Estudo comparativo do genoma de trypanosoma cruzi com ênfase nas regiões teloméricas e subteloméricas.

• Autor(a) principal: Antonio, Cristiane Regina [UNIFESP]
• Data de Publicação: 2018
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UNIFESP
• Texto Completo: https://sucupira.capes.gov.br/sucupira/public/consultas/coleta/trabalhoConclusao/viewTrabalhoConclusao.jsf?popup=true&id_trabalho=6728658; https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/52935
• topic: Trypanosoma Cruzi; Polimorfismo Cromossômico; Acgh

O parasita protozoário Trypanosoma cruzi é o agente etiológico da doença de Chagas. As regiões subteloméricas de T. cruzi são enriquecidas em genes de proteínas de superfície e RHS, sugerindo que eles podem ter atuado como um local para recombinação e geração de novas variantes de proteínas de superfície. As regiões subteloméricas do clone CL Brener são altamente polimórficas, variando na abundância e organização desses genes. Neste trabalho, analisamos a organização de regiões subteloméricas em diferentes linhagens de T. cruzi (TcIisolados Dm28 e G; TcIIEsmeraldo cl3; TcVICL Brener). Foram identificados 28 marcadores específicos de telômeros que foram hibridizados com as bandas cromossômicas separadas por PFGE. Marcadores intersticiais de cada cromossomo também foram hibridizados como um controle interno. Padrões de hibridização idênticos foram observados com os marcadores específicos dos cromossomos telômeros e intersticiais em diferentes isolados, sugerindo que a sintenia nas extremidades cromossômicas é conservada nas linhagens de T. cruzi. Conseguimos identificar dois eventos de recombinação. É possível que as regiões subteloméricas desempenhem um papel na estabilização da replicação e no número de cópias dos cromossomos. Usamos hibridação genômica comparativa (aCGH) para comparar a cepa CL, CLB e CL14. Os cariótipos da cepa CL, CLB e CL14 foram analisados por hibridização de bandas cromossômicas com marcadores específicos de cromossomos. Esta análise revelou diferenças cariotípicas menores entre a cepa CL e seus clones, sendo que a maioria dos polimorfismos foi de pequena amplitude. Por exemplo, CL e CLB exibiram uma grande banda cromossómica de 2,09 Mb que sofreu uma deleção resultando numa banda de <2 Mb em CL14. Encontramos 155 anormalidades cromossômicas, 33 no CLB e 96 no CL14, além de 26 eventos comuns a ambos. Identificamos uma deleção de 50,1 kb em TcChr 39P e um 63,2 kb em TcChr 39S localizado na faixa de <2 Mb no clone CL14. Essa deleção ocorreu em uma região enriquecida de proteínas hipotéticas e genes de proteínas ribossômicas indicando um possível sítio frágil. A integração de dados de aCGH com aqueles da hibridização de bandas cromossômicas forneceu informações significativas em relação à freqüência e variedade de rearranjos cromossômicos observados neste parasita protozoário