G., ... & MINAFRA, C. S. Microbiota intestinal das aves de produção: revisão bibliográfica. Research, Society and Development, v. 9, n. 5, p. e42952779-e42952779, 2020. DE SANT’ANA, Carlos ER et al. Análise Microbiológica em Aves Silvestres: Patógenos Virais e Bacterianos. Revista Processos Químicos, v. 6, n. 12, p. 74-79, 2012. DEVRIESE, L. A.; VAN DAMME, L. R.; FAMEREE, L. Methicillin (cloxacillin)‐resistant Staphylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis cases. Zentralblatt für Veterinärmedizin Reihe B, v. 19, n. 7, p. 598-605, 1972. DIALLO, Ousmane Oumou et al. Antibiotic resistance surveillance systems: A review. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2020. DICKINSON, Vanessa M. et al. Nasal and cloacal bacteria in free-ranging desert tortoises from the western United States. Journal of Wildlife Diseases, v. 37, n. 2, p. 252-257, 2001. DOS SANTOS, Márcia Alves; DE PAIVA, Isabel Cristina; DA SILVA ANDRADE, Erci Gaspar. Enterococcus resistente a vancomicina (vre): perfil geral. Revista JRG de Estudos Acadêmicos, v. 4, n. 8, p. 127-139, 2021. D'SOUZA, Roshan et al. Phenotypic and genotypic characterization of Acinetobacter spp. panel strains: a cornerstone to facilitate antimicrobial development. Frontiers in microbiology, v. 10, p. 559, 2019. DUNLAP, Christopher A.; ROONEY, Alejandro P. Acinetobacter dijkshoorniae is a later heterotypic synonym of Acinetobacter lactucae. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 68, n. 1, p. 131-132, 2018 DURMAZ, Riza et al. The optimization of a rapid pulsed-field gel electrophoresis protocol for the typing of Acinetobacter baumannii, Escherichia coli and Klebsiella spp. Jpn J Infect Dis, v. 62, n. 5, p. 372-7, 2009. 79 ELLIFF, C. 2020. O que o COVID-19 pode nos ensinar sobre conservação ambiental. [online]. Disponível em: www.batepapocomnetuno.com. Acesso em: 23 de março de 2020. EMBRAPA. Empresa Brasileira de Pesquisa em Agropecuária. Estatíticas. 2021 Disponível em: https://www.embrapa.br/suinos-e-aves/cias/ Acesso em: novembro de 2021 EWERS, Christa et al. OXA-23 and ISAba1–OXA-66 class D β-lactamases in Acinetobacter baumannii isolates from companion animals. International journal of antimicrobial agents, v. 49, n. 1, p. 37-44, 2017. EWERS, Christa; JANßEN, Traute; WIELER, Lothar H. Avian pathogenic Escherichia coli (APEC). Berliner und Munchener tierarztliche Wochenschrift, v. 116, n. 9-10, p. 381-395, 2003. FALLAH, Fatemeh et al. Prevalence of blaNDM, blaPER, blaVEB, blaIMP, and blaVIM genes among Acinetobacter baumannii isolated from two hospitals of Tehran, Iran. Scientifica, v. 2014, 2014. FERNÁNDEZ-CUENCA, Felipe et al. Attenuated virulence of a slow-growing pandrug- resistant Acinetobacter baumannii is associated with decreased expression of genes encoding the porins CarO and OprD-like. International journal of antimicrobial agents, v. 38, n. 6, p. 548-549, 2011. FERNANDES, Raimunda Thyciana Vasconcelos et al. Aditivos fitogenicos na alimentacao de frangos de corte: óleos essenciais e especiarias. PubVet, v. 9, p. 502-557, 2015. FERNANDES, J. C. T.; CARDOSO, M. R. I. Mamite ovina causada por Staphylococcus aureus. Primeira observação no Brasil. Arquivos da Faculdade de Veterinária da UFRGS, v. 13, p. 71-74, 1985 FLEISS, Joseph L.; LEVIN, Bruce; PAIK, Myunghee Cho. Statistical methods for rates and proportions. john wiley & sons, 2013. FLEMING, A. On the anticiotical action os culture os a penicillium, with special reference to their use in the isolation of B. influenzae. British Journal of experimental pathology, v.10, n.3, p.226. 1929 FOXMAN, Betsy et al. Choosing an appropriate bacterial typing technique for epidemiologic studies. Epidemiologic perspectives & innovations, v. 2, n. 1, p. 1-8, 2005. FRANTZ, Laurent AF et al. Animal domestication in the era jhhnof ancient genomics. Nature Reviews Genetics, v. 21, n. 8, p. 449-460, 2020. GAGGINI, Thais Schwarz et al. Endocardite vegetativa em leitões causada por streptococcus suis sorotipo 9. Veterinária e Zootecnia, v. 25, n. 1, p. 94-98, 2018. GALLAGHER, Peter; BAKER, Stephen. Developing new therapeutic approaches for treating infections caused by multi-drug resistant Acinetobacter baumannii: Acinetobacter baumannii therapeutics. Journal of Infection, v. 81, n. 6, p. 857-861, 2020. GALOSI, Livio et al. Health assessment of wild speckled dwarf tortoises, CHERSOBIUS SIGNATUS. BMC veterinary research, v. 17, n. 1, p. 1-11, 2021. GARCIA, Jessica et al. Prevalence and predictors of bacteremia in dairy calves with diarrhea. Journal of Dairy Science, 2021. GARCIA, Danitiele Almas; GOMES, Deriane Elias. A avicultura brasileira e os avanços nutricionais. Revista Científica, v. 1, n. 1, 2019. GAY, Kathryn et al. Plasmid-mediated quinolone resistance in non-Typhi serotypes of Salmonella enterica. Clinical Infectious Diseases, v. 43, n. 3, p. 297-304, 2006. GESER, N.; STEPHAN, R.; KORCZAK, B.M.; BEUTIN, L.; HÄCHLERA, H. Molecular Identification of Extended-Spectrum-β-Lactamase Genes from Enterobacteriaceae Isolated from Healthy Human Carriers in Switzerland. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 56, n. 3, p. 1609–1612, 2012. 80 GHAIMA, K. K. Distribution of extended spectrum β-lactamase ( ESBL ) genes 71 among Acinetobacter baumannii isolated from burn infections. MOJ Cell Sci Rep, v. 5, n. 2, p. 42– 46, 2018. GHOSH, Antara et al. Abatement of arsenic-induced phytotoxic effects in rice seedlings by an arsenic-resistant Pantoea dispersa strain. Environmental Science and Pollution Research , v. 28, n. 17, p. 21633-21649, 2021. GOERING, Richard V. Pulsed field gel electrophoresis: a review of application and interpretation in the molecular epidemiology of infectious disease. Infection, Genetics and Evolution, v. 10, n. 7, p. 866-875, 2010. GOŁAWSKA, Olga et al. Complex bacterial flora of imported pet tortoises deceased during quarantine: Another zoonotic threat?. Comparative immunology, microbiology and infectious diseases, v. 65, p. 154-159, 2019. GOMES, Camila Moreira Barreto et al. Determinação de enterobactérias de mamíferos silvestres em criadouro conservacionista. Revista de Biologia e Ciências da Terra, v. 11, n. 2, p. 74-80, 2011. GUO, San Jun; SHAN, R. E. N.; XIE, Yong En. Evaluation of the protective efficacy of a fused OmpK/Omp22 protein vaccine candidate against Acinetobacter baumannii infection in mice. Biomedical and environment al sciences, v. 31, n. 2, p. 155-158, 2018 HAAG, Andreas F.; FITZGERALD, J. Ross; PENADÉS, José R. Staphylococcus aureus in Animals. Microbiology Spectrum, v. 7, n. 3, p. 7.3. 11, 2019. HAENNI, Marisa; LUPO, Agnese; MADEC, Jean-Yves. Antimicrobial resistance in Streptococcus spp. Microbiology spectrum, v. 6, n. 2, p. 6.2. 09, 2018. HAMOUDA, Ahmed et al. Epidemiology of Acinetobacter baumannii of animal origin. International journal of antimicrobial agents, v. 38, n. 4, p. 314-318, 2011. HARKINS, C.P., PICHON, B., DOUMITH, M. et al. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus emerged long before the introduction of methicillin into clinical practice. Genome Biol 18, 130 2017 HASANI, Alka et al. Expression of Efflux Pumps, Porins and Genotypic Insight Into the Carbapenem Resistance in Acinetobacter Baumannii. 2021. HEUER, Holger et al. Accumulation of sulfonamide resistance genes in arable soils due to repeated application of manure containing sulfadiazine. Applied and Environmental Microbiology, v. 77, n. 7, p. 2527-2530, 2011. HIGGINS, Paul G. et al. Inclusion of OXA-143 primers in a multiplex polymerase chain reaction (PCR) for genes encoding prevalent OXA carbapenemases in Acinetobacter spp. International journal of antimicrobial agents, v. 35, n. 3, 2010. HOLMSTROM, Theresse et al. Methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius: an underestimated risk at pet clinic. Brazilian Journal of Veterinary Medicine, v. 42, n. 1, p. e107420-e107420, 2020. HUANG, Angela M. et al. Impact of rapid organism identification via matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight combined with antimicrobial stewardship team intervention in adult patients with bacteremia and candidemia. Clinical infectious diseases, v. 57, n. 9, p. 1237-1245, 2013. HUSSAIN, A. et al. Risk of Transmission of Antimicrobial Resistant Escherichia coli from Commercial Broiler and Free-Range Retail Chicken in India. Frontiers in Microbiology, v.8, 2017. JIMÉNEZ-GUERRA, Gemma et al. Urinary tract infection by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa: evolution of antimicrobial resistance and therapeutic alternatives. Journal of medical microbiology, v. 67, n. 6, p. 790-797, 2018. 81 IEVY, Samina et al. Molecular detection of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) for the first time in layer farms in Bangladesh and their antibiotic resistance patterns. Microorganisms, v. 8, n. 7, p. 1021, 2020. INEA. Instituto Estadual do Ambiente. Triagem e Reabilitação (CETAS e CRAS). 2022. Disponível em: http://www.inea.rj.gov.br/biodiversidade-territorio/triagem-e-reabilitacao- cetas-e-cras/ Acesso em: janeiro de 2022 INEA. Resolução INEA N° 157 de 19 de outubro de 2018. Dispõe sobre as categorias de uso e manejo da fauna silvestre, nativa e exótica em cativeiro, no território do estado do Rio de Janeiro. Disponível: http://www.inea.rj.gov.br/wp- content/uploads/2019/02/RESOLU%C3%87%C3%83O-INEA-N%C2%BA-157.pdf Acesso: janeiro de 2022. IOANNOU, Petros; MAVRIKAKI, Vasiliki; KOFTERIDIS, Diamantis P. Infective endocarditis by Acinetobacter species: A systematic review. Journal of Chemotherapy, v. 33, n. 4, p. 203-215, 2021 IOVLEVA, Alina et al. The ecology of extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) in the developed world. Journal of travel medicine, v. 24, n. suppl_1, p. S44-S51, 2017. ITO, N. M. K.; MIYAJI, C. I.; LIMA, E. A.; OKABAYASHI, S. Antimicrobianos: Usos preventivos e curativos na avicultura. In: PALERMO-NETO, J.; SPINOSA, H. S.; GÓRNIAK, S. L. Farmacologia aplicada à avicultura: boas práticas no manejo de medicamentos. São Paulo: Editora Roca, 2005. cap. 8, p. 115-147. JIANG, Lingmin et al. Potential of Pantoea dispersa as an effective biocontrol agent for black rot in sweet potato. Scientific reports, v. 9, n. 1, p. 1-13, 2019. JOHNSON, T. J.; WANNEMUEHLER, Y. M.; JOHNSON, S. J.; NOLAN, L. K. Complete DNA Sequence, Comparative Genomics, and Prevalence of an IncHI2 Plasmid Occurring among Extraintestinal Pathogenic Escherichia coliIsolates. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 50, n. 11,p. 3929–3933,2006. JOHNSON, T. J.; WANNEMUEHLER, Y.; DOETKOTT, C.; JOHNSON, S. J.; ROSEN- BERGER, S. C.; NOLAN, L. K. Identification of Minimal Predictors of Avian Pathogenic Escherichia coli Virulence for Use as a Rapid Diagnostic Tool. Journal of clinical microbiology, v. 46, n. 12, p. 3987-3996,2008. JOHNSON, J. R &STELL, A. L. Extended virulence genotypes of Escherichia coli 9 strains from patients with urosepsis in relation to phylogeny and host compromise. J. Infect. Dis. v. 181, p. 261-272. 2000 JUNQUEIRA, Otto Mack et al. Uso de aditivos em rações para suínos nas fases de creche, crescimento e terminação. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 38, p. 2394-2400, 2009. KACZOREK, E. et al. Phenotypic and genotypic antimicrobial susceptibility pattern of Streptococcus spp. isolated from cases of clinical mastitis in dairy cattle in Poland. Journal of Dairy Science, v. 100, n. 8, p. 6442-6453, 2017. KANAMORI, Hajime et al. Next-generation sequencing and comparative analysis of sequential outbreaks caused by multidrug-resistant Acinetobacter baumannii at a large academic burn center. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 60, n. 3, p. 1249-1257, 2015. KAPOOR, Garima; SAIGAL, Saurabh; ELONGAVAN, Ashok. Action and resistance mechanisms of antibiotics: A guide for clinicians. Journal of anaesthesiology, clinical pharmacology, v. 33, n. 3, p. 300, 2017. KEMPF, Isabelle; JOUY, Eric; CHAUVIN, Claire. Colistin use and colistin resistance in bacteria from animals. International journal of antimicrobial agents, v. 48, n. 6, p. 598-606, 2016. KIMURA, Yui et al. Species distribution, virulence factors and antimicrobial resistance of Acinetobacter spp. isolates from dogs and cats: a preliminary study. Microbiology and immunology, v. 62, n. 7, p. 462-466, 2018. 82 KISLAK, J. W. Susceptibility of pneumococci to nine antibiotics. Am. J. Med. Sci., v. 250, p. 261-268, 1965. KOPOTSA, Katlego; OSEI SEKYERE, John; MBELLE, Nontombi Marylucy. Plasmid evolution in carbapenemase‐producing Enterobacteriaceae: a review. Annals of the New York Academy of Sciences, v. 1457, n. 1, p. 61-91, 2019. KUZI, S. et al. Multi‐drug‐resistant Acinetobacter calcoaceticus‐Acinetobacter baumannii complex infection outbreak in dogs and cats in a veterinary hospital. Journal of Small Animal Practice, v. 57, n. 11, p. 617-625, 2016 LASCOLA, Bernard et al. Sequencing of the rpoB gene and flanking spacers for molecular identification of Acinetobacter species. Journal of clinical microbiology, v. 44, n. 3, p. 827- 832, 2006. LEE, Terence et al. Antimicrobial-resistant CC17 Enterococcus faecium: The past, the present and the future. Journal of Global Antimicrobial Resistance ,[S. l.], 2018. LEE, Chang-Ro et al. Biology of Acinetobacter baumannii: pathogenesis, antibiotic resistance mechanisms, and prospective treatment options. Frontiers in cellular and infection microbiology, v. 7, p. 55, 2017. LIM, Daniel; STRYNADKA, Natalie CJ. Structural basis for the β lactam resistance of PBP2a from methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Nature structural biology, v. 9, n. 11, p. 870-876, 2002. LIMA, Débora Costa Viegas de et al. Microbiology of rectal and otologic swabs of wild carnivores from the Zoo of the Parque Estadual de Dois Irmãos, Pernambuco, Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 32, n. 2, p. 159-164, 2012. LITAKE, G. M. et al. Phenotypic ESBL Detection in Acinetobacter baumannii: A Real Challenge. American Journal of Infectious Diseases Original, 2015. LIU, Yi-Yun et al. Emergence of plasmid-mediated colistin resistance mechanism mcr-1 in animals and human beings in China: a microbiological and molecular biological study. The Lancet infectious diseases, v. 16, n. 2, p. 161-168, 2016. LUO, Qixia; WANG, Yuan; XIAO, Yonghong. Prevalence and transmission of mobilized colistin resistance (mcr) gene in bacteria common to animals and humans. Biosafety and Health, v. 2, n. 02, p. 71-78, 2020. MABONI, Grazieli et al. Antimicrobial resistance patterns of Acinetobacter spp. of animal origin reveal high rate of multidrug resistance. Veterinary Microbiology, v. 245, p. 108702, 2020 MACKENZIE, John S.; JEGGO, Martyn. The One Health approach—Why is it so important?. Tropical Medicine and Infectious Disease, v. 4, n. 2, p. 88, 2019. MAGALHÃES, Vanda D. et al. Eletroforese em campo pulsante em bacteriologia-uma revisão técnica. Revista do Instituto Adolfo Lutz, v. 64, n. 2, p. 155-161, 2005. MAGIORAKOS, A.-P. et al. Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pandrug- resistant bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. Clinical microbiology and infection, v. 18, n. 3, p. 268-281, 2012. MAHICH, Swati et al. Acinetobacter sepsis among out-born neonates admitted to neonatal unit in pediatric emergency of a tertiary care hospital in North India. The Indian Journal of Pediatrics, v. 88, n. 2, p. 127-133, 2021. MAIORKI, Karolyna Mattes; FUKUMOTO, Nelson Massaru. Colibacilose Aviária: Revisão de Literatura. Brazilian Journal of Development, v. 7, n. 10, p. 99696-99707, 2021. MALOV, V. A.; MALEYEV, V. V. Pets in modern society: hidden threats. Terapevticheskii arkhiv, v. 90, n. 11, p. 105-111, 2018. MARTAK, Daniel et al. Comparison of pulsed-field gel electrophoresis and whole-genome- sequencing-based typing confirms the accuracy of pulsed-field gel electrophoresis for the 83 investigation of local Pseudomonas aeruginosa outbreaks. Journal of Hospital Infection, v. 105, n. 4, p. 643-647, 2020. McMULLIN, P. Produção avícola sem antibióticos: riscos potenciais de contaminação cruzada e detecção de resíduos. In: CONFERÊNCIA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2004, Santos. Anais... Santos: Facta, 2004. v. 2, p. 219-226. MENIN, Álvaro. Saúde única: uma reflexão. Encuentro de Salud Animal, v. 4, 2018. MENIN, Álvaro et al. Diagnóstico de infecção urinária em fêmeas suínas produtivas em granjas comerciais no sul do Brasil. Ciência Animal Brasileira, v. 9, n. 1, p. 197-206, 2008. MINARINI, Luciene AR et al. Prevalence of community-occurring extended spectrum β- lactamase-producing Enterobacteriaceae in Brazil. Current microbiology, v. 54, n. 5, p. 335- 341, 2007. MONTEIRO, Jussimara et al. Rapid detection of carbapenemase genes by multiplex real-time PCR. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, v. 67, n. 4, p. 906-909, 2012. MOREIRA, J. M. A. R., MENEZES, I. G., LUNA, I. S. R., NOGUEIRA, B. S., SOUSA, A. T. H. I. D., CÂNDIDO, S. L., ... & NAKAZATO, L. Vancomycin susceptibility profiles of Staphylococcus spp. isolates from domestic and wild animals. Ciência Rural, v. 50, 2020. MORENO, Gilberti et al. Resistência a drogas em enterobactérias isoladas de animais silvestres. Revista do Instituto Adolfo Lutz, v. 32, n. 1-2, p. 57-61, 1972. MUNIER, Anne-Lise et al. Incidence, risk factors and outcome of multi-drug resistant Acinetobacter baumannii nosocomial infections during an outbreak in a burn unit. International Journal of Infectious Diseases, v. 79, p. 179-184, 2019. NATIONAL RESEARCH COUNCIL. NRC. Nutrient requirements of dairy cattle. Washington, D.C.: National Academy Press, 2001. 381p. National Research Council,1984. Nutrient Requirementsof Poultry. 8th rev. ed. National Academy Press, Washington, DC NEOH, Hui-min et al. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE): A review of the “gold standard” for bacteria typing and current alternatives. Infection, Genetics and Evolution, v. 74, p. 103935, 2019. NEWSOM, S. W. B. Ogston's coccus. Journal of hospital Infection, v. 70, n. 4, p. 369-372, 2008. NOCERA, Francesca Paola; ATTILI, Anna-Rita; DE MARTINO, Luisa. Acinetobacter baumannii: Its clinical significance in Human and Veterinary Medicine. Pathogens, v. 10, n. 2, p. 127, 2021. NOWAK, Jennifer et al. High incidence of pandrug-resistant Acinetobacter baumannii isolates collected from patients with ventilator-associated pneumonia in Greece, Italy and Spain as part of the MagicBullet clinical trial. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, v. 72, n. 12, p. 3277-3282, 2017. NOVOVIĆ, Katarina et al. Acinetobacter spp. porin Omp33-36: Classification and transcriptional response to carbapenems and host cells. PloS one, v. 13, n. 8, p. e0201608, 2018 NUNES, O. C., OLIVEIRA, E. D., LABORDA, S. S., HOHLENWERGER, J. C., NETO, M. M., & FRANKE, C. R Isolamento e identificação de cepas de Salmonella spp de jabutis-piranga oriundos do tráfico de animais silvestres. Ciência Animal Brasileira, v. 11, n. 1, p. 168-173, 2010. OMT- Organização Mundial de Turismo. Disponível em: https://news.un.org/pt/story/2021/08/1761632 Acesso em: 21 de dezembro de 2021 O’NEILL, J. Antimicrobials in Agriculture and the Environment: Reducing Unnecessary Use and Waste. The Review on Antimicrobial Resistance. 2015. Disponível em: https://amr- review.org/sites/default/files/Antimicrobials%20in%20agriculture%20and%20the%20environ ment%20-%20Reducing%20unnecessary%20use%20and%20waste.pdf. Acesso em: 23 outubro de 2021. 84 ÖZDEMIR, Rahime; TUNCER, Yasin. Detection of antibiotic resistance profiles and aminoglycoside-modifying enzyme (AME) genes in high-level aminoglycoside-resistant (HLAR) enterococci isolated from raw milk and traditional cheeses in Turkey. Molecular Biology Reports, v. 47, n. 3, p. 1703-1712, 2020. PANDITRAO, Mridul; PANDITRAO, Minnu. Pantoea dispersa: is it the next emerging “monster” in our intensive care units? A case report and review of literature. Anesthesia, Essays and Researches, v. 12, n. 4, p. 963, 2018. PENESYAN, Anahit; GILLINGS, Michael; PAULSEN, Ian T. Antibiotic discovery: combatting bacterial resistance in cells and in biofilm communities. Molecules, v. 20, n. 4, p. 5286-5298, 2015. PEREIRA, David Guilherme et al. Endocardite por Staphylococcus sp. em bovino e ovino causando osteoartrite e sepse como desfechos incomuns. Acta Scientiae Veterinariae, v. 46, n. 1, p. 303, 2018. PIFFARETTI, Jean-Claude. Antibiotic resistance: the emergence of plasmid-mediated colistin resistance enhances the need of a proactive one-health approach. FEMS microbiology letters, v. 363, n. 5, 2016. PIMENTA, Ramon Loureiro et al. Characterization of Staphylococcus spp. isolates and β- lactam resistance in broiler chicken production. Brazilian Journal of Veterinary Medicine, v. 43, n. 1, p. e00720-e00720, 2021. PIMENTA GUIMARÃES, Kátia de Oliveira et al. Infecção por Acinetobacter em um cão: relato de um caso. Archives of Veterinary Science, v. 18, n. 3, 2013. PIZO, M.A. Padrões e causas de variação no tamanho de bando de psitacídeos neotropicais. In: GALETTI, M.E.; PIZO, M.A. Ecologia e conservação de psitacídeos no Brasil. Belo Horizonte, MG: Melopsittacus Publicações Científicas, p.49-62.2002 POIREL, Laurent et al. Multiplex PCR for detection of acquired carbapenemase genes. Diagnostic microbiology and infectious disease, v. 70, n. 1, p. 119-123, 2011. PREMATUNGE C, MACDOUGALL C, JOHNSTONE J, ADOMAKO K, LAM F, ROBERTSON J, et al. Resultados de Bacteremia VRE e VSE na Era da Terapia Eficaz de VRE: Uma Revisão Sistemática e Meta-análise. Epidemiol do Hospital de Controle de Infecções. V.37, n.1, p.26–35, 2016 PROCOP, Gary W. et al. Koneman's color atlas and textbook of diagnostic microbiology. 2018. PROJAHN, Michaela et al. Reviewing interventions against Enterobacteriaceae in broiler processing: using old techniques for meeting the new challenges of ESBL E. coli? BioMed research international, v. 2018, 2018. OLDER, Caitlin E. et al. Characterization of cutaneous bacterial microbiota from superficial pyoderma forms in atopic dogs. Pathogens, v. 9, n. 8, p. 638, 2020. OVERGAAUW, Paul AM et al. A one health perspective on the human–companion animal relationship with emphasis on zoonotic aspects. International journal of environmental research and public health, v. 17, n. 11, p. 3789, 2020. OVIAÑO, Marina; RODRÍGUEZ-SÁNCHEZ, Belén. MALDI-TOF mass spectrometry in the 21st century clinical microbiology laboratory. Enfermedades infecciosas y microbiologia clinica (English ed.), v. 39, n. 4, p. 192-200, 2021. RAFEI, Rayane et al. Update on the epidemiological typing methods for Acinetobacter baumannii. Future Microbiology, v. 14, n. 12, p. 1065-1080, 2019. RODRÍGUEZ, C. H.; NASTRO, M.; FAMIGLIETTI, A. Carbapenemases in Acinetobacter baumannii. Review of their dissemination in Latin America. Revista Argentina de Microbiologia. 50(3):327-333, 2018. ROSTAGNO, Horacio Santiago et al. Tabelas Brasileiras. para Aves e SUíDOS. 2005. RUPP, Mark E.; FEY, Paul D. Extended spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Enterobacteriaceae. Drugs, v. 63, n. 4, p. 353-365, 2003. 85 RUSSO, Thomas A. et al. The K1 capsular polysaccharide of Acinetobacter baumannii strain 307-0294 is a major virulence factor. Infection and immunity, v. 78, n. 9, p. 3993-4000, 2010. SADER, H. S. O uso de antimicrobianos promotores de crescimento contribui para a resistência a antibióticos? Anais... Fundação Apinco de Ciência e Tecnologia Avícolas, Campinas, Brasil, p.211-217. 2004. SHAHID, M. Citrobacter spp. Simultaneously Harboring blaCTX-M, blaTEM, blaSHV, blaampC, and Insertion Sequences IS26 and orf513: an Evolutionary Phenomenon of Recent Concern for Antibiotic Resistance. Journal of Clinical Microbiology, v. 48, n. 5, p. 1833–1838, 2010. SALIU, Eva-Maria; VAHJEN, Wilfried; ZENTEK, Jürgen. Types and prevalence of extended– spectrum beta–lactamase producing Enterobacteriaceae in poultry. Animal Health Research Reviews, v. 18, n. 1, p. 46-57, 2017. SANZ, Susana et al. Airborne Dissemination of Bacteria (Enterococci, Staphylococci and Enterobacteriaceae) in a Modern Broiler Farm and Its Environment. Animals, v. 11, n. 6, p. 1783, 2021. SEIBERT, L.M. Social behavior of psittacine birds. In: LuescherAU. Manual of Parrot Behaviour. Oxford: Blackwell Publishing, 2006. p 43-47. SELVAKUMAR, G. et al. Characterization of a cold-tolerant plant growth-promoting bacterium Pantoea dispersa isolated from a sub-alpine soil in the North Western Indian Himalayas. World Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 24, n. 7, p. 955-960, 2008. asaiSILVA-MARIANO, Luísa Cerqueira et al. SEPTICEMIA NEONATAL EM CÃO CAUSADA POR Streptococcus canis. Science and Animal Health, v. 9, n. 1, p. 76-87, 2021. SMANI, Younes; PACHÓN, Jerónimo. Loss of the OprD homologue protein in Acinetobacter baumannii: impact on carbapenem susceptibility. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 57, n. 1, p. 677-677, 2013. SILVEIRA, Débora R. et al. Campylobacter jejuni, Campylobacter coli, Salmonella spp. e Yersinia enterocolitica isoladas de animais silvestres em um centro de reabilitação. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 38, p. 1838-1843, 2018. SMET, Annemieke et al. Acinetobacter gandensis sp. nov. isolated from horse and cattle. International journal of systematic and evolutionary microbiology, v. 64, n. Pt_12, p. 4007- 4015, 2014. SPINALI, Sébastien et al. Microbial typing by matrix-assisted laser desorption ionization–time of flight mass spectrometry: do we need guidance for data interpretation? Journal of clinical microbiology, v. 53, n. 3, p. 760-765, 2015. SUBEDI, Manita et al. Antibiotic resistance pattern and virulence genes content in avian pathogenic Escherichia coli (APEC) from broiler chickens in Chitwan, Nepal. BMC Veterinary research, v. 14, n. 1, p. 1-6, 2018. REBELO, Ana Rita et al. Multiplex PCR for detection of plasmid-mediated colistin resistance determinants, mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4 and mcr-5 for surveillance purposes. Eurosurveillance, v. 23, n. 6, p. 17-00672, 2018. REIS, Túlio Leite; VIEITES, Flávio Medeiros. Antibiótico, prebiótico, probiótico e simbiótico em rações de frangos de corte egalinhas poedeiras. Ciênc. Anim. Bras, v. 29, p. 133-147, 2019. RIBEIRO VMF & MEDEIROS LS. Animais Silvestres: Convivências e Riscos. 1a edição. Rio Branco. Acre. Editora da Universidade Federal do Acre – Edufacé. 2017importante RIBOT EM, GAUTOM R, CAMERON DN, HUNTER SB, SWAMINATHAN B, BARRETTJ. Standardization of pulsed-field gel electrophoresis protocols for the subtyping of Escherichia coli 0157:H7, Salmonella, and Shigella for PulseNet. Foodborne Pathog Dis. 2006 ROSATO, Adriana E. et al. mecA-blaZ corepressors in clinical Staphylococcus aureus isolates. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 47, n. 4, p. 1460-1463, 2003. 86 SELVAKUMAR, G. et al. Characterization of a cold-tolerant plant growth-promoting bacterium Pantoea dispersa 1A isolated from a sub-alpine soil in the North Western Indian Himalayas. World Journal of Microbiology and Biotechnology, v. 24, n. 7, p. 955-960, 2008. SILVA-MARIANO, Luísa Cerqueira et al. SEPTICEMIA NEONATAL EM CÃO CAUSADA POR Streptococcus canis. Science And Animal Health, v. 9, n. 1, p. 76-87, 2021. SOUSA, A. T. H. I. et al. Perfil de resistência antimicrobiana de Klebsiella pneumoniae isoladas de animais domésticos e silvestres. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 71, p. 584-593, 2019. SPINELLI, Taciana P. et al. Normal aerobic bacterial conjunctival flora in the Crab‐eating raccoon (Procyon cancrivorus) and Coati (Nasua nasua) housed in captivity in pernambuco and paraiba (Northeast, Brazil). Veterinary ophthalmology, v. 13, p. 134-136, 2010. SUBEDI, Manita et al. Antibiotic resistance pattern and virulence genes content in avian pathogenic Escherichia coli (APEC) from broiler chickens in Chitwan, Nepal. BMC veterinary research, v. 14, n. 1, p. 1-6, 2018. SUZUKI, M. T.; GIOVANNONI, S. J. Bias caused by template annealing in the amplification of mixtures of 16S rRNA genes by PCR.Appl. Environ. Microbiol., v. 62, n. 2, p. 625-30, 1996 TAFFAREL, Andréia Cristiane. Aspectos do papel do médico veterinário na saúde pública, o ensino curricular e o conceito de One Health: revisão de literatura e considerações. 2015. TAKEBAYASHI, Yuiko et al. Variability in carbapenemase activity of intrinsic OxaAb (OXA- 51-like) β-lactamase enzymes in Acinetobacter baumannii. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, v. 76, n. 3, p. 587-595, 2021. TAYABALI, Azam F. et al. Comparison of the virulence potential of Acinetobacter strains from clinical and environme ntal sources. PloS one, v. 7, n. 5, p. e37024, 2012. TENOVER, Fred C. et al. Interpreting chromosomal DNA restriction patterns produced by pulsed-field gel electrophoresis: criteria for bacterial strain typing. Journal of clinical microbiology, v. 33, n. 9, p. 2233-2239, 1995. THERIAULT, Nicolette; TILLOTSON, Glenn; SANDROCK, Christian E. Global travel and Gram-negative bacterial resistance; implications on clinical management. Expert Review of Anti-infective Therapy, v. 19, n. 2, p. 181-196, 2021. THOMRONGSUWANNAKIJ, Thotsapol et al. A comparison of virulence genes, antimicrobial resistance profiles and genetic diversity of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) isolates from broilers and broiler breeders in Thailand and Australia. Avian Pathology, v. 49, n. 5, p. 457-466, 2020 TIWARI, Ruchi et al. COVID-19: animals, veterinary and zoonotic links. Veterinary Quarterly, v. 40, n. 1, p. 169-182, 2020. TRABULSI, L.R & ALTERTHUM, F. Microbiologia. 5 ed. São Paulo: Atheneu, 2008. TUCUNDUVA, P., RODRIGUES, M. B., DE CARVALHO, R. B. J., & BERTO, B. P EIMERIA psittacarae n. sp. (Apicomplexa: Eimeiriidae) from white-eyed parakeets Psittacara leucophthalmus (Müller, 1776) (Psittaciformes: Psittacidae) kept for rehabilitation and reintroduction in the Parque Nacional da Serra dos Órgãos, Southeastern Brazil. Zootaxa, v. 4459, n. 1, p. 164-170, 2018. TURLEJ, AGATA; HRYNIEWICZ, WALERIA; EMPEL, Joanna. Staphylococcal cassette chromosome mec (Sccmec) classification and typing methods: an overview. Polish journal of microbiology, v. 60, n. 2, p. 95, 2011. TURNER, Nicholas A. et al. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus: an overview of basic and clinical research. Nature Reviews Microbiology, v. 17, n. 4, p. 203-218, 2019. 87 TURTON, Jane F. et al. Identification of Acinetobacter baumannii by detection of the bla OXA- 51-like carbapenemase gene intrinsic to this species. Journal of clinical microbiology, v. 44, n. 8, p. 2974-2976, 2006 TUTTOBENE, M. R. et al. Light modulates important pathogenic determinants and virulence in ESKAPE pathogens Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, and Staphylococcus aureus. Journal of bacteriology, v. 203, n. 5, p. e00566-20, 2020. VAISSAIRE, Josée et al. Septicémie à pneumocoque (Streptococcus pneumoniae) chez le veau. Bulletin de l'Académie Vétérinaire de France, v. 141, n. 2, p. 173-180, 1988. VALENTIM, Jean Kaique et al. Implicações sobre o uso de promotores de crescimento na dieta de frangos de corte. 2019. VAN DER KOLK, Johannes Hermanus et al. Acinetobacter in veterinary medicine, with an emphasis on Acinetobacter baumannii. Journal of global antimicrobial resistance, v. 16, p. 59-71, 2019. VIEITES, Flávio Medeiros et al. Aditivos zootécnicos na alimentação de suínos– Revisão de Literatura. Brazilian Journal of Development, v. 6, n. 7, p. 45880-45895, 2020. VIJAYAKUMAR, Saranya; BISWAS, Indranil; VEERARAGHAVAN, Balaji. Accurate identification of clinically important Acinetobacter spp.: an update. Future science OA, v. 5, n. 7, p. FSO395, 2019. WANG, Jianfeng et al. Species distribution of clinical Acinetobacter isolates revealed by different identification techniques. PloS one, v. 9, n. 8, p. e104882, 2014. WALKER, Clay B. The acquisition of antibiotic resistance in the periodontal microflora. Periodontology 2000, v. 10, n. 1, p. 79-88, 1996. WANG, Teng-Ho et al. Prevalence of different carbapenemase genes among carbapenem- resistant Acinetobacter baumannii blood isolates in Taiwan. Antimicrobial Resistance & Infection Control, v. 7, n. 1, p. 1-8, 2018 WANG, Chengcheng et al. Identification of novel mobile colistin resistance gene mcr-10. Emerging microbes & infections, v. 9, n. 1, p. 508-516, 2020. WARETH, Gamal; NEUBAUER, Heinrich; SPRAGUE, Lisa D. Acinetobacter baumannii–a neglected pathogen in veterinary and environmental health in Germany. Veterinary research communications, v. 43, n. 1, p. 1-6, 2019. WATKINS, Richard R.; HOLUBAR, Marisa; DAVID, Michael Z. Antimicrobial resistance in methicillin-resistant Staphylococcus aureus to newer antimicrobial agents. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 63, n. 12, p. e01216-19, 2019. WEBER, M. N., MOSENA, A. C. S., DA SILVA, M. S., CANOVA, R., DE LORENZO, C., OLEGÁRIO, J. C., ... & CANAL, C. W Virome of crab-eating (Cerdocyon thous) and pampas foxes (Lycalopex gymnocercus) from southern Brazil and Uruguay. Infection, Genetics and Evolution, v. 85, p. 104421, 2020. WEINBERG, S. E. et al. Control and management of multidrug resistant Acinetobacter baumannii: A review of the evidence and proposal of novel approaches. Infection prevention in practice, v. 2, n. 3, p. 100077, 2020. WEITZMAN, Chava L.; SANDMEIER, Franziska C.; TRACY, C. Richard. Host species, pathogens and disease associated with divergent nasal microbial communities in tortoises. Royal Society open science, v. 5, n. 10, p. 181068, 2018. WONG, Darren et al. Clinical and pathophysiological overview of Acinetobacter infections: a century of challenges. Clinical microbiology reviews, v. 30, n. 1, p. 409-447, 2017. WOODFORD, Neil et al. Multiplex PCR for genes encoding prevalent OXA carbapenemases in Acinetobacter spp. International journal of antimicrobial agents, v. 27, n. 4, p. 351-353, 2006. World Health Organization (WHO) Disponível em: www.who.int/hpvcenter/statiscs/dynamic/ico/contry.pdf/bra/pdf. Acesso em 01.02.2022. 88 YADAV, Sudhir et al. Cecal microbiome profile of Hawaiian feral chickens and pasture-raised broiler (commercial) chickens determined using 16S rRNA amplicon sequencing. Poultry Science, v. 100, n. 7, p. 101181, 2021. YEATES, C. et al. Methods for microbial DNA extraction from soil for PCR amplification. Biological procedures online, v. 1, n. 1, p. 40-47, 1998. ZHANG, K.; SPARLING, J.; CHOW, B.L.; ELSAYED, S.; HUSSAIN, Z.; CHURCH, D.L.; GREGSON, D.B.; LOUIE, T.; CONLY, J.M. New Quadriplex PCR Assay forDetection of Methicillin and Mupirocin Resistance and Simultaneous Discrimination of Staphylococcus aureus from Coagulase-Negative Staphylococci. Journal of Clinical Microbiology, v. 42, n 11, p. 4947–4955, 2004 ZIMBLER, D. L. Stress Response and Virulence Functions of the Acinetobacter baumannii NfuA Fe-S Scaffold Protein. Journal of Bacteriology, v. 194, n. 11, p. 2884–2893, 2012.reponame:Repositório Institucional da UFRRJinstname:Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ)instacron:UFRRJinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINAL2022 - Theresse Camille Nascimento Holmstrom.pdf2022 - Theresse Camille Nascimento Holmstrom.pdfapplication/pdf2079313https://rima.ufrrj.br/jspui/bitstream/20.500.14407/17637/1/2022%20-%20Theresse%20Camille%20Nascimento%20Holmstrom.pdf20dc9d75a454f71d5e6726d5858d4f7aMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://rima.ufrrj.br/jspui/bitstream/20.500.14407/17637/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXT2022 - Theresse Camille Nascimento Holmstrom.pdf.txt2022 - Theresse Camille Nascimento Holmstrom.pdf.txtExtracted texttext/plain239631https://rima.ufrrj.br/jspui/bitstream/20.500.14407/17637/3/2022%20-%20Theresse%20Camille%20Nascimento%20Holmstrom.pdf.txt39fe0f7d0a91e7f009c26a45bd754dfcMD53THUMBNAIL2022 - Theresse Camille Nascimento Holmstrom.pdf.jpg2022 - Theresse Camille Nascimento Holmstrom.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1165https://rima.ufrrj.br/jspui/bitstream/20.500.14407/17637/4/2022%20-%20Theresse%20Camille%20Nascimento%20Holmstrom.pdf.jpg05124e50aedc80bc2fb181a85c97c38fMD5420.500.14407/176372024-08-06 02:52:55.395oai:rima.ufrrj.br:20.500.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Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttps://tede.ufrrj.br/PUBhttps://tede.ufrrj.br/oai/requestbibliot@ufrrj.bropendoar:2024-08-06T05:52:55Repositório Institucional da UFRRJ - Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única
title Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única
spellingShingle Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única
Holmström, Thérèsse Camille Nascimento
Medicina Veterinária
genes de resistência
patógenos bacterianos
Saúde Única
bacterial pathogens
resistance genes
One Health
title_short Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única
title_full Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única
title_fullStr Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única
title_full_unstemmed Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única
title_sort Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única
author Holmström, Thérèsse Camille Nascimento
author_facet Holmström, Thérèsse Camille Nascimento
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Holmström, Thérèsse Camille Nascimento
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Souza, Miliane Moreira Soares de
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0865211214618618
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Coelho, Irene da Silva
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/2191695584157582
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv Melo, Dayanne Araujo de
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/1205965922491865
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Soares, Lidiane de Castro
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7426431710199990
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Souza, Miliane Moreira Soares de
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0865211214618618
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Maboni, Grazieli
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/9416154230640250
dc.contributor.referee4.fl_str_mv Anzai, Eleine Kuroki
dc.contributor.referee4Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6430630810174173
dc.contributor.referee5.fl_str_mv Souza, Cláudio Marcos Rocha de
dc.contributor.referee5Lattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7903354651687538
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8222063891834662
contributor_str_mv Souza, Miliane Moreira Soares de
Coelho, Irene da Silva
Melo, Dayanne Araujo de
Soares, Lidiane de Castro
Souza, Miliane Moreira Soares de
Maboni, Grazieli
Anzai, Eleine Kuroki
Souza, Cláudio Marcos Rocha de
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Medicina Veterinária
topic Medicina Veterinária
genes de resistência
patógenos bacterianos
Saúde Única
bacterial pathogens
resistance genes
One Health
dc.subject.por.fl_str_mv genes de resistência
patógenos bacterianos
Saúde Única
bacterial pathogens
resistance genes
One Health
description Ao longo das últimas décadas, múltiplos fatores como o estreitamento da relação entre humanos e animais de estimação, as mudanças ambientais decorrentes da urbanização de áreas periurbanas e rurais, a significativa intensificação da produção animal, acarretaram uma significativa mudança na dinâmica homem-animal com consequente aumento da circulação de patógenos bacterianos entre humanos e animais e a emergência e reemergência de doenças. A identificação de bactérias emergentes na rotina do diagnóstico veterinário tem se apresentado como um grande desafio, uma vez que, geralmente, estes patógenos não possuem estudos de referência a partir das amostras oriundas do ambiente animal, e por vezes, metodologias desenvolvidas para amostras de origem humana não se mostram efetivas para sua identificação. Outro aspecto associado a tal emergência é a circulação de genes de resistência apontando para a importância de caracterizar a resistência antimicrobiana de espécies bacterianas oriundas de diferentes ambientes animais. Neste trabalho foram caracterizadas espécies bacterianas e seu respectivo perfil de resistência oriundas de animais silvestres, produção avícola e amostras laboratoriais clínicas de diferentes espécies. Amostras oriundas de diferentes espécies de animais selvagens, como maritacas, jabutis, cachorro do mato e mão pelada, forneceram 103 cepas da família Enterobacterales, 28 Staphylococcus spp., 2 Streptococcus spp. e 1 Enterococcus spp. Uma cepa de Pantoea dispersa isolada de maritaca foi detectada albergando o gene de resistência à colistina mcr-9. A partir das amostras de jabuti, foram detectadas 2 amostras apresentando o gene de resistência blaTEM, 1 apresentou o gene blaCTX e 1 apresentou ambos os genes. Dentre as amostras da produção avícola os isolados de Enteobacterales revelaram 45,45% (20/44) de cepas produtoras de ESBL, sendo 35% (9/20) blaSHV, 20% (4/20) blaCTX-M, 15% (3/20) blaTEM, 10% (2/20) apresentando os genes blaSHV e blaCTX, e 10% (2/20) apresentando blaSHV e blaTEM, simultaneamente. Dentre as 51 cepas de Enterococcus spp, 1 cepa de E. faecium oriunda de cloaca de pinto foi identificado o gene vanB e em 1 cepa de E. faecalis de frango adulto foram identificados vanA e vanB, simultaneamente. Destas mesmas 51 cepas 23,53% (12/51) apresentaram resistência a estreptomicina. Dentre as 25 cepas de Staphylococcus spp. foi detectado 1 isolado com o gene mecA. A cama de maravalha utilizada pelos animais da avicultura também foi avaliada e foi detectado 1 amostra positiva para o gene blaVIM. As 35 cepas de Acinetobacter spp. foram identificadas por análise proteômica, genotípica e sequenciamento. Para avaliar a diferença entre as técnicas foi utilizado o teste de Kappa entre MALDI-TOF e PCR, MALDI-TOF e rpoB, PCR e rpoB, e entre as três técnicas. O perfil de resistência dessas amostras também foi avaliado, sendo 54,28% (19/35) classificadas como MDR, 51,42% (18/35) apresentaram 1 ou mais genes de ESBL, sendo 4 cepas com gene blaCTX, 1 cepa com blaSHV, 9 cepas com blaTEM, 3 cepas com blaCTX e blaTEM e 1 cepa com blaSHV e blaTEM. O presente trabalho buscou identificar bactérias e detectar genes de resistência em diferentes ambientes veterinários. Este é um grande desafio principalmente porque há poucos trabalhos e ausência de padrões de análise fenotípica sobre isolados de origem animal. O papel do animal silvestre, de produção ou de companhia tem relevante participação na disseminação de genes de resistência no ambiente, enfatizando a Saúde Única e gerando um alerta quanto ao foco de novos estudos para entender e avaliar ambientes veterinários.
publishDate 2022
dc.date.issued.fl_str_mv 2022-03-22
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-07-17T14:57:52Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-07-17T14:57:52Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv HOLMSTRÖM, Thérèsse Camille Nascimento. Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única. 2022. 109 f. Tese (Doutorado em Ciências Veterinárias) - Instituto de Veterinária, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, 2022.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/17637
identifier_str_mv HOLMSTRÖM, Thérèsse Camille Nascimento. Desafios na caracterização e na análise da resistência antimicrobiana de espécies bacterianas na medicina veterinária com uma abordagem em saúde única. 2022. 109 f. Tese (Doutorado em Ciências Veterinárias) - Instituto de Veterinária, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, 2022.
url https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/17637
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.references.pt_BR.fl_str_mv AARESTRUP, Frank Moller et al. Glycopeptide susceptibility among Danish Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis isolates of animal and human origin and PCR identification of genes within the VanA cluster. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 40, n. 8, p. 1938-1940, 1996. ADZITEY, Frederick; HUDA, Nurul; ALI, Gulam Rusul Rahmat. Molecular techniques for detecting and typing of bacteria, advantages and application to foodborne pathogens isolated from ducks. 3 Biotech, v. 3, n. 2, p. 97-107, 2013. Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA) - Nota Técnica no 1/2013. Medidas para identificação, prevenção e controle de infecções relacionadas à assistência à saúde por microrganismos multirresistentes. Brasília, DF, 2013 AGHAPOUR, Zahra et al. Molecular mechanisms related to colistin resistance in Enterobacteriaceae. Infection and drug resistance, v. 12, p. 965, 2019. AGHAPOUR, Zahra et al. Genes involved in colistin resistance of gram-negative isolates in the northwest of Iran. Gene Reports, v. 14, p. 81-86, 2019. AHMED, Mohamed O.; BAPTISTE, Keith E. Vancomycin-resistant enterococci: a review of antimicrobial resistance mechanisms and perspectives of human and animal health. Microbial Drug Resistance, v. 24, n. 5, p. 590-606, 2018. ALBORNOZ, Luis Antonio Llanco; NAKANO, Viviane; AVILA-CAMPOS, Mario Julio. Clostridium perfringens e a enterite necrótica em frangos: principais fatores de virulência, genéticos e moleculares. Brazilian Journal of Veterinary Research and Animal Science, v. 51, n. 3, p. 178-193, 2014. ALEXANDRINO, Samantha Leandro de Sousa Andrade et al. Microbiota intestinal e os fatores que influenciam na avicultura. Research, Society and Development, v. 9, n. 6, p. e87963098- e87963098, 2020. ALÓS, Juan-Ignacio. Resistencia bacteriana a los antibióticos: una crisis global. Enfermedades infecciosas y microbiología clínica, v. 33, n. 10, p. 692-699, 2015. ALTMAN, D.G. (1991). Practical statistics for medical research. New York: Chapman and Hall. ALVAREZ-VEGA, Marco et al. Multidrug-resistant Acinetobacter meningitis in neurosurgical patients with intraventricular catheters: assessment of different treatments—authors’ response. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, v. 75, n. 3, p. 783-784, 2020. APOSTOLAKOS, Ilias et al. High-resolution characterisation of ESBL/pAmpC-producing Escherichia coli isolated from the broiler production pyramid. Scientific Reports, v. 10, n. 1, p. 1-12, 2020. ARGUDÍN, M. Angeles et al. Genetic diversity among Staphylococcus aureus isolates showing oxacillin and/or cefoxitin resistance not linked to the presence of mec genes. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 62, n. 7, p. e00091-18, 2018. ARIAS, Mônica V. Bahr et al. Estudo da ocorrência de infecção hospitalar em cães e gatos em um centro cirúrgico veterinário universitário. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 33, p. 771- 779, 2013. ASAI, Nobuhiro et al. Pantoea dispersa bacteremia in an immunocompetent patient: a case report and review of the literature. Journal of medical case reports, v. 13, n. 1, p. 1-5, 2019. AYOUB MOUBARECK, Carole; HAMMOUDI HALAT, Dalal. Insights into Acinetobacter baumannii: a review of microbiological, virulence, and resistance traits in a threatening nosocomial pathogen. Antibiotics, v. 9, n. 3, p. 119, 2020. AZEVEDO, Alessandra Lages Oliveira et al. Perfil de susceptibilidade aos carbapenêmicos de bacilos Gram-negativos fermentadores da glicose isolados de hemoculturas. Rev. bras. anal. clin, p. 255-259, 2020. 76 BARBER, M.1961. Methicillin resistant staphylococci. J. Clin. Pathol.14:385–393BARBOSA, Nei André Arruda et al. Digestibilidade ileal de frangos de corte alimentados com dietas suplementadas com enzimas exógenas. Comunicata Scientiae, v. 5, n. 4, p. 361-369, 2014. BARON, Sophie et al. Molecular mechanisms of polymyxin resistance: knowns and unknowns. International journal of antimicrobial agents, v. 48, n. 6, p. 583-591, 2016. BEZERRA, W. G. A. et al. Antibióticos no setor avícola: uma revisão sobre a resistência microbiana. Archivos de zootecnia, v. 66, n. 254, p. 301-307, 2017. BRESSLAU, Suzana; COORDENADORA, C. P. R. A. Plano de Ação Nacional para Prevenção e Controle da Resistência aos Antimicrobianos. 2017. BORDIER, Marion et al. Characteristics of one health surveillance systems: a systematic literature review. Preventive veterinary medicine, v. 181, p. 104560, 2020. BOROWIAK, Maria et al. Development of a novel mcr-6 to mcr-9 multiplex PCR and assessment of mcr-1 to mcr-9 occurrence in colistin-resistant Salmonella enterica isolates from environment, feed, animals and food (2011–2018) in Germany. Frontiers in microbiology, v. 11, p. 80, 2020. BRASIL. Ministério do Meio Ambiente. Biomas. 2022. Disponível em: https://antigo.mma.gov.br/biomas.html#:~:text=O%20Brasil%20%C3%A9%20formado%20p or,de%20vegeta%C3%A7%C3%A3o%20e%20de%20fauna. Acesso em: janeiro de 2022 BRASIL, Ministério da Pecuário, Agricultura e Abastecimento. Exportações do agronegócio batem recorde para setembro, com US$ 10,1 bilhões. 2021 Disponível em: https://www.gov.br/pt-br/noticias/agricultura-e-pecuaria/2021/10/exportacoes-do- agronegocio-batem-recorde-para-setembro-com-us-10-1-bilhoes Acesso em: novembro de 2021 BRASIL, Ministério da Pecuário, Agricultura e Abastecimento. IN 45 de 22 de outubro de 2016. Proibir, em todo o território nacional, a importação e a fabricação da substância antimicrobiana sulfato de colistina, com a finalidade de aditivo zootécnico melhorador de desempenho na alimentação animal, na forma desta Instrução Normativa. Disponível em: https://www.in.gov.br/materia/-/asset_publisher/Kujrw0TZC2Mb/content/id/22078290/do1- 2016-11-30-instrucao-normativa-n-45-de-22-de-novembro-de-2016-22078259 Acesso em: 22 de outubro de 2021 BRASIL, Ministério da Pecuário, Agricultura e Abastecimento. Portaria número 171, de 13 de dezembro de 2018 Disponível em: http://www.in.gov.br/materia//asset_publisher/Kujrw0TZC2Mb/content/id/55878469/do12011 219-portaria-n-171-de-13-de-dezembro-de-2018-55878239 Acesso em: 22 de outubro de 2021 BUSH K, JACOBY GA, MEDEIROS AA. A functional classification scheme for β-lactamases and its correlation with molecular structure. Antimicrob Agents Chemother 1995; 39: 1211- 33 BUSS, Paulo M. et al. Cadernos CRIS-Fiocruz: Saúde Global e Diplomacia da Saúde-Informe 17-Setembro/Outubro-2021. 2021. BUYUKCANGAZ, ESRA et al Molecular typing os Staphylococcus aureus and methicillin- resistant S. aureus (MRSA) isolated from animals and retail meat in North Dakota, United States. Foodborne pathogens and disease, v.10, n.7, p.608-617. 2013 CALISTRI, P. et al. The components of ‘one world–one health’approach. Transboundary and emerging diseases, v. 60, p. 4-13, 2013. CARROLL, Laura M. et al. Identification of novel mobilized colistin resistance gene mcr-9 in a multidrug-resistant, colistin-susceptible Salmonella enterica serotype Typhimurium isolate. MBio, v. 10, n. 3, p. e00853-19, 2019. CELI, P.; VERLHAC, V.; PÉREZ C. E.; SCHMEISSER, J.&KLUENTER, A. M. 2019. Biomarcadores da funcionalidade gastrointestinal na nutrição e saúde animal. Rev. Ciência e 77 Tecnologia de Ração Animal. 250:9-31. doi: https://doi.org/10.1016/j.anifeedsci.2018.07.012. Acesso em: 09 de janeiro de 2022 CEPEA. Centro de Economia Aplicada em Estudos Aplicado. PIB do Agronegócio Brasileiro. 2021. Disponível EM: https://www.cepea.esalq.usp.br/br/pib-do-agronegocio-brasileiro.aspx Acesso em:| novembro de 2021 CERON, K., CARVALHO, P. S., MÖCKLINGHOFF, L., & SANTANA, D. J Diurnal feeding behaviour of crab-eating raccoon upon a paradoxal frog, with a review of its diet. Acta Biológica Colombiana, v. 25, n. 2, p. 359-367, 2020. CHEN, TE-LI, LEE, YI-TZU, KUO, SHU-CHEN, YANG, SU-PEN, FUNG, CHANG- PHONE, LEE SHOU-DONG. Rapid identification of Acinetobacter baumannii, Acinetobacter nosocomialis and Acinetobacter pittii with a multiplex PCR assay. Journal of Medical Microbiology, 63, 1154–1159 DOI 10.1099/jmm.0.071712-0, 2014. CHEN, Lu et al. Comparison of clinical manifestations and antibiotic resistances among three genospecies of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex. PloS one, v. 13, n. 2, p. e0191748, 2018. CHERAZARD, Regine et al. Antimicrobial resistant Streptococcus pneumoniae: prevalence, mechanisms, and clinical implications. American journal of therapeutics, v. 24, n. 3, p. e361- e369, 2017. CLARK, N. C., COOKSEY, R. C., HILL, B. C., SWENSON, J. M., & TENOVER, F. C Characterization of glycopeptide-resistant enterococci from US hospitals. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 37, n. 11, p. 2311-2317, 1993. COLLIGNON, Peter J.; MCEWEN, Scott A. One health—its importance in helping to better control antimicrobial resistance. Tropical medicine and infectious disease, v. 4, n. 1, p. 22, 2019 CORMICAN, Martin G.; MARSHALL, Steven A.; JONES, Ronald N. Detection of extended- spectrum β-lactamase (ESBL)-producing strains by the Etest ESBL screen. Journal of Clinical Microbiology, v. 34, n. 8, p. 1880-1884, 1996. COSGAYA C, MAR ́I-ALMIRALL M, VAN ASSCHE A et al. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus– Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66(10), 4105–4111 (2016). CHRISTOFOLI, Marcela et al. Microbiota intestinal benéfica e prejudicial na avicultura: Revisão. Research, Society and Development, v. 9, n. 7, p. e43973667-e43973667, 2020. CUNHA, M.P.V. et al. Caracterização de APEC (avian pathogenic Escherichia coli) multivirulentas e multirresistentes. Revista de Educação Continuada em Medicina Veterinária e Zootecnica do CRMV-SP, v. 13, n.12. 2015. DAME-KOREVAAR, Anita et al. Transmission routes of ESBL/pAmpC producing bacteria in the broiler production pyramid, a literature review. Preventive veterinary medicine, v. 162, p. 136-150, 2019. DA SILVA DAVID, Maria Tereza Santos. O impacto do uso indiscriminado de antibióticos na pandemia do COVID-19. PANDEMIA: Caminhos para Aprendizagem [S. l.]: Pedro & João Editores, p. 165, 2021.) DA SILVEIRA ROSINA, Laís et al. OCORRÊNCIA DE Salmonella sp. NA CLOACA DE RÉPTEIS DE COMPANHIA. Revista de Medicina Veterinária do UNIFESO, v. 1, n. 01, 2021. DA SILVA, Elidiomar Ribeiro; COELHO, Luci Boa Nova. Sobre incursões da fauna silvestre a áreas urbanas durante a pandemia do novo coronavírus. Revista A Bruxa, v. 4, n. 2, p. 1-13, 2020. 78 DA SILVA, Raphael Paiva Paschoal; MANÇANO, Stella Maria Casas Novas; PICÃO, Renata Cristina. Cronologia da emergência global de carbapenemases em bacilos gram-negativos. Revista Saber Digital, v. 10, n. 2, p. 43-61, 2018. DA SILVA, Gabriela Jorge. Resistência à colistina e sua disseminação: implicações em saúde pública. Revista Portuguesa de Farmacoterapia, v. 10, n. 1, p. 47-52, 2018. DA SILVA MC, DE SOUSA RM, PADILHA KG. Patient destination after discharge from intensive care units: wards or intermediate care units? Rev Lat Am Enfermagem. 2010 DE ANDRADE FRANCO, Marcos Bevilacqua; DE ANDRADE FRANCO, Jose Luiz; CUNHA, Andre A. Ecoturismo, Conservação da Natureza e Deep Ecology: uma Reflexão sobre o Turismo como Experiência de Ampliação da Consciência. Environmental Science, v. 10, n. 2, 2021. DE CARVALHO, Juliana Jeanne Vieira et al. Bactérias multirresistentes e seus impactos na saúde pública: Uma responsabilidade social. Research, Society and Development, v. 10, n. 6, p. e58810616303-e58810616303, 2021. DE FREITAS, Maria Helena Dantas; RODRIGUES, Márcio Nogueira. Osteomielite no membro pélvico de felino secundária à infecção bacteriana: Relato de caso. PUBVET, v. 14, p. 163, 2019. DE MAGALHAES, Walkyria Biondi Lopes; CORDEIRO, Lara Celeste; COUTO, João Pedro Piccolo. ANTROPOMORFIZAÇÃO DOS ANIMAIS NAS REDES SOCIAIS E O TRÁFICO DE ANIMAIS SILVESTRES. Revista Multidisciplinar de Educação e Meio Ambiente, v. 2, n. 3, p. 50-50, 2021. DE MELO, Dayanne A. et al. Accuracy of PCR universal primer for methicillin-resistant Staphylococcus and comparison of different phenotypic screening assays. Brazilian Journal of Microbiology, v. 51, n. 1, p. 403-407, 2020. DE OLIVEIRA FEITOSA, THIAGO JORDÃO C. E., DE SOUZA, R. G., LIMA, C. D. S., DE CARVALHO GURGEL, A., DE OLIVEIRA, L. L. G., ... & MINAFRA, C. S. Microbiota intestinal das aves de produção: revisão bibliográfica. Research, Society and Development, v. 9, n. 5, p. e42952779-e42952779, 2020. DE SANT’ANA, Carlos ER et al. Análise Microbiológica em Aves Silvestres: Patógenos Virais e Bacterianos. Revista Processos Químicos, v. 6, n. 12, p. 74-79, 2012. DEVRIESE, L. A.; VAN DAMME, L. R.; FAMEREE, L. Methicillin (cloxacillin)‐resistant Staphylococcus aureus strains isolated from bovine mastitis cases. Zentralblatt für Veterinärmedizin Reihe B, v. 19, n. 7, p. 598-605, 1972. DIALLO, Ousmane Oumou et al. Antibiotic resistance surveillance systems: A review. Journal of Global Antimicrobial Resistance, 2020. DICKINSON, Vanessa M. et al. Nasal and cloacal bacteria in free-ranging desert tortoises from the western United States. Journal of Wildlife Diseases, v. 37, n. 2, p. 252-257, 2001. DOS SANTOS, Márcia Alves; DE PAIVA, Isabel Cristina; DA SILVA ANDRADE, Erci Gaspar. Enterococcus resistente a vancomicina (vre): perfil geral. Revista JRG de Estudos Acadêmicos, v. 4, n. 8, p. 127-139, 2021. D'SOUZA, Roshan et al. Phenotypic and genotypic characterization of Acinetobacter spp. panel strains: a cornerstone to facilitate antimicrobial development. Frontiers in microbiology, v. 10, p. 559, 2019. DUNLAP, Christopher A.; ROONEY, Alejandro P. Acinetobacter dijkshoorniae is a later heterotypic synonym of Acinetobacter lactucae. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, v. 68, n. 1, p. 131-132, 2018 DURMAZ, Riza et al. The optimization of a rapid pulsed-field gel electrophoresis protocol for the typing of Acinetobacter baumannii, Escherichia coli and Klebsiella spp. Jpn J Infect Dis, v. 62, n. 5, p. 372-7, 2009. 79 ELLIFF, C. 2020. O que o COVID-19 pode nos ensinar sobre conservação ambiental. [online]. Disponível em: www.batepapocomnetuno.com. Acesso em: 23 de março de 2020. EMBRAPA. Empresa Brasileira de Pesquisa em Agropecuária. Estatíticas. 2021 Disponível em: https://www.embrapa.br/suinos-e-aves/cias/ Acesso em: novembro de 2021 EWERS, Christa et al. OXA-23 and ISAba1–OXA-66 class D β-lactamases in Acinetobacter baumannii isolates from companion animals. International journal of antimicrobial agents, v. 49, n. 1, p. 37-44, 2017. EWERS, Christa; JANßEN, Traute; WIELER, Lothar H. Avian pathogenic Escherichia coli (APEC). Berliner und Munchener tierarztliche Wochenschrift, v. 116, n. 9-10, p. 381-395, 2003. FALLAH, Fatemeh et al. Prevalence of blaNDM, blaPER, blaVEB, blaIMP, and blaVIM genes among Acinetobacter baumannii isolated from two hospitals of Tehran, Iran. Scientifica, v. 2014, 2014. FERNÁNDEZ-CUENCA, Felipe et al. Attenuated virulence of a slow-growing pandrug- resistant Acinetobacter baumannii is associated with decreased expression of genes encoding the porins CarO and OprD-like. International journal of antimicrobial agents, v. 38, n. 6, p. 548-549, 2011. FERNANDES, Raimunda Thyciana Vasconcelos et al. Aditivos fitogenicos na alimentacao de frangos de corte: óleos essenciais e especiarias. PubVet, v. 9, p. 502-557, 2015. FERNANDES, J. C. T.; CARDOSO, M. R. I. Mamite ovina causada por Staphylococcus aureus. Primeira observação no Brasil. Arquivos da Faculdade de Veterinária da UFRGS, v. 13, p. 71-74, 1985 FLEISS, Joseph L.; LEVIN, Bruce; PAIK, Myunghee Cho. Statistical methods for rates and proportions. john wiley & sons, 2013. FLEMING, A. On the anticiotical action os culture os a penicillium, with special reference to their use in the isolation of B. influenzae. British Journal of experimental pathology, v.10, n.3, p.226. 1929 FOXMAN, Betsy et al. Choosing an appropriate bacterial typing technique for epidemiologic studies. Epidemiologic perspectives & innovations, v. 2, n. 1, p. 1-8, 2005. FRANTZ, Laurent AF et al. Animal domestication in the era jhhnof ancient genomics. Nature Reviews Genetics, v. 21, n. 8, p. 449-460, 2020. GAGGINI, Thais Schwarz et al. Endocardite vegetativa em leitões causada por streptococcus suis sorotipo 9. Veterinária e Zootecnia, v. 25, n. 1, p. 94-98, 2018. GALLAGHER, Peter; BAKER, Stephen. Developing new therapeutic approaches for treating infections caused by multi-drug resistant Acinetobacter baumannii: Acinetobacter baumannii therapeutics. Journal of Infection, v. 81, n. 6, p. 857-861, 2020. GALOSI, Livio et al. Health assessment of wild speckled dwarf tortoises, CHERSOBIUS SIGNATUS. BMC veterinary research, v. 17, n. 1, p. 1-11, 2021. GARCIA, Jessica et al. Prevalence and predictors of bacteremia in dairy calves with diarrhea. Journal of Dairy Science, 2021. GARCIA, Danitiele Almas; GOMES, Deriane Elias. A avicultura brasileira e os avanços nutricionais. Revista Científica, v. 1, n. 1, 2019. GAY, Kathryn et al. Plasmid-mediated quinolone resistance in non-Typhi serotypes of Salmonella enterica. Clinical Infectious Diseases, v. 43, n. 3, p. 297-304, 2006. GESER, N.; STEPHAN, R.; KORCZAK, B.M.; BEUTIN, L.; HÄCHLERA, H. Molecular Identification of Extended-Spectrum-β-Lactamase Genes from Enterobacteriaceae Isolated from Healthy Human Carriers in Switzerland. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, v. 56, n. 3, p. 1609–1612, 2012. 80 GHAIMA, K. K. Distribution of extended spectrum β-lactamase ( ESBL ) genes 71 among Acinetobacter baumannii isolated from burn infections. MOJ Cell Sci Rep, v. 5, n. 2, p. 42– 46, 2018. GHOSH, Antara et al. Abatement of arsenic-induced phytotoxic effects in rice seedlings by an arsenic-resistant Pantoea dispersa strain. Environmental Science and Pollution Research , v. 28, n. 17, p. 21633-21649, 2021. GOERING, Richard V. Pulsed field gel electrophoresis: a review of application and interpretation in the molecular epidemiology of infectious disease. Infection, Genetics and Evolution, v. 10, n. 7, p. 866-875, 2010. GOŁAWSKA, Olga et al. Complex bacterial flora of imported pet tortoises deceased during quarantine: Another zoonotic threat?. Comparative immunology, microbiology and infectious diseases, v. 65, p. 154-159, 2019. GOMES, Camila Moreira Barreto et al. Determinação de enterobactérias de mamíferos silvestres em criadouro conservacionista. Revista de Biologia e Ciências da Terra, v. 11, n. 2, p. 74-80, 2011. GUO, San Jun; SHAN, R. E. N.; XIE, Yong En. Evaluation of the protective efficacy of a fused OmpK/Omp22 protein vaccine candidate against Acinetobacter baumannii infection in mice. Biomedical and environment al sciences, v. 31, n. 2, p. 155-158, 2018 HAAG, Andreas F.; FITZGERALD, J. Ross; PENADÉS, José R. Staphylococcus aureus in Animals. Microbiology Spectrum, v. 7, n. 3, p. 7.3. 11, 2019. HAENNI, Marisa; LUPO, Agnese; MADEC, Jean-Yves. Antimicrobial resistance in Streptococcus spp. Microbiology spectrum, v. 6, n. 2, p. 6.2. 09, 2018. HAMOUDA, Ahmed et al. Epidemiology of Acinetobacter baumannii of animal origin. International journal of antimicrobial agents, v. 38, n. 4, p. 314-318, 2011. HARKINS, C.P., PICHON, B., DOUMITH, M. et al. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus emerged long before the introduction of methicillin into clinical practice. Genome Biol 18, 130 2017 HASANI, Alka et al. Expression of Efflux Pumps, Porins and Genotypic Insight Into the Carbapenem Resistance in Acinetobacter Baumannii. 2021. HEUER, Holger et al. Accumulation of sulfonamide resistance genes in arable soils due to repeated application of manure containing sulfadiazine. Applied and Environmental Microbiology, v. 77, n. 7, p. 2527-2530, 2011. HIGGINS, Paul G. et al. Inclusion of OXA-143 primers in a multiplex polymerase chain reaction (PCR) for genes encoding prevalent OXA carbapenemases in Acinetobacter spp. International journal of antimicrobial agents, v. 35, n. 3, 2010. HOLMSTROM, Theresse et al. Methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius: an underestimated risk at pet clinic. Brazilian Journal of Veterinary Medicine, v. 42, n. 1, p. e107420-e107420, 2020. HUANG, Angela M. et al. Impact of rapid organism identification via matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight combined with antimicrobial stewardship team intervention in adult patients with bacteremia and candidemia. Clinical infectious diseases, v. 57, n. 9, p. 1237-1245, 2013. HUSSAIN, A. et al. Risk of Transmission of Antimicrobial Resistant Escherichia coli from Commercial Broiler and Free-Range Retail Chicken in India. Frontiers in Microbiology, v.8, 2017. JIMÉNEZ-GUERRA, Gemma et al. Urinary tract infection by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa: evolution of antimicrobial resistance and therapeutic alternatives. Journal of medical microbiology, v. 67, n. 6, p. 790-797, 2018. 81 IEVY, Samina et al. Molecular detection of avian pathogenic Escherichia coli (APEC) for the first time in layer farms in Bangladesh and their antibiotic resistance patterns. Microorganisms, v. 8, n. 7, p. 1021, 2020. INEA. Instituto Estadual do Ambiente. Triagem e Reabilitação (CETAS e CRAS). 2022. Disponível em: http://www.inea.rj.gov.br/biodiversidade-territorio/triagem-e-reabilitacao- cetas-e-cras/ Acesso em: janeiro de 2022 INEA. Resolução INEA N° 157 de 19 de outubro de 2018. Dispõe sobre as categorias de uso e manejo da fauna silvestre, nativa e exótica em cativeiro, no território do estado do Rio de Janeiro. Disponível: http://www.inea.rj.gov.br/wp- content/uploads/2019/02/RESOLU%C3%87%C3%83O-INEA-N%C2%BA-157.pdf Acesso: janeiro de 2022. IOANNOU, Petros; MAVRIKAKI, Vasiliki; KOFTERIDIS, Diamantis P. Infective endocarditis by Acinetobacter species: A systematic review. Journal of Chemotherapy, v. 33, n. 4, p. 203-215, 2021 IOVLEVA, Alina et al. The ecology of extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) in the developed world. Journal of travel medicine, v. 24, n. suppl_1, p. S44-S51, 2017. ITO, N. M. K.; MIYAJI, C. I.; LIMA, E. A.; OKABAYASHI, S. Antimicrobianos: Usos preventivos e curativos na avicultura. In: PALERMO-NETO, J.; SPINOSA, H. S.; GÓRNIAK, S. L. Farmacologia aplicada à avicultura: boas práticas no manejo de medicamentos. São Paulo: Editora Roca, 2005. cap. 8, p. 115-147. JIANG, Lingmin et al. Potential of Pantoea dispersa as an effective biocontrol agent for black rot in sweet potato. Scientific reports, v. 9, n. 1, p. 1-13, 2019. JOHNSON, T. J.; WANNEMUEHLER, Y. M.; JOHNSON, S. J.; NOLAN, L. K. Complete DNA Sequence, Comparative Genomics, and Prevalence of an IncHI2 Plasmid Occurring among Extraintestinal Pathogenic Escherichia coliIsolates. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 50, n. 11,p. 3929–3933,2006. JOHNSON, T. J.; WANNEMUEHLER, Y.; DOETKOTT, C.; JOHNSON, S. J.; ROSEN- BERGER, S. C.; NOLAN, L. K. Identification of Minimal Predictors of Avian Pathogenic Escherichia coli Virulence for Use as a Rapid Diagnostic Tool. Journal of clinical microbiology, v. 46, n. 12, p. 3987-3996,2008. JOHNSON, J. R &STELL, A. L. Extended virulence genotypes of Escherichia coli 9 strains from patients with urosepsis in relation to phylogeny and host compromise. J. Infect. Dis. v. 181, p. 261-272. 2000 JUNQUEIRA, Otto Mack et al. Uso de aditivos em rações para suínos nas fases de creche, crescimento e terminação. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 38, p. 2394-2400, 2009. KACZOREK, E. et al. Phenotypic and genotypic antimicrobial susceptibility pattern of Streptococcus spp. isolated from cases of clinical mastitis in dairy cattle in Poland. Journal of Dairy Science, v. 100, n. 8, p. 6442-6453, 2017. KANAMORI, Hajime et al. Next-generation sequencing and comparative analysis of sequential outbreaks caused by multidrug-resistant Acinetobacter baumannii at a large academic burn center. Antimicrobial agents and chemotherapy, v. 60, n. 3, p. 1249-1257, 2015. KAPOOR, Garima; SAIGAL, Saurabh; ELONGAVAN, Ashok. Action and resistance mechanisms of antibiotics: A guide for clinicians. Journal of anaesthesiology, clinical pharmacology, v. 33, n. 3, p. 300, 2017. KEMPF, Isabelle; JOUY, Eric; CHAUVIN, Claire. Colistin use and colistin resistance in bacteria from animals. International journal of antimicrobial agents, v. 48, n. 6, p. 598-606, 2016. KIMURA, Yui et al. Species distribution, virulence factors and antimicrobial resistance of Acinetobacter spp. isolates from dogs and cats: a preliminary study. Microbiology and immunology, v. 62, n. 7, p. 462-466, 2018. 82 KISLAK, J. W. Susceptibility of pneumococci to nine antibiotics. Am. J. Med. Sci., v. 250, p. 261-268, 1965. KOPOTSA, Katlego; OSEI SEKYERE, John; MBELLE, Nontombi Marylucy. Plasmid evolution in carbapenemase‐producing Enterobacteriaceae: a review. Annals of the New York Academy of Sciences, v. 1457, n. 1, p. 61-91, 2019. KUZI, S. et al. Multi‐drug‐resistant Acinetobacter calcoaceticus‐Acinetobacter baumannii complex infection outbreak in dogs and cats in a veterinary hospital. Journal of Small Animal Practice, v. 57, n. 11, p. 617-625, 2016 LASCOLA, Bernard et al. Sequencing of the rpoB gene and flanking spacers for molecular identification of Acinetobacter species. Journal of clinical microbiology, v. 44, n. 3, p. 827- 832, 2006. LEE, Terence et al. Antimicrobial-resistant CC17 Enterococcus faecium: The past, the present and the future. Journal of Global Antimicrobial Resistance ,[S. l.], 2018. LEE, Chang-Ro et al. Biology of Acinetobacter baumannii: pathogenesis, antibiotic resistance mechanisms, and prospective treatment options. Frontiers in cellular and infection microbiology, v. 7, p. 55, 2017. LIM, Daniel; STRYNADKA, Natalie CJ. Structural basis for the β lactam resistance of PBP2a from methicillin-resistant Staphylococcus aureus. Nature structural biology, v. 9, n. 11, p. 870-876, 2002. LIMA, Débora Costa Viegas de et al. Microbiology of rectal and otologic swabs of wild carnivores from the Zoo of the Parque Estadual de Dois Irmãos, Pernambuco, Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, v. 32, n. 2, p. 159-164, 2012. LITAKE, G. M. et al. Phenotypic ESBL Detection in Acinetobacter baumannii: A Real Challenge. American Journal of Infectious Diseases Original, 2015. LIU, Yi-Yun et al. Emergence of plasmid-mediated colistin resistance mechanism mcr-1 in animals and human beings in China: a microbiological and molecular biological study. The Lancet infectious diseases, v. 16, n. 2, p. 161-168, 2016. LUO, Qixia; WANG, Yuan; XIAO, Yonghong. Prevalence and transmission of mobilized colistin resistance (mcr) gene in bacteria common to animals and humans. Biosafety and Health, v. 2, n. 02, p. 71-78, 2020. MABONI, Grazieli et al. Antimicrobial resistance patterns of Acinetobacter spp. of animal origin reveal high rate of multidrug resistance. Veterinary Microbiology, v. 245, p. 108702, 2020 MACKENZIE, John S.; JEGGO, Martyn. The One Health approach—Why is it so important?. Tropical Medicine and Infectious Disease, v. 4, n. 2, p. 88, 2019. MAGALHÃES, Vanda D. et al. Eletroforese em campo pulsante em bacteriologia-uma revisão técnica. Revista do Instituto Adolfo Lutz, v. 64, n. 2, p. 155-161, 2005. MAGIORAKOS, A.-P. et al. Multidrug-resistant, extensively drug-resistant and pandrug- resistant bacteria: an international expert proposal for interim standard definitions for acquired resistance. Clinical microbiology and infection, v. 18, n. 3, p. 268-281, 2012. MAHICH, Swati et al. Acinetobacter sepsis among out-born neonates admitted to neonatal unit in pediatric emergency of a tertiary care hospital in North India. The Indian Journal of Pediatrics, v. 88, n. 2, p. 127-133, 2021. MAIORKI, Karolyna Mattes; FUKUMOTO, Nelson Massaru. Colibacilose Aviária: Revisão de Literatura. Brazilian Journal of Development, v. 7, n. 10, p. 99696-99707, 2021. MALOV, V. A.; MALEYEV, V. V. Pets in modern society: hidden threats. Terapevticheskii arkhiv, v. 90, n. 11, p. 105-111, 2018. MARTAK, Daniel et al. Comparison of pulsed-field gel electrophoresis and whole-genome- sequencing-based typing confirms the accuracy of pulsed-field gel electrophoresis for the 83 investigation of local Pseudomonas aeruginosa outbreaks. Journal of Hospital Infection, v. 105, n. 4, p. 643-647, 2020. McMULLIN, P. Produção avícola sem antibióticos: riscos potenciais de contaminação cruzada e detecção de resíduos. In: CONFERÊNCIA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2004, Santos. Anais... Santos: Facta, 2004. v. 2, p. 219-226. MENIN, Álvaro. Saúde única: uma reflexão. Encuentro de Salud Animal, v. 4, 2018. MENIN, Álvaro et al. Diagnóstico de infecção urinária em fêmeas suínas produtivas em granjas comerciais no sul do Brasil. Ciência Animal Brasileira, v. 9, n. 1, p. 197-206, 2008. MINARINI, Luciene AR et al. Prevalence of community-occurring extended spectrum β- lactamase-producing Enterobacteriaceae in Brazil. Current microbiology, v. 54, n. 5, p. 335- 341, 2007. MONTEIRO, Jussimara et al. Rapid detection of carbapenemase genes by multiplex real-time PCR. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, v. 67, n. 4, p. 906-909, 2012. MOREIRA, J. M. A. R., MENEZES, I. G., LUNA, I. S. R., NOGUEIRA, B. S., SOUSA, A. T. H. I. D., CÂNDIDO, S. L., ... & NAKAZATO, L. Vancomycin susceptibility profiles of Staphylococcus spp. isolates from domestic and wild animals. Ciência Rural, v. 50, 2020. MORENO, Gilberti et al. Resistência a drogas em enterobactérias isoladas de animais silvestres. Revista do Instituto Adolfo Lutz, v. 32, n. 1-2, p. 57-61, 1972. MUNIER, Anne-Lise et al. Incidence, risk factors and outcome of multi-drug resistant Acinetobacter baumannii nosocomial infections during an outbreak in a burn unit. International Journal of Infectious Diseases, v. 79, p. 179-184, 2019. NATIONAL RESEARCH COUNCIL. NRC. Nutrient requirements of dairy cattle. Washington, D.C.: National Academy Press, 2001. 381p. National Research Council,1984. Nutrient Requirementsof Poultry. 8th rev. ed. National Academy Press, Washington, DC NEOH, Hui-min et al. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE): A review of the “gold standard” for
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFRRJ
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
dc.publisher.department.fl_str_mv Instituto de Veterinária
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRRJ
instname:Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ)
instacron:UFRRJ
instname_str Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ)
instacron_str UFRRJ
institution UFRRJ
reponame_str Repositório Institucional da UFRRJ
collection Repositório Institucional da UFRRJ
bitstream.url.fl_str_mv https://rima.ufrrj.br/jspui/bitstream/20.500.14407/17637/1/2022%20-%20Theresse%20Camille%20Nascimento%20Holmstrom.pdf
https://rima.ufrrj.br/jspui/bitstream/20.500.14407/17637/2/license.txt
https://rima.ufrrj.br/jspui/bitstream/20.500.14407/17637/3/2022%20-%20Theresse%20Camille%20Nascimento%20Holmstrom.pdf.txt
https://rima.ufrrj.br/jspui/bitstream/20.500.14407/17637/4/2022%20-%20Theresse%20Camille%20Nascimento%20Holmstrom.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 20dc9d75a454f71d5e6726d5858d4f7a
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
39fe0f7d0a91e7f009c26a45bd754dfc
05124e50aedc80bc2fb181a85c97c38f
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRRJ - Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro (UFRRJ)
repository.mail.fl_str_mv bibliot@ufrrj.br
_version_ 1810107799842062336

Registros relacionados