Análise de elementos transponíveis em Hemileia vastatrix e Coffea spp.

• Autor(a) principal: Silva, Lucas Fagundes da
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/30735; https://doi.org/10.47328/ufvbbt.2022.753
• topic: Ferrugem do café - Aspectos genéticos; Café - Resistência à doenças e pragas - Aspectos genéticos; Translocação (Genéticva); Fitopatologia

A ferrugem do cafeeiro é causada pelo fungo Hemileia vastatrix Berk. & Broome, um parasita obrigatório que infecta folhas de plantas do gênero botânico Coffea. Entre as espécies cultivadas deste gênero, Coffea arabica é a mais suscetível. A desfolha precoce pode levar à morte de ramos, seguido de perdas da produtividade no ano subsequente. Os danos podem alcançar índices de 50% quando as condições são favoráveis. Há um consenso que existe grande variabilidade genética na população de H. vastatrix e o surgimento de novas raças são um grande desafio para o manejo da doença. A raça II de H. vastatrix é a mais prevalente e a raça XXXIII suplantou a resistência de algumas cultivares comerciais de C. canephora no Brasil. No entanto, como o ciclo sexual ainda é parcialmente descrito, não são claros quais são mecanismos-chave de variabilidade genética ligados ao surgimento de raças em H. vastatrix. Nesse contexto, os elementos transponíveis (ETs) podem ser uma abordagem promissora, porém, pouco explorada nos estudos que visam a compreender a variabilidade genética em raças de H. vastatrix. Este trabalho teve como objetivo verificar o impacto de retrotransposons e elementos transponíveis de DNA nos genomas de H. vastatrix, C. arabica, C. canephora e C. eugenioides. Foram desenvolvidos scripts de bioinformáticas para identificação, caracterização e analise da divergência genética. No capitulo I, foram identificados ETs expressos nas interações de compatibilidade entre H. vastratrix e o cafeeiro. No capítulo II, as populações dos ETs foram estruturadas de acordo com as espécies de café analisadas. No capítulo III, genótipos de café arábica foram agrupadas em função do padrão de resistência às raças II e XXXIII de H. vastatrix. Este trabalho relata novos ETs e apresenta novas informações sobre seus os impactos na coevolução entre o H. vastatrix e cafeeiro. Palavras-chave: Transcriptoma. Hemileia. Coffea. Transposons.