Identificação de um novo elemento repetitivo de Trypanosoma cruzi que apresenta inserção sítio-específica no genoma

• Autor(a) principal: Souza, Renata Torres [UNIFESP]
• Data de Publicação: 2007
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
• Texto Completo: http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/39421
• topic: Trypanosoma cruzi; Elemento repetitivo; Inserção sítio-específica; Organização genômica

Nós identificamos em T. cruzi uma nova família de retroelementos sítioespecífico chamada TcTREZO (Trypanosoma cruzi Tandem Repetitive Element ZO). O elemento TcTREZO é uma repetição de natureza composta sendo constituído por seqüências presentes em outras localidades do genoma não associadas ao elemento. Análise da distribuição do TcTREZO no genoma indica claramente que o elemento está inserido em sítios específicos do genoma. A maioria dos elementos TcTREZO é flanqueada por seqüências conservadas. A região 5´ do elemento é flanqueada por uma seqüência conservada de 68-pb e a região 3´ por um domínio de aproximadamente 500 pb cujas extremidades não são muito bem definidas. Análises de hibridação em “northern blot” e amplificação por RT-PCR indicam a presença de transcritos TcTREZO poliadenilados cujo tamanho (1,6 kb) corresponde ao tamanho do elemento completo. Também foram detectados transcritos de ~ 0,2 kb derivados de uma pequena região do elemento TcTREZO. O número de cópias do elemento foi estimado como sendo de ~ 1800 cópias por genoma haplóide. TcTREZO parece ter sido formado por inserção de seqüências em um elemento progenitor. Uma vez associadas entre si, essas foram amplificadas com sucesso gerando um novo elemento que representa ~ 5 % do genoma de T. cruzi. TcTREZO poderia ter sido originado por um único evento de inserção após o qual o aumento do número de cópias teria ocorrido por “crossing-over” desigual ou conversão gênica. O fato de TcTREZO ser encontrado apenas em T. cruzi sugere que ele possa ter tido algum papel na especiação deste parasita por amplificação e distribuição no genoma. TcTREZO insere-se em sítios específicos, sugerindo que uma endonuclease específica pode ser a responsável por sua inserção em sítios únicos do genoma.