Genomic analyses for predicted milk fatty acid composition in dairy cattle: a longitudinal perspective

• Autor(a) principal: Freitas, Pedro Henrique Ferreira
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: eng
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/26914
• topic: Bovinos de leite; Leite - Composição; Ácidos graxos; Espectroscopia de infravermelho; Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos

A composição da gordura do leite tem implicações importantes nas propriedades nutricionais e de processamento do leite. Além dos aspectos nutricionais e de saúde, a composição da gordura do leite também pode estar associada ao estado fisiológico e sanitário do animal. A composição de gordura do leite pode ser melhorada através de várias formas, incluindo modificação da dieta da vaca e seleção genética. Os principais objetivos deste estudo foram: 1) estimar parâmetros genéticos para cinco grupos de ácidos graxos do leite (AG) (isto é, cadeia curta, cadeia média, cadeia longa, saturados e insaturados) com base na espectroscopia do infravermelho médio do leite para as raças Ayrshire, Holandês e Jersey; 2) realizar predição genômica de valores genéticos usando uma abordagem longitudinal de um único passo GBLUP para estas cinco características; 3) conduzir um estudo de associação genômica ampla, com o objetivo de identificar regiões genômicas, genes candidatos e vias metabólicas associadas à AG do leite e, consequentemente, compreender os mecanismos biológicos de expressão dessas características. Utilizaram-se 31.709 registros de 9.488 registros de vacas Ayrshire de 268 rebanhos, 629.769 registros de 201.465 vacas Holandês de 6.105 rebanhos e 34.341 registros de 11.479 vacas Jersey de 883 rebanhos. Esses registros foram coletados (e usados para a previsão de AG de leite) entre janeiro de 2013 e julho de 2018. O banco de dados genômico continha um total de 2.330 animais Ayrshire, 8.865 Holandês e 1.019 Jersey. A h2 média diária variou de 0,18 (AG de cadeia longa) a 0,34 (AG de cadeia média), de 0,24 (AG insaturado) a 0,47 (AGs de cadeia média e insaturado) e de 0,25 (AGs de cadeia longa e insaturado) a 0,52 (AGs de cadeia média e saturado) para Ayrshire, Holandês e Jersey, respectivamente. A confiabilidade da previsão genômica, considerando τ e ω igual a 1 (padrão), variou de 0,540 (AG saturado) a 0,746 (AG insaturado) em Ayrshire, e de 0,564 (AG de cadeia longa) a 0,737 (AG de cadeia média) em Holandês. Ao usar os valores τ e ω ótimos, a confiabilidade do valor genômico estimado variou de 0,528 (AG saturado) a 0,786 (AG insaturado) para Ayrshire, e de 0,583 (AG de cadeia longa) a 0,732 (AG de cadeia curta) para Holandês. Regiões genômicas importantes foram identificadas nos cromossomos BTA3, BTA5, BTA12, BTA13, BTA14, BTA16, BTA18, BTA20, e BTA21. A proporção da variação explicada para 20 SNPs adjacentes variou de 0,70% (AGS) a 1,12% (AGCC) para Ayrshire, de 0,71% (AGS) a 15,12% (AGCL) para Holandês, e de 0,70% (AGI) a 3.23% (AGCM) para Jersey. Importantes genes e vias metabólicas também foram identificados. Os resultados deste estudo contribuem para um melhor entendimento da arquitetura genética de AG do leite em bovinos leiteiros e serão de grande valia para a implementação da seleção genômica para essas características.