Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Santos, Simone Gualberto
Data de Publicação: 2008
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: http://locus.ufv.br/handle/123456789/351
Resumo: The genus Dalbergia L. f. (Fabaceae: Papilionoideae) includes approximately 100 pantropical species. In Brazil there are 40 Dalbergia species distributed in different Brazilian ecossistems. D. nigra and D. miscolobium which occur in the Mata Atlântica and Cerrado regions, respectively, are considered to be vicariant. Vicariance between these two species has been investigated by phytosociological and chymosystematic studies, however, new approaches need to be used for these studies as this hypothesis has not been confirmed and is not fully accepted by the scientific community. In this work the chloroplast trnL intron sequences of D. nigra and D. miscolobium have been analyzed as a tool to distinguish these two species and possibly aid the discussion of vicariance between them. Leaf DNA samples was extracted, amplified and sequenced with specific primers for the trnL-c and trnL-d regions of the trnL gene present in the chloroplast DNA. The sequences obtained were aligned generating a matrix with 530 characters. Seventy-five variable sites were obtained, 37 of them were informative for the parsimony analysis. As a whole the maximum parsimony nd the neighbor-joining analyses were consistent, giving rise to trees with similar topologies, separating the different taxa into clades. The phylogenetic relationships between the species studied based on molecular data support those based on morphological data presented in the literature, however, they do not confirm the hypothesis of vicariance between D. nigra and D. miscolobium.
id UFV_894864b0ce09f974dba8c5bd1bc9ebea
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/351
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str 2145
spelling Santos, Simone Gualbertohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4771603T0Oliveira, Luiz Orlando dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781626T2Otoni, Wagner Camposhttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4786133Y6Barros, Everaldo Gonçalves dehttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781285J6Meira Neto, João Augusto Alveshttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728376H9Viccini, Lyderson Faciohttp://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784356J22015-03-26T12:19:19Z2009-05-142015-03-26T12:19:19Z2008-04-17SANTOS, Simone Gualberto. Analysis of vicariance hypothesis between Dalbergia nigra Allem. ex Benth. and Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) based on chloroplast DNA sequences. 2008. 43 f. Tese (Doutorado em Botânica estrutural; Ecologia e Sistemática) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.http://locus.ufv.br/handle/123456789/351The genus Dalbergia L. f. (Fabaceae: Papilionoideae) includes approximately 100 pantropical species. In Brazil there are 40 Dalbergia species distributed in different Brazilian ecossistems. D. nigra and D. miscolobium which occur in the Mata Atlântica and Cerrado regions, respectively, are considered to be vicariant. Vicariance between these two species has been investigated by phytosociological and chymosystematic studies, however, new approaches need to be used for these studies as this hypothesis has not been confirmed and is not fully accepted by the scientific community. In this work the chloroplast trnL intron sequences of D. nigra and D. miscolobium have been analyzed as a tool to distinguish these two species and possibly aid the discussion of vicariance between them. Leaf DNA samples was extracted, amplified and sequenced with specific primers for the trnL-c and trnL-d regions of the trnL gene present in the chloroplast DNA. The sequences obtained were aligned generating a matrix with 530 characters. Seventy-five variable sites were obtained, 37 of them were informative for the parsimony analysis. As a whole the maximum parsimony nd the neighbor-joining analyses were consistent, giving rise to trees with similar topologies, separating the different taxa into clades. The phylogenetic relationships between the species studied based on molecular data support those based on morphological data presented in the literature, however, they do not confirm the hypothesis of vicariance between D. nigra and D. miscolobium.O gênero Dalbergia L. f. (Fabaceae: Papilionoideae), possui cerca de 100 espécies de distribuição pantropical. No Brasil, há 40 espécies de Dalbergia distribuídas em áreas representativas dos diferentes ecossistemas brasileiros. D. nigra e D. miscolobium são espécies consideradas vicariantes, que ocorrem na Mata Atlântica e no Cerrado, respectivamente. Estas espécies figuram como objetos de estudo sobre vicariância em trabalhos anteriores de fitossociologia e quimiossistemática, porém, estes estudos necessitam de outras abordagens, visto ser a teoria de vicariância ainda polêmica entre pesquisadores. Neste trabalho, objetivou-se analisar as seqüências do íntron trnL em D. nigra e D. miscolobium, visando investigar a validade dessa região genômica para distinguir essas espécies e discutir possível vicariância entre elas. Amostras de DNA de plantas das espécies de Dalbergia foram extraídas e amplificadas com primers específicos trnL-c e trnL-d (cpDNA). As seqüências de DNA alinhadas produziram uma matriz com 530 caracteres. Excluindo os autopomórficos e os invariáveis, foram obtidos 75 sítios variáveis dos quais 37 foram informativos para análise de parcimônia. De modo geral, as análises de máxima parcimônia e neighbor-joining foram consistentes, resultando em árvores de topologias semelhantes entre si, com a separação dos taxa em clados. As relações filogenéticas entre as espécies estudadas, com base nos dados moleculares, corroboram aquelas baseadas em dados de morfologia encontrados na literatura, contudo não confirmam a hipótese de vicariância entre D. nigra e D. miscolobium.Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado da Bahiaapplication/pdfporUniversidade Federal de ViçosaDoutorado em BotânicaUFVBRBotânica estrutural; Ecologia e SistemáticaDalbergiaTrnLJacarandáFilogeniaVicariânciaDalbergia nigraTrnLDalbergia miscolobiumPhylogenyVicarianceCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICAAnálise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídicoAnalysis of vicariance hypothesis between Dalbergia nigra Allem. ex Benth. and Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) based on chloroplast DNA sequencesinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdfapplication/pdf249096https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/351/1/texto%20completo.pdfceee6c4e83452beb7b74f6f2ef747b01MD51TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain80338https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/351/2/texto%20completo.pdf.txt28a6e53dc2998786c6b9efe3323b3a0bMD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3773https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/351/3/texto%20completo.pdf.jpg0803452c7dd9537486d66674ed5663bdMD53123456789/3512016-04-06 23:01:34.802oai:locus.ufv.br:123456789/351Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-07T02:01:34LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.por.fl_str_mv Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico
dc.title.alternative.eng.fl_str_mv Analysis of vicariance hypothesis between Dalbergia nigra Allem. ex Benth. and Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) based on chloroplast DNA sequences
title Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico
spellingShingle Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico
Santos, Simone Gualberto
Dalbergia
TrnL
Jacarandá
Filogenia
Vicariância
Dalbergia nigra
TrnL
Dalbergia miscolobium
Phylogeny
Vicariance
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA
title_short Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico
title_full Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico
title_fullStr Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico
title_full_unstemmed Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico
title_sort Análise da hipótese da vicariância entre Dalbergia nigra Allem. ex Benth. e Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) com base em DNA cloroplastídico
author Santos, Simone Gualberto
author_facet Santos, Simone Gualberto
author_role author
dc.contributor.authorLattes.por.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4771603T0
dc.contributor.author.fl_str_mv Santos, Simone Gualberto
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv Oliveira, Luiz Orlando de
dc.contributor.advisor-co1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781626T2
dc.contributor.advisor-co2.fl_str_mv Otoni, Wagner Campos
dc.contributor.advisor-co2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4786133Y6
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Barros, Everaldo Gonçalves de
dc.contributor.advisor1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4781285J6
dc.contributor.referee1.fl_str_mv Meira Neto, João Augusto Alves
dc.contributor.referee1Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4728376H9
dc.contributor.referee2.fl_str_mv Viccini, Lyderson Facio
dc.contributor.referee2Lattes.fl_str_mv http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4784356J2
contributor_str_mv Oliveira, Luiz Orlando de
Otoni, Wagner Campos
Barros, Everaldo Gonçalves de
Meira Neto, João Augusto Alves
Viccini, Lyderson Facio
dc.subject.por.fl_str_mv Dalbergia
TrnL
Jacarandá
Filogenia
Vicariância
topic Dalbergia
TrnL
Jacarandá
Filogenia
Vicariância
Dalbergia nigra
TrnL
Dalbergia miscolobium
Phylogeny
Vicariance
CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA
dc.subject.eng.fl_str_mv Dalbergia nigra
TrnL
Dalbergia miscolobium
Phylogeny
Vicariance
dc.subject.cnpq.fl_str_mv CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BOTANICA
description The genus Dalbergia L. f. (Fabaceae: Papilionoideae) includes approximately 100 pantropical species. In Brazil there are 40 Dalbergia species distributed in different Brazilian ecossistems. D. nigra and D. miscolobium which occur in the Mata Atlântica and Cerrado regions, respectively, are considered to be vicariant. Vicariance between these two species has been investigated by phytosociological and chymosystematic studies, however, new approaches need to be used for these studies as this hypothesis has not been confirmed and is not fully accepted by the scientific community. In this work the chloroplast trnL intron sequences of D. nigra and D. miscolobium have been analyzed as a tool to distinguish these two species and possibly aid the discussion of vicariance between them. Leaf DNA samples was extracted, amplified and sequenced with specific primers for the trnL-c and trnL-d regions of the trnL gene present in the chloroplast DNA. The sequences obtained were aligned generating a matrix with 530 characters. Seventy-five variable sites were obtained, 37 of them were informative for the parsimony analysis. As a whole the maximum parsimony nd the neighbor-joining analyses were consistent, giving rise to trees with similar topologies, separating the different taxa into clades. The phylogenetic relationships between the species studied based on molecular data support those based on morphological data presented in the literature, however, they do not confirm the hypothesis of vicariance between D. nigra and D. miscolobium.
publishDate 2008
dc.date.issued.fl_str_mv 2008-04-17
dc.date.available.fl_str_mv 2009-05-14
2015-03-26T12:19:19Z
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-26T12:19:19Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SANTOS, Simone Gualberto. Analysis of vicariance hypothesis between Dalbergia nigra Allem. ex Benth. and Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) based on chloroplast DNA sequences. 2008. 43 f. Tese (Doutorado em Botânica estrutural; Ecologia e Sistemática) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://locus.ufv.br/handle/123456789/351
identifier_str_mv SANTOS, Simone Gualberto. Analysis of vicariance hypothesis between Dalbergia nigra Allem. ex Benth. and Dalbergia miscolobium Benth. (Fabaceae) based on chloroplast DNA sequences. 2008. 43 f. Tese (Doutorado em Botânica estrutural; Ecologia e Sistemática) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa, 2008.
url http://locus.ufv.br/handle/123456789/351
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.publisher.program.fl_str_mv Doutorado em Botânica
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFV
dc.publisher.country.fl_str_mv BR
dc.publisher.department.fl_str_mv Botânica estrutural; Ecologia e Sistemática
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/351/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/351/2/texto%20completo.pdf.txt
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/351/3/texto%20completo.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv ceee6c4e83452beb7b74f6f2ef747b01
28a6e53dc2998786c6b9efe3323b3a0b
0803452c7dd9537486d66674ed5663bd
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1801212833774436352