Caracterização morfológica e molecular de espécies endofíticas e patogênicas de Colletotrichum associadas a oiti (Licania tomentosa)
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Título da fonte: | LOCUS Repositório Institucional da UFV |
Texto Completo: | https://locus.ufv.br//handle/123456789/27414 |
Resumo: | A antracnose é a doença mais importante do oiti (Licania tomentosa), esta espécie florestal é utilizada principalmente para arborização de cidades brasileiras. Entretanto, estudos abrangentes para elucidar a etiologia desta doença são escassos. O objetivo desse trabalho foi identificar, com base em caracteres morfológicos e dados moleculares, as espécies endofíticas e patogênicas de Colletotrichum em oiti. Amostras de folhas sadias e com sintomas típicos de antracnose foram coletadas nos estados de Minas Gerais, Bahia, Espírito Santo, São Paulo, Rio de Janeiro, Goiás, Paraná, Alagoas e no Distrito Federal. Um total de 32 isolados monospóricos (8 endofíticos e 24 patogênicos) foram obtidos por isolamento indireto (folhas assintomáticas e sintomáticas) e direto (folhas sintomáticas). O DNA genômico foi extraído para amplificação da região parcial do gene GAPDH. As sequências foram comparadas no banco de dados Q-Bank Fungi e após uma identificação preliminar, um subconjunto de 6 isolados (patogênicos e endofíticos) foram selecionados para sequenciamento das regiões parciais dos genes ACT, CAL, CHS1, GAPDH, TUB2, SOD2 e ITS. As sete regiões gênicas foram concatenadas para análise por Inferência Bayesiana. Após a identificação molecular, um isolado representativo de cada espécie foi selecionado para caracterização morfológica (taxa de crescimento da colônia, forma e tamanho de conídios e apressórios). Para comprovar a patogenicidade, plantas de L. tomentosa foram inoculadas com discos de micélio na superfície adaxial das folhas. A caracterização morfológica e análise filogenética confirmaram que todos isolados pertenceram ao complexo C. gloeosporioides, sendo as espécies C. fructicola e C. tropicale encontradas apenas endofíticamente, enquanto Colletotrichum sp. nov. encontrada tanto de forma endofítica quanto patogênica. De acordo com o teste de patogenicidade, todas as espécies causaram doença em L. tomentosa. Porém Colletotrichum sp. nov. foi significativamente mais agressiva. Estes resultados sugerem que a antracnose em oiti no Brasil é causada por uma nova espécie de Colletotrichum, ainda desconhecida pela comunidade científica. |
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Lisboa, Daniela de Oliveirahttp://lattes.cnpq.br/5957358954355979Furtado, Gleiber Quintão2019-11-13T11:38:42Z2019-11-13T11:38:42Z2015-02-24LISBOA, Daniela de Oliveira. Caracterização morfológica e molecular de espécies endofíticas e patogênicas de Colletotrichum associadas a oiti (Licania tomentosa). 2015. 25 f. Dissertação (Mestrado em Fitopatologia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2015.https://locus.ufv.br//handle/123456789/27414A antracnose é a doença mais importante do oiti (Licania tomentosa), esta espécie florestal é utilizada principalmente para arborização de cidades brasileiras. Entretanto, estudos abrangentes para elucidar a etiologia desta doença são escassos. O objetivo desse trabalho foi identificar, com base em caracteres morfológicos e dados moleculares, as espécies endofíticas e patogênicas de Colletotrichum em oiti. Amostras de folhas sadias e com sintomas típicos de antracnose foram coletadas nos estados de Minas Gerais, Bahia, Espírito Santo, São Paulo, Rio de Janeiro, Goiás, Paraná, Alagoas e no Distrito Federal. Um total de 32 isolados monospóricos (8 endofíticos e 24 patogênicos) foram obtidos por isolamento indireto (folhas assintomáticas e sintomáticas) e direto (folhas sintomáticas). O DNA genômico foi extraído para amplificação da região parcial do gene GAPDH. As sequências foram comparadas no banco de dados Q-Bank Fungi e após uma identificação preliminar, um subconjunto de 6 isolados (patogênicos e endofíticos) foram selecionados para sequenciamento das regiões parciais dos genes ACT, CAL, CHS1, GAPDH, TUB2, SOD2 e ITS. As sete regiões gênicas foram concatenadas para análise por Inferência Bayesiana. Após a identificação molecular, um isolado representativo de cada espécie foi selecionado para caracterização morfológica (taxa de crescimento da colônia, forma e tamanho de conídios e apressórios). Para comprovar a patogenicidade, plantas de L. tomentosa foram inoculadas com discos de micélio na superfície adaxial das folhas. A caracterização morfológica e análise filogenética confirmaram que todos isolados pertenceram ao complexo C. gloeosporioides, sendo as espécies C. fructicola e C. tropicale encontradas apenas endofíticamente, enquanto Colletotrichum sp. nov. encontrada tanto de forma endofítica quanto patogênica. De acordo com o teste de patogenicidade, todas as espécies causaram doença em L. tomentosa. Porém Colletotrichum sp. nov. foi significativamente mais agressiva. Estes resultados sugerem que a antracnose em oiti no Brasil é causada por uma nova espécie de Colletotrichum, ainda desconhecida pela comunidade científica.Anthracnose is the disease most important of oiti (Licania tomentosa), this forest species is mainly used for afforestation Brazilian cities. However, comprehensive studies to elucidate the etiology of this disease are limited. The objective of this study was to identify, based on morphology and molecular data, endophytic and pathogenic species of Colletotrichum in oiti. Samples of uninfested leaves and with the typical anthracnose symptoms were collected from trees in the states of Minas Gerais, Bahia, Espírito Santo, São Paulo, Rio de Janeiro, Goiás, Paraná, Alagoas and in Distrito Federal. A total of 32 isolates monosporic (8 endophytic and 25 pathogenic) were obtained by indirect isolation (assymptomatic and symptomatic leaves) and direct isolation (symptomatic leaves). Genomic DNA was extracted for amplification of the partial region of GAPDH. The sequences were compared with the database Q-Bank Fungi and after a preliminary identification, subset of six isolates (pathogenic and endophytic) was selected for partial sequencing of regions of genes ACT, CAL, CHS1, GAPDH, TUB2, SOD2 and ITS. The seven genic regions were concatenated for analysis by Bayesian Inference. Following the molecular identification one isolate representative of each specie was selected for morphologic characterization (colony growth, conidial size and appressoria shape). To prove the pathogenicity, oiti plants were inoculated with mycelial plugs placed on the adaxial surface of the leaves. The morphological characterization and phylogenetic analysis confirmed that all isolates belonged to complex C. gloeosporioides, being the species C. fructicola and C. tropicale found only endophytically, while Colletotrichum sp. nov. was found as endophytics and as pathogenics. According to the pathogenicity test, all species caused disease in oiti. However Colletotrichum sp. nov. was significantly most aggressive. These results suggest that anthracnose on oiti in Brazil is caused by a new species of Colletotrichum, still unknown to scientific community.porUniversidade Federal de ViçosaLicania tomentosaFilogeniaAntractoneColletotrichumFungos patogênicosFitopatologiaCaracterização morfológica e molecular de espécies endofíticas e patogênicas de Colletotrichum associadas a oiti (Licania tomentosa)Morphological and molecular characterization of endophytic and pathogenic species of Colletotrichum associated with oiti (Licania tomentosa)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de FitopatologiaMestre em FitopatologiaViçosa - MG2015-02-24Mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf761448https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/27414/1/texto%20completo.pdf106ff705a992e80cf69ee8cc5eab1c6eMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/27414/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/274142019-11-22 09:48:28.155oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452019-11-22T12:48:28LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false |
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