Estudo semi-empírico da interação de 20-hidroxiecdisona e seus agonistas sintéticos com modelos de homologia de receptores de ecdisteróide (EcR),

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Ana Cristina Souza dos
Data de Publicação: 2002
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFRRJ
Texto Completo: https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/10229
Resumo: As dibenzoilidrazinas RH-5849, RH-5992 e RH-2485 são agonista não esteroidais de 20-hidroxiecdisona (20E) e exerce seu efeito inseticida através da interação com o receptor de 20E (EcR). No entanto RH-5992 e RH-2485 são seletivamente tóxicos para lepidópteros. O estudo da seletividade das DBHs RH-5992 e RH-2485 para lepidóptero envolveu a avaliação dos modelos do EcR de Manduca Sexta, um lepidóptero, e o EcR de Drosophila melanogaster, um díptero, cujas estruturas 3D foram construídas através de modelagem por homologia. Os modelos gerados por homologia para os EcRs das duas espécies de insetos foram construídos a partir de estruturas cristalográficas de proteínas pertencentes a supertiamília de receptores nucleares esteroidais, que incluem o receptores humano de ácido retnóico, vitamina D e o do hormônio da tiróide. Os modelos resultantes do alinhamento múltiplo entre as proteínas apresentaram boa correlação entre as estruturas moldes e as proteínas-alvo, com aspecto bastante similar, sendo as mais importantes diferenças relatadas para a seqüência terminal. A opção pelo estudo a partir do modelo inicial foi baseado no foco do trabalho, que sé limita à CIL, região interna da proteína, identiticada através das proteínas moldes utilizadas e que são consideradas regiões conservadas. Após proposição do sítio de interação com o ligante (SIL) dos EcRs modelados, foi realizada uma avaliação prévia dos modelos através do atracamento de 20E na possível cavidade de interação com o ligante (CIL). As CILs de M. sexta e D. melanogaster foram definidas pelos aminoácidos que realmente poderiam interagir com o ligante. O mesmo procedimento foi envolvido com as DBHs. Para avaliar as diferenças de interações nas CILs dos EcRs foram, consideradas a energia de interação e a geometria entre agonistas (ligantes) e as CILs, com o propósito de explicar a atividade e seletividade dessas moléculas ti'ente ao receptor. Os cálculos de entalpia associado com as forças de interação entre os agonistas sintéticos e os aminoácidos nos modelos das CILs revelaram resultados concordantes com a atividade biológica das DBHs para as espécies Lepidóptera e Díptera. O estudo da interação cavidade/ligante incluiu outras diferentes DBHs, através da busca de correlações entre os diferentes termos de energia envolvidos na interação no modelo da cavidade de interação do receptor de ecdisteróide de M. sexta (msEcR-CIL) e os valores de pLD50 dos respectivos agonistas [SMAGGHE et al., 1999]. Novos ligames com possível potencial pesticida foram construídos após a identificação de grupos funcionais importantes para a atividade agonista de 20E. Os resultados de entalpia associado com as forças de interação entre os novos ligantes (RURAL-l, RURAL-2, RURAL-3) e os aminoácidos nos modelos das CILs revelaram resultados significativos, comparado aos resultados do complexo entre RH-2485 e a CIL do EcR de M. sexta (msEcR-CIL).
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O estudo da seletividade das DBHs RH-5992 e RH-2485 para lepidóptero envolveu a avaliação dos modelos do EcR de Manduca Sexta, um lepidóptero, e o EcR de Drosophila melanogaster, um díptero, cujas estruturas 3D foram construídas através de modelagem por homologia. Os modelos gerados por homologia para os EcRs das duas espécies de insetos foram construídos a partir de estruturas cristalográficas de proteínas pertencentes a supertiamília de receptores nucleares esteroidais, que incluem o receptores humano de ácido retnóico, vitamina D e o do hormônio da tiróide. Os modelos resultantes do alinhamento múltiplo entre as proteínas apresentaram boa correlação entre as estruturas moldes e as proteínas-alvo, com aspecto bastante similar, sendo as mais importantes diferenças relatadas para a seqüência terminal. A opção pelo estudo a partir do modelo inicial foi baseado no foco do trabalho, que sé limita à CIL, região interna da proteína, identiticada através das proteínas moldes utilizadas e que são consideradas regiões conservadas. Após proposição do sítio de interação com o ligante (SIL) dos EcRs modelados, foi realizada uma avaliação prévia dos modelos através do atracamento de 20E na possível cavidade de interação com o ligante (CIL). As CILs de M. sexta e D. melanogaster foram definidas pelos aminoácidos que realmente poderiam interagir com o ligante. O mesmo procedimento foi envolvido com as DBHs. Para avaliar as diferenças de interações nas CILs dos EcRs foram, consideradas a energia de interação e a geometria entre agonistas (ligantes) e as CILs, com o propósito de explicar a atividade e seletividade dessas moléculas ti'ente ao receptor. Os cálculos de entalpia associado com as forças de interação entre os agonistas sintéticos e os aminoácidos nos modelos das CILs revelaram resultados concordantes com a atividade biológica das DBHs para as espécies Lepidóptera e Díptera. O estudo da interação cavidade/ligante incluiu outras diferentes DBHs, através da busca de correlações entre os diferentes termos de energia envolvidos na interação no modelo da cavidade de interação do receptor de ecdisteróide de M. sexta (msEcR-CIL) e os valores de pLD50 dos respectivos agonistas [SMAGGHE et al., 1999]. Novos ligames com possível potencial pesticida foram construídos após a identificação de grupos funcionais importantes para a atividade agonista de 20E. Os resultados de entalpia associado com as forças de interação entre os novos ligantes (RURAL-l, RURAL-2, RURAL-3) e os aminoácidos nos modelos das CILs revelaram resultados significativos, comparado aos resultados do complexo entre RH-2485 e a CIL do EcR de M. sexta (msEcR-CIL).The dibenzoylhydrazines (DBHs) R11-5849, Rtt-5992 (tebulienozide), and RH-2485 (metoxifenozide) are non-steroidal agonists of 20-hydroxyecdysone (20E) insect hormone, that exert their insecticide eflect by interaction with the 20E receptor (EcR). Tebulènozide and metoxifenozide are selectively toxic to lepidopteran species. In this theoretical study, the DBHs were firstly evaluated by a comparison with the natural agonist (20E) structure. In the next step, the RH-2485 selectivity towards Lepidoptera was studied with models of EcRs of the Lepidoptera Manduca Sexta, andof the Diptera Drosophila melanojzaster. The 3D structures of both EcRs were constructed by homology modeling with the SWISS-MODEL server. The models were constructed from crystallographic coordinates of related proteins ofthe nuclear receptor super Family, which includes the human receptors of vitamin D, retinoic acid, and thyroid hormone. The initial models, aPter a previous optimization by molecular mechanics, were simplified to an internal conserved region, the receptor ligand interaction site (I,IS), identified by comparison with original template proteins. Atter this step, it was implemented a rigid docking study of 20E inside the probable ligand interaction cavity (LIC) of the models. The M. sexta and D. melanogaster LICs were defined by the amino acids that could directly interact with the ligand. The same procedure was employed [br the DBHs RH-5849 and RH-2485. In order to evaluate the interaction pattern inside the EcR LICs, the enthalpy of interaction and the geometry of the ligand/LlC complexes were studied by the semiempirical approach. The ca[culated enthalpies associated with the interaction forces between the synthetic agonists and the amino acids of the LICs are in accordance with the experimental biological activity ofthe DBHs towards Lepidoptera and Diptera. In the following step, an interaction study between the M. sexta LIC (msEcR-LIC) and 10 additional DBHs was implemented to search for correlations between calculated enttlalpy terras associated with the interaction and pLDs0 experimental values of the synthetic agonists [SMAGGHE et al., 1999]. New DBH ligands with potential pesticide activity were proposed alter identification of the important groups for the EcR agonist activity. The interaction of the new ligands (RURAL-l, RURAL-2, and RURAL-3) with the msEcR-LIC amino acids resulted in quite favorable enthalpies, as compared to the known pesticides tebufenozide and metoxifenozide.application/pdfporUniversidade Federal Rural do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em QuímicaUFRRJBrasilInstituto de Ciências ExatasQuímicaQuímicaEstudo semi-empírico da interação de 20-hidroxiecdisona e seus agonistas sintéticos com modelos de homologia de receptores de ecdisteróide (EcR),...info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis...https://tede.ufrrj.br/retrieve/63679/2002%20-%20Ana%20Cristina%20Souza%20dos%20Santos.pdf.jpghttps://tede.ufrrj.br/jspui/handle/jspui/4305Submitted by Celso Magalhaes (celsomagalhaes@ufrrj.br) on 2020-12-29T14:34:33Z No. of bitstreams: 1 2002 - Ana Cristina Souza dos Santos.pdf: 7125057 bytes, checksum: 0bb48cd47b0ff5d2f07806407117ccbb (MD5)Made available in DSpace on 2020-12-29T14:34:33Z (GMT). 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