Variabilidade genética em famílias de Jatropha curcas L. por marcadores SSR
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | LOCUS Repositório Institucional da UFV |
Texto Completo: | http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/7541 |
Resumo: | Jatropha curcas L. é a oleaginosa perene mais promissora para produção de biodiesel e bioquerosene. Contudo, pesquisas recentes revelam estreita variabilidade genética na espécie e novos estudos nesse tema são necessários para fundamentar o seu melhoramento. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética entre 93 famílias, cada qual representada por uma planta, por meio de cinco pares de marcadores SSR. Estas 93 famílias compõem o Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Universidade Federal de Viçosa (UFV). No total foram avaliados 60 pares de primers SSR, mas apenas os cinco mais polimórficos foram selecionados. Observou-se a constituição de nove grupos de diversidade pelo método UPGMA, com destaque para as famílias UFVJC 19, UFVJC 36 e UFVJC 98 que apresentaram a maior divergência genética. Pelo método de Tocher ocorreu a formação de 13 grupos, evidenciando a divergência das famílias UFVJC 18, UFVJC 36 e UFVJC 71 por suas singularidades. A variabilidade presente entre as famílias coletadas no norte de Minas Gerais suporta a hipótese da região como possível centro secundário de diversidade da espécie. Ainda que exploratória, a presente pesquisa evidenciou expressiva variabilidade genética no BAG. Este fato corrobora o acerto da estratégia de coleta das famílias do BAG-UFV, praticada com muitas plantas por família (mínimo de 16). Na implantação de outros BAGs a ênfase foi coletar maior número de acessos, porém com poucas plantas por acesso. Essa é talvez a principal razão de os estudos anteriores apontarem baixa variabilidade genética na espécie. A obtenção de novos marcadores SSR polimórficos e o processamento de análises de variabilidade dentro das famílias será a etapa seguinte da pesquisa. |
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Caixeta, Eveline TeixeiraCruz, Cosme DamiãoSousa, Romero de Limahttp://lattes.cnpq.br/4123947499484455Dias, Luiz Antônio dos Santos2016-04-22T14:00:04Z2016-04-22T14:00:04Z2015-07-15SOUSA, Romero de Lima. Variabilidade genética em famílias de Jatropha curcas L. por marcadores SSR. 2015. 42f. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento) - Universidade Federal de Viçosa, Viçosa. 2015.http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/7541Jatropha curcas L. é a oleaginosa perene mais promissora para produção de biodiesel e bioquerosene. Contudo, pesquisas recentes revelam estreita variabilidade genética na espécie e novos estudos nesse tema são necessários para fundamentar o seu melhoramento. O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética entre 93 famílias, cada qual representada por uma planta, por meio de cinco pares de marcadores SSR. Estas 93 famílias compõem o Banco Ativo de Germoplasma (BAG) da Universidade Federal de Viçosa (UFV). No total foram avaliados 60 pares de primers SSR, mas apenas os cinco mais polimórficos foram selecionados. Observou-se a constituição de nove grupos de diversidade pelo método UPGMA, com destaque para as famílias UFVJC 19, UFVJC 36 e UFVJC 98 que apresentaram a maior divergência genética. Pelo método de Tocher ocorreu a formação de 13 grupos, evidenciando a divergência das famílias UFVJC 18, UFVJC 36 e UFVJC 71 por suas singularidades. A variabilidade presente entre as famílias coletadas no norte de Minas Gerais suporta a hipótese da região como possível centro secundário de diversidade da espécie. Ainda que exploratória, a presente pesquisa evidenciou expressiva variabilidade genética no BAG. Este fato corrobora o acerto da estratégia de coleta das famílias do BAG-UFV, praticada com muitas plantas por família (mínimo de 16). Na implantação de outros BAGs a ênfase foi coletar maior número de acessos, porém com poucas plantas por acesso. Essa é talvez a principal razão de os estudos anteriores apontarem baixa variabilidade genética na espécie. A obtenção de novos marcadores SSR polimórficos e o processamento de análises de variabilidade dentro das famílias será a etapa seguinte da pesquisa.Jatropha curcas L. is the most promising perennial oilseed for biodiesel and biokerosene. However, recent research reveals narrow genetic variability in the species and further studies on this topic are needed to support its genetic improvement. We evaluated the genetic variability among 93 families, each one represented by a single plant, through five primers of SSR markers. These 93 families make up the genebank of the Universidade Federal de Viçosa (UFV). In total 60 SSR primer pairs were evaluated, but only the five most polymorphic were selected. There was the establishment of nine clusters of diversity by using UPGMA method. Families UFVJC 19, UFVJC 36 and 98 had the highest genetic diversity. A total of 13 clusters were formed by using Tocher method, with the families UFVJC 18, UFVJC 36 and UFVJC 71 as the most divergent. This variability among families collected in northern Minas Gerais state supported the hypothesis of the region as putative secondary center of diversity of the species. Although exploratory, the present research showed significant genetic variability in UFV genebank. This fact confirms the correctness of the collection strategy of UFV genebank families, practiced with many plants per family (minimum of 16). In the implementation of other genebanks the emphasis was to collect more accessions, but with few plants for accession. Perhaps this is the main reason previous studies suggest low genetic variability in species. Obtaining new polymorphic SSR markers and processing variability analysis within families are the next step of the research.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorporUniversidade Federal de ViçosaPinhão-mansoMicrossatélites (Genética)Diversidade genéticaMelhoramento VegetalVariabilidade genética em famílias de Jatropha curcas L. por marcadores SSRGenetic variability in Jatropha curcas L. families by using SSR markersinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisUniversidade Federal de ViçosaDepartamento de FitotecniaDoutor em Genética e MelhoramentoViçosa - MG2015-07-15Doutoradoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:LOCUS Repositório Institucional da UFVinstname:Universidade Federal de Viçosa (UFV)instacron:UFVORIGINALtexto completo.pdftexto completo.pdftexto completoapplication/pdf442843https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/7541/1/texto%20completo.pdf214b021a6cbd81302f374a561f9712caMD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/7541/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52THUMBNAILtexto completo.pdf.jpgtexto completo.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg3525https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/7541/3/texto%20completo.pdf.jpg413d8e70885eb69b20c28fc5c4ac8659MD53TEXTtexto completo.pdf.txttexto completo.pdf.txtExtracted texttext/plain100814https://locus.ufv.br//bitstream/123456789/7541/4/texto%20completo.pdf.txt9a32761f1be782deb0e24d5530640c1dMD54123456789/75412016-04-25 07:15:19.718oai:locus.ufv.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://www.locus.ufv.br/oai/requestfabiojreis@ufv.bropendoar:21452016-04-25T10:15:19LOCUS Repositório Institucional da UFV - Universidade Federal de Viçosa (UFV)false |
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