Acurácia da PCR em tempo real na deteção do Mycobacterium leprae em raspados intradérmicos direto (Swab) e de lâmina de baciloscopia

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Bruno Oliveira Souza e
Data de Publicação: 2022
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFVJM
Texto Completo: https://acervo.ufvjm.edu.br//handle/123456789/3373
Resumo: Cury, Geraldo Cunha; Miranda, Silvana Spíndola de; Xavier, Marcelo Antônio Pascoal; Ribeiro, Mirtes; Pires, Ivy Scorzi Cazelli; Dias, João Victor leite.
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spelling Silva, Bruno Oliveira Souza eMiranda, Silvana Spíndola deXavier, Marcelo Antônio PascoalUniversidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)Cury, Geraldo Cunha2024-10-14T20:44:50Z20222023-07-06SILVA, Bruno Oliveira Souza e. Acurácia da PCR em tempo real na deteção do Mycobacterium leprae em raspados intradérmicos direto (Swab) e de lâmina de baciloscopia. 2022. 96 p. Dissertação (Mestrado Profissional em Ensino em Saúde) – Programa de Pós-graduação em Ensino em Saúde, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, Diamantina, 2023.https://acervo.ufvjm.edu.br//handle/123456789/3373Cury, Geraldo Cunha; Miranda, Silvana Spíndola de; Xavier, Marcelo Antônio Pascoal; Ribeiro, Mirtes; Pires, Ivy Scorzi Cazelli; Dias, João Victor leite.Em todas as partes que compõem a obra, consta o título: "Acurácia da PCR em tempo real na detecção do Mycobacterium leprae em raspados intradérmicos direto (Swab) e de lâmina de baciloscopia".A hanseníase é uma doença dermatoneurológica infecciosa e crônica, considerada a causa mais frequente de deficiências físicas em todo o mundo. Permanece como um grande desafio para a saúde pública do Brasil, que está classificado como um país de alta carga para a doença e configura o segundo lugar em número de casos entre todas as nações. A inexistência de uma vacina específica faz com que o diagnóstico precoce e, consequentemente, o tratamento oportuno, seja a forma mais eficaz de se combater a doença. Os exames laboratoriais são ferramentas importantes para complementação da avaliação clínica-epidemiológica e as técnicas moleculares surgiram na esperança de diminuir as limitações existentes no diagnóstico laboratorial da hanseníase. Este estudo objetivou avaliar a acurácia da Reação em Cadeia da Polimerase em tempo real (qPCR) na detecção do Mycobacterium leprae em raspados intradérmicos direto (swab) e em esfregaços de lâminas de baciloscopia. Trata-se de uma pesquisa observacional e transversal para avaliação de testes diagnósticos, que utilizou o exame de baciloscopia como padrão-ouro. Foram incluídos participantes com suspeitas epidemiológicas e/ou clínica de hanseníase da região nordeste de Minas Gerais, encaminhados ao Laboratório Macrorregional para a coleta de raspado intradérmico dos lóbulos auriculares, cotovelo direito, cotovelo esquerdo ou lesão suspeita. As baciloscopias foram realizadas segundo o Guia de Procedimentos Técnicos do Ministério da Saúde e as amostras de DNA, após extração e quantificação, foram submetidas a qPCR com primers específicos para a região RLEP de Mycobacterium leprae. As análises estatísticas descritivas, comparativas e de acurácia foram feitas utilizando-se os softwares Minitab 17 e GraphPad Prism versão 6.00. O estudo obteve o número de 45 amostras coletadas de casos suspeitos de hanseníase no período compreendido entre maio/2022 e fevereiro/2023. O perfil social e clínico da população do estudo ficou restrito aos casos notificados no SINAN e os indivíduos do sexo masculino, faixa etária entre 40 e 49 anos, raça/cor parda e de baixa escolaridade foram os mais presentes na amostra. A forma clínica e a classificação operacional predominantes foram a dimorfa (48,1%) e a multibacilar (74,1%). A sensibilidade da qPCR nas amostras de raspados intradérmicos direto (swab) e dos esfregaços de lâminas, em comparação com a baciloscopia, foi de 100%. A especificidade foi maior na qPCR das amostras de swab de raspado (64,3%) que nas lâminas de baciloscopia (53,8%). O desempenho da qPCR nas amostras de swab de raspado intradérmicos e de lâmina de baciloscopia indicou acurácias de 82,10% e 76,9%, respectivamente. Os resultados da comparação das proporções de positividade da qPCR das duas amostras mostraram associação estatisticamente significativa (P-valor = 0,025), com um grau de concordância de 57% (Kappa = 0,57). Em conjunto, os resultados das análises do desempenho e comparativas da qPCR em swab de raspados intradérmicos e lâminas de baciloscopia mostram boa acurácia em relação à baciloscopia e moderada concordância entre essas diferentes estratégias de qPCR.Dissertação (Mestrado) – Programa de Pós-graduação em Ensino em Saúde, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2023.Leprosy is an infectious and chronic dermatoneurological disease, considered the most frequent cause of physical disabilities in the whole world. It remains a big challenge for public health in Brazil, which is classified as a high burden country for the disease and ranks the second place in number of cases among all nations. The lack of a specific vaccine makes the early diagnosis and, consequently, the right treatment, the most effective way to combat the disease.The laboratory tests are important tools to complement the clinical and epidemiological evaluation, and molecular techniques have emerged in the hope of reducing the existing limitations in the laboratory diagnosis of leprosy. This report aimed to evaluate the accuracy of the real time Polymerase Chain Reaction (qPCR) in detecting the Mycobacterium leprae in direct intradermal scrapings (swab) and on bacilloscopy slide smears. This is an observational and cross-sectional survey for the evaluation of diagnostic tests, which used sputum smear microscopy as the gold standard. Were included participants with epidemiological and/or clinical suspicion of leprosy from the Northeast of Minas Gerais, referred to the Macroregional Laboratory for collection of intradermal scraping of the earlobes, right elbow, left elbow or suspicious lesions. The bacilloscopies were made according the Technical Procedures Guide of the Ministry of the Health and the DNA samples, after extraction and quantification, were submitted to qPCR with specific primers for the RLEP region of Mycobacterium leprae. The descriptive, comparative and accuracy statistical analyses were made using the Minitab a17 and GraphPad Prism version 6.00 softwares. The study obtained the number of 45 samples collected from suspected leprosy cases in the period between May/2022 and February/2023. The social and clinical profile of the study population was restricted to cases reported in SINAN, and males, aged between 40 and 49 years, mixed race/color and low schooling were the most present in the sample. The predominant clinical form and operational classification were dimorphic (48.1%) and multibacillary (74.1%). The sensitivity of qPCR in direct intradermal scrapings (swab) and slide smear samples, compared to the bascilloscopy, was 100%. Specificity was higher in the qPCR of scrape swab samples (64.3%) than on sputum smear slides (53.8%). The performance of qPCR on theintraderrmal scraping swab and sputum smear slide samples indicated accuracy of 82.10% and 76.9%, respectively. The results of the comparing the proportions of qPCR positivity of the two samples showed a statistically significant association (P-value = 0.025), with a 57% agreement (Kappa = 0.57). Taken together, the results of the performance and comparative analyses of qPCR on intradermal swab scrapings and sputum smear slides show good accuracy compared to sputum smears and moderate agreement between these different qPCR strategies.porUFVJMA concessão da licença deste item refere-se ao à termo de autorização impresso assinado pelo autor, assim como na licença Creative Commons, com as seguintes condições: Na qualidade de titular dos direitos de autor da publicação, autorizo a Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri e o IBICT a disponibilizar por meio de seus repositórios, sem ressarcimento dos direitos autorais, de acordo com a Lei nº 9610/98, o texto integral da obra disponibilizada, conforme permissões assinaladas, para fins de leitura, impressão e/ou download, a título de divulgação da produção científica brasileira, e preservação, a partir desta data.info:eu-repo/semantics/openAccessAcurácia da PCR em tempo real na deteção do Mycobacterium leprae em raspados intradérmicos direto (Swab) e de lâmina de baciloscopiainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisHanseníaseDiagnósticoqPCRLeprosyDiagnosisqPCRreponame:Repositório Institucional da UFVJMinstname:Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)instacron:UFVJMLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://acervo.ufvjm.edu.br//bitstreams/491d8cbc-9f7f-4a29-ae13-caa9e2ba2044/downloadbb9bdc0b3349e4284e09149f943790b4MD52falseAnonymousREADTEXTbruno_oliveira_souza_silva.pdf.txtbruno_oliveira_souza_silva.pdf.txtExtracted texttext/plain103094https://acervo.ufvjm.edu.br//bitstreams/b08187ff-375f-4d4b-b054-2ff60f9a9045/downloadc8a0e4cfb9b80ce29f7968462f8eb6ddMD53falseAnonymousREADTHUMBNAILbruno_oliveira_souza_silva.pdf.jpgbruno_oliveira_souza_silva.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2780https://acervo.ufvjm.edu.br//bitstreams/09de7e7b-c9fa-480d-b9f8-f225262baed1/download7806aefb1afb2b2e55018f5e42e2c28dMD54falseAnonymousREADORIGINALbruno_oliveira_souza_silva.pdfbruno_oliveira_souza_silva.pdfapplication/pdf5214859https://acervo.ufvjm.edu.br//bitstreams/e8e85c51-43b8-4df4-9d56-3bd6e1c7133a/download0a7cc6b4c47ccb9b669f19b1e6f52a39MD51trueAnonymousREAD123456789/33732024-10-15 06:02:38.051open.accessoai:acervo.ufvjm.edu.br:123456789/3373https://acervo.ufvjm.edu.br/Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufvjm.edu.brrepositorio@ufvjm.edu.bropendoar:21452024-10-15T06:02:38Repositório Institucional da UFVJM - Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri (UFVJM)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