Evolutionary analysis of pathogenicity genes from Erwinia psidii infecting Eucalyptus spp.

• Autor(a) principal: Pereira, Isadora Cristófoli
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: eng
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/30083
• topic: Erwinia psidii; Eucalipto; Goiaba; Secreção; Fitopatologia

Erwinia psidii é uma bactéria Gram-negativa que ameça tanto a produção de goiaba quanto a de eucalipto. Apesar da importância de ambas as culturas para a economia brasileira, pouco se conhece sobre os mecanismos de patogenicidade desta bactéria. Sendo assim, neste estudo abordagens de bioinformática foram aplicadas para a determinação da composição gênica do cluster hrp/hrc de E. psidii, o qual codifica para o sistema de secreção de tipo III, bastante reconhecido por sua importância para a patogenicidade de muitas bactérias Gram-negativas fitopatogênicas. Utilizou-se métodos de bioinformática também para a predição do repertório de efetores, tanto do tipo II quanto do tipo III, de E. psidii. Adicionalmente, realizou-se análises evolutivas com base na sequência destes candidatos a efetores do tipo III, a fim de determinar como a patogenicidade desta espécie bacteriana evoluiu com o decorrer do tempo. Neste estudo, caracterizou-se a composição gênica do cluster hrp/hrc de E. psidii com base na comparação com o os genes hrp/hrc de outras bactérias pertencentes a família Enterobacteriaceae, bem como identificou-se 11 proteínas candidatas a efetoras do tipo III, dentre elas DspA/E e Eop1, duas importantes proteínas efetoras de E. amylovora, espécie filogeneticamente próxima a E. psidii. Curiosamente, estas duas proteínas candidatas a efetoras, parecem ter sido adquiridas por E. psidii através de transferência horizontal de genes entre espécies do gênero Erwinia e Pantoea. Adicionalmente, identificou- se 47 proteínas candidatas a efetoras do tipo II, sendo a maioria descrita com ação enzimática, tanto com atividade hidrolítica como não hidrolítica. Estes resultados fornecem relevante conhecimento para futuras análises in vivo, podendo estas serem baseadas na construção de estirpes mutantes e caracterização funcional destes candidatos a efetores durante a interação planta-bactéria.