Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Cunha, César
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFSC
Texto Completo: https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/253510
Resumo: TCC (graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Ciências Biológicas.
id UFSC_c51ed7208d55de45bd629f06803d9788
oai_identifier_str oai:repositorio.ufsc.br:123456789/253510
network_acronym_str UFSC
network_name_str Repositório Institucional da UFSC
repository_id_str 2373
spelling Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)NeuroproteçãoGuanosinaCanal BKTCC (graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Ciências Biológicas.Com o aumento da longevidade humana, as doenças neurodegenerativas (DNs) vêm se tornando mais prevalentes, tornando urgente o estudo dos mecanismos fisiológicos envolvidos e a busca por moléculas neuroprotetoras. A guanosina (GUO) é uma molécula endógena e no sistema nervoso central a sua liberação aumenta durante eventos patológicos. GUO possui efeitos neuroprotetores em modelos in vivo e in vitro de DNs como as doenças de Alzheimer, Parkinson, epilepsia, isquemia e depressão. Porém, o mecanismo deste efeito ainda não está elucidado e uma das hipóteses é a atuação da GUO ativando o canal de potássio de alta condutância dependente de cálcio (BK). GUO promove a abertura do canal BK quando adicionada no meio extracelular e seu efeito neuroprotetor é abolido por bloqueadores do BK. O BK é uma proteína formada por um tetrâmero de subunidades-α que pode ou não possuir subunidades auxiliares (beta). Diversas moléculas modulam a atividade deste canal, porém o sítio de interação da maioria desses ligantes é desconhecido. Para corroborar a evidência da interação molecular entre GUO e BK e buscar um possível sítio de interação, este trabalho usou as seguintes análises in silico: identificação de possíveis cavidades hidrofóbicas na estrutura cristalizada do BK humano em suas conformações aberta e fechada, com e sem a subunidade auxiliar β4; simulação da interação da GUO nestas cavidades por molecular docking, analisando os aminoácidos envolvidos nesta interação; e alinhamento da sequência de aminoácidos do BK humano com outras espécies. A mesma análise de interação foi feita com dois ativadores sintéticos do BK, que também não se conhece o sítio de interação, o NS1619 e o NS11021. Foram encontradas possíveis cavidades hidrofóbicas que poderiam ser sítios de interação e a análise de docking encontrou uma conformação com energia livre baixa (alta afinidade) comparada às obtidas com ligantes naturais para todas as conformações, indicando que essa é uma interação possível. Foram encontrados também os seguintes possíveis aminoácidos-chave para esta interação: ASN136, PHE144, TYR145, LEU150, VAL193 e SER202. O alinhamento de aminoácidos do BK de diferentes espécies mostrou que estes aminoácidos são conservados entre os vertebrados e, portanto, podem ser alvos de estudos futuros que confirmem os resultados deste trabalho. Conclui-se que há um possível sítio de interação para GUO, NS1619 e NS11021 na porção extracelular do canal e foram destacados aminoácidos essenciais para esta interação, sendo que sua conservação sugere potenciais alvos para futuras investigações.Florianópolis, SC.Tasca, Carla InêsMaciel, Guilherme RazzeraUniversidade Federal de Santa Catarina.Cunha, César2023-12-19T14:21:41Z2023-12-19T14:21:41Z2023-11-29info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis45 f.application/pdfhttps://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/253510Open Access.info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFSCinstname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)instacron:UFSC2023-12-19T14:21:41Zoai:repositorio.ufsc.br:123456789/253510Repositório InstitucionalPUBhttp://150.162.242.35/oai/requestopendoar:23732023-12-19T14:21:41Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)false
dc.title.none.fl_str_mv Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)
title Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)
spellingShingle Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)
Cunha, César
Neuroproteção
Guanosina
Canal BK
title_short Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)
title_full Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)
title_fullStr Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)
title_full_unstemmed Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)
title_sort Análise computacional da interação molecular entre o nucleosídeo neuroprotetor guanosina e o canal de potássio de alta condutância ativado por cálcio (BK)
author Cunha, César
author_facet Cunha, César
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Tasca, Carla Inês
Maciel, Guilherme Razzera
Universidade Federal de Santa Catarina.
dc.contributor.author.fl_str_mv Cunha, César
dc.subject.por.fl_str_mv Neuroproteção
Guanosina
Canal BK
topic Neuroproteção
Guanosina
Canal BK
description TCC (graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Ciências Biológicas.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-12-19T14:21:41Z
2023-12-19T14:21:41Z
2023-11-29
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/253510
url https://repositorio.ufsc.br/handle/123456789/253510
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Open Access.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Open Access.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 45 f.
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Florianópolis, SC.
publisher.none.fl_str_mv Florianópolis, SC.
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFSC
instname:Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron:UFSC
instname_str Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
instacron_str UFSC
institution UFSC
reponame_str Repositório Institucional da UFSC
collection Repositório Institucional da UFSC
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFSC - Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1808651909844697088