Avaliação de métodos de seleção tradicionais, assistida por marcadores moleculares, e por genes candidatos, com dados simulados

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Corrêa, Felipe José de Carvalho
Data de Publicação: 2001
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/11342
Resumo: Como o objetivo do melhoramento animal é o aumento da freqüência dos alelos favoráveis relacionados com características de importância econômica, os melhores indivíduos são selecionados, de forma a transmitir esses alelos favoráveis às gerações futuras. Para este objetivo, vários métodos de seleção foram propostos e aperfeiçoados, como a seleção individual, o índice de seleção e a seleção baseada na melhor predição linear não-viesada, BLUP. Porém, nos últimos anos, avanços observados na biotecnologia têm indicado revolução nas metodologias de seleção. Isto é feito pela seleção assistida por marcadores (MAS) e seleção por genes candidatos (CGS). Apesar da seleção ser importante ferramenta, o tempo e a necessidade de animais e laboratórios que aumentam os custos, se tornam fatores limitantes, dificultando a realização de alguns trabalhos. Assim, pesquisadores utilizam técnicas de simulação, permitindo a obtenção de grande volume de dados em um curto período de tempo, sem os elevados custos de animais e de laboratórios. Este trabalho visou verificar, na condição de dez marcas moleculares polimórficas, uma característica quantitativa de herdabilidade baixa (0,10), durante 20 gerações; os desempenhos dos métodos de seleções tradicionais (individual e baseada no BLUP), dos métodos de seleções moleculares (assistida por marcadores moleculares e por genes candidatos) e da combinação dos dois (associação da seleção individual e a assistida por marcadores), na tentativa de apresentar a superioridade dos métodos de seleção moleculares. Foi simulado um genoma (GENESYS 2000) composto de 200 locos. Seis populações-base de 1000 animais cada (500 machos e 500 fêmeas) foram criadas, a partir do mesmo genoma, com alterações nos efeitos aditivos (aleatórios no intervalo de –1,258 a 1,258, fixados nos valores -2 e 2 e fixado nos valores -5 e 5) dos genes próximos aos marcadores, e da transformação dos marcadores em candidatos. Para cada população base, foi construída uma população inicial, na qual teve início o processo de avaliação genética. Os parâmetros avaliados foram: ganho fenotípico, porcentagem de homozigotos, variância genética aditiva, porcentagem de alelos desfavoráveis e favoráveis fixados e limite de seleção. Com o uso do BLUP, obtiveram -se, para os três grupos de efeitos aditivos dos genes, os maiores ganhos fenotípicos, após as 20 gerações simuladas. À medida que se fixaram os valores dos efeitos aditivos moleculares dos (seleção genes, o assistida desempenho por dos marcadores métodos e seleção de seleção por genes candidatos), melhorou, sendo superior as respostas dos métodos de seleção tradicionais até a quinta geração. Em todas as respostas analisadas, as variâncias genéticas aditivas decresceram, sendo que, a maior queda foi observada quando foram usados métodos de seleção moleculares. Os resultados das porcentagens de locos fixados com alelos desfavoráveis e favoráveis, mostraram que os métodos de seleção moleculares foram semelhantes para os grupos de efeitos aditivos dos genes e superiores aos demais métodos tanto na fixação dos locos com alelos favoráveis quanto desfavoráveis. Conclui-se que os métodos de seleção tradicionais são melhores que os de seleção moleculares, durante 20 gerações, sem genes de grande efeito aditivo. Entretanto, aumentando o efeito aditivo dos genes, os métodos de seleção moleculares são as melhores opções até cinco gerações.
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Este trabalho visou verificar, na condição de dez marcas moleculares polimórficas, uma característica quantitativa de herdabilidade baixa (0,10), durante 20 gerações; os desempenhos dos métodos de seleções tradicionais (individual e baseada no BLUP), dos métodos de seleções moleculares (assistida por marcadores moleculares e por genes candidatos) e da combinação dos dois (associação da seleção individual e a assistida por marcadores), na tentativa de apresentar a superioridade dos métodos de seleção moleculares. Foi simulado um genoma (GENESYS 2000) composto de 200 locos. Seis populações-base de 1000 animais cada (500 machos e 500 fêmeas) foram criadas, a partir do mesmo genoma, com alterações nos efeitos aditivos (aleatórios no intervalo de –1,258 a 1,258, fixados nos valores -2 e 2 e fixado nos valores -5 e 5) dos genes próximos aos marcadores, e da transformação dos marcadores em candidatos. 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Os resultados das porcentagens de locos fixados com alelos desfavoráveis e favoráveis, mostraram que os métodos de seleção moleculares foram semelhantes para os grupos de efeitos aditivos dos genes e superiores aos demais métodos tanto na fixação dos locos com alelos favoráveis quanto desfavoráveis. Conclui-se que os métodos de seleção tradicionais são melhores que os de seleção moleculares, durante 20 gerações, sem genes de grande efeito aditivo. Entretanto, aumentando o efeito aditivo dos genes, os métodos de seleção moleculares são as melhores opções até cinco gerações.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoporUniversidade Federal de ViçosaMétodos de seleçãoEfeito médio dos genesCiências AgráriasAvaliação de métodos de seleção tradicionais, assistida por marcadores moleculares, e por genes candidatos, com dados simuladosEvaluation of traditional selection methods, molecular markers assisted selection, and cadidates genes selection, with simulated datainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de ZootecniaMestre em ZootecniaViçosa - MG2001-03-16Mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf410609https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/11342/1/texto%20completo.pdf7fec8323c331702cef17f030fbf1eef4MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/11342/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3695https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/11342/3/texto%20completo.pdf.jpg3da7375d899445a5046ba1345aade122MD53123456789/113422017-07-18 23:00:30.698oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452017-07-19T02:00:30LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
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