Seleção e associação genômica ampla para o melhoramento genético animal com uso do método ssGBLUP

• Autor(a) principal: Pértile, Simone Fernanda Nedel
• Data de Publicação: 2016
• Outros Autores: Silva, Fabyano Fonseca e, Salvian, Mayara, Mourão, Gerson Barreto
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/s0100-204x2016001000004; http://locus.ufv.br//handle/123456789/25942
• topic: Coeficiente de parentesco; Habilidade preditiva; Herdabilidade; Validação cruzada; Kinship coefficient; Predictive ability; Heritability; Cross‐validation

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método ssGBLUP quanto à seleção e à associação genômica ampla, com atribuição de pesos a marcadores genéticos e uso de informações de genótipos e fenótipos, com ou sem informações de pedigree, com diferentes coeficientes de herdabilidade. A população estudada foi obtida por simulação de dados com 8.150 animais, 5.850 dos quais eram genotipados. Utilizou-se o método ssGBLUP para a análise dos dados, com duas matrizes de relacionamento – com ou sem informações de pedigree –, e pesos para os marcadores genéticos obtidos em cada iteração. O aumento do coeficiente de herdabilidade melhorou os resultados de seleção e associação genômica. O melhor desempenho quanto à habilidade preditiva foi obtido quando não se utilizaram informações de pedigree. O tipo de matriz de relacionamento utilizada não influenciou a identificação de regiões associadas a características de interesse. O método ssGBLUP é eficiente tanto para a seleção quanto para a identificação de regiões associadas às características estudadas.