Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Brito, Giovani Greigh de
Data de Publicação: 2007
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: http://locus.ufv.br/handle/123456789/996
Resumo: Coffee leaf rust caused by the fungus Hemileia vastatrix is the most important disease of Coffea arabica. The objective of this study was to characterize the inheritance of coffee resistance gene to race II of this pathogen, and to identify and map molecular markers linked to this trait. Different segregation populations were used to achieve these objectives, as F2 (160 individuals), BCr (20), and BCs (135), originated from cross the Timor Hybrid UFV 427-15 (CIFC 1343-136), resistant and Catuai Amarelo UFV 2143-236 (IAC 30), susceptible. In the Timor Hybrids populations were detected five gene (SH5 at SH9) that, in isolated way or in association, could confer resistance to the physiologic races of H. vastatrix to the moment identified. The segregation analysis have shown that resistance to coffee rust race II in Timor Hybrid (UFV 427-15, resistant) is conferred by a single dominant gene. The amplification of 852 primers ombinations using bulked segregant analysis and AFLP methodologies, has allowed the identification of three molecular markers linked to the resistance gene. Genetic mapping of these three markers in the F2 population has shown that they are distributed in both sides of the resistance gene. In one side of the resistance gene, it was found the marker E.CTC/M.TTT405 at 8,69 cM, (LOD =18,91) and E.CGT/M.TGT300 at 28,00 cM (LOD= 4,02), whereas in ther side, the marker E.CCT/M.TTC230 was at 20,50 cM (LOD= 6,15). These markers are the first rust resistance markers identified in Timor Hybrid and can be useful for molecular assisted breeding for rust resistance programs in Brazil.
id UFV_4b8e6155e20ebb70c931054658f71f9f
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/996
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str 2145
spelling Brito, Giovani Greigh dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4778792D8Caixeta, Eveline Teixeirahttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728636Z7Loureiro, Marcelo Ehlershttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780851Y3Zambolim, Eunize Macielhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783380J6Pereira, Luiz Filipe Protasiohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782233H5Pereira, Antonio Alveshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780579Y12015-03-26T12:40:44Z2007-04-192015-03-26T12:40:44Z2007-02-13BRITO, Giovani Greigh de. Genetic mapping of AFLP markers linked to Hemileia vastatrix Berk. & Br. resistance gene. 2007. 66 f. Tese (Doutorado em Controle da maturação e senescência em órgãos perecíveis; Fisiologia molecular de plantas superiores) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2007.http://locus.ufv.br/handle/123456789/996Coffee leaf rust caused by the fungus Hemileia vastatrix is the most important disease of Coffea arabica. The objective of this study was to characterize the inheritance of coffee resistance gene to race II of this pathogen, and to identify and map molecular markers linked to this trait. Different segregation populations were used to achieve these objectives, as F2 (160 individuals), BCr (20), and BCs (135), originated from cross the Timor Hybrid UFV 427-15 (CIFC 1343-136), resistant and Catuai Amarelo UFV 2143-236 (IAC 30), susceptible. In the Timor Hybrids populations were detected five gene (SH5 at SH9) that, in isolated way or in association, could confer resistance to the physiologic races of H. vastatrix to the moment identified. The segregation analysis have shown that resistance to coffee rust race II in Timor Hybrid (UFV 427-15, resistant) is conferred by a single dominant gene. The amplification of 852 primers ombinations using bulked segregant analysis and AFLP methodologies, has allowed the identification of three molecular markers linked to the resistance gene. Genetic mapping of these three markers in the F2 population has shown that they are distributed in both sides of the resistance gene. In one side of the resistance gene, it was found the marker E.CTC/M.TTT405 at 8,69 cM, (LOD =18,91) and E.CGT/M.TGT300 at 28,00 cM (LOD= 4,02), whereas in ther side, the marker E.CCT/M.TTC230 was at 20,50 cM (LOD= 6,15). These markers are the first rust resistance markers identified in Timor Hybrid and can be useful for molecular assisted breeding for rust resistance programs in Brazil.A ferrugem alaranjada causada por Hemileia vastatrix Berk et Br é tida como a mais importante doença do cafeeiro. Este trabalho objetivou estudar a herança gênica e a identificação de marcadores moleculares ligados ao gene que confere resistência à raça II de H vastatrix. Para este estudo foram utilizados a população F2 (160 indivíduos), o retrocruzamento resistente (RCr; 20 indivíduos) e o suscetível (RCs, 135 indivíduos), derivados do cruzamento entre o Híbrido de Timor UFV 427-15 (CIFC 1343-136), genitor resistente e o suscetível Catuaí Amarelo UFV-2143-36 (IAC 30). Na população do Híbrido de Timor já foram detectados cinco genes (SH5 a SH9) que, de forma isolada ou em associação, conferem resistência às raças fisiológicas de H. vastatrix até o momento identificadas. Constituem-se, portanto, em importantes fontes de resistência, as quais poderão auxiliar na obtenção de cultivares que apresentem resistência durável a esta doença. A análise de segregação das populações, em estudo, indicou que um único gene dominante, presente no acesso do Híbrido de Timor UFV427-5, é responsável pela resistência à raça II do fungo H. vastatrix. Foram utilizadas as metodologias de BSA (Bulked Segregant Analysis) e AFLP, e analisadas 852 combinações de primers, que permitiram identificar três marcadores ligados ao gene de resistência. O mapeamento genético na população F2 demonstrou que estes marcadores flanqueiam esse gene. De um lado, o marcador E.CTC/M.TTT405 posicionase a 8,69 cM do gene, (LOD= 18,91), enquanto o marcador E.CGT/M.TGT300 dista-se 28,00 cM (LOD= 4,02). Do outro lado do gene, o marcador E.CCT/M.TTC230 situa-se a 20,50 cM do gene de resistência (LOD= 6,15). Estes são os primeiros marcadores ligados ao gene de resistência à ferrugem presente no Híbrido de Timor identificados e poderão ser úteis na seleção em programas de melhoramento para a resistência à ferrugem.Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicoapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaDoutorado em Fisiologia VegetalUFVBRControle da maturação e senescência em órgãos perecíveis; Fisiologia molecular de plantas superioresMapeamento genéticoMarcadores genéticosCaféFerrugem do cafeeiroAFLPGenetic mappingGenetic markersCoffeeCoffee rustAFLPCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA::FISIOLOGIA VEGETALMapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.Genetic mapping of AFLP markers linked to Hemileia vastatrix Berk. & Br. resistance geneinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf1232158https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/996/1/texto%20completo.pdf2d985a98a3e6bd99bd610f375268e606MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain113374https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/996/2/texto%20completo.pdf.txt8ffb92909a8e413073e18d91030718a6MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3690https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/996/3/texto%20completo.pdf.jpgbaca8b9c8150fb9632bae998616971a5MD53123456789/9962016-04-06 23:21:43.65oai:locus.ufv.br:123456789/996Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-07T02:21:43LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.por.fl_str_mv Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Genetic mapping of AFLP markers linked to Hemileia vastatrix Berk. & Br. resistance gene
title Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.
spellingShingle Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.
Brito, Giovani Greigh de
Mapeamento genético
Marcadores genéticos
Café
Ferrugem do cafeeiro
AFLP
Genetic mapping
Genetic markers
Coffee
Coffee rust
AFLP
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA::FISIOLOGIA VEGETAL
title_short Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.
title_full Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.
title_fullStr Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.
title_full_unstemmed Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.
title_sort Mapeamento genético de marcadores AFLP ligados ao gene de resistência do cafeeiro à Hemileia vastatrix Berk. & Br.
author Brito, Giovani Greigh de
author_facet Brito, Giovani Greigh de
author_role author
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4778792D8
dc.contributor.author.fl_str_mv Brito, Giovani Greigh de
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Caixeta, Eveline Teixeira
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728636Z7
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Loureiro, Marcelo Ehlers
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780851Y3
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Zambolim, Eunize Maciel
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4783380J6
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Pereira, Luiz Filipe Protasio
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4782233H5
dc.contributor.referee3.fl_str_mv Pereira, Antonio Alves
dc.contributor.referee3Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780579Y1
contributor_str_mv Caixeta, Eveline Teixeira
Loureiro, Marcelo Ehlers
Zambolim, Eunize Maciel
Pereira, Luiz Filipe Protasio
Pereira, Antonio Alves
dc.subject.por.fl_str_mv Mapeamento genético
Marcadores genéticos
Café
Ferrugem do cafeeiro
AFLP
topic Mapeamento genético
Marcadores genéticos
Café
Ferrugem do cafeeiro
AFLP
Genetic mapping
Genetic markers
Coffee
Coffee rust
AFLP
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA::FISIOLOGIA VEGETAL
dc.subject.eng.fl_str_mv Genetic mapping
Genetic markers
Coffee
Coffee rust
AFLP
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA::FISIOLOGIA VEGETAL
description Coffee leaf rust caused by the fungus Hemileia vastatrix is the most important disease of Coffea arabica. The objective of this study was to characterize the inheritance of coffee resistance gene to race II of this pathogen, and to identify and map molecular markers linked to this trait. Different segregation populations were used to achieve these objectives, as F2 (160 individuals), BCr (20), and BCs (135), originated from cross the Timor Hybrid UFV 427-15 (CIFC 1343-136), resistant and Catuai Amarelo UFV 2143-236 (IAC 30), susceptible. In the Timor Hybrids populations were detected five gene (SH5 at SH9) that, in isolated way or in association, could confer resistance to the physiologic races of H. vastatrix to the moment identified. The segregation analysis have shown that resistance to coffee rust race II in Timor Hybrid (UFV 427-15, resistant) is conferred by a single dominant gene. The amplification of 852 primers ombinations using bulked segregant analysis and AFLP methodologies, has allowed the identification of three molecular markers linked to the resistance gene. Genetic mapping of these three markers in the F2 population has shown that they are distributed in both sides of the resistance gene. In one side of the resistance gene, it was found the marker E.CTC/M.TTT405 at 8,69 cM, (LOD =18,91) and E.CGT/M.TGT300 at 28,00 cM (LOD= 4,02), whereas in ther side, the marker E.CCT/M.TTC230 was at 20,50 cM (LOD= 6,15). These markers are the first rust resistance markers identified in Timor Hybrid and can be useful for molecular assisted breeding for rust resistance programs in Brazil.
publishDate 2007
dc.date.available.fl_str_mv 2007-04-19
2015-03-26T12:40:44Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2007-02-13
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-26T12:40:44Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv BRITO, Giovani Greigh de. Genetic mapping of AFLP markers linked to Hemileia vastatrix Berk. & Br. resistance gene. 2007. 66 f. Tese (Doutorado em Controle da maturação e senescência em órgãos perecíveis; Fisiologia molecular de plantas superiores) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2007.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://locus.ufv.br/handle/123456789/996
identifier_str_mv BRITO, Giovani Greigh de. Genetic mapping of AFLP markers linked to Hemileia vastatrix Berk. & Br. resistance gene. 2007. 66 f. Tese (Doutorado em Controle da maturação e senescência em órgãos perecíveis; Fisiologia molecular de plantas superiores) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2007.
url http://locus.ufv.br/handle/123456789/996
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher.program.fl_str_mv Doutorado em Fisiologia Vegetal
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFV
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Controle da maturação e senescência em órgãos perecíveis; Fisiologia molecular de plantas superiores
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/996/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/996/2/texto%20completo.pdf.txt
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/996/3/texto%20completo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 2d985a98a3e6bd99bd610f375268e606
8ffb92909a8e413073e18d91030718a6
baca8b9c8150fb9632bae998616971a5
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1801212994976219136