Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pereira, Ana Carolina Anauate [UNIFESP]
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
Texto Completo: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=6370655
https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/52313
Resumo: Objetivo: Analisar a expressão de miR1204, miR1205, miR1206, miR1207 e miR1208 em tecido gástrico neoplásico e não neoplásico de pacientes com e sem CG, determinar os genes de referência para essa análise, avaliar o número de cópias gênicas desses miRNA, e associar estas variáveis com os parâmetros clínicos e patológicos dos pacientes com CG. Métodos: A expressão dos miRNA alvos miR1204, miR1205, miR1206, miR12075p, miR12073p, e miR1208 foi avaliada por RTqPCR em 65 pares de amostras neoplásicas (T) e margem adjacente não neoplásicas (A) de pacientes com CG, e 20 amostras de tecido gástrico não neoplásica de indivíduos sem câncer submetidos à endoscopia (C), e determinada pelo método ΔCt. O número de cópias dos genes miR1204, miR1205, miR1207, e miR1208 foi determinado por qPCR em 69 amostras T e com o uso do programa Copy Caller. Resultados: O grupo de amostras C não diferiu em relação ao gênero e idade dos pacientes com CG (p>0,05). Apenas o miR1205 apresentou diferença de expressão entre os grupos de amostra A e C, com maior expressão no grupo A (p=0,02). Não foi observada expressão de miR1204 e miR1206 nas amostras de tecido gástrico analisadas. Foi observada uma correlação positiva e forte entre a expressão de miR12075p e miR1208 (p<0,01, ρ=0,71), e uma correlação positiva, mas fraca, entre a expressão de miR1205 e miR12073p (p=0,04, ρ=0,21). Não foi observada associação entre a expressão de miR1205, miR12075p, miR12073p, e miR1208 e o número de cópias dos seus respectivos genes (p>0,05). O aumento do número de cópias do gene miR1207 foi associado aos tumores localizados na região não cárdia do estômago (p=0,01), e a perda do número de cópias do gene miR1208 à presença de infecção por H. pylori (p=0,01). Conclusões: Não foram encontradas diferenças significantes entre a expressão de miR1205, miR12075p, miR12073p, e miR1208 nas amostras T vs A, e entre T vs C. Porém, o miR1205 apresentou expressão aumentada nas amostras A em relação às C. Os resultados sugerem que o miR1205 parece ter um papel importante no início do desenvolvimento do CG. Além disso, a ausência de associação entre a expressão desses miRNA e o número de cópias gênicas indica que a alteração do número de cópias do miR1205 não seja o mecanismo que leva à sua desregulação nas amostras avaliadas.
id UFSP_c74f58c73cda170953066bbbeb5bb3f1
oai_identifier_str oai:repositorio.unifesp.br:11600/52313
network_acronym_str UFSP
network_name_str Repositório Institucional da UNIFESP
repository_id_str 3465
spelling Pereira, Ana Carolina Anauate [UNIFESP]Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)http://lattes.cnpq.br/0324626849656801Marilia de Arruda Cardoso SmithSmith, Marilia De Arruda Cardoso [UNIFESP]São Paulo2020-03-25T11:43:42Z2020-03-25T11:43:42Z2018-05-24https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=6370655https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/523132018-0242.pdfObjetivo: Analisar a expressão de miR1204, miR1205, miR1206, miR1207 e miR1208 em tecido gástrico neoplásico e não neoplásico de pacientes com e sem CG, determinar os genes de referência para essa análise, avaliar o número de cópias gênicas desses miRNA, e associar estas variáveis com os parâmetros clínicos e patológicos dos pacientes com CG. Métodos: A expressão dos miRNA alvos miR1204, miR1205, miR1206, miR12075p, miR12073p, e miR1208 foi avaliada por RTqPCR em 65 pares de amostras neoplásicas (T) e margem adjacente não neoplásicas (A) de pacientes com CG, e 20 amostras de tecido gástrico não neoplásica de indivíduos sem câncer submetidos à endoscopia (C), e determinada pelo método ΔCt. O número de cópias dos genes miR1204, miR1205, miR1207, e miR1208 foi determinado por qPCR em 69 amostras T e com o uso do programa Copy Caller. Resultados: O grupo de amostras C não diferiu em relação ao gênero e idade dos pacientes com CG (p>0,05). Apenas o miR1205 apresentou diferença de expressão entre os grupos de amostra A e C, com maior expressão no grupo A (p=0,02). Não foi observada expressão de miR1204 e miR1206 nas amostras de tecido gástrico analisadas. Foi observada uma correlação positiva e forte entre a expressão de miR12075p e miR1208 (p<0,01, ρ=0,71), e uma correlação positiva, mas fraca, entre a expressão de miR1205 e miR12073p (p=0,04, ρ=0,21). Não foi observada associação entre a expressão de miR1205, miR12075p, miR12073p, e miR1208 e o número de cópias dos seus respectivos genes (p>0,05). O aumento do número de cópias do gene miR1207 foi associado aos tumores localizados na região não cárdia do estômago (p=0,01), e a perda do número de cópias do gene miR1208 à presença de infecção por H. pylori (p=0,01). Conclusões: Não foram encontradas diferenças significantes entre a expressão de miR1205, miR12075p, miR12073p, e miR1208 nas amostras T vs A, e entre T vs C. Porém, o miR1205 apresentou expressão aumentada nas amostras A em relação às C. Os resultados sugerem que o miR1205 parece ter um papel importante no início do desenvolvimento do CG. Além disso, a ausência de associação entre a expressão desses miRNA e o número de cópias gênicas indica que a alteração do número de cópias do miR1205 não seja o mecanismo que leva à sua desregulação nas amostras avaliadas.Objective: To analyze the expression of miR1204, miR1205, miR1206, miR1207 and miR1208 in neoplastic and nonneoplastic gastric tissue from patients with and without GC, determine the reference genes for this analysis, the number of gene copies of these miRNAs, and to associate these variables with the clinical and pathological parameters of GC patients. Methods: The expression of miR1204, miR1205, miR1206, miR12075p, miR12073p, and miR1208 target miRNA was evaluated by RTqPCR in 65 paired neoplastic (T) and adjacent nonneoplastic (A) samples from patients with GC, and 20 nonneoplastic gastric tissue samples from cancerfree individuals submitted to endoscopy (C), and determined by the ΔCt method. The number of copies of the miR1204, miR1205, miR1207, and miR1208 genes was determined by qPCR in 69 T samples using the Copy Caller program. Results: The C group of samples did not differ in relation to gender and age of CG patients (p> 0.05). Only miR1205 presented different expression between A and C groups, with higher expression in A group (p = 0.02). Expression of miR1204 and miR1206 was not observed in the analyzed gastric tissue samples. A strong positive correlation was observed between miR12075p and miR1208 expression (p <0.01, ρ = 0.71), and a very weak positive correlation between miR1205 and miR12073p expression (p = 0.04, ρ = 0.21). No association was observed between miR1205, miR12075p, miR12073p, and miR1208 expression and the number of copies of their respective genes (p> 0.05). Increased miR1207 gene copy number was associated with tumors located in noncardiac region of the stomach (p = 0.01), and the loss of copies of miR1208 gene was associated with H. pylori infection (p = 0.01). Conclusion: No significant differences were found between miR1205, miR12075p, miR12073p, and miR1208 expression in T vs A and T vs C samples. However, miR1205 showed an increased expression in A samples compared to C samples. The results suggest that miR1205 participates in the beginning of GC development. In addition, the absence of association between these miRNA expressions and the gene copy number indicates that the change in miR1205 copy number is not the mechanism leading to its deregulation in the samples tested.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)Dados abertos - Sucupira - Teses e dissertações (2018)64 f.porUniversidade Federal de São Paulo (UNIFESP)Câncer gástricoMicrornaExpressão gênicaGastric cancerMicrornaGene expressionAnálise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástricoAnalysis of 8q24 microRNA cluster expression and copy number variation in gastric cancer.info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisMestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UNIFESPinstname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)instacron:UNIFESPSão Paulo, Escola Paulista de MedicinaBiologia Estrutural e FuncionalCiências BiológicasORIGINALAna Carolina Anauate Pereira - A.pdfAna Carolina Anauate Pereira - A.pdfDissertação de mestradoapplication/pdf1920107${dspace.ui.url}/bitstream/11600/52313/1/Ana%20Carolina%20Anauate%20Pereira%20-%20A.pdfaef720e6bc8e4d197d54cc20ffa53a26MD51open access11600/523132023-06-28 11:09:46.917open accessoai:repositorio.unifesp.br:11600/52313Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.unifesp.br/oai/requestopendoar:34652023-06-28T14:09:46Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)false
dc.title.pt.fl_str_mv Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico
dc.title.alternative.none.fl_str_mv Analysis of 8q24 microRNA cluster expression and copy number variation in gastric cancer.
title Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico
spellingShingle Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico
Pereira, Ana Carolina Anauate [UNIFESP]
Câncer gástrico
Microrna
Expressão gênica
Gastric cancer
Microrna
Gene expression
title_short Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico
title_full Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico
title_fullStr Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico
title_full_unstemmed Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico
title_sort Análise da expressão e do número de cópias gênicas de microrna da região 8q24.21 no câncer gástrico
author Pereira, Ana Carolina Anauate [UNIFESP]
author_facet Pereira, Ana Carolina Anauate [UNIFESP]
author_role author
dc.contributor.institution.pt.fl_str_mv Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.contributor.authorLattes.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/0324626849656801
dc.contributor.advisorLattes.none.fl_str_mv Marilia de Arruda Cardoso Smith
dc.contributor.author.fl_str_mv Pereira, Ana Carolina Anauate [UNIFESP]
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Smith, Marilia De Arruda Cardoso [UNIFESP]
contributor_str_mv Smith, Marilia De Arruda Cardoso [UNIFESP]
dc.subject.por.fl_str_mv Câncer gástrico
Microrna
Expressão gênica
topic Câncer gástrico
Microrna
Expressão gênica
Gastric cancer
Microrna
Gene expression
dc.subject.eng.fl_str_mv Gastric cancer
Microrna
Gene expression
description Objetivo: Analisar a expressão de miR1204, miR1205, miR1206, miR1207 e miR1208 em tecido gástrico neoplásico e não neoplásico de pacientes com e sem CG, determinar os genes de referência para essa análise, avaliar o número de cópias gênicas desses miRNA, e associar estas variáveis com os parâmetros clínicos e patológicos dos pacientes com CG. Métodos: A expressão dos miRNA alvos miR1204, miR1205, miR1206, miR12075p, miR12073p, e miR1208 foi avaliada por RTqPCR em 65 pares de amostras neoplásicas (T) e margem adjacente não neoplásicas (A) de pacientes com CG, e 20 amostras de tecido gástrico não neoplásica de indivíduos sem câncer submetidos à endoscopia (C), e determinada pelo método ΔCt. O número de cópias dos genes miR1204, miR1205, miR1207, e miR1208 foi determinado por qPCR em 69 amostras T e com o uso do programa Copy Caller. Resultados: O grupo de amostras C não diferiu em relação ao gênero e idade dos pacientes com CG (p>0,05). Apenas o miR1205 apresentou diferença de expressão entre os grupos de amostra A e C, com maior expressão no grupo A (p=0,02). Não foi observada expressão de miR1204 e miR1206 nas amostras de tecido gástrico analisadas. Foi observada uma correlação positiva e forte entre a expressão de miR12075p e miR1208 (p<0,01, ρ=0,71), e uma correlação positiva, mas fraca, entre a expressão de miR1205 e miR12073p (p=0,04, ρ=0,21). Não foi observada associação entre a expressão de miR1205, miR12075p, miR12073p, e miR1208 e o número de cópias dos seus respectivos genes (p>0,05). O aumento do número de cópias do gene miR1207 foi associado aos tumores localizados na região não cárdia do estômago (p=0,01), e a perda do número de cópias do gene miR1208 à presença de infecção por H. pylori (p=0,01). Conclusões: Não foram encontradas diferenças significantes entre a expressão de miR1205, miR12075p, miR12073p, e miR1208 nas amostras T vs A, e entre T vs C. Porém, o miR1205 apresentou expressão aumentada nas amostras A em relação às C. Os resultados sugerem que o miR1205 parece ter um papel importante no início do desenvolvimento do CG. Além disso, a ausência de associação entre a expressão desses miRNA e o número de cópias gênicas indica que a alteração do número de cópias do miR1205 não seja o mecanismo que leva à sua desregulação nas amostras avaliadas.
publishDate 2018
dc.date.issued.fl_str_mv 2018-05-24
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-03-25T11:43:42Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-03-25T11:43:42Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.pt.fl_str_mv https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=6370655
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/52313
dc.identifier.file.none.fl_str_mv 2018-0242.pdf
url https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=6370655
https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/52313
identifier_str_mv 2018-0242.pdf
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 64 f.
dc.coverage.spatial.none.fl_str_mv São Paulo
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UNIFESP
instname:Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
instacron:UNIFESP
instname_str Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
instacron_str UNIFESP
institution UNIFESP
reponame_str Repositório Institucional da UNIFESP
collection Repositório Institucional da UNIFESP
bitstream.url.fl_str_mv ${dspace.ui.url}/bitstream/11600/52313/1/Ana%20Carolina%20Anauate%20Pereira%20-%20A.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv aef720e6bc8e4d197d54cc20ffa53a26
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UNIFESP - Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1802764274989268992