Genetic variability and host specialization among brazilian populations of Ceratocystis fimbriata s.l.

• Autor(a) principal: Fernandes, Fernando Montezano
• Data de Publicação: 2021
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: eng
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/30014; https://doi.org/10.47328/ufvbbt.2021.200
• topic: Ceratocystis fimbriata; Mapeamento cromossômico; Eletroforese em gel campo pulsado; Genômica; Variação genética; Fitopatologia

Ceratocystis fimbriata é um dos mais importantes patógenos de plantas lenhosas em todo o mundo. Os fungos colonizam o tecido vascular, causando manchas na madeira e morte de galhos ou plantas inteiras. Devido à grande variedade de hospedeiros, é possível que populações adaptadas de C. fimbriata tenham sido selecionadas para hospedeiros específicos e que haja alta variabilidade genética e fisiológica dentro da população do patógeno. O conhecimento dos fatores fisiológicos que determinam a gama de hospedeiros e a especificidade do hospedeiro são aspectos importantes para o manejo da doença. Portanto, os objetivos deste estudo foram: (i) determinar a especialização fisiológica de 11 isolados em oito hospesdeiros; (ii) investigar o cariótipo de isolados do complexo de espécies de C. fimbriata de diferentes plantas hospedeiras e origens geográficas no Brasil e; (iii) avaliar a variabilidade genética de isolados cariotipados utilizando o marcador molecular retrotransposon-microssatélite amplificado polimorfismo (REMAP). Além disso, a identidade dos isolados foi confirmada por meio de filogenia multilocus usando sequências de DNA de genes de mating type, TEF-1α e β-tubulina. Com base nos resultados da inoculação de 11 isolados em oito hospedeiros, foi encontrada uma grande variação na agressividade. Os isolados utilizados neste estudo foram mais agressivos em seus respectivos hospedeiros. Alguns hospedeiros, entretanto, eram suscetíveis a isolados de outros hospedeiros. Considerando o comprimento da lesão do xilema causada pelos isolados de C. fimbriata, as plantas de F. carica foram as mais suscetíveis aos isolados testados, seguido por M. indica. Apenas os isolados de T. cacao e C. guianensis se mostraram especializados por seus hospedeiros. Foi encontrado polimorfismo no número e tamanho dos cromossomos, indicando a existência de diferenças genômicas entre os isolados e a ocorrência de rearranjos cromossômicos no complexo de espécies. O número de cromossomos variou de seis a oito e os tamanhos mínimos estimados dos cromossomos foram estimados entre 2,7 e 6,0 Mbp. Pequenos cromossomos polimórficos foram observados em todos os isolados, levantando a hipótese de que eles poderiam ser cromossomos supranumerários. Como a variação cromossômica pode ser causada por elementos transponíveis (TEs), também avaliamos a variabilidade dos mesmos isolados usando o marcador molecular retrotransposon-microssatélite amplificado polimorfismo (REMAP). A análise REMAP dos isolados cariotipados revelou variabilidade genética e isolados do mesmo hospedeiro tendem a se agrupar em um mesmo cluster. A análise baseada nos perfis de microssatélites (SSR) de C. fimbriata mostrou uma separação dos isolados de acordo com o hospedeiro. Palavras-chave: Rearranjos cromossômicos. Arquitetura genômica. PFGE. Murcha de Ceratocystis. Inoculações cruzadas. Variabilidade fisiológica.