Investigating the genetic architecture of heat stress response and related traits in pig populations

• Autor(a) principal: Oliveira, Letícia Fernanda de
• Data de Publicação: 2024
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: eng
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/32304; https://doi.org/10.47328/ufvbbt.2024.140
• topic: Suíno; Genômica; Genética animal; Efeitos da temperatura; Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos

O aquecimento global apresenta um desafio significativo para a produção animal, impactando o bem-estar e o desempenho animal. O aumento resultante nas temperaturas promove o estresse térmico (HS) na produção animal, destacando a necessidade de criar animais mais resilientes. A melhoria da tolerância ao calor poderia ampliar a capacidade dos animais de lidar com condições de HS. Para promover o melhoramento da resiliência ao HS, é crucial entender a arquitetura genética de características relacionados à resiliência e os mecanismos genéticos subjacentes à resposta ao HS. Este estudo teve como objetivo investigar a arquitetura genética de indicadores de resposta ao HS e características relacionados em suínos, apresentando três objetivos principais. Primeiro, avaliar o impacto dos efeitos genéticos não aditivos na estimativa de componentes de variância em dois bancos de dados independentes: populações cruzadas e puras, e na predição genômica em uma população pura. Segundo, identificar regiões genômicas, genes candidatos e variantes pleiotrópicas potencialmente associadas a indicadores de resposta ao HS em porcas lactantes usando dados imputados de sequência completa do genoma (WGS). Terceiro, detectar variações no número de cópias (CNVs) e regiões de CNV (CNVRs) em suínos e explorar suas associações com indicadores fisiológicos e anatômicos de resposta ao HS mensurados em porcas lactantes cruzadas (Large White x Landrace). A inclusão de efeitos genéticos não aditivos nos modelos não melhorou a acurácia dos valores genômicos para características de desempenho em suínos puros. No entanto, houve um reordenamento significativo de candidatos à seleção dependendo do modelo ajustado. Baixas estimativas de variância genética não-aditiva foram observadas para a maioria dos indicadores de resposta ao HS em suínos cruzados, exceto para escore de ofegação e densidade de pelos. Indicadores fisiológicos e anatômicos de resposta ao HS em porcas lactantes apresentaram variância genética aditiva, mas altamente poligênicos. Genes candidatos associados a atividades de proteínas de choque térmico, resposta imune e estresse oxidativo celular foram identificados, indicando sua importância na resposta ao HS. Várias CNVs e CNVRs foram identificados no genoma de suínos da população estudada. 15 CNVRs foram significativamente associados a indicadores fisiológicos e anatômicos de resposta ao HS em porcas lactantes. Vários genes envolvidos em respostas imunes e de estresse foram observados nas CNVRs, sugerindo que essas CNVRs podem contribuir para a resiliência climática em porcas durante o estágio de lactação. Palavras-chave: resiliência climática; predição genômica; efeitos genéticos não aditivos; pleiotropia; estudo de associação genômica ampla; variação no número de cópias.