Identificação de genes que codificam proteínas secretadas por Puccinia psidii, agente etiológico da ferrugem das mirtáceas

• Autor(a) principal: Silva, Ricardo Roberto da
• Data de Publicação: 2010
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: http://locus.ufv.br/handle/123456789/4714
• topic: Eucalyptus; Puccinia psidii; Efetor; Resistência; Eucalyptus; Puccinia psidii; Effector; Resistance; CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::RECURSOS FLORESTAIS E ENGENHARIA FLORESTAL::SILVICULTURA::GENETICA E MELHORAMENTO FLORESTAL

A ferrugem causada pelo basidiomiceto Puccinia psidii é uma das doenças mais destrutivas da cultura do eucalipto no Brasil, e motivo de restrições sanitárias onde a doença ainda não ocorre na Ásia e Oceania. Durante a interação com o hospedeiro os fungos biotróficos, como as ferrugens, secretam proteínas efetoras envolvidas na supressão da resposta de defesa e na manipulação do metabolismo do hospedeiro. Uma estratégia que pode ser utilizada para descoberta dessas proteínas é a predição in silico de sequências de exportação celular em sequências abertas de leitura deduzidas a partir do sequenciamento de cDNAs. O presente trabalho teve por objetivo identificar e caracterizar sequências de cDNAs de P. psidii que codificam proteínas secretadas por meio da análise de seqüências de uma biblioteca de cDNA construída a partir de mRNA isolado de folhas de Eucalyptus grandis infectadas por P. psidii. Foram analisadas 9864 etiquetas de seqüências expressas (ESTs). A partir de 1675 transcritos que codificam proteínas sem similaridade a sequências protéicas do banco não redundante do GenBank/NCBI e que não possuíam identidade a sequências de cDNA ou sequências genômicas depositadas em bancos de dados de eucalipto, foram obtidas 173 ORFs que apresentaram predição positiva em cinco ou mais parâmetros do algoritmo de predição de sequências sinal de exportação SignalP. Foi selecionado um subgrupo de 31 clones com melhores valores de predição de exportação celular em diferentes algoritmos para caracterização. Vinte e nove dos clones selecionados tiveram a região da ORF amplificada do genoma de P. psidii, gerando fragmentos iguais ou maiores aos amplificados a partir do cDNA. Oito clones apresentaram similaridade a seqüências de Puccinia graminis e cinco a sequências de Melampsora laricis, dentre as quais, quatro têm similares em ambos os bancos. Os clones selecionados também foram comparados entre si utilizando o programa BlastP, e apresentaram similaridade, variando desde pequenos motivos compartilhados a extensa identidade. Foi confirmada a secreção in vitro das proteínas codificadas por 24 clones pelo sistema de armadilha de sinal de secreção em levedura (YST). Vinte clones tiveram sua ORF clonada em um vetor para expressão transiente mediada por Agrobacterium. Análises de expressão transiente e do monitoramento da expressão das proteínas secretadas estão sendo otimizados para investigação do papel efetor das proteínas hipotéticas identificadas.