Caracterização genética de rinovírus humano em amostras de populações distintas do Estado de São Paulo
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2012 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UNIFESP |
Texto Completo: | http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/9187 |
Resumo: | Infections caused by Human Rhinoviruses (HRVs) account for 25%-50% of respiratory illnesses among individuals presenting influenza-like illness (ILI). HRVs could be classified in at least three species: HRV-A, HRV-B, and HRV-C. The HRV-C species has frequently been described among children and apparently has led to severe illness resulting in hospitalization; however, the occurrence among adults is unknown. The aim of this study was to assess the clinical presentation and species distribution of HRV infections in different populations during 2001-2005. A total of 682 samples were collected. Subjects consisted of 132 adults from the general community and 198 health-care workers (2001-2003), 242 renaltransplanted outpatients (2002-2004), 61 children with congenital heart disease (2005) and 49 elderly persons from Botucatu city, Sao Paulo, Brazil (2003-2004). Amplification of HRV genes was performed by Reverse Transcriptase – Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and followed by sequencing and phylogenetic analysis. HRV was detected in 24.05% of samples (164/682), 15.2% (20/132) among adults from general community, 29.8% (59/198) among health-care workers, 23.6% (57/242) among renal-transplanted outpatients, 22.9% (14/61) among children with congenital heart disease and 28.6% (14/49) among elderlies. A total of 85.5% (137/164) previously positive HRV samples were sequenced and 79.9% (131/164) were analyzed. We identified 80 isolates (61.0%) of the HRV A species, 22 (16.8%) of the HRV B species and 29 isolates (22.2%) of the HRV C species. High ILI rate (38.9%) was found among HRV infected patients. Logistic regression showed a three-fold increase in prevalence of ILI in individuals with HRV A infection compared with HRV C infected patients. HRV infections caused ILI among non-hospitalized patients. HRV specie A was associated with a disease more intense than a common cold. The dynamics of infection among different species deserve further analysis. |
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Caracterização genética de rinovírus humano em amostras de populações distintas do Estado de São PauloHuman rhinovirus genotyping in samples of distinct populations of São Paulo State, SP, BrazilRhinovirusGenotypeRisk groupsRhinovirusGenótipoGrupos de RiscoInfections caused by Human Rhinoviruses (HRVs) account for 25%-50% of respiratory illnesses among individuals presenting influenza-like illness (ILI). HRVs could be classified in at least three species: HRV-A, HRV-B, and HRV-C. The HRV-C species has frequently been described among children and apparently has led to severe illness resulting in hospitalization; however, the occurrence among adults is unknown. The aim of this study was to assess the clinical presentation and species distribution of HRV infections in different populations during 2001-2005. A total of 682 samples were collected. Subjects consisted of 132 adults from the general community and 198 health-care workers (2001-2003), 242 renaltransplanted outpatients (2002-2004), 61 children with congenital heart disease (2005) and 49 elderly persons from Botucatu city, Sao Paulo, Brazil (2003-2004). Amplification of HRV genes was performed by Reverse Transcriptase – Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) and followed by sequencing and phylogenetic analysis. HRV was detected in 24.05% of samples (164/682), 15.2% (20/132) among adults from general community, 29.8% (59/198) among health-care workers, 23.6% (57/242) among renal-transplanted outpatients, 22.9% (14/61) among children with congenital heart disease and 28.6% (14/49) among elderlies. A total of 85.5% (137/164) previously positive HRV samples were sequenced and 79.9% (131/164) were analyzed. We identified 80 isolates (61.0%) of the HRV A species, 22 (16.8%) of the HRV B species and 29 isolates (22.2%) of the HRV C species. High ILI rate (38.9%) was found among HRV infected patients. Logistic regression showed a three-fold increase in prevalence of ILI in individuals with HRV A infection compared with HRV C infected patients. HRV infections caused ILI among non-hospitalized patients. HRV specie A was associated with a disease more intense than a common cold. The dynamics of infection among different species deserve further analysis.Infecções causadas pelos rinovírus humanos (HRV) são responsáveis por 25-50% das doenças respiratórias entre indivíduos que apresentam doença semelhante à gripe (Influenza-Like Illness - ILI). Os HRVs podem ser classificados em pelo menos três espécies: HRV A, HRV B e HRV C. O HRV C tem sido frequentemente descrito entre crianças aparentemente levando a doenças mais graves e hospitalizações, no entanto a ocorrência dessa espécie entre adultos não é bem conhecida. O objetivo deste estudo foi avaliar a apresentação clínica e a distribuição das espécies de HRV que causam infecções em diferentes populações durante os anos de 2001 a 2005. Um total de 682 amostras foi coletado. As populações estudadas eram compostos por: 132 adultos da comunidade atendidos em pronto socorro e 198 adultos profissionais de saúde (2001-2003); 242 pacientes transplantados renais (2002-2004); 61 crianças portadoras de cardiopatia congênita (2005) e 49 idosos da cidade de Botucatu, São Paulo, Brasil (2003-2004). A amplificação dos genes do HRV foi realizada através da Reação em Cadeia da Polimerase precedida de Transcrição Reversa (RT-PCR), seguida de sequenciamenteo genético e análise filogenética. O HRV foi detectado em 24.05% das amostras (164/682), 15.2% (20/132) em adultos da comunidade, 29.8% (59/198) em profissionais da área da saúde, 23.6% (57/242) em transplantados renais, 22.9% (14/61) em crianças portadoras de cardiopatia congênita e 28.6% (14/49) em idosos. Um total de 85.5% (137/164) das amostras positivas foi seqüenciado, e 79.9% (131/164) foram analisadas através de filogenia. Foram identificadas 80 (61%) das amostras pertencentes à espécie A, 22 (16.8%) a espécie B e 29 (22.2%) pertencentes à espécie C. Foi encontrada uma alta taxa de ILI (38.9%) em pacientes infectados pelo HRV. A regressão logística mostrou um aumento de ILI de três vezes quando os indivíduos estavam infectados com HRV A em comparação ao HRV C. A infecção pelo HRV causa ILI em paciente adultos não hospitalizados. O HRV A foi associado à infecção mais intensa do que o resfriado comum. A dinâmica da infecção entre as diferentes espécies de HRV merece análise no futuro.TEDEBV UNIFESP: Teses e dissertaçõesUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Bellei, Nancy Cristina Junqueira [UNIFESP]Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Watanabe, Aripuanã Sakurada Aranha [UNIFESP]2015-07-22T20:49:42Z2015-07-22T20:49:42Z2012-03-30info:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersion134 p.application/pdfapplication/pdfWATANABE, Aripuanã Sakurada Aranha. Caracterização genética de rinovírus humano em amostras de populações distintas do Estado de São Paulo. 2012. Tese (Doutorado) - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), São Paulo, 2012.Publico-12520a.pdfPublico-12520b.pdfhttp://repositorio.unifesp.br/handle/11600/9187porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESP2024-08-06T14:28:33Zoai:repositorio.unifesp.br/:11600/9187Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestbiblioteca.csp@unifesp.bropendoar:34652024-08-06T14:28:33Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false |
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