Investigação de rearranjos cromossômicos no gene BRAF em carcinomas pediátricos da tiroide

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sisdelli, Luiza de Mello Oliveira [UNIFESP]
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
Texto Completo: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=5022141
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Resumo: A incidência de carcinoma da tiroide, principalmente do subtipo histológico papilífero (CPT), aumentou na maioria das populações, incluindo pacientes pediátricos. As alterações genéticas que conduzem à ativação da via MAPK são altamente prevalentes no CPT. Tem sido demonstrado que a mutação BRAF V600E é a mais frequente no CPT adulto (~40%). No entanto, essa alteração é raramente identificada no CPT pediátrico. Em contraste, rearranjos cromossômicos envolvendo BRAF têm sido identificados, principalmente,no CPT pediátrico exposto à radiação. Nosso grupo descreveu a presença da fusão AGK/BRAF pela primeira vez em CPT pediátrico esporádico, sugerindo que rearranjos neste gene podem ser um mecanismo alternativo de ativação alterada de BRAF em casos pediátricos. Desse modo, o objetivo deste trabalho foi investigar rearranjos envolvendo BRAF na faixa etária pediátrica. Na primeira parte do estudo, realizamos a investigação em 22 CPTs pediátricos, por FISH break-apart (FISH BA), 5’RACE e sequenciamento. A técnica de FISH BA revelou quatro casos positivos para a quebra no gene BRAF, nas proporções de 10%, 11%, 17% e 36% das células do tumor primário portando o rearranjo. A partir de 5’RACE e sequenciamento, foi possível identificar o rearranjo AGK/BRAF em uma delas. Na segunda parte do estudo, a casuística foi aumentada para 52 pacientes. Foi realizada uma triagem para a fusão AGK/BRAF por RT-PCR. A mutação BRAF V600E foi investigada por PCR e sequenciamento. A fusão AGK/BRAF foi identificada em 27% dos casos e associada com pacientes mais jovens, e a mutação BRAF V600E, em 8% e associada com pacientes mais velhos. CPTs com alterações em BRAF tendem a ter um comportamento biológico mais agressivo.
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Em contraste, rearranjos cromossômicos envolvendo BRAF têm sido identificados, principalmente,no CPT pediátrico exposto à radiação. Nosso grupo descreveu a presença da fusão AGK/BRAF pela primeira vez em CPT pediátrico esporádico, sugerindo que rearranjos neste gene podem ser um mecanismo alternativo de ativação alterada de BRAF em casos pediátricos. Desse modo, o objetivo deste trabalho foi investigar rearranjos envolvendo BRAF na faixa etária pediátrica. Na primeira parte do estudo, realizamos a investigação em 22 CPTs pediátricos, por FISH break-apart (FISH BA), 5’RACE e sequenciamento. A técnica de FISH BA revelou quatro casos positivos para a quebra no gene BRAF, nas proporções de 10%, 11%, 17% e 36% das células do tumor primário portando o rearranjo. A partir de 5’RACE e sequenciamento, foi possível identificar o rearranjo AGK/BRAF em uma delas. Na segunda parte do estudo, a casuística foi aumentada para 52 pacientes. Foi realizada uma triagem para a fusão AGK/BRAF por RT-PCR. A mutação BRAF V600E foi investigada por PCR e sequenciamento. A fusão AGK/BRAF foi identificada em 27% dos casos e associada com pacientes mais jovens, e a mutação BRAF V600E, em 8% e associada com pacientes mais velhos. CPTs com alterações em BRAF tendem a ter um comportamento biológico mais agressivo.The incidence of thyroid carcinoma, mainly of the papillary histological subtype (PTC), has increased in most populations, including pediatric patients. Genetic alterations leading to the MAPK pathway activation are highly prevalent in PTC. It has been demonstrated that BRAF V600E mutation is the most prevalent alteration found in sporadic PTC in adult (~40%). However, this event is rarely identified in pediatric PTC. In contrast, chromosomal rearrangements involving BRAF have been identified, mainly in radiation-exposed pediatric PTC. Our group described, for the first time, the presence of AGK-BRAF fusion in sporadic pediatric PTC. This suggests that it might be an alternative mechanismof aberrant BRAF activation in pediatric cases. Thus, the objective of this work was to investigate rearrangements involving BRAF. In the first part of the study, we performed the investigation on 22 pediatric PTC, by FISH break-apart (FISH BA), 5'RACE and sequencing. By FISH BA, it was revealed four positive cases for the BRAF gene breakage, with 10%, 11%, 17% and 36% of the primary tumor cells carrying the rearrangement. Using 5'RACE and sequencing techniques, it was possible to identify the AGK/BRAF rearrangement in one of them. In the second part of the study, we expanded our analysis to 52 pediatric PTC. AGK/BRAF fusion was investigated by RT-PCR and BRAF V600E mutation by PCR and sequencing methodologies. The AGK/BRAF fusion was identified in 27% of the cases and associated with younger ages while BRAF V600E mutation was found in 8% and associated with older ages. PTC with BRAF alterations tends to have a more aggressive biological behavior.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Dados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2017)158 f.porUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Câncer da tiroideGenética do câncerMutaçõesRearranjos cromossômicosCancer of the thyroidCancer geneticsMutationsChromosomal rearrangementsInvestigação de rearranjos cromossômicos no gene BRAF em carcinomas pediátricos da tiroideInvestigation of chromosomal rearrangements in BRAF gene in pediatric thyroid carcinomainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPEscola Paulista de Medicina (EPM)Biologia estrutural e funcionalGenéticaGenética e Epigenética do CâncerORIGINALLuiza de Mello Oliveira Sisdelli PDF A.pdfLuiza de Mello Oliveira Sisdelli PDF A.pdfDissertação de mestradoapplication/pdf3415833${dspace.ui.url}/bitstream/11600/50209/1/Luiza%20de%20Mello%20Oliveira%20Sisdelli%20PDF%20A.pdf966efe619987ed4511a092b69dc088cdMD51open access11600/502092023-09-29 12:49:46.021open accessoai:repositorio.unifesp.br:11600/50209Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestopendoar:34652023-09-29T15:49:46Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false
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