Análise do padrão de uso de códons sinônimos em papilomavírus humano

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Tatiane Emiliano
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFS
Texto Completo: http://ri.ufs.br/jspui/handle/riufs/8722
Resumo: São Cristóvão,SE.
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spelling Santos, Tatiane EmilianoBatista, Marcus Vinícius Aragão2018-08-17T15:25:56Z2018-08-17T15:25:56Z2016-05-20SANTOS, Tatiane Emiliano. Análise do padrão de uso de códons sinônimos em papilomavírus humano. São Cristóvão, SE, 2015. Monografia (Graduação em Biologia) - Departamento de Biologia, Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, Universidade Federal de Sergipe, São Cristóvão, SE, 2016.http://ri.ufs.br/jspui/handle/riufs/8722porPapilomavírus humano (HPV)Códons sinônimosViés de uso de códonsHPVCâncer do colo do úteroÚtero (câncer)CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA::BIOLOGIA E FISIOLOGIA DOS MICROORGANISMOS::VIROLOGIAAnálise do padrão de uso de códons sinônimos em papilomavírus humanoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisSão Cristóvão,SE.O câncer de colo de útero é o segundo tipo de câncer mais comum em mulheres vivendo em regiões em desenvolvimento. A principal causa de câncer de colo de útero é a infecção por papilomavírus humano (HPV). O objetivo deste trabalho é investigar o papel do uso de códons sinônimos na evolução do papilomavírus humano e seu hospedeiro, utilizando as diferentes variantes virais, visando identificar possíveis padrões adaptativos associados à sua patogenicidade. Foram calculados para este estudo a utilização relativa de códons sinônimos (RSCU), número efetivo de códons (ENC), análise de componentes principais (PCA), análise de correlação e análise de agrupamentos. Foi verificado um viés na utilização dos códons em HPV, evidenciando que a frequência de códons sinônimos não é a mesma para o mesmo aminoácido. Os diferentes gêneros de HPV mostram uma utilização de códons semelhantes entre si, porém não coincidente com a do hospedeiro, corroborando com resultados de pesquisas de outros autores. O gênero Alphapapillomavirus apresentou uso de códons diferente dos demais gêneros. Esse gênero possui os tipos de HPV de alto risco, e essa utilização diferenciada de códons pode estar relacionada com a sua adaptação ao hospedeiro, permitindo aos vírus de Alphapapillomavirus graus maiores de patogenicidade. Outros estudos ainda precisam ser realizados para que se determine as possíveis relações entre os padrões de uso de códons em HPV, sua diversificação, e a associação com os diferentes níveis de patogenicidade dos diferentes tipos e variantes virais.Universidade Federal de SergipeDBI - Departamento de Biologia – São Cristóvão – Presencialreponame:Repositório Institucional da UFSinstname:Universidade Federal de Sergipe (UFS)instacron:UFSinfo:eu-repo/semantics/openAccessTEXTTatiane_Emiliano_Santos.pdf.txtTatiane_Emiliano_Santos.pdf.txtExtracted texttext/plain72553https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/8722/3/Tatiane_Emiliano_Santos.pdf.txt4cdeebb3135e59b16c9e1b7595f35776MD53THUMBNAILTatiane_Emiliano_Santos.pdf.jpgTatiane_Emiliano_Santos.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1241https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/8722/4/Tatiane_Emiliano_Santos.pdf.jpg857fa07d8473c6994e6e33d39a0a80f3MD54LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81475https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/8722/1/license.txt098cbbf65c2c15e1fb2e49c5d306a44cMD51ORIGINALTatiane_Emiliano_Santos.pdfTatiane_Emiliano_Santos.pdfapplication/pdf4335110https://ri.ufs.br/jspui/bitstream/riufs/8722/2/Tatiane_Emiliano_Santos.pdff8070bc0f66e0fa4b5e35803cd54ce38MD52riufs/87222018-08-17 12:25:56.997oai:ufs.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://ri.ufs.br/oai/requestrepositorio@academico.ufs.bropendoar:2018-08-17T15:25:56Repositório Institucional da UFS - Universidade Federal de Sergipe (UFS)false
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