Avaliação por Ngs das mutações de resistência nos genes da integrase, protease e transcriptase reversa do HIV-1 em indivíduos em falha virológica

• Autor(a) principal: Duro, Rodrigo Lopes Sanz [UNIFESP]
• Data de Publicação: 2017
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
• Texto Completo: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5010435; http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/50707
• topic: Resistência; Medicamento de resgate; Mutações; NGS; HIV-1; Infecções por HIV; Antirretrovirais; Análise de sequência

Introdução: Com a introdução da Terapia Antirretroviral houve uma melhora na qualidade de vida nos indivíduos portadores do Vírus da Imunodeficiência Humana. Porém a pressão seletiva exercida por estes medicamentos teve um papel negativo no tratamento destes indivíduos, uma vez que, poderiam selecionar cepas virais resistentes que levariam a falha virológica. Com isto houve a necessidade do desenvolvimento de novos medicamentos, que apresentassem uma melhor barreira genética, capazes de suportar um maior número de mutações, estes medicamentos hoje são utilizados na Terapia de resgate. Outro fator muito discutido são as mutações minoritárias, não detectadas pelo método de sequenciamento de Sanger, e que podem vir a interferir durante o tratamento do individuo. Por este motivo o uso do NGS é importante uma vez que apresenta alta cobertura sendo capaz de detectar estas mutações minoritárias. Deste modo podemos avaliar a presença de mutações majoritárias e minoritárias para os medicamentos de terceira geração empregados na terapia de resgate. Objetivo: Avaliar a ocorrência de mutações de resistência nos genes da Integrase, Protease e Transcriptase Reversa do HIV-1 para os medicamentos de resgate Darunavir, Etravirina e Raltegravir em amostras de pacientes HIV positivos, em falha ao TARV, na cidade de São Paulo. Métodos: Foram analisados 147 indivíduos em falha terapêutica, com CD4 <500 cél/mm3, CV >3,7 log/mL, idade ≥18 anos. Reação em Cadeia da Polimerase foi realizada para as regiões da Transcriptase Reversa, Protease e Integrase e foi realizado o Sequenciamento Paralelo Massivo destas amostras. Resultados: Foram encontradas mutações para região da Integrase (S147G, N155H e Q148H), para região da Protease associado ao Darunavir (I47V, I54L, I84V, L33F, I50V, L33F, V32I, I54M e L76V) e para região da Transcriptase Reversa associado à Etravirina (L100I, K101P, M230L, Y181C e G190E). Para mutações minoritárias foram encontradas para região da Protease (M46I, I47V, F53L, I54L, V82A, I84V), para região da Transcriptase Reversa (M41l, K65R, D67N D67G, D67E, K70R, K70E, L74I, V75A, F77L, M184V, T215Y, K219N, L100I, K101P, K103S, Y188L, Y188S, P225H). Conclusão: Por terem sido encontradas mutações de resistência associadas à região da Integrase este pode ser um dos poucos casos de resistência transmitida identificados até hoje. Os indivíduos deste estudo por serem multiexperimentados apresentaram uma grande presença de mutações que diminuiriam a susceptibilidade aos medicamentos Darunavir e Etravirina mesmo estes apresentando uma maior barreira genética em relação aos outros medicamentos. As mutações minoritárias identificadas neste estudo demonstraram ser uma preocupação uma vez que foram identificadas mutações que interfeririam nos medicamentos de resgate além de terem sido observadas a presença de algumas TAMs.