Prevalência e contexto genético de 16S rRNA metiltransferases em bacilos gram-negativos isolados no complexo Hospital São Paulo

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Corsi, Dandara Cassu [UNIFESP]
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
Texto Completo: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=3900270
http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/47712
Resumo: Os aminoglicosídeos têm sido cada vez mais utilizados no tratamento de infecções por bactérias resistentes às demais classes de antimicrobianos. A produção de 16S rRNA metiltranferases vem sendo um motivo preocupação, pois são responsáveis aos altos níveis de resistência a esta classe de antimicrobiano, limitando ainda mais as opções teurapêuticas. Objetivo: Caracterizar as amostras bacterianas gram-negativas produtoras de 16S rRNA metiltransferases. Metodologia: Foram analisadas todas as amostras bacterianas gram-negativas isoladas no Complexo Hospital São Paulo/UNIFESP no período de outubro a dezembro de 2014. Os isolados que apresentaram redução da sensibilidade aos aminoglicosídeos pelo sistema Phoenix ou por técnicas manuais foram submetidos à confirmação deste fenótipo pela técnica de ágar diluição (teste triagem) para amicacina, gentamicina e tobramicina, seguindo os pontos de corte estabelecidos pelo CLSI (2015). As amostras resistentes aos três aminoglicosídeos foram submetidas à reação de PCR para a verificação da presença de 16S rRNA metiltransferases, que posteriormente foram submetidas ao teste de microdiluição em caldo para determinação da CIM às demais classes de antimicrobianos. A avaliação de similaridade genética dos isolados produtores de 16S rRNA metiltransferases foi determinada pela técnica de PFGE. Por se tratar da disseminação de um único clone, foram selecionados apenas dois isolados para a determinação do MLST. Os testes de conjugação e transformação foram realizados neste estudo. Os plasmídeos carreadores de rmtB-1 de três isolados [duas K. pneumoniae, (com e sem blaKPC-2) e o isolado de P. mirabilis] foram sequenciados. Resultados: Dentre as 1248 amostras consecutivas isoladas, 55 foram resistentes aos três aminoglicosídeos testados, sendo que 22 amostras de K. pneumoniae e um isolado de P.mirabilis eram produtores de RmtB-1. Além disso, 4 amostras de P. aeruginosa foram produtoras de RmtD-1. Estes isolados apresentaram CIMS >128 ?L/mL para os aminoglicosídeos. Apenas um isolado de K. pneumoniae (A64.216) e o isolado de P. mirabilis (64.421) foi sensível a maioria dos carbapenêmicos. Os isolados produtores de RmtB-1 foram também positivos para o gene blaCTX-M-1/2, blaSHV, blaTEM. Entretanto, apenas 6 isolados foram positivos para o gene blaCTX-M-14, e apenas 2 isolados foram negativos para blaKPC (um isolado de K. pneumoniae-A64.216 e o isolado de P. mirabilis). O gene blaSPM-1 foi identificado em todos as amostras de P. aeruginosa produtoras de RmtD. Tanto os isolados de K. pneumoniae,quanto os isolados de P. aeruginosa, apresentaram o mesmo perfil clonal. As amostras de K. pneumoniae pertenciam ao ST258. Não foi obtido transconjugante ou transformante dos isolados testados. De acordo com os sequenciamentos dos plasmídeos, o gene rmtB-1 está inserido em transposon, flanqueado pelo gene blaTEM, ao lado de um integron de classe 1. Conclusões: A prevalência de isolados gram-negativos carreadores de genes codificadores de metiltransferases no Complexo do Hospital São Paulo é baixa. O sequenciamento dos plasmídeos elucidou a localização e o contexto no qual rmtB-1 encontra-se inserido, bem como a de outros genes de resistência e virulência, além dos genes necessários para a replicação e transferência. Os plasmídeos de K. pnuemoniae foram classificados como IncFIIk. O plasmídeo do P. mirabilis foi considerado como não-tipável e o pasmídeo do blaKPC-2 apresentou um resultado duvidoso.
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A produção de 16S rRNA metiltranferases vem sendo um motivo preocupação, pois são responsáveis aos altos níveis de resistência a esta classe de antimicrobiano, limitando ainda mais as opções teurapêuticas. Objetivo: Caracterizar as amostras bacterianas gram-negativas produtoras de 16S rRNA metiltransferases. Metodologia: Foram analisadas todas as amostras bacterianas gram-negativas isoladas no Complexo Hospital São Paulo/UNIFESP no período de outubro a dezembro de 2014. Os isolados que apresentaram redução da sensibilidade aos aminoglicosídeos pelo sistema Phoenix ou por técnicas manuais foram submetidos à confirmação deste fenótipo pela técnica de ágar diluição (teste triagem) para amicacina, gentamicina e tobramicina, seguindo os pontos de corte estabelecidos pelo CLSI (2015). As amostras resistentes aos três aminoglicosídeos foram submetidas à reação de PCR para a verificação da presença de 16S rRNA metiltransferases, que posteriormente foram submetidas ao teste de microdiluição em caldo para determinação da CIM às demais classes de antimicrobianos. A avaliação de similaridade genética dos isolados produtores de 16S rRNA metiltransferases foi determinada pela técnica de PFGE. Por se tratar da disseminação de um único clone, foram selecionados apenas dois isolados para a determinação do MLST. Os testes de conjugação e transformação foram realizados neste estudo. Os plasmídeos carreadores de rmtB-1 de três isolados [duas K. pneumoniae, (com e sem blaKPC-2) e o isolado de P. mirabilis] foram sequenciados. Resultados: Dentre as 1248 amostras consecutivas isoladas, 55 foram resistentes aos três aminoglicosídeos testados, sendo que 22 amostras de K. pneumoniae e um isolado de P.mirabilis eram produtores de RmtB-1. Além disso, 4 amostras de P. aeruginosa foram produtoras de RmtD-1. Estes isolados apresentaram CIMS >128 ?L/mL para os aminoglicosídeos. Apenas um isolado de K. pneumoniae (A64.216) e o isolado de P. mirabilis (64.421) foi sensível a maioria dos carbapenêmicos. Os isolados produtores de RmtB-1 foram também positivos para o gene blaCTX-M-1/2, blaSHV, blaTEM. Entretanto, apenas 6 isolados foram positivos para o gene blaCTX-M-14, e apenas 2 isolados foram negativos para blaKPC (um isolado de K. pneumoniae-A64.216 e o isolado de P. mirabilis). O gene blaSPM-1 foi identificado em todos as amostras de P. aeruginosa produtoras de RmtD. Tanto os isolados de K. pneumoniae,quanto os isolados de P. aeruginosa, apresentaram o mesmo perfil clonal. As amostras de K. pneumoniae pertenciam ao ST258. Não foi obtido transconjugante ou transformante dos isolados testados. De acordo com os sequenciamentos dos plasmídeos, o gene rmtB-1 está inserido em transposon, flanqueado pelo gene blaTEM, ao lado de um integron de classe 1. Conclusões: A prevalência de isolados gram-negativos carreadores de genes codificadores de metiltransferases no Complexo do Hospital São Paulo é baixa. O sequenciamento dos plasmídeos elucidou a localização e o contexto no qual rmtB-1 encontra-se inserido, bem como a de outros genes de resistência e virulência, além dos genes necessários para a replicação e transferência. Os plasmídeos de K. pnuemoniae foram classificados como IncFIIk. O plasmídeo do P. mirabilis foi considerado como não-tipável e o pasmídeo do blaKPC-2 apresentou um resultado duvidoso.The aminoglycosides have been inscreasingly used in the tretatment of infection caused by resistant bacteria to other classes of antimicrobials. The production of 16S rRNA metyltransferases has been a cause of concern, because they are responsible for high level of resistance to this antimicrobial class, and limiting the tereapeutic options. Objective: The aim of this study was to characterize the presence of genes encoding for 16S rRNA metyltransferases. Methodology: Were recovered all gram-negatives isolated from the Complex Hospital São Paulo/UNIFESP from October to December of 2014.The isolates with a reduced susceptible profile to aminoglycosides by Phoenix or manual techniques were selected for confirmation of susceptibility profile by agar screening by testing amikacin, gentamicin, and tobramicin according to the CLSI guidelines (2015). The presence of genes encoding for 16 rRNA methyltransferases was verified by PCR. Antimicrobial susceptibility profile of isolates possessing 16 rRNA methyltransferases genes was determined by CLSI broth microdilution. Evaluation of genetic similarity of the 16S rRNA methyltransferases isolates was determined by PFGE. Because of the spread of a single clone, only two isolates were evaluated by the MLST. Conjugation and transformation tests were performed in this study. Three plasmids extracted from three isolates [two K. pneumoniae (carrying blaKPC-2 and not carrying blaKPC-2) and a single isolate of P. mirabilis carrying rmtB gene] were sequenced. Results: Among 1248 consecutives isolates, 55 were resistant to the three aminoglycosides tested, in which 22 K. pneumoniae and one P.mirabilis carried rmtB, and four P. aeruginosa possessed rmtD. These isolates showed MICs >128 uL/mL to aminoglycosides. Only one isolate of K. pneumoniae (A64.216) and isolate of P. mirabilis (64.421) were susceptible to most carbapenems. The isolates carrying rmtB were also positive for blaCTX-M-1/2, blaSHV, blaTEM. However, only 6 strains carried blaCTX-M-14. Only two isolates did not encode blaKPC-2 (one isolate of K. pneumoniae-A64.216 and P. mirabilis isolate). The blaSPM-1 gene was identified in all P. aeruginosa possessing rmtD, which exhibited a single PFGE pattern. A single PFGE pattern was observed among K. pneumoniae isolates possessing rmtB, that were classified under ST258. No transconjugants ou transformants were obtained. According to the plasmid DNA sequencing, it was observed that rmtB-1 gene was inserted into transposon, which was flanked by blaTEM-1, and a class1 integron. blaKPC-2 and rmtB- 1 gene were inserted into distinct plasmids in isolated K. pneumoniae A64.477. blaCTX-M-14 gene was inserted in the same plasmid that carried rmtB-1 in the P. mirabilis strain. Conclusions: The prevalence genes encoding 16S rRNA methyltransferases was low among gram- negatives isolated from the Complex Hospital São Paulo. The sequencing of plasmids showed the location and context which is inserted the rmtB-1 gene and the location of other resistance and virulence, as well as replication and transfer genes. The K. pneumoniae plasmids were classified as IncFIIk. The P. mirabilis plasmid was considered as non-typeable and the plasmid blaKPC-2 harboring showed an uncertain result.Dados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2013 a 2016)142 f.porUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Resistência aos aminoglicosídeosMetiltransferasesrmtBBacilos gram-negativosResistance to aminoglycosides6s methyltransferasesrmtBGram-negative bacilliPrevalência e contexto genético de 16S rRNA metiltransferases em bacilos gram-negativos isolados no complexo Hospital São PauloPrevalence and context genetic of 16S rRNA methyltransferases producing isoleted from the complex Hospital São Pauloinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPSão Paulo, Escola Paulista de Medicina (EPM)InfectologiaCiências da saúdeMedicinaORIGINALDandara Cassu Corsi - PDF A.pdfDandara Cassu Corsi - PDF A.pdfDissertação de mestradoapplication/pdf1956867${dspace.ui.url}/bitstream/11600/47712/1/Dandara%20Cassu%20Corsi%20-%20PDF%20A.pdf3f50df4cc1a5fa43f411e01a6eaa333aMD51open access11600/477122023-07-25 10:59:33.946open accessoai:repositorio.unifesp.br:11600/47712Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestopendoar:34652023-07-25T13:59:33Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false
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