Begomoviruses associated with weeds and legume crops in Mozambique: emergence, variability and recombination-driven evolution

• Autor(a) principal: Chipiringo, Baltazar do Azarento Isabel
• Data de Publicação: 2021
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: eng
• Título da fonte: LOCUS Repositório Institucional da UFV
• Texto Completo: https://locus.ufv.br//handle/123456789/28191
• topic: Begomovirus; Recombinação (Genética); Leguminosa - Doenças e pragas; Fitopatologia

A agricultura em Moçambique caminha para a "modernização", com aumento de áreas de monocultura, períodos de cultivo prolongados, irrigação e mecanização substituindo a agricultura de subsistência. No entanto, tais mudanças nas práticas agrícolas podem promover a emergência de patógenos. Compreender a emergência e evolução dos vírus de plantas proporciona informações importantes sobre o manejo dessas doenças. Este trabalho objetivou a detecção, identificação e caracterização molecular de begomovírus associados a leguminosas e plantas não-cultivadas em Moçambique. No primeiro estudo, uma amostra de Pyrenacantha sp. (Icacinaceae) com sintomas de mosaico amarelo foi coletada no distrito de Malema, província de Nampula. O genoma viral foi amplificado, clonado e sequenciado. A sequência de nucleotídeos do DNA-A tem maior identidade (78%) com o tomato leaf curl Namakele virus. O DNA-B tem maior identidade (70%) com Deinbolia mosaic virus. Os dois componentes têm organização genômica típica dos begomovírus bissegmentados do Velho Mundo. O alinhamento das regiões comuns (CR) mostrou uma inserção de 35 nt na CR do DNA-A. A identidade entre as CRs é de 83%, aumentando para 96% quando a inserção de 35 nt é desconsiderada. As CRs têm iterons idênticos e a sequência de aminoácidos da proteína Rep contém o IRD que reconhece esses iterons. Esses resultados indicam que o DNA-A e o DNA- B são componentes cognatos do mesmo vírus, e a inserção de 35 nt sugere um evento de recombinação na CR do DNA-A. O nome Pyrenecantha yellow mosaic virus é proposto para o novo vírus. Para o segundo estudo, amostras sintomáticas de plantas de feijão, soja e caupi foram coletadas nas regiões Centro e Norte de Moçambique. Sete DNAs-A e 11 DNAs-B foram clonados e sequenciados. As sequências de DNA-A são 96% idênticas entre si, indicando que representam o mesmo vírus. A maior identidade com outros begomovírus é de 85% com o cowpea golden mosaic virus. Os DNAs-B possuem 93% de identidade entre si e máximo de 72% com cotton yellow mosaic virus. O alinhamento das CRs indica que os DNAs-A e DNAs- B são componentes cognatos. O nome Mozambique legume mosaic virus é proposto. Três eventos de recombinação foram detectados no DNA-B. O DNA-B é mais variável do que o DNA-A, e a diversidade de nucleotídeos do DNA-B é maior no gene MP e na região intergênica curta. O MLMV é um begomovírus emergente em leguminosas em Moçambique, e sua adaptação aos novos hospedeiros parece ser impulsionada por recombinação no DNA-B. Palavras-chave: Pyrenacanthae. PyYMV. 35-nt. MLMV. Mozlegume. Feijão. Soja. Caupi.