Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Dias, Felipe de Oliveira
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/28883
Resumo: Este trabalho teve o objetivo de ajustar modelos estatísticos com resíduos espacialmente dependentes e independentes para predição dos valores genotípicos, identificando o modelo de melhor ajuste para selecionar as linhagens de tomateiro mais resistentes à Phytophthora infestans. Para isso, 71 linhagens de introgressão de Solanum pennellii foram avaliadas quanto a essa característica em campo, com inoculação artificial, em ensaio com testemunhas intercalares. As testemunhas utilizadas foram as seguintes: a cultivar M82 e o acesso LA 716, parentais das linhagens de introgressão; a cultivar Santa Clara, padrão de suscetibilidade; e as cultivares NC 25P e NC 1 CEL BR, resistentes à P. infestans. As plantas receberam notas, a cada três dias, de acordo com a severidade da doença, que posteriormente foram utilizadas para a obtenção da área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Foram ajustados 25 modelos para análise, sendo o mais adequado selecionado pelos critérios de informação de Akaike (AIC) e de Schwarz (BIC). Criou-se os intervalos de confiança com nível de confiança de 95% (IC(μ) 0.95 ) para os parâmetros ajustados nos modelos. Foram estimadas a herdabilidade e a acurácia dos modelos, além dos valores genéticos de cada linhagem via melhor preditor linear não viesado (BLUP). As análises estatísticas foram realizadas no software ASReml e Programa Genes. O modelo mais adequado foi um dos modelos espaciais, que difere do modelo tradicional por apresentar dois tipos de erro: o resíduo aleatório “nugget” e o erro correlacionado. As estimativas de herdabilidade e acurácia deste modelo foram menores em relação ao modelo tradicional. Os parâmetros espaciais ajustados tiveram sua significância comprovada pelo IC. O ranqueamento das linhagens selecionadas pelo modelo mais adequado e pelo tradicional teve ordenamento diferente em ambos, levando a seleção de diferentes linhagens por cada modelo. As linhagens que tiveram os menores valores genéticos preditos do modelo selecionado devem continuar no programa de melhoramento do tomateiro para obtenção de cultivares resistentes à P. infestans. Palavras-chave: Melhoramento. Requeima. Solanum lycopersicum. Análise espacial.
id UFV_a5121613b86d011bedadec75721a5045
oai_identifier_str oai:locus.ufv.br:123456789/28883
network_acronym_str UFV
network_name_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
repository_id_str 2145
spelling Carneiro, Pedro Crescêncio SouzaDias, Felipe de Oliveirahttp://lattes.cnpq.br/8319234525654849Gomes, Carlos Nick2022-05-04T14:01:38Z2022-05-04T14:01:38Z2020-03-02DIAS, Felipe de Oliveira. Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary. 2020. 47 f. Dissertação (Mestrado em Fitotecnia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2020.https://locus.ufv.br//handle/123456789/28883Este trabalho teve o objetivo de ajustar modelos estatísticos com resíduos espacialmente dependentes e independentes para predição dos valores genotípicos, identificando o modelo de melhor ajuste para selecionar as linhagens de tomateiro mais resistentes à Phytophthora infestans. Para isso, 71 linhagens de introgressão de Solanum pennellii foram avaliadas quanto a essa característica em campo, com inoculação artificial, em ensaio com testemunhas intercalares. As testemunhas utilizadas foram as seguintes: a cultivar M82 e o acesso LA 716, parentais das linhagens de introgressão; a cultivar Santa Clara, padrão de suscetibilidade; e as cultivares NC 25P e NC 1 CEL BR, resistentes à P. infestans. As plantas receberam notas, a cada três dias, de acordo com a severidade da doença, que posteriormente foram utilizadas para a obtenção da área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Foram ajustados 25 modelos para análise, sendo o mais adequado selecionado pelos critérios de informação de Akaike (AIC) e de Schwarz (BIC). Criou-se os intervalos de confiança com nível de confiança de 95% (IC(μ) 0.95 ) para os parâmetros ajustados nos modelos. Foram estimadas a herdabilidade e a acurácia dos modelos, além dos valores genéticos de cada linhagem via melhor preditor linear não viesado (BLUP). As análises estatísticas foram realizadas no software ASReml e Programa Genes. O modelo mais adequado foi um dos modelos espaciais, que difere do modelo tradicional por apresentar dois tipos de erro: o resíduo aleatório “nugget” e o erro correlacionado. As estimativas de herdabilidade e acurácia deste modelo foram menores em relação ao modelo tradicional. Os parâmetros espaciais ajustados tiveram sua significância comprovada pelo IC. O ranqueamento das linhagens selecionadas pelo modelo mais adequado e pelo tradicional teve ordenamento diferente em ambos, levando a seleção de diferentes linhagens por cada modelo. As linhagens que tiveram os menores valores genéticos preditos do modelo selecionado devem continuar no programa de melhoramento do tomateiro para obtenção de cultivares resistentes à P. infestans. Palavras-chave: Melhoramento. Requeima. Solanum lycopersicum. Análise espacial.This work aimed to adjust statistical models with spatially dependent and independent residues to predict genotypic values, identifying the fittest model to select tomato lines resistant to Phytophthora infestans. For this, 71 introgression lines (IL’s) of Solanum pennellii were assessed for P. infestans resistance in the field. Plants were inoculated artificially. Genotype treatments were arranged according to an intercalary control experimental scheme. The parental lines (M82 and the accession LA 716), the susceptible fresh market tomato cultivar Santa Clara, and the resistant tomato cultivars NC 25P and NC 1 CEL BR were used as control. Tomato plants were scored for P. infestans resistance, every three days, according to a disease severity scale. Disease severity scores were later used to obtain the area under the disease progress curve (AUDPC). Twenty-five models were adjusted for analysis, and the most suitable was selected by the Akaike (AIC) and Schwarz (BIC) information criteria. Confidence intervals were created with a 95% confidence level (CI (μ) 0.95 ) for the parameters adjusted in the models. Were estimated heritability and accuracy of the models, beyond genetic values of each IL using the best linear unbiased predictor (BLUP). Statistical analyzes were performed using the ASReml software and the Genes Program. The most suitable model was one of the spatial models, which differs from the traditional model for having two types of error: the random residue “nugget” and the correlated error. Heritability and accuracy estimates for this model were lower compared to the traditional model. Adjusted spatial parameters had their significance confirmed by the CI. Genotype ranking obtained by the traditional model differed from the genotype ranking obtained by the selected spatial model, leading to selection of different IL’s on each model. IL’s showing the lowest predicted genetic values on the selected model must continue in the tomato breeding program to obtain cultivars resistant to P. infestans. Keywords: Tomato breeding. Late blight. Solanum lycopersicum. Spatial analysis.Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisporUniversidade Federal de ViçosaTomate - Melhoramento genéticoRequeimaSolanum lycopersicumAnálise espacial (Estatística)FitotecniaModelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de BaryModelling spatial trends to select tomato lines resistant to Phytophthora infestans (Mont.) de Baryinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de AgronomiaMestre em FitotecniaViçosa - MG2020-03-02Mestradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf708713https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/28883/1/texto%20completo.pdfade6e356865f4e1271e9d04ad4ebc8e2MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/28883/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52123456789/288832022-05-04 11:02:02.846oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452022-05-04T14:02:02LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false
dc.title.pt-BR.fl_str_mv Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
dc.title.en.fl_str_mv Modelling spatial trends to select tomato lines resistant to Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
title Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
spellingShingle Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
Dias, Felipe de Oliveira
Tomate - Melhoramento genético
Requeima
Solanum lycopersicum
Análise espacial (Estatística)
Fitotecnia
title_short Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
title_full Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
title_fullStr Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
title_full_unstemmed Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
title_sort Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary
author Dias, Felipe de Oliveira
author_facet Dias, Felipe de Oliveira
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt-BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/8319234525654849
dc.contributor.none.fl_str_mv Carneiro, Pedro Crescêncio Souza
dc.contributor.author.fl_str_mv Dias, Felipe de Oliveira
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Gomes, Carlos Nick
contributor_str_mv Gomes, Carlos Nick
dc.subject.pt-BR.fl_str_mv Tomate - Melhoramento genético
Requeima
Solanum lycopersicum
Análise espacial (Estatística)
topic Tomate - Melhoramento genético
Requeima
Solanum lycopersicum
Análise espacial (Estatística)
Fitotecnia
dc.subject.cnpq.fl_str_mv Fitotecnia
description Este trabalho teve o objetivo de ajustar modelos estatísticos com resíduos espacialmente dependentes e independentes para predição dos valores genotípicos, identificando o modelo de melhor ajuste para selecionar as linhagens de tomateiro mais resistentes à Phytophthora infestans. Para isso, 71 linhagens de introgressão de Solanum pennellii foram avaliadas quanto a essa característica em campo, com inoculação artificial, em ensaio com testemunhas intercalares. As testemunhas utilizadas foram as seguintes: a cultivar M82 e o acesso LA 716, parentais das linhagens de introgressão; a cultivar Santa Clara, padrão de suscetibilidade; e as cultivares NC 25P e NC 1 CEL BR, resistentes à P. infestans. As plantas receberam notas, a cada três dias, de acordo com a severidade da doença, que posteriormente foram utilizadas para a obtenção da área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Foram ajustados 25 modelos para análise, sendo o mais adequado selecionado pelos critérios de informação de Akaike (AIC) e de Schwarz (BIC). Criou-se os intervalos de confiança com nível de confiança de 95% (IC(μ) 0.95 ) para os parâmetros ajustados nos modelos. Foram estimadas a herdabilidade e a acurácia dos modelos, além dos valores genéticos de cada linhagem via melhor preditor linear não viesado (BLUP). As análises estatísticas foram realizadas no software ASReml e Programa Genes. O modelo mais adequado foi um dos modelos espaciais, que difere do modelo tradicional por apresentar dois tipos de erro: o resíduo aleatório “nugget” e o erro correlacionado. As estimativas de herdabilidade e acurácia deste modelo foram menores em relação ao modelo tradicional. Os parâmetros espaciais ajustados tiveram sua significância comprovada pelo IC. O ranqueamento das linhagens selecionadas pelo modelo mais adequado e pelo tradicional teve ordenamento diferente em ambos, levando a seleção de diferentes linhagens por cada modelo. As linhagens que tiveram os menores valores genéticos preditos do modelo selecionado devem continuar no programa de melhoramento do tomateiro para obtenção de cultivares resistentes à P. infestans. Palavras-chave: Melhoramento. Requeima. Solanum lycopersicum. Análise espacial.
publishDate 2020
dc.date.issued.fl_str_mv 2020-03-02
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-05-04T14:01:38Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-05-04T14:01:38Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv DIAS, Felipe de Oliveira. Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary. 2020. 47 f. Dissertação (Mestrado em Fitotecnia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2020.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://locus.ufv.br//handle/123456789/28883
identifier_str_mv DIAS, Felipe de Oliveira. Modelagem de tendências espaciais na seleção de linhagens de tomateiro resistentes à Phytophthora infestans (Mont.) de Bary. 2020. 47 f. Dissertação (Mestrado em Fitotecnia) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2020.
url https://locus.ufv.br//handle/123456789/28883
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Viçosa
dc.source.none.fl_str_mv reponame:LOCUS Repositório Institucional da UFV
instname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron:UFV
instname_str Universidade Federal de Viçosa (UFV)
instacron_str UFV
institution UFV
reponame_str LOCUS Repositório Institucional da UFV
collection LOCUS Repositório Institucional da UFV
bitstream.url.fl_str_mv https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/28883/1/texto%20completo.pdf
https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/28883/2/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv ade6e356865f4e1271e9d04ad4ebc8e2
8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)
repository.mail.fl_str_mv fabiojreis@ufv.br
_version_ 1801212857715523584