Seleção genômica para melhoramento vegetal com diferentes estruturas populacionais

• Autor(a) principal: Valente, Mágno Sávio Ferreira
• Data de Publicação: 2016
• Outros Autores: Viana, José Marcelo Soriano, Resende, Marcos Deon Vilela de, Silva, Fabyano Fonseca e, Lopes, Maria Teresa Gomes
• Tipo de documento: Artigo
• Idioma: por
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: http://dx.doi.org/10.1590/s0100-204x2016001100008; http://locus.ufv.br//handle/123456789/26079
• topic: Zea mays; Acurácia da predição; Eficiência da seleção genômica; Predição de valor genético; Relação de parentesco; Tamanho efetivo; Prediction accuracy; Genomic selection efficiency; Breeding value prediction; Kin relationship; Effective size

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência da seleção genômica em diferentes cenários de estrutura populacional em milho-pipoca, com estimação dos efeitos e uso de marcadores na própria população de referência e em populações não relacionadas, e determinar a influência do tamanho efetivo e das relações de parentesco na população de estimação sobre a acurácia da predição. Foram simuladas populações com diferentes desequilíbrios de ligação (LD) e variâncias aditivas, tendo-se considerado diferentes caracteres, densidades de marcadores, herdabilidades e gerações, no total de 144 cenários. Também foram simuladas populações estruturadas em progênies. A acurácia da predição dos valores genéticos aditivos foi obtida por meio da correlação entre os valores paramétricos e os valores estimados por RR-BLUP (ridge regression- best linear unbiased prediction). Em populações com baixo LD e menor variância aditiva, o uso de maiores densidades de SNP (10 SNP 0,1 cM-1) é indicado, e, além disso, o candidato à seleção deve ser relacionado à população de estimação, para que a acurácia de predição seja satisfatória. O uso de população de seleção na mesma geração da população de estimação reduz em pelo menos 8% a acurácia. A estruturação da população em progênies de maior relacionamento e menor tamanho efetivo aumenta a eficiência da seleção genômica.