Padronização de extração de DNA de bacteriófago
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2017 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFU |
Texto Completo: | https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/21653 |
Resumo: | A resistência bacteriana aos antibióticos convencionais tem se tornado cada vez mais recorrente, tornando-se um grave problema para a saúde pública. Isso tem sido um estímulo para o estudo de novas formas de tratamento, seja com outras substâncias antimicrobianas, ou com terapias alternativas, como a terapia com fagos. Esta é tida como uma forma de controle biológico, utilizando bacteriófagos que são vírus que infectam de maneira especifica as células bacterianas. Esse trabalho utilizou do bacteriófago modelo T4 na infecção da bactéria Escherichia coli cepa B4. Assim, cultivou-se o vírus na bactéria hospedeira e, após a eliminação do DNA e RNA bacteriano, o vírus foi concentrado utilizando polietilenoglicol/NaCl. Em seguida, o vírus foi lisado utilizando proteinase K/SDS e o DNA foi extraído com fenol/clorofórmio, seguido de precipitação com acetato de sódio/isopropanol. Após centrifugação, o precipitado foi lavado com etanol 70%, ressuspenso em tampão Tris-EDTA e submetido à eletroforese em gel de agarose. Esse protocolo foi base para mais dois outros protocolos testados, com alterações na concentração e incubação do PEG, e alteração do tempo de incubação para precipitação com acetato de sódio e isopropanol. Utilizando o protocolo C obtido após as alterações, observou-se DNA com massa molecular acima de 20 Kbp. Assim, será possível obter DNA de outros bacteriófagos, para caracterização e avaliação do seu potencial na lise de células bacterianas. |
id |
UFU_a85ed3de31428b3b54848fc0fbdfafbe |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufu.br:123456789/21653 |
network_acronym_str |
UFU |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFU |
repository_id_str |
|
spelling |
2018-06-26T23:02:34Z2018-06-26T23:02:34Z2017-12-01ALCÂNTARA, N. M. Padronização de extração de DNA de bacteriófago. 2017. 32 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2015.https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/21653A resistência bacteriana aos antibióticos convencionais tem se tornado cada vez mais recorrente, tornando-se um grave problema para a saúde pública. Isso tem sido um estímulo para o estudo de novas formas de tratamento, seja com outras substâncias antimicrobianas, ou com terapias alternativas, como a terapia com fagos. Esta é tida como uma forma de controle biológico, utilizando bacteriófagos que são vírus que infectam de maneira especifica as células bacterianas. Esse trabalho utilizou do bacteriófago modelo T4 na infecção da bactéria Escherichia coli cepa B4. Assim, cultivou-se o vírus na bactéria hospedeira e, após a eliminação do DNA e RNA bacteriano, o vírus foi concentrado utilizando polietilenoglicol/NaCl. Em seguida, o vírus foi lisado utilizando proteinase K/SDS e o DNA foi extraído com fenol/clorofórmio, seguido de precipitação com acetato de sódio/isopropanol. Após centrifugação, o precipitado foi lavado com etanol 70%, ressuspenso em tampão Tris-EDTA e submetido à eletroforese em gel de agarose. Esse protocolo foi base para mais dois outros protocolos testados, com alterações na concentração e incubação do PEG, e alteração do tempo de incubação para precipitação com acetato de sódio e isopropanol. Utilizando o protocolo C obtido após as alterações, observou-se DNA com massa molecular acima de 20 Kbp. Assim, será possível obter DNA de outros bacteriófagos, para caracterização e avaliação do seu potencial na lise de células bacterianas.Bacterial resistance to conventional antibiotics has become increasingly recurrent, becoming a serious problem for public health. This has been a stimulus for the study of new forms of treatment, either with other antimicrobial substances, or with alternative therapies, such as phage therapy. This is taken as a form of biological control, using bacteriophages which are viruses that specifically infect bacterial cells. This work used the bacteriophage model T4 in the infection of the bacterium Escherichia coli strain B4. Thus, the virus was cultured in the host bacterium and, after removal of the bacterial DNA and RNA, the virus was concentrated using polyethylene glycol / NaCl. The virus was then lysed using proteinase K / SDS and the DNA was phenol / chloroform extracted, followed by precipitation with sodium acetate / isopropanol. After centrifugation, the precipitate was washed with 70% ethanol, resuspended in Tris-EDTA buffer and subjected to agarose gel electrophoresis. This protocol was based on two other protocols tested, with changes in PEG concentration and incubation, and change in incubation time for precipitation with sodium acetate and isopropanol. Using the protocol C obtained after the alterations, DNA with molecular mass above 20 Kbp was observed. Thus, it will be possible to obtain DNA from other bacteriophages, for characterization and evaluation of their potential in bacterial cell lysis.CBMM - Companhia Brasileira de Metalurgia e MineraçãoCBP&D/Café - Consórcio Brasileiro de Pesquisa e Desenvolvimento do CaféCEFET/GO - Centro Federal de Educação Tecnológica de GoiásCEMIG - Companhia Energética de Minas GeraisCENAPAD - Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho em São PauloCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoencil ConstruçõesCSIRO - Tropical Ecosystems Research CentreDerly J. G. RodriguesDuratexEletrobras - Centrais Elétricas Brasileiras S.A.Embraco - Empresa Brasileira de CompressoresEmbrapa - Empresa Brasileira de Pesquisa AgropecuáriaEuropean Union ProgrammeFAPEAL - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de AlagoasFAPEAM - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado do AmazonasFAPEG - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de GoiásFAPEMA - Fundação de Amparo a Pesquisa e ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico do MaranhãoFAPEMAT - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Mato GrossoFAPEMIG - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas GeraisFAPERGS - Fundação de Amparo a Pesquisa no Estado do Rio Grande do SulFAPERJ - Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de JaneiroFAPESB - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado da BahiaFAPESP - Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de São PauloFATEC - Fundação de Amparo a Ciência e TecnologiaFAU - Fundação de Apoio UniversitárioFinep - Financiadora de Estudos e ProjetosFMB - Fundação Manoel de BarrosFNS - Fundo Nacional de Saúde - Ministério da SaúdeFPM - Faculdade Patos de MinasFUNCAP - Fundação Cearense de Apoio ao Desenvolvimento Científico e TecnológicoFundação LemannGCUB - Grupo Coimbra de Universidades BrasileirasHolcim BrasilIFG - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de GoiásIFM - Instituto Fábrica do MilênioIFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato GrossoINEO - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Eletrônica OrgânicaINCT-Hympar Sudeste - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia dos Hymenoptera Parasitoides da Região Sudeste BrasileiraINCT-MACC - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia - Medicina Assistida por Computação CientíficaINCT-EIE - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia De Estruturas Inteligentes em EngenhariaINCT - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de NanobiofarmacêuticaINCT - Instituto Nacional de Ciência e TecnologiaIMMP - Instituto Multidiciplinar de Materiais PoliméricosIpea - Instituto de Pesquisa Econômica AplicadaIQUFU - Instituto de Química da Universidade Federal de UberlândiaMCTESTP - Ministério da Ciência e Tecnologia de MoçambiqueN-Biofar - Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Nano-BiofarmacêuticaNanobraxNational Science FoundationNSF - National Science FoundationOEA - Organização das Nações AmericanasPetrobrás - Petróleo Brasileiro S.APetropasy Tecnologia em PoliuretanosPrefeitura Municipal de ItuiutabaRede FitocerradoRQMG - Rede Mineira de QuímicaSEE/SP - Secretaria da Educação do Estado de São PauloSES-MT - Secretaria de Estado de Saúde de Mato GrossoUEG - Universidade Estadual de GoiásUEMS - Universidade Estadual do Mato Grosso do SulUESB - Universidade Estadual do Sudoeste da BahiaUF - Universidade da FlóridaUFAC - Universidade Federal do AcreUFMS - Universidade Federal do Mato Grosso do SulUFU - Universidade Federal de UberlândiaUNEC - Centro Universitário de CaratingaUNEMAT - Universidade do Estado de Mato GrossoUNIARAXÁ - Centro Universitário do Planalto de AraxáUNIFRAN - Universidade de FrancaUnimontes - Universidade Estadual de Montes ClarosUNIPAC - Universidade Presidente Antônio CarlosUNIPAM - Centro Universitário de Patos de MinasUSIMINAS - Usinas Siderúrgicas de Minas Gerais S/AVALE S. A.ZF_Sachs do BrasilTrabalho de Conclusão de Curso (Graduação)porUniversidade Federal de UberlândiaBiotecnologiaBrasilCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASBacteriófagoDNABacteriophagePadronização de extração de DNA de bacteriófagoStandardization of DNA extraction from bacteriophageinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisYokosawa, Jonnyhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723270U5Araújo, Bruna fugahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4458879Z4Polli, Mayara garciahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K8138658U0http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K8920817A4Alcântara, Naiara machado de32info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFUinstname:Universidade Federal de Uberlândia (UFU)instacron:UFUORIGINALPadronizaçaoExtraçaoDNA.pdfPadronizaçaoExtraçaoDNA.pdfapplication/pdf1180754https://repositorio.ufu.br/bitstream/123456789/21653/5/Padroniza%c3%a7aoExtra%c3%a7aoDNA.pdf6cebc8393f5ac238852c96986986381bMD55LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81792https://repositorio.ufu.br/bitstream/123456789/21653/6/license.txt48ded82ce41b8d2426af12aed6b3cbf3MD56TEXTPadronizaçaoExtraçaoDNA.pdf.txtPadronizaçaoExtraçaoDNA.pdf.txtExtracted texttext/plain48007https://repositorio.ufu.br/bitstream/123456789/21653/7/Padroniza%c3%a7aoExtra%c3%a7aoDNA.pdf.txt22de29db3d3bf02dc37d494eed06639cMD57THUMBNAILPadronizaçaoExtraçaoDNA.pdf.jpgPadronizaçaoExtraçaoDNA.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1088https://repositorio.ufu.br/bitstream/123456789/21653/8/Padroniza%c3%a7aoExtra%c3%a7aoDNA.pdf.jpga389388657a8456b66af823fbbb17decMD58123456789/216532018-06-26 20:02:35.11oai:repositorio.ufu.br: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Repositório InstitucionalONGhttp://repositorio.ufu.br/oai/requestdiinf@dirbi.ufu.bropendoar:2018-06-26T23:02:35Repositório Institucional da UFU - Universidade Federal de Uberlândia (UFU)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Padronização de extração de DNA de bacteriófago |
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv |
Standardization of DNA extraction from bacteriophage |
title |
Padronização de extração de DNA de bacteriófago |
spellingShingle |
Padronização de extração de DNA de bacteriófago Alcântara, Naiara machado de CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS Bacteriófago DNA Bacteriophage |
title_short |
Padronização de extração de DNA de bacteriófago |
title_full |
Padronização de extração de DNA de bacteriófago |
title_fullStr |
Padronização de extração de DNA de bacteriófago |
title_full_unstemmed |
Padronização de extração de DNA de bacteriófago |
title_sort |
Padronização de extração de DNA de bacteriófago |
author |
Alcântara, Naiara machado de |
author_facet |
Alcântara, Naiara machado de |
author_role |
author |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
Yokosawa, Jonny |
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4723270U5 |
dc.contributor.referee1.fl_str_mv |
Araújo, Bruna fuga |
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4458879Z4 |
dc.contributor.referee2.fl_str_mv |
Polli, Mayara garcia |
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K8138658U0 |
dc.contributor.authorLattes.fl_str_mv |
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K8920817A4 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Alcântara, Naiara machado de |
contributor_str_mv |
Yokosawa, Jonny Araújo, Bruna fuga Polli, Mayara garcia |
dc.subject.cnpq.fl_str_mv |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS |
topic |
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS Bacteriófago DNA Bacteriophage |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Bacteriófago DNA Bacteriophage |
description |
A resistência bacteriana aos antibióticos convencionais tem se tornado cada vez mais recorrente, tornando-se um grave problema para a saúde pública. Isso tem sido um estímulo para o estudo de novas formas de tratamento, seja com outras substâncias antimicrobianas, ou com terapias alternativas, como a terapia com fagos. Esta é tida como uma forma de controle biológico, utilizando bacteriófagos que são vírus que infectam de maneira especifica as células bacterianas. Esse trabalho utilizou do bacteriófago modelo T4 na infecção da bactéria Escherichia coli cepa B4. Assim, cultivou-se o vírus na bactéria hospedeira e, após a eliminação do DNA e RNA bacteriano, o vírus foi concentrado utilizando polietilenoglicol/NaCl. Em seguida, o vírus foi lisado utilizando proteinase K/SDS e o DNA foi extraído com fenol/clorofórmio, seguido de precipitação com acetato de sódio/isopropanol. Após centrifugação, o precipitado foi lavado com etanol 70%, ressuspenso em tampão Tris-EDTA e submetido à eletroforese em gel de agarose. Esse protocolo foi base para mais dois outros protocolos testados, com alterações na concentração e incubação do PEG, e alteração do tempo de incubação para precipitação com acetato de sódio e isopropanol. Utilizando o protocolo C obtido após as alterações, observou-se DNA com massa molecular acima de 20 Kbp. Assim, será possível obter DNA de outros bacteriófagos, para caracterização e avaliação do seu potencial na lise de células bacterianas. |
publishDate |
2017 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2017-12-01 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2018-06-26T23:02:34Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2018-06-26T23:02:34Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/bachelorThesis |
format |
bachelorThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
ALCÂNTARA, N. M. Padronização de extração de DNA de bacteriófago. 2017. 32 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2015. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/21653 |
identifier_str_mv |
ALCÂNTARA, N. M. Padronização de extração de DNA de bacteriófago. 2017. 32 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação em Biotecnologia) - Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia, 2015. |
url |
https://repositorio.ufu.br/handle/123456789/21653 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Uberlândia Biotecnologia |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Uberlândia Biotecnologia |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFU instname:Universidade Federal de Uberlândia (UFU) instacron:UFU |
instname_str |
Universidade Federal de Uberlândia (UFU) |
instacron_str |
UFU |
institution |
UFU |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFU |
collection |
Repositório Institucional da UFU |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufu.br/bitstream/123456789/21653/5/Padroniza%c3%a7aoExtra%c3%a7aoDNA.pdf https://repositorio.ufu.br/bitstream/123456789/21653/6/license.txt https://repositorio.ufu.br/bitstream/123456789/21653/7/Padroniza%c3%a7aoExtra%c3%a7aoDNA.pdf.txt https://repositorio.ufu.br/bitstream/123456789/21653/8/Padroniza%c3%a7aoExtra%c3%a7aoDNA.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
6cebc8393f5ac238852c96986986381b 48ded82ce41b8d2426af12aed6b3cbf3 22de29db3d3bf02dc37d494eed06639c a389388657a8456b66af823fbbb17dec |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFU - Universidade Federal de Uberlândia (UFU) |
repository.mail.fl_str_mv |
diinf@dirbi.ufu.br |
_version_ |
1802110495766872064 |