Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Natália Maria [UNIFESP]
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
Texto Completo: https://repositorio.unifesp.br/xmlui/handle/11600/62540
Resumo: Os hidrocarbonetos são compostos químicos encontrados no meio ambiente, sendo provenientes da combustão incompleta da matéria orgânica e de atividades antropogênicas oriundas da exploração de petróleo, rejeitos de indústrias petroquímicas, postos de gasolina e acidentes ambientais. Além de serem recalcitrantes, alguns possuem efeitos carcinogênicos e mutagênicos, sendo considerados poluentes tóxicos e prejudiciais à saúde humana e ao meio ambiente. As actinobactérias são ubiquitárias e os gêneros Gordonia e Mycolicibacterium têm sido foco de estudos por possuírem relatos de isolados com potencial para degradação de compostos xenobióticos. Os clusters gênicos alk e CYP153 são descritos principalmente como responsáveis pela degradação de alcanos em diversos gêneros bacterianos. Já para a degradação microbiana de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (HPAs) ocorrem pela ação de múltiplos genes de dioxigenases (nid) localizados em uma ilha genômica também denominada região A. Deste modo, este trabalho investigou a degradação de n-hexadecano por cromatografia a gás acoplada a espectrometria de massas (CG-EM) e a presença de genes alk e CYP153 nos genomas de dois isolados do gênero Gordonia: G. paraffinivorans (MTZ052) e G. sihwensis (MTZ096). Investigou também a presença de genes envolvidos na degradação de HPAs nos genomas de cinco isolados de Mycolicibacterium austroafricanum, além da sua capacidade de degradação de pireno por CG-EM. O isolado MTZ052 apresentou apenas o cluster gênico CYP153 e uma taxa de degradação de n-hexadecano de 86%. Já o isolado MTZ096 apresentou em seu genoma os dois clusters gênicos (alk e CYP153) com uma taxa de degradação de 100%, indicando que a degradação de n-hexadecano foi mais efetiva pela ação dos dois sistemas. Os resultados de CG-EM mostraram que os isolados M. austroafricanum (MYC038 e MYC040) apresentaram degradação de 96% e 88% de pireno, respectivamente, em 7 dias de incubação. Interessantemente, as análises genômicas mostraram que estes isolados não possuem a ilha genômica contendo os genes descritos como degradadores de HPA.
id UFSP_99006889b793892f00868a3c7a85915f
oai_identifier_str oai:repositorio.unifesp.br:11600/62540
network_acronym_str UFSP
network_name_str Repositório Institucional da UNIFESP
repository_id_str 3465
spelling Silva, Natália Maria [UNIFESP]http://lattes.cnpq.br/7929098887276347http://lattes.cnpq.br/6723968833615135Niero, Cristina Viana [UNIFESP]Diadema2022-01-13T18:22:23Z2022-01-13T18:22:23Z2021-12-17https://repositorio.unifesp.br/xmlui/handle/11600/62540Os hidrocarbonetos são compostos químicos encontrados no meio ambiente, sendo provenientes da combustão incompleta da matéria orgânica e de atividades antropogênicas oriundas da exploração de petróleo, rejeitos de indústrias petroquímicas, postos de gasolina e acidentes ambientais. Além de serem recalcitrantes, alguns possuem efeitos carcinogênicos e mutagênicos, sendo considerados poluentes tóxicos e prejudiciais à saúde humana e ao meio ambiente. As actinobactérias são ubiquitárias e os gêneros Gordonia e Mycolicibacterium têm sido foco de estudos por possuírem relatos de isolados com potencial para degradação de compostos xenobióticos. Os clusters gênicos alk e CYP153 são descritos principalmente como responsáveis pela degradação de alcanos em diversos gêneros bacterianos. Já para a degradação microbiana de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (HPAs) ocorrem pela ação de múltiplos genes de dioxigenases (nid) localizados em uma ilha genômica também denominada região A. Deste modo, este trabalho investigou a degradação de n-hexadecano por cromatografia a gás acoplada a espectrometria de massas (CG-EM) e a presença de genes alk e CYP153 nos genomas de dois isolados do gênero Gordonia: G. paraffinivorans (MTZ052) e G. sihwensis (MTZ096). Investigou também a presença de genes envolvidos na degradação de HPAs nos genomas de cinco isolados de Mycolicibacterium austroafricanum, além da sua capacidade de degradação de pireno por CG-EM. O isolado MTZ052 apresentou apenas o cluster gênico CYP153 e uma taxa de degradação de n-hexadecano de 86%. Já o isolado MTZ096 apresentou em seu genoma os dois clusters gênicos (alk e CYP153) com uma taxa de degradação de 100%, indicando que a degradação de n-hexadecano foi mais efetiva pela ação dos dois sistemas. Os resultados de CG-EM mostraram que os isolados M. austroafricanum (MYC038 e MYC040) apresentaram degradação de 96% e 88% de pireno, respectivamente, em 7 dias de incubação. Interessantemente, as análises genômicas mostraram que estes isolados não possuem a ilha genômica contendo os genes descritos como degradadores de HPA.Hydrocarbons are chemical compounds found in the environment and are products of the incomplete combustion of organic material, as well as of human activities involving petrol exploitation, petrochemical industries waste, gas stations, and also environmental disasters. Besides being recalcitrant, some hydrocarbons have carcinogenic and mutagenic effects and are toxic pollutants harmful to human health and the environment as well. Actinobacteria are ubiquitous and the genera Gordonia and Mycolicibacterium have been in focus for their potential to degrade xenobiotic compounds. The gene clusters alk and CYP153 are described for their role in the alkanes biodegradation by several bacterium genera. On the other hand, the microbial degradation of polycyclic aromatic hydrocarbons (PAH) is a result of the action of multiple dioxygenases genes (nid) which are localized in a genomic island denominate region A. As so, this work evaluated n-hexadecane degradation by Gas Chromatography coupled to Mass Spectrometry (GC-MS) and the presence of alk and CYP153 genes in the genomes of two Gordonia isolates, G. paraffinivorans (MTZ052) and G. sihwensis (MTZ096). Besides, nid genes were also searched in five Mycolicibacterium austroafricanum isolates and their capacity of pyrene degradation were evaluated by GC-MS. The MTZ052 isolate presented only the CYP153 gene cluster and an n-hexadecane degradation index of 86%, while the MTZ096 possessing alk and CYP153 clusters showed a 100% degradation index meaning that both clusters might play a more effective role in the n-hexadecane biodegradation. The GC-MS analysis showed pyrene degradation indexes of 96% and 88% by the isolates M. austroafricanum MYC038 and MYC040 respectively, in seven days incubation period. Interestingly, the genomic analyses of these isolates did not detect the genomic island harboring the genes involved in PAH biodegradation.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)CNPq: 406710/2018-0FAPESP 2019/141374107 f.porUniversidade Federal de São PauloMycobacteriumActinobacteriasalkCYP153DioxigenasesAnálise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPInstituto de Ciências Ambientais, Químicas e Farmacêuticas (ICAQF)Biologia QuímicaBiologia QuímicaBiologia Química em Modelos CelularesORIGINALTese_final.pdfTese_final.pdfTese de Doutoradoapplication/pdf5655993${dspace.ui.url}/bitstream/11600/62540/1/Tese_final.pdf5a82b59a7fafbd1b144adae1c75708f8MD51open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-85893${dspace.ui.url}/bitstream/11600/62540/2/license.txt0d558a47b7cbf57ce5b812be7e33fe44MD52open accessTEXTTese_final.pdf.txtTese_final.pdf.txtExtracted texttext/plain151184${dspace.ui.url}/bitstream/11600/62540/6/Tese_final.pdf.txt0f8f692b10b19532cff3c30335197cabMD56open accessTHUMBNAILTese_final.pdf.jpgTese_final.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg4184${dspace.ui.url}/bitstream/11600/62540/8/Tese_final.pdf.jpgdff61ef129edd5808bb18d837bc07316MD58open access11600/625402023-05-21 01:24:15.321open accessoai:repositorio.unifesp.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestopendoar:34652023-05-21T04:24:15Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos
title Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos
spellingShingle Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos
Silva, Natália Maria [UNIFESP]
Mycobacterium
Actinobacterias
alk
CYP153
Dioxigenases
title_short Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos
title_full Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos
title_fullStr Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos
title_full_unstemmed Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos
title_sort Análise química e genômica de isolados dos gêneros Gordonia e Mycolicibacterium com capacidade de biotransformação de hidrocarbonetos
author Silva, Natália Maria [UNIFESP]
author_facet Silva, Natália Maria [UNIFESP]
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/7929098887276347
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6723968833615135
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Natália Maria [UNIFESP]
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Niero, Cristina Viana [UNIFESP]
contributor_str_mv Niero, Cristina Viana [UNIFESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Mycobacterium
Actinobacterias
alk
CYP153
Dioxigenases
topic Mycobacterium
Actinobacterias
alk
CYP153
Dioxigenases
description Os hidrocarbonetos são compostos químicos encontrados no meio ambiente, sendo provenientes da combustão incompleta da matéria orgânica e de atividades antropogênicas oriundas da exploração de petróleo, rejeitos de indústrias petroquímicas, postos de gasolina e acidentes ambientais. Além de serem recalcitrantes, alguns possuem efeitos carcinogênicos e mutagênicos, sendo considerados poluentes tóxicos e prejudiciais à saúde humana e ao meio ambiente. As actinobactérias são ubiquitárias e os gêneros Gordonia e Mycolicibacterium têm sido foco de estudos por possuírem relatos de isolados com potencial para degradação de compostos xenobióticos. Os clusters gênicos alk e CYP153 são descritos principalmente como responsáveis pela degradação de alcanos em diversos gêneros bacterianos. Já para a degradação microbiana de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos (HPAs) ocorrem pela ação de múltiplos genes de dioxigenases (nid) localizados em uma ilha genômica também denominada região A. Deste modo, este trabalho investigou a degradação de n-hexadecano por cromatografia a gás acoplada a espectrometria de massas (CG-EM) e a presença de genes alk e CYP153 nos genomas de dois isolados do gênero Gordonia: G. paraffinivorans (MTZ052) e G. sihwensis (MTZ096). Investigou também a presença de genes envolvidos na degradação de HPAs nos genomas de cinco isolados de Mycolicibacterium austroafricanum, além da sua capacidade de degradação de pireno por CG-EM. O isolado MTZ052 apresentou apenas o cluster gênico CYP153 e uma taxa de degradação de n-hexadecano de 86%. Já o isolado MTZ096 apresentou em seu genoma os dois clusters gênicos (alk e CYP153) com uma taxa de degradação de 100%, indicando que a degradação de n-hexadecano foi mais efetiva pela ação dos dois sistemas. Os resultados de CG-EM mostraram que os isolados M. austroafricanum (MYC038 e MYC040) apresentaram degradação de 96% e 88% de pireno, respectivamente, em 7 dias de incubação. Interessantemente, as análises genômicas mostraram que estes isolados não possuem a ilha genômica contendo os genes descritos como degradadores de HPA.
publishDate 2021
dc.date.issued.fl_str_mv 2021-12-17
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-01-13T18:22:23Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-01-13T18:22:23Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.unifesp.br/xmlui/handle/11600/62540
url https://repositorio.unifesp.br/xmlui/handle/11600/62540
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 107 f.
dc.coverage.spatial.pt_BR.fl_str_mv Diadema
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Paulo
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Paulo
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNIFESP
instname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
instacron:UNIFESP
instname_str Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
instacron_str UNIFESP
institution UNIFESP
reponame_str Repositório Institucional da UNIFESP
collection Repositório Institucional da UNIFESP
bitstream.url.fl_str_mv ${dspace.ui.url}/bitstream/11600/62540/1/Tese_final.pdf
${dspace.ui.url}/bitstream/11600/62540/2/license.txt
${dspace.ui.url}/bitstream/11600/62540/6/Tese_final.pdf.txt
${dspace.ui.url}/bitstream/11600/62540/8/Tese_final.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 5a82b59a7fafbd1b144adae1c75708f8
0d558a47b7cbf57ce5b812be7e33fe44
0f8f692b10b19532cff3c30335197cab
dff61ef129edd5808bb18d837bc07316
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1802764259569958912