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Identificação in silico de prováveis alvos vacinais e de fármacos contra Haemophilus ducreyi: uma abordagem em vacinologia reversa e genômica subtrativaHaemophilus ducreyi.Cancro mole.Candidatos vacinais.Alvos de drogas.Docking molecular.Haemophilus ducreyi.Chancroid.Reverse vaccinology.Vaccine candidates.Drug targets.Molecular docking.CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::PARASITOLOGIACNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::FARMACOLOGIACNPQ::CIENCIAS DA SAUDE::MEDICINA::CLINICA MEDICA::DOENCAS INFECCIOSAS E PARASITARIASO cancro mole é uma infecção sexualmente transmissível (IST) causada pela bactéria Gram-negativa Haemophilus ducreyi. O controle do cancro mole é difícil porque uma infecção prévia por H. ducreyi não induz uma resposta imune adaptativa adequada e os métodos convencionais de triagem de antígeno não tiveram sucesso na obtenção de moléculas alvo apropriadas. O único tratamento disponível atualmente é com antibiótico; no entanto, a resistência tem sido relatada em áreas endêmicas. Devido aos surtos recentes de ISTs em todo o mundo, é importante continuar procurando por novas estratégias de tratamento e medidas preventivas. Neste trabalho, utilizamos abordagens de vacinologia reversa e genômica subtrativa para a predição in silico de potenciais alvos vacinais e de drogas contra H. ducreyi. Identificamos as proteínas não homólogas ao hospedeiro e predizemos sua localização subcelular, essencialidade, funcionalidade e virulência. Ao todo, predizemos 13 prováveis alvos vacinais e 3 alvos de fármacos, onde 2 alvos vacinais (A01_1275 e A01_0690) e 3 alvos de drogas (A01_0698, A01_0702 e A01_0677) são albergados por ilhas de patogenicidade. Por fim, aplicamos uma abordagem de docking molecular para analisar cada alvo de droga e selecionamos ZINC77257029, ZINC43552589 e ZINC67912117 como moléculas promissoras com interações favoráveis com os resíduos dos sítios ativos dos alvos. Os alvos identificados aqui podem ser usados em estratégias futuras para controlar o cancro mole em todo o mundo.Chancroid is a sexually transmitted infection (STI) caused by the Gram-negative bacterium Haemophilus ducreyi. The control of chancroid is difficult because an earlier infection by H. ducreyi does not induce an appropriate adaptative immune response and the conventional antigen screening methods have been unsuccessful in finding suitable target molecules. The only current available treatment is with antibiotic; however, resistance has been reported in endemic areas. Due to recent outbreaks of STIs worldwide, it is important to keep searching for new treatment strategies and preventive measures. Here, we applied reverse vaccinology and subtractive genomic approaches for the in silico prediction of potential vaccine and drug targets against H. ducreyi. We identified the non-host homologous proteins and predicted their subcellular localization, essentiality, functionality and virulence. Altogether, we predicted 13 candidate vaccine targets and 3 drug targets,where 2 vaccine (A01_1275 and A01_0690) and 3 drug targets (A01_0698, A01_0702, and A01_0677) are harbored by pathogenicity islands. Finally, we applied a molecular docking approach to analyze each drug target and selected ZINC77257029, ZINC43552589, and ZINC67912117 as promising molecules with favorable interactions with the targets active site residues. Altogether, the targets identified here may be used in future strategies to control chancroid worldwide.Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais - FAPEMIGUniversidade Federal do Triângulo MineiroInstituto de Ciências da Saúde - ICS::Curso de MedicinaBrasilUFTMCurso de Pós-Graduação em Ciências Fisiológicas - Parasitologia, Imunologia e MicrobiologiaSOARES, Siomar de Castro05695182611http://lattes.cnpq.br/4393381414254469ANCHIETA, Alissa de Sarom Ferreira Freitas2022-07-21T12:49:08Z2018-03-122022-07-21T12:49:08Z2018-03-12info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://bdtd.uftm.edu.br/handle/123456789/1331porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFTMinstname:Universidade Federal do Triangulo Mineiro (UFTM)instacron:UFTM2022-07-22T02:02:44Zoai:bdtd.uftm.edu.br:123456789/1331Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://bdtd.uftm.edu.br/PUBhttp://bdtd.uftm.edu.br/oai/requestbdtd@uftm.edu.br||bdtd@uftm.edu.bropendoar:2024-04-24T09:59:20.290364Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da UFTM - Universidade Federal do Triangulo Mineiro (UFTM)false
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