Variabilidade genética de populações de Drosophila capricorni oriundas de unidades de conservação de Santa Satarina usando o marcador COI

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Salgueiro, Ane Caroline Lino
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSC
Texto Completo: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/187707
Resumo: TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.
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spelling Variabilidade genética de populações de Drosophila capricorni oriundas de unidades de conservação de Santa Satarina usando o marcador COIGenética de populaçõesDrosophilamtDNABiodiversidade genéticaTCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.Drosophila capricorni pertence a família Drosophilidae, subgênero Sophophora, grupo willistoni. Para acessar a variabilidade genética de três populações de D. capricorni em Santa Catarina foi utilizado o gene mitocondrial citocromo oxidase I (COI). As coletas foram realizadas em três unidades de conservação: Reserva Biológica Estadual da Canela Preta, Reserva Biológica Estadual do Aguaí e o Parque Estadual da Serra do Tabuleiro. A captura das moscas foi realizada utilizando armadilhas de frutas fermentadas e sua identificação foi realizada a partir de caracteres morfológicos. Foram sequenciados 663 pb do gene mtCOI, de 32 indivíduos machos (9 Aguaí, 13 Canela preta e 12 Tabuleiro). Foram realizadas análises de diversidade genética, testes de neutralidade, cálculos de Fst, teste de seleção, montagem de rede de haplótipos através do uso de diferentes softwares. Foram observados 19 haplótipos e 20 sítios polimórficos nas três populações. O maior valor de π encontrado foi para a população Canela Preta, que obteve o maior número de haplótipos. Os cálculos de Fst apresentaram um único valor significativo, entre as populações Tabuleiro e Aguaí. A ação antrópica e atividade siderúrgica na região, pode estar levando a uma diminuição nos corredores ecológicos que ligam essas populações de drosofilídeos. Os testes de neutralidade realizados apresentaram em sua maioria valores negativos, mas somente os testes Fs de Fu e R2 apresentaram desvios significativos nas populações Aguaí e Canela Preta e quando considerando as três populações juntas indicando um possível evento de expansão populacional ou ação da seleção purificadora. O resultado do teste de seleção mostrou que grande parte dos códons dessa sequência está sob forte influência da seleção purificadora.Drosophila capricorni belongs to the family Drosophilidae, ss Sophophora subgenus, willistoni group. In order to access the genetic variability of three populations of D. capricorni the mitochondrial gene, cytochrome oxidase I (COI), was used. The collections were carried out in three conservation units: the Canela Preta State Biological Reserve, the Aguaí State Biological Reserve and the Serra do Tabuleiro State Park. Flies were captured using fermented fruit traps and their identification was performed from morphological characters. A fragment of 663 bp was analyzed from 32 males (9 from Aguaí, 13 from Canela Preta and 12 from Tabuleiro). Genetic diversity analysis, neutrality tests, Fst calculation, selection test and construction of a haplotype network were performed using different software. We found 19 haplotypes and 20 polymorphic sites among the three populations. The highest value of π was found for the Canela Preta population, which obtained the highest number of haplotypes. The Fst presenting a significant value occurred only between the Tabuleiro and Aguaí populations. Anthropogenic and steel mining in the region near UC Aguaí may be leading to a decrease in the ecological corridors linking these drosophilids populations. The neutrality tests presented mostly negative values, but only the Fu’s Fs and R2 showed significant deviations in the Aguaí and Canela Preta populations and when considering the three populations together. These results may have been caused by a possible event of local population expansion or by the action of the purifying selection. The result of the selection test showed that a large part of the codons of this sequence is under strong influence of the purifying selection.Florianópolis, SC.Silva, Norma Machado daUniversidade Federal de Santa CatarinaSalgueiro, Ane Caroline Lino2018-07-04T18:50:07Z2018-07-04T18:50:07Z2018-06-19info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisxx f.application/pdfhttps://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/187707porreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSCinfo:eu-repo/semantics/openAccess2018-07-04T18:50:07Zoai:repositorio.ufsc.br:123456789/187707Repositório InstitucionalPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestopendoar:23732018-07-04T18:50:07Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
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