Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Garcia, Diogo Anast?cio
Data de Publicação: 2010
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFVJM
Texto Completo: http://acervo.ufvjm.edu.br:8080/jspui/handle/1/730
Resumo: ?rea de concentra??o: Produ??o Animal.
id UFVJM-2_773a2b39bfbb945f1562426e76957986
oai_identifier_str oai:acervo.ufvjm.edu.br/jspui:1/730
network_acronym_str UFVJM-2
network_name_str Repositório Institucional da UFVJM
repository_id_str 2145
spelling Garcia, Diogo Anast?cioPereira, Idalmo GarciaPires, Aldrin VieiraSilva, Fabyano Fonseca eUniversidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)Pereira, Idalmo Garcia2015-11-16T13:55:28Z2015-11-16T13:55:28Z20102010-02-22GARCIA, Diogo Anast?cio. Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos. 2010. 50 p. Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, Diamantina, 2010.http://acervo.ufvjm.edu.br:8080/jspui/handle/1/730?rea de concentra??o: Produ??o Animal.Objetivou-se avaliar a aplica??o dos modelos lineares generalizados mistos na avalia??o gen?tica da prenhez precoce, comparando as fun??es de liga??o probit e logit, utilizando dados simulados e reais, al?m de avaliar os efeitos na variabilidade gen?tica e na sele??o de reprodutores quando diferentes defini??es desta caracter?stica s?o adotadas. O processo de simula??o foi determinado pela transforma??o aplicada para se obterem as probabilidades de prenhez das novilhas e da fun??o de liga??o utilizada na an?lise dos dados, sendo constru?das as estruturas de simula??o: logit-logit (LL), logit-probit (LP), probit-logit (PL) e probit-probit (PP). Foram adotadas distintas porcentagens de f?meas precoces (%FP): 5, 10, 15, 20, 25 e 30%. Para cada cen?rio de simula??o, constru?dos pela combina??o das estruturas e %FP, foram realizadas 100 repeti??es, sendo o valor param?trico da herdabilidade (h2) igual a 0,40. Nos dados reais, a prenhez precoce foi definida aos 15, 17, 19 e 21 meses, representadas por PP15, PP17, PP19 e PP21. A implementa??o da simula??o e a estima??o dos par?metros e predi??o dos valores gen?ticos foram realizadas no software R. No estudo de simula??o, as estimativas obtidas para a herdabilidade ( ) foram comparadas com o valor param?trico por meio do Erro Quadr?tico M?dio (EQM). Correla??es de Pearson (CP), entre os valores gen?ticos preditos e reais, e a porcentagem de touros em comum, entre a classifica??o real e predita, considerando apenas 10% dos touros com maiores valores gen?ticos (TOP10) foram calculadas. Para os dados reais, correla??es de Pearson, entre os valores gen?ticos preditos pelas fun??es de liga??o, e a TOP10, entre a classifica??o predita pela logit e probit e em cada fun??o entre PP15, PP17, PP19 e PP21 foram mensuradas. Al?m disso, para comparar o ajuste dos modelos, foram calculados os crit?rios de informa??o Bayesiano de Schwarz (BIC) e de Akaike (AIC). Considerando a simula??o, as estruturas LP e PL apresentaram resultados inferiores a LL e PP. Os valores de , EQM, correla??es de Pearson e TOP10, para as estruturas LL e PP, foram muito pr?ximos. Para os dados reais, as para PP15, PP17, PP19 e PP21, foram pr?ximas entre logit e probit, com exce??o da PP15. As CP e a TOP10 entre as fun??es foram altas. O AIC e BIC apresentaram-se semelhantes entre as fun??es, independente da classe de prenhez estudada. A TOP10, considerando a predi??o da mesma fun??o de liga??o, entre PP17-PP19, PP17-PP21 e PP19-PP21 foram de moderadas a alta. Entretanto, a TOP10 entre PP15-PP17, PP15-PP19 e PP15-PP21 podem ser consideradas baixas, independente da fun??o utilizada. ? necess?rio comparar o ajuste das fun??es de liga??o, uma vez que ao simular dados na escala logit e alis?-los por probit, e vice-versa, os resultados nas estimativas dos par?metros e predi??o n?o foram satisfat?rios como aqueles apresentados quando se gerou e analisou os dados por meio da mesma escala e fun??o de liga??o. Para as classes de precocidade estudadas, os modelos apresentaram estimativas de par?metros gen?ticos, predi??es dos efeitos aleat?rios e ajuste dos modelos muito semelhantes. A classifica??o dos touros foi consideravelmente diferente entre PP15-PP17, PP15-PP19 e PP15-PP21.Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-11-16T13:54:40Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) diogo_anastacio_garcia.pdf: 241254 bytes, checksum: 3f5025c7cbe992519b20507c5901711c (MD5)Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-11-16T13:55:28Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) diogo_anastacio_garcia.pdf: 241254 bytes, checksum: 3f5025c7cbe992519b20507c5901711c (MD5)Made available in DSpace on 2015-11-16T13:55:28Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) diogo_anastacio_garcia.pdf: 241254 bytes, checksum: 3f5025c7cbe992519b20507c5901711c (MD5) Previous issue date: 2010Funda??o de Amparo ? Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG)Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2010.ABSTRACT This study aimed to evaluate the application of generalized linear mixed models on genetic evaluation of early pregnancy, by comparing probit and logit functions and using simulated and real data. Besides this, effects on genetic variability and on selection of sires under different definition are adopted. Simulation process was determined by the transformation applied to obtain probabilities of heifer pregnancy and the function used to analyze data, being simulation structures: logit-logit (LL), logit-probit (LP), probit-logit (PL) and probit-probit (PP). Different percentages of early female (%EF) were adopted: 5, 10, 15, 20, 25 and 30%. To each simulation, formed according to structures and %EP combination, there were 100 repetitions, being 0.40 the parametric value of heritability (h2). At real data, early pregnancy was determined at 15, 17, 19 and 21 months, represented by EP15, EP17, EP19 and EP21. To implement simulation, estimate parameters and predict genetic values, software R was used. In simulation study, estimative obtained to heritability ( ) were compared to parametric value through mean-square error (MSE). Pearson correlations (PC) were calculated between genetic real or predicted values and percentage of bulls in common, between real and predicted classification, considering only 10% of bulls with higher genetic values (TOP 10). To real data, there was Pearson Correlation between genetic values predicted by functions and the TOP10, between classification predicted by logit and probit and in each function between EP15, EP17, EP19 and EP21. In order to compare models adjustment, information criteria of Bayesiano of Schwarz (BIC) and Akaike (AIC) were calculated. Considering the simulation, LP and PL structures showed results inferior to LL and PP. Values of , MSEEQM, Pearson correlation and TOP10, to as LL and PP, were near. To real data, to EP15, EP17, EP19 and EP21, were near between logit and probit, except to EP15. AIC and BIC were similar among functions, independently of pregnancy class studied. Considering prediction of same function between EP17-EP19, EP17-EP21 and EP19-EP21 was from moderated to high. However, TOP10 between EP15-EP17, EP15-EP19 and EP15-EP21 can be considered low in any function. It is necessary to compare function adjustment because when data is simulated in logit and analyzed by probit, and vice-versa, results on estimated and predicted parameters were not satisfactory as the one shown when data were created and analyzed by the same scale and function. In precocity classes studied, the models showed estimative of genetic parameters, random effect prediction and models adjustment very similar. Bulls? classification was very different EP15-EP17, EP15-EP19 and EP15-EP21.porUFVJMA concess?o da licen?a deste item refere-se ao ? termo de autoriza??o impresso assinado pelo autor, assim como na licen?a Creative Commons, com as seguintes condi??es: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publica??o, autorizo a Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri e o IBICT a disponibilizar por meio de seus reposit?rios, sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei n? 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permiss?es assinaladas, para fins de leitura, impress?o e/ou download, a t?tulo de divulga??o da produ??o cient?fica brasileira, e preserva??o, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessAvalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistosGenetic evaluation of early pregnancy in Nellore cattle by using generalized linear mixed modelsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisGado de corteHerdabilidadeGLMMNeloreSimula??oreponame:Repositório Institucional da UFVJMinstname:Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)instacron:UFVJMTEXTdiogo_anastacio_garcia.pdf.txtdiogo_anastacio_garcia.pdf.txtExtracted texttext/plain92678http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/6/diogo_anastacio_garcia.pdf.txt2d685a0fedf4b2b035e8da0dc1fe09beMD56LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82111http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/5/license.txtf5c843397da71f5d32b775fd8c4cbf56MD55CC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-852http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/2/license_url3d480ae6c91e310daba2020f8787d6f9MD52license_textlicense_texttext/html; charset=utf-822293http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/3/license_text2e3704dede0ecd7f1809da0ed422cae0MD53license_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-823898http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/4/license_rdfe363e809996cf46ada20da1accfcd9c7MD54ORIGINALdiogo_anastacio_garcia.pdfdiogo_anastacio_garcia.pdfapplication/pdf241254http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/1/diogo_anastacio_garcia.pdf3f5025c7cbe992519b20507c5901711cMD511/7302018-01-18 14:03:19.682oai:acervo.ufvjm.edu.br/jspui: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Repositório InstitucionalPUBhttp://acervo.ufvjm.edu.br/oai/requestrepositorio@ufvjm.edu.bropendoar:21452018-01-18T16:03:19Repositório Institucional da UFVJM - Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos
dc.title.alternative.en.fl_str_mv Genetic evaluation of early pregnancy in Nellore cattle by using generalized linear mixed models
title Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos
spellingShingle Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos
Garcia, Diogo Anast?cio
Gado de corte
Herdabilidade
GLMM
Nelore
Simula??o
title_short Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos
title_full Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos
title_fullStr Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos
title_full_unstemmed Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos
title_sort Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos
author Garcia, Diogo Anast?cio
author_facet Garcia, Diogo Anast?cio
author_role author
dc.contributor.references.none.fl_str_mv Pereira, Idalmo Garcia
Pires, Aldrin Vieira
Silva, Fabyano Fonseca e
dc.contributor.institution.pt_BR.fl_str_mv Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)
dc.contributor.author.fl_str_mv Garcia, Diogo Anast?cio
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Pereira, Idalmo Garcia
contributor_str_mv Pereira, Idalmo Garcia
dc.subject.keyword.pt_BR.fl_str_mv Gado de corte
Herdabilidade
GLMM
Nelore
Simula??o
topic Gado de corte
Herdabilidade
GLMM
Nelore
Simula??o
description ?rea de concentra??o: Produ??o Animal.
publishDate 2010
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2010-02-22
dc.date.issued.fl_str_mv 2010
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-11-16T13:55:28Z
dc.date.available.fl_str_mv 2015-11-16T13:55:28Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv GARCIA, Diogo Anast?cio. Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos. 2010. 50 p. Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, Diamantina, 2010.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://acervo.ufvjm.edu.br:8080/jspui/handle/1/730
identifier_str_mv GARCIA, Diogo Anast?cio. Avalia??o gen?tica da prenhez precoce em animais da ra?a Nelore utilizando modelos lineares generalizados mistos. 2010. 50 p. Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, Diamantina, 2010.
url http://acervo.ufvjm.edu.br:8080/jspui/handle/1/730
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv UFVJM
publisher.none.fl_str_mv UFVJM
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFVJM
instname:Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)
instacron:UFVJM
instname_str Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)
instacron_str UFVJM
institution UFVJM
reponame_str Repositório Institucional da UFVJM
collection Repositório Institucional da UFVJM
bitstream.url.fl_str_mv http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/6/diogo_anastacio_garcia.pdf.txt
http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/5/license.txt
http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/2/license_url
http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/3/license_text
http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/4/license_rdf
http://acervo.ufvjm.edu.br/jspui/bitstream/1/730/1/diogo_anastacio_garcia.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 2d685a0fedf4b2b035e8da0dc1fe09be
f5c843397da71f5d32b775fd8c4cbf56
3d480ae6c91e310daba2020f8787d6f9
2e3704dede0ecd7f1809da0ed422cae0
e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7
3f5025c7cbe992519b20507c5901711c
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFVJM - Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)
repository.mail.fl_str_mv repositorio@ufvjm.edu.br
_version_ 1801865792032079872

Registros relacionados