Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silva, Fernanda Miquelitto Figueira da
Data de Publicação: 2008
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: http://locus.ufv.br/handle/123456789/2398
Resumo: O Porcine circovirus 2 (PCV2) é um vírus não envelopado com genoma de DNA circular fita simples de aproximadamente 1,76 Kb. O PCV2 é o principal agente etiológico das doenças associadas ao PCV2 (PCVAD), sendo o responsável por grandes perdas econômicas na indústria de suínos. Os objetivos deste trabalho consistiram da utilização de metodologias moleculares para a determinação dos órgãos mais adequados para a quantificação da carga viral do PCV2 e a comparação dos genótipos e carga viral em órgãos com diferentes estágios de lesões teciduais. O DNA foi extraído com o kit Wizard SV Genomic Purification System (Promega). As reações de nested PCR foram realizadas utilizando dois pares de oligonucleotídeos e analisadas em gel de agarose. A PCR em tempo real foi realizada utilizando o método TaqMan. As amostras de tecidos foram fixadas em formol 10%, incluídas em blocos de parafina e processadas para a investigação histopatológica. A comparação da sensibilidade do método da PCR em tempo real com a nested PCR mostrou 91% de amostras positivas pelo método da PCR em tempo real, enquanto a nested PCR foi capaz de detectar apenas 66,5% de amostras positivas. Estes resultados mostram que a PCR em tempo real é mais eficaz para detectar o PCV2 em amostras de tecidos do que a nested PCR. Para as amostras de suínos analisadas, os linfonodos foram os que apresentaram a carga viral média significativamente superior aos demais tipos de órgãos (P<0,01) sendo, portanto, o órgão recomendado para ser utilizado em estudos de diagnóstico e patogenia do PCV2. As comparações entre a carga viral e os quatro graus de lesões não mostraram nenhum resultado significativo, assim acredita-se que os diferentes graus de lesões linfóides podem estar associados a outros co-fatores infecciosos ou não infecciosos.
id UFV_3d435a7e60880b991d907805fee5dbd2
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/2398
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str 2145
spelling Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWSReal time PCR in the detection and quantification of PCV2 in different organs of clinically healthy and presenting PMWS pigsPCR em tempo realCircovírus suíno 2PMWSReal time PCRSwine circovirus 2PMWSCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICAO Porcine circovirus 2 (PCV2) é um vírus não envelopado com genoma de DNA circular fita simples de aproximadamente 1,76 Kb. O PCV2 é o principal agente etiológico das doenças associadas ao PCV2 (PCVAD), sendo o responsável por grandes perdas econômicas na indústria de suínos. Os objetivos deste trabalho consistiram da utilização de metodologias moleculares para a determinação dos órgãos mais adequados para a quantificação da carga viral do PCV2 e a comparação dos genótipos e carga viral em órgãos com diferentes estágios de lesões teciduais. O DNA foi extraído com o kit Wizard SV Genomic Purification System (Promega). As reações de nested PCR foram realizadas utilizando dois pares de oligonucleotídeos e analisadas em gel de agarose. A PCR em tempo real foi realizada utilizando o método TaqMan. As amostras de tecidos foram fixadas em formol 10%, incluídas em blocos de parafina e processadas para a investigação histopatológica. A comparação da sensibilidade do método da PCR em tempo real com a nested PCR mostrou 91% de amostras positivas pelo método da PCR em tempo real, enquanto a nested PCR foi capaz de detectar apenas 66,5% de amostras positivas. Estes resultados mostram que a PCR em tempo real é mais eficaz para detectar o PCV2 em amostras de tecidos do que a nested PCR. Para as amostras de suínos analisadas, os linfonodos foram os que apresentaram a carga viral média significativamente superior aos demais tipos de órgãos (P<0,01) sendo, portanto, o órgão recomendado para ser utilizado em estudos de diagnóstico e patogenia do PCV2. As comparações entre a carga viral e os quatro graus de lesões não mostraram nenhum resultado significativo, assim acredita-se que os diferentes graus de lesões linfóides podem estar associados a outros co-fatores infecciosos ou não infecciosos.Porcine circovirus 2 (PCV2) is a non-enveloped virus containing a single stranded circular DNA of approximately 1.76 Kb. PCV2 is the primary etiologic agent of porcine circovirus-associated disease (PCVAD) responsible for large economic losses in the swine industry. The objectives of this work were to use molecular methods to determine the most suitable organs for quantification of PCV2 viral load and compare the genotype and viral load in organs with different levels of tissue injury. A plasmid containing the complete viral genome was quantified by spectrophotometry and used to create a standard curve for PCV2 quantification. DNA was extracted using the Wizard SV Genomic Purification System (Promega). Reactions of nested PCR were performed using two pairs of primers and analyzed in agarose gel. Real-time PCR was carried out using TaqMan. Tissue samples were fixed in 10% formalin, embedded in paraffin blocks and processed for histopathological investigation. Comparison of sensitivity of real time PCR with nested PCR showed 91% of positive samples by real time PCR, whereas nested PCR detected only 66.5% of positive samples. Results showed that real time PCR is more effective to detect PCV2 in tissue samples than nested PCR. In the tested swine samples, lymph nodes showed mean viral load significantly higher than other types of organs (P <0.01) and thus it is recommended for PCV2 diagnosis and pathogenesis studies. Comparisons among viral load and the four injury levels did not show any significant results, it is believed, therefore, that the different levels of lymphoid lesions may be associated with other infectious or non-infectious co-factors.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoUniversidade Federal de ViçosaBRBioquímica e Biologia molecular de plantas; Bioquímica e Biologia molecular animalMestrado em Bioquímica AgrícolaUFVhttp://lattes.cnpq.br/5824362921133395Fietto, Juliana Lopes Rangelhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4790238D0Brommonschenkel, Sérgio Hermíniohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780948Y4Lamêgo, Márcia Rogéria de Almeidahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782197P4Viloria, Marlene Isabel Vargashttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781964E6Fietto, Luciano Gomeshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4763824H8Zerbini Júnior, Francisco Murilohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783743U5Silva, Fernanda Miquelitto Figueira da2015-03-26T13:07:24Z2009-06-152015-03-26T13:07:24Z2008-10-31info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfapplication/pdfSILVA, Fernanda Miquelitto Figueira da. Real time PCR in the detection and quantification of PCV2 in different organs of clinically healthy and presenting PMWS pigs. 2008. 3 f. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Biologia molecular de plantas; Bioquímica e Biologia molecular animal) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.http://locus.ufv.br/handle/123456789/2398porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFV2016-04-08T02:19:42Zoai:locus.ufv.br:123456789/2398Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-08T02:19:42LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.none.fl_str_mv Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS
Real time PCR in the detection and quantification of PCV2 in different organs of clinically healthy and presenting PMWS pigs
title Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS
spellingShingle Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS
Silva, Fernanda Miquelitto Figueira da
PCR em tempo real
Circovírus suíno 2
PMWS
Real time PCR
Swine circovirus 2
PMWS
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA
title_short Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS
title_full Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS
title_fullStr Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS
title_full_unstemmed Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS
title_sort Utilização da PCR em tempo real na detecção e quantificação de PCV2 em diferentes órgãos de suínos clinicamente sadios e apresentando PMWS
author Silva, Fernanda Miquelitto Figueira da
author_facet Silva, Fernanda Miquelitto Figueira da
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/5824362921133395
Fietto, Juliana Lopes Rangel
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4790238D0
Brommonschenkel, Sérgio Hermínio
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780948Y4
Lamêgo, Márcia Rogéria de Almeida
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782197P4
Viloria, Marlene Isabel Vargas
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781964E6
Fietto, Luciano Gomes
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4763824H8
Zerbini Júnior, Francisco Murilo
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783743U5
dc.contributor.author.fl_str_mv Silva, Fernanda Miquelitto Figueira da
dc.subject.por.fl_str_mv PCR em tempo real
Circovírus suíno 2
PMWS
Real time PCR
Swine circovirus 2
PMWS
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA
topic PCR em tempo real
Circovírus suíno 2
PMWS
Real time PCR
Swine circovirus 2
PMWS
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOQUIMICA
description O Porcine circovirus 2 (PCV2) é um vírus não envelopado com genoma de DNA circular fita simples de aproximadamente 1,76 Kb. O PCV2 é o principal agente etiológico das doenças associadas ao PCV2 (PCVAD), sendo o responsável por grandes perdas econômicas na indústria de suínos. Os objetivos deste trabalho consistiram da utilização de metodologias moleculares para a determinação dos órgãos mais adequados para a quantificação da carga viral do PCV2 e a comparação dos genótipos e carga viral em órgãos com diferentes estágios de lesões teciduais. O DNA foi extraído com o kit Wizard SV Genomic Purification System (Promega). As reações de nested PCR foram realizadas utilizando dois pares de oligonucleotídeos e analisadas em gel de agarose. A PCR em tempo real foi realizada utilizando o método TaqMan. As amostras de tecidos foram fixadas em formol 10%, incluídas em blocos de parafina e processadas para a investigação histopatológica. A comparação da sensibilidade do método da PCR em tempo real com a nested PCR mostrou 91% de amostras positivas pelo método da PCR em tempo real, enquanto a nested PCR foi capaz de detectar apenas 66,5% de amostras positivas. Estes resultados mostram que a PCR em tempo real é mais eficaz para detectar o PCV2 em amostras de tecidos do que a nested PCR. Para as amostras de suínos analisadas, os linfonodos foram os que apresentaram a carga viral média significativamente superior aos demais tipos de órgãos (P<0,01) sendo, portanto, o órgão recomendado para ser utilizado em estudos de diagnóstico e patogenia do PCV2. As comparações entre a carga viral e os quatro graus de lesões não mostraram nenhum resultado significativo, assim acredita-se que os diferentes graus de lesões linfóides podem estar associados a outros co-fatores infecciosos ou não infecciosos.
publishDate 2008
dc.date.none.fl_str_mv 2008-10-31
2009-06-15
2015-03-26T13:07:24Z
2015-03-26T13:07:24Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv SILVA, Fernanda Miquelitto Figueira da. Real time PCR in the detection and quantification of PCV2 in different organs of clinically healthy and presenting PMWS pigs. 2008. 3 f. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Biologia molecular de plantas; Bioquímica e Biologia molecular animal) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.
http://locus.ufv.br/handle/123456789/2398
identifier_str_mv SILVA, Fernanda Miquelitto Figueira da. Real time PCR in the detection and quantification of PCV2 in different organs of clinically healthy and presenting PMWS pigs. 2008. 3 f. Dissertação (Mestrado em Bioquímica e Biologia molecular de plantas; Bioquímica e Biologia molecular animal) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.
url http://locus.ufv.br/handle/123456789/2398
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
BR
Bioquímica e Biologia molecular de plantas; Bioquímica e Biologia molecular animal
Mestrado em Bioquímica Agrícola
UFV
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
BR
Bioquímica e Biologia molecular de plantas; Bioquímica e Biologia molecular animal
Mestrado em Bioquímica Agrícola
UFV
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1822610574621540352