Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Silveira, Thamyres Cardoso da
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Tese
Idioma: eng
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/21588
Resumo: Manihot Mill. (Euphorbiaceae) é um gênero Neotropical com aproximadamente 100 espécies. Manihot carthagenensis é uma espécie muito polimórfica e associada com ambientes secos, principalmente a caatinga e o chaco. Atualmente, critérios morfológicos associados com distribuição geográfica distingue três táxons infraespecíficos em M. carthagenensis: M. carthagenensis subsp. carthagenensis, M. carthagenensis subsp. glaziovii, and M. carthagenensis subsp. hahnii. Reunimos conjuntos de dados multilocus com dados de sequências de DNA obtidos de quatro genes nucleares (sts, ch_metE, g3pdh, and nia-i3) para 34 amostras das três subespécies de M. carthagenensis e 14 amostras de 10 espécies relacionadas e realizamos análise filogenética Bayesiana. Também obtivemos dados de microssatélites para 19 populações representativas amostradas ao longo da maior parte da extensão conhecida de M. carthagenensis, para investigar a estrutura genética e diversidade. Nosso estudo filogenético sugeriu que M. carthagenensis, como atualmente circunscrita, não constitui um clado monofilético mas representa três linhagens bem diferenciadas: M. carthagenensis, M. glaziovii e M. hahnii. Essas três linhagens foram apoiadas com base em diferenças morfológicas, relações genealógicas e associação com a vegetação. Dados de microssatélites sugerem que M. carthagenensis consiste em pelo menos três pools gênicos distintos, parcialmente estruturados de acordo com a geografia. Hipotetizamos que esses pools gênicos evoluíram em alopatria mas permaneceram interférteis e foram capazes de produzir zonas híbridas após reconexão. Assim, a mistura genética generalizada que observamos é de origem recente e devido à expansão populacional.
id UFV_423d672d085008f8b8b83d494c53faf1
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/21588
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str 2145
spelling Martins, Márcio Lacerda LopesSilveira, Thamyres Cardoso dahttp://lattes.cnpq.br/4411732208380218Oliveira, Luiz Orlando de2018-09-03T17:15:44Z2018-09-03T17:15:44Z2018-06-28SILVEIRA, Thamyres Cardoso da. Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America. 2018. 48 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2018.http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/21588Manihot Mill. (Euphorbiaceae) é um gênero Neotropical com aproximadamente 100 espécies. Manihot carthagenensis é uma espécie muito polimórfica e associada com ambientes secos, principalmente a caatinga e o chaco. Atualmente, critérios morfológicos associados com distribuição geográfica distingue três táxons infraespecíficos em M. carthagenensis: M. carthagenensis subsp. carthagenensis, M. carthagenensis subsp. glaziovii, and M. carthagenensis subsp. hahnii. Reunimos conjuntos de dados multilocus com dados de sequências de DNA obtidos de quatro genes nucleares (sts, ch_metE, g3pdh, and nia-i3) para 34 amostras das três subespécies de M. carthagenensis e 14 amostras de 10 espécies relacionadas e realizamos análise filogenética Bayesiana. Também obtivemos dados de microssatélites para 19 populações representativas amostradas ao longo da maior parte da extensão conhecida de M. carthagenensis, para investigar a estrutura genética e diversidade. Nosso estudo filogenético sugeriu que M. carthagenensis, como atualmente circunscrita, não constitui um clado monofilético mas representa três linhagens bem diferenciadas: M. carthagenensis, M. glaziovii e M. hahnii. Essas três linhagens foram apoiadas com base em diferenças morfológicas, relações genealógicas e associação com a vegetação. Dados de microssatélites sugerem que M. carthagenensis consiste em pelo menos três pools gênicos distintos, parcialmente estruturados de acordo com a geografia. Hipotetizamos que esses pools gênicos evoluíram em alopatria mas permaneceram interférteis e foram capazes de produzir zonas híbridas após reconexão. Assim, a mistura genética generalizada que observamos é de origem recente e devido à expansão populacional.Manihot Mill. (Euphorbiaceae) is a Neotropical genus with approximately 100 species. Manihot carthagenensis is a very polymorphic species and associated with dry environments, mostly the caatinga and the chaco. Currently, morphological criteria associated with geographic distribution distinguish three infraspecific taxa in M. carthagenensis: M. carthagenensis subsp. carthagenensis, M. carthagenensis subsp. glaziovii, and M. carthagenensis subsp. hahnii. Herein, we assembled multilocus datasets with DNA sequence data obtained from four nuclear genes (sts, ch_metE, g3pdh, and nia-i3) for 34 samples of the three subspecies of M. carthagenensis and 14 samples from 10 closely-related species and carried out Bayesian phylogenetic analyses. We also obtained microsatellite data from 19 representative populations sampled throughout most of the known range of M. carthagenensis to investigate genetic structure and diversity. Our phylogenetic study suggested that M. carthagenensis, as presently circumscribed, does not constitute a monophyletic clade, but represents three well-differentiated lineages: M. carthagenensis, M. glaziovii and M. hahnii. These three lineages were supported based on morphological differences, genealogical relationships, and vegetation associations. Microsatellite data suggest that M. carthagenensis consists of at least three distinct gene pools partly structured according to geography. We hyphothesized that these gene pools evolved in allopatry but remained interfertile and were able to produce hybrid zones after reconnecting. Thereby the genetic admixture is of recent origin and owing to population expansion.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoengUniversidade Federal de ViçosaMicrossatélites (Genética)Manihot carthagenensis - FilogeniaFilogeografiaCiências AgráriasEvolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South AmericaHistória evolutiva de Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) e espécies afins no leste da América do Sulinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de Bioquímica e Biologia MolecularDoutor em Genética e MelhoramentoViçosa - MG2018-06-28Doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf1536754https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/21588/1/texto%20completo.pdfb298a5181a8740d77097de57b1778b9bMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/21588/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3703https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/21588/3/texto%20completo.pdf.jpge8c801e8d53b3eeb167df3675f304799MD53123456789/215882018-09-03 23:00:44.825oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452018-09-04T02:00:44LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.en.fl_str_mv Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America
dc.title.pt-BR.fl_str_mv História evolutiva de Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) e espécies afins no leste da América do Sul
title Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America
spellingShingle Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America
Silveira, Thamyres Cardoso da
Microssatélites (Genética)
Manihot carthagenensis - Filogenia
Filogeografia
Ciências Agrárias
title_short Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America
title_full Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America
title_fullStr Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America
title_full_unstemmed Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America
title_sort Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America
author Silveira, Thamyres Cardoso da
author_facet Silveira, Thamyres Cardoso da
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt-BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4411732208380218
dc.contributor.none.fl_str_mv Martins, Márcio Lacerda Lopes
dc.contributor.author.fl_str_mv Silveira, Thamyres Cardoso da
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Oliveira, Luiz Orlando de
contributor_str_mv Oliveira, Luiz Orlando de
dc.subject.pt-BR.fl_str_mv Microssatélites (Genética)
Manihot carthagenensis - Filogenia
Filogeografia
topic Microssatélites (Genética)
Manihot carthagenensis - Filogenia
Filogeografia
Ciências Agrárias
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Ciências Agrárias
description Manihot Mill. (Euphorbiaceae) é um gênero Neotropical com aproximadamente 100 espécies. Manihot carthagenensis é uma espécie muito polimórfica e associada com ambientes secos, principalmente a caatinga e o chaco. Atualmente, critérios morfológicos associados com distribuição geográfica distingue três táxons infraespecíficos em M. carthagenensis: M. carthagenensis subsp. carthagenensis, M. carthagenensis subsp. glaziovii, and M. carthagenensis subsp. hahnii. Reunimos conjuntos de dados multilocus com dados de sequências de DNA obtidos de quatro genes nucleares (sts, ch_metE, g3pdh, and nia-i3) para 34 amostras das três subespécies de M. carthagenensis e 14 amostras de 10 espécies relacionadas e realizamos análise filogenética Bayesiana. Também obtivemos dados de microssatélites para 19 populações representativas amostradas ao longo da maior parte da extensão conhecida de M. carthagenensis, para investigar a estrutura genética e diversidade. Nosso estudo filogenético sugeriu que M. carthagenensis, como atualmente circunscrita, não constitui um clado monofilético mas representa três linhagens bem diferenciadas: M. carthagenensis, M. glaziovii e M. hahnii. Essas três linhagens foram apoiadas com base em diferenças morfológicas, relações genealógicas e associação com a vegetação. Dados de microssatélites sugerem que M. carthagenensis consiste em pelo menos três pools gênicos distintos, parcialmente estruturados de acordo com a geografia. Hipotetizamos que esses pools gênicos evoluíram em alopatria mas permaneceram interférteis e foram capazes de produzir zonas híbridas após reconexão. Assim, a mistura genética generalizada que observamos é de origem recente e devido à expansão populacional.
publishDate 2018
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2018-09-03T17:15:44Z
dc.date.available.fl_str_mv 2018-09-03T17:15:44Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2018-06-28
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SILVEIRA, Thamyres Cardoso da. Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America. 2018. 48 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2018.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/21588
identifier_str_mv SILVEIRA, Thamyres Cardoso da. Evolutionary history of Manihot carthagenensis (Euphorbiaceae) and allied species in eastern South America. 2018. 48 f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2018.
url http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/21588
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/21588/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/21588/2/license.txt
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/21588/3/texto%20completo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv b298a5181a8740d77097de57b1778b9b
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
e8c801e8d53b3eeb167df3675f304799
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1801213104972890112