Impacto da restrição de dados na avaliação genética animal

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Yamaki, Marcos
Data de Publicação: 2009
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: http://locus.ufv.br/handle/123456789/1299
Resumo: Populations were simulated by information from a population A, with 59.028 Landrace swines, and a population B, 17.116 Pietrain swines, aiming to evaluate the impact of restrictions strategies on genetic evaluation of simulated and real populations. Simulated populations were generated by the pedigree and phenotypic means for age to reach 100 kg live weight, back fat thickness at 100 kg of live weight and feed conversion ratio, of their respective populations. On both type of populations, simulated and real, two situations were evaluated on three different restrictions, commonly used on animal genetic evaluations. The studied restrictions were: number of generations considered on the analysis, considering the last six and three generations of the populations, minimum offspring by boars, considering males with at least ten and 50 offspring and minimum observations considered on levels of fixed effect of contemporary group, considering at least six and three observations by level. Expected breeding values (EBV) from group of the selected animals, obtained by using complete data set, were compared to the EBV’s obtained on the various scenarios described on each type of restriction for simulated and real populations. The EBV’s of selected animals after restrictions were rescued from analysis of respective populations using the entire data set. Greater variations on heritabilities, and consequently on EBV’s, were observed that restriction that considered the last three generations on both populations, A and B, and this behavior was also observed on the real populations. The analysis restricting boars with less than 50 offspring caused the second bigger variation on B populations. The restriction of dataset to three generations is not indicated for genetic evaluations, on big and small populations, for causing huge variations on EBV’s and compromising the evaluations.
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Tese (Doutorado em Genética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; Me) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2009.http://locus.ufv.br/handle/123456789/1299Populations were simulated by information from a population A, with 59.028 Landrace swines, and a population B, 17.116 Pietrain swines, aiming to evaluate the impact of restrictions strategies on genetic evaluation of simulated and real populations. Simulated populations were generated by the pedigree and phenotypic means for age to reach 100 kg live weight, back fat thickness at 100 kg of live weight and feed conversion ratio, of their respective populations. On both type of populations, simulated and real, two situations were evaluated on three different restrictions, commonly used on animal genetic evaluations. The studied restrictions were: number of generations considered on the analysis, considering the last six and three generations of the populations, minimum offspring by boars, considering males with at least ten and 50 offspring and minimum observations considered on levels of fixed effect of contemporary group, considering at least six and three observations by level. Expected breeding values (EBV) from group of the selected animals, obtained by using complete data set, were compared to the EBV’s obtained on the various scenarios described on each type of restriction for simulated and real populations. The EBV’s of selected animals after restrictions were rescued from analysis of respective populations using the entire data set. Greater variations on heritabilities, and consequently on EBV’s, were observed that restriction that considered the last three generations on both populations, A and B, and this behavior was also observed on the real populations. The analysis restricting boars with less than 50 offspring caused the second bigger variation on B populations. The restriction of dataset to three generations is not indicated for genetic evaluations, on big and small populations, for causing huge variations on EBV’s and compromising the evaluations.Populações simuladas foram geradas a partir de informações de uma população A, composta por 59.028 animais da raça Landrace, e de uma população B, composta por 17.116 animais da raça Pietrain, com o objetivo de avaliar o impacto de diferentes estratégias de restrição de dados em avaliações genéticas de populações simuladas e reais. As populações simuladas foram geradas a partir do pedigree das populações reais e das médias fenotípicas das características idade aos 100 kg de peso vivo, espessura de toucinho aos 100 kg de peso vivo e conversão alimentar, de suas respectivas populações assumindo (co)variâncias genéticas aditivas e residuais conhecidas para as características. Foram avaliadas, nas populações simuladas e nas reais, duas situações, em três diferentes estratégias de restrição de dados comumente utilizadas em avaliações genéticas de animais. As restrições estudadas foram: número de gerações consideradas na análise, considerando as últimas seis e três gerações das populações, número mínimo de filhos por macho, considerando pais com pelo menos dez e 50 filhos e número mínimo de observações permitidas por nível de efeito fixo de grupo contemporâneo, considerando pelo menos seis e três observações por nível de GC. Foram obtidas as estimativas dos componentes de (co)variância das populações simuladas, em cada situação de restrição, e comportamentos da alteração de estimativas de parâmetros e valores genéticos foram comparados com as respectivas populações reais. Para avaliar as alterações, foram criados índices de seleção para cada sexo de cada população (A e B). As médias de valores genéticos estimados do grupo de animais selecionados, utilizando o banco de dados completo, foram comparadas às médias obtidas nos diversos cenários descritos em cada tipo de restrição para as populações simuladas e reais. A média dos animais selecionados após as restrições foi resgatada da análise das respectivas populações utilizando o banco de dados completo. Maiores variações nas estimativas de herdabilidade, e conseqüentemente nos valores genéticos, foram observadas na restrição considerando as últimas três gerações, tanto na população simulada B quanto na A e também verificou-se o mesmo comportamento nas populações reais. Além desta, a restrição de machos com pelo menos 50 filhos foi a que causou as maiores alterações depois desta nas populações B. A restrição do arquivo de dados a três gerações é extremamente em estudos de avaliação genética, tantona população A quanto B, por causar grandes alterações nas estimavas dos valores genéticos e comprometendo as avaliações.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicoapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaDoutorado em Genética e MelhoramentoUFVBRGenética animal; Genética molecular e de microrganismos; Genética quantitativa; Genética vegetal; MeSimulaçãoÍndice de seleçãoParâmetros genéticosSimulationSelection indexGenetic parametersCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOSImpacto da restrição de dados na avaliação genética animalImpact of data restriction on animal genetic evaluationinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf236000https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1299/1/texto%20completo.pdf2afd232bd651763381d291a807fd41bbMD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain86017https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1299/2/texto%20completo.pdf.txte37e5f34004d5e9f12a05db97daadfb9MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3449https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/1299/3/texto%20completo.pdf.jpg75bb95e3572cf347ffa782b1e5563f61MD53123456789/12992016-04-07 23:02:26.067oai:locus.ufv.br:123456789/1299Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-08T02:02:26LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
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