Molecular phylogeny and morphological characterization of the etiological agent of sour rot on fruits and vegetables in Brazil

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Autor(a) principal: Paes, Simone Albino
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Tese
Idioma: eng
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/30098
Resumo: A podridão azeda representa um problema sério no campo e na pós-colheita de frutas e hortaliças, limitando a produção e a comercialização. Geotrichum candidum tem sido relatado como a principal espécie causando esta doença. Neste estudo, 165 isolados causadores de podridão pós-colheita em diferentes estados do Brasil foram caracterizados com base na filogenia molecular e morfologia. Para caracterização molecular, o DNA genômico foi extraído, e o domínio D1/D2 do gene rRNA da subunidade maior (LSU) foi amplificado e sequenciado. As análises filogenéticas baseadas no domínio D1/D2 revelaram que 129 isolados pertencem a espécie Geotrichum candidum, enquanto outros isolados não agruparam com nenhuma espécie conhecida, provavelmente representando novas espécies. Além disso, outros gêneros, isto é, Hyphopichia, Magnusiomyces, Saccharomycopsis, Trichosporon e Zygoascus, foram identificados associados a podridão azeda em frutas e hortaliças no Brasil. Todas as espécies testadas, incluindo as possíveis espécies novas, foram patogênicas quando inoculadas artificialmente em frutos sadios de tomate do tipo longa vida, italiano e sweet grape, bem como em tubérculos de batata e frutos de seriguela. Em conclusão, embora Geotrichum candidum tenha sido relatado como a única espécie a causar podridão azeda, outras espécies de Geotrichum e outros gêneros estão associados à podridão azeda em frutas e hortaliças no Brasil, o que demonstra uma diversidade de fungos associados a essa doença. Palavras-chave: Dipodascaceae. Geotrichum. Patologia pós-colheita. Podridões.
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spelling Reis, AiltonPaes, Simone Albinohttp://lattes.cnpq.br/4430912256844145Pereira, Olinto Liparini2022-10-14T18:53:38Z2022-10-14T18:53:38Z2020-04-30PAES, Simone Albino. Molecular phylogeny and morphological characterization of the etiological agent of sour rot on fruits and vegetables in Brazil. 2020. 71 f. Tese (Doutorado em Fitopatologia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2020.https://locus.ufv.br//handle/123456789/30098A podridão azeda representa um problema sério no campo e na pós-colheita de frutas e hortaliças, limitando a produção e a comercialização. Geotrichum candidum tem sido relatado como a principal espécie causando esta doença. Neste estudo, 165 isolados causadores de podridão pós-colheita em diferentes estados do Brasil foram caracterizados com base na filogenia molecular e morfologia. Para caracterização molecular, o DNA genômico foi extraído, e o domínio D1/D2 do gene rRNA da subunidade maior (LSU) foi amplificado e sequenciado. As análises filogenéticas baseadas no domínio D1/D2 revelaram que 129 isolados pertencem a espécie Geotrichum candidum, enquanto outros isolados não agruparam com nenhuma espécie conhecida, provavelmente representando novas espécies. Além disso, outros gêneros, isto é, Hyphopichia, Magnusiomyces, Saccharomycopsis, Trichosporon e Zygoascus, foram identificados associados a podridão azeda em frutas e hortaliças no Brasil. Todas as espécies testadas, incluindo as possíveis espécies novas, foram patogênicas quando inoculadas artificialmente em frutos sadios de tomate do tipo longa vida, italiano e sweet grape, bem como em tubérculos de batata e frutos de seriguela. Em conclusão, embora Geotrichum candidum tenha sido relatado como a única espécie a causar podridão azeda, outras espécies de Geotrichum e outros gêneros estão associados à podridão azeda em frutas e hortaliças no Brasil, o que demonstra uma diversidade de fungos associados a essa doença. Palavras-chave: Dipodascaceae. Geotrichum. Patologia pós-colheita. Podridões.Sour rot represents a serious problem in the field and postharvest of fruits and vegetables by limiting production and marketing. Geotrichum candidum has been reported as the main species causing this disease. In this study, 165 fungal isolates causing postharvest rot in different states of Brazil were characterized on the basis of molecular phylogeny and morphology. For molecular characterization, the genomic DNA was extracted, the D1/D2 domain of large subunit rRNA (LSU) gene was amplified and sequenced. The phylogenetic analyses revealed that 129 isolates of this study grouped with the species Geotrichum candidum, while other isolates did not cluster to any known species, probably representing new species. Moreover, other fungal genera, i.e. Hyphopichia, Magnusiomyces, Saccharomycopsis, Trichosporon and Zygoascus were identified associated with the sour rot disease on fruits and vegetables in Brazil. All species tested, including the putative new species, were pathogenic when artificially inoculated on healthy tomato fruit types, Long-self life, Italian tomato and sweet grape, as well as potato tubers and red mombin fruits. In conclusion, although Geotrichum candidum has been related as the only species causing sour rot, other species of Geotrichum and other genera are associated with sour rot on fruits and vegetables in Brazil, which demonstrates a diversity of fungi associated with this disease. Keywords: Dipodascaceae. Geotrichum . Postharvest disease. Rot disease.engUniversidade Federal de ViçosaFitopatologiaFrutas - Doenças e pragasHortaliças - Doenças e pragasPerdas pós-colheitasPodridãoTaxonomiaFitopatologiaMolecular phylogeny and morphological characterization of the etiological agent of sour rot on fruits and vegetables in BrazilFilogenia molecular e caracterização morfológica do agente etiológico da podridão azeda em frutas e hortaliças no Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de FitopatologiaDoutor em FitopatologiaViçosa - MG2020-04-30Doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf5147885https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30098/1/texto%20completo.pdf70320565f732cfb18d75281ebdf83f97MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/30098/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/300982022-10-14 15:53:38.314oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452022-10-14T18:53:38LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
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