Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Lopes, Ingrid Santana
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
Idioma: por
Título da fonte: Biblioteca Digital de Monografias da UnB
Texto Completo: https://bdm.unb.br/handle/10483/27264
Resumo: Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2018.
id UNB-2_1f45665ab2c98befd5fb21f6f6324594
oai_identifier_str oai:bdm.unb.br:10483/27264
network_acronym_str UNB-2
network_name_str Biblioteca Digital de Monografias da UnB
repository_id_str 11571
spelling Lopes, Ingrid SantanaHolanda, Maristela Terto deLOPES, Ingrid Santana. Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática. 2018. 79 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Engenharia da Computação)—Universidade de Brasília, Brasília, 2018.https://bdm.unb.br/handle/10483/27264Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2018.Para a quantidade crescente de dados gerados por várias áreas do conhecimento dá-se o nome de Big Data. Neste cenário, pode-se dizer que as pesquisas de bioinformática necessitam de dados de proveniência, pois estes são capazes de fornecer o histórico das informações coletadas no workflow da pesquisa e responder questões relacionadas à origem dos dados. Big Data trouxe o surgimento da abordagem NoSQL (Not Only SQL) como uma alternativa ao uso de Modelos de Banco de Dados Relacional por não apresentar as limitações observadas no Modelo de Banco de Dados Relacional quando este é aplicado em uma grande quantidade de dados. Com foco no MongoDB, este trabalho propõe, com o auxílio de um programa, criado capaz de executar automaticamente um workflow, armazenar sua proveniência e dados brutos em três diferentes formatos de documentos: referencial, embutido e híbrido. Essas três maneiras diferentes são comparadas e analisadas usando parâmetros como tempo e recursos de consulta. Os resultados mostraram algumas particularidades da bioinformática e vantagens ou desvantagens para cada mod- elo.Submitted by Thatiane de Lima Pereira (160146178@aluno.unb.br) on 2021-03-15T18:31:45Z No. of bitstreams: 1 2018_IngridSantanaLopes_tcc.pdf: 2900429 bytes, checksum: bcaa4e9880273dd6fa140f3a05164221 (MD5)Approved for entry into archive by Luanna Maia (luanna@bce.unb.br) on 2021-04-19T14:40:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2018_IngridSantanaLopes_tcc.pdf: 2900429 bytes, checksum: bcaa4e9880273dd6fa140f3a05164221 (MD5)Made available in DSpace on 2021-04-19T14:40:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2018_IngridSantanaLopes_tcc.pdf: 2900429 bytes, checksum: bcaa4e9880273dd6fa140f3a05164221 (MD5)The increasing amount of data named generated by several areas of knowledge is named Big Data. In this scenary, it can be said that Bioinformatic researchs needs provenance data, since it is capable of providing the history of the information collected in the research workflow and answer questions related to the data source. Big Data brought the emergence of the NoSQL (Not Only SQL) approach as an alternative to the use of Relational Database Models because it does not present the limitations observed in the Relational Database Model when it is applied in a large dataset. With focus on MongoDB, this work proposes a program that can automatically execute a workflow and store its provenance and raw data into three different document formats: reference, embedded and hybrid. Those three different ways are compared using parameters such as time and query capabilities. Results showed some bioinformatics particularities and advantages or disadvantages for each model.A concessão da licença deste item refere-se ao termo de autorização impresso assinado pelo autor que autoriza a Biblioteca Digital da Produção Intelectual Discente da Universidade de Brasília (BDM) a disponibilizar o trabalho de conclusão de curso por meio do sítio bdm.unb.br, com as seguintes condições: disponível sob Licença Creative Commons 4.0 International, que permite copiar, distribuir e transmitir o trabalho, desde que seja citado o autor e licenciante. Não permite o uso para fins comerciais nem a adaptação desta.info:eu-repo/semantics/openAccessNoSQL (Not Only SQL)Banco de dadosBiologia computacionalBig DataAnálise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformáticainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis2021-04-19T14:40:03Z2021-04-19T14:40:03Z2018-11-28porreponame:Biblioteca Digital de Monografias da UnBinstname:Universidade de Brasília (UnB)instacron:UNBLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain1817http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/27264/2/license.txt21554873e56ad8ddc69c092699b98f95MD52ORIGINAL2018_IngridSantanaLopes_tcc.pdf2018_IngridSantanaLopes_tcc.pdfapplication/pdf2900429http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/27264/1/2018_IngridSantanaLopes_tcc.pdfbcaa4e9880273dd6fa140f3a05164221MD5110483/272642021-04-19 11:40:03.342oai:bdm.unb.br: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Biblioteca Digital de Monografiahttps://bdm.unb.br/PUBhttp://bdm.unb.br/oai/requestbdm@bce.unb.br||patricia@bce.unb.bropendoar:115712021-04-19T14:40:03Biblioteca Digital de Monografias da UnB - Universidade de Brasília (UnB)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática
title Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática
spellingShingle Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática
Lopes, Ingrid Santana
NoSQL (Not Only SQL)
Banco de dados
Biologia computacional
Big Data
title_short Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática
title_full Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática
title_fullStr Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática
title_full_unstemmed Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática
title_sort Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática
author Lopes, Ingrid Santana
author_facet Lopes, Ingrid Santana
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Lopes, Ingrid Santana
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Holanda, Maristela Terto de
contributor_str_mv Holanda, Maristela Terto de
dc.subject.keyword.pt_BR.fl_str_mv NoSQL (Not Only SQL)
Banco de dados
Biologia computacional
Big Data
topic NoSQL (Not Only SQL)
Banco de dados
Biologia computacional
Big Data
description Trabalho de Conclusão de Curso (graduação)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Exatas, Departamento de Ciência da Computação, 2018.
publishDate 2018
dc.date.submitted.none.fl_str_mv 2018-11-28
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2021-04-19T14:40:03Z
dc.date.available.fl_str_mv 2021-04-19T14:40:03Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
format bachelorThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv LOPES, Ingrid Santana. Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática. 2018. 79 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Engenharia da Computação)—Universidade de Brasília, Brasília, 2018.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://bdm.unb.br/handle/10483/27264
identifier_str_mv LOPES, Ingrid Santana. Análise de modelos de dados para NoSQL baseados em documento em workflows de bioinformática. 2018. 79 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Engenharia da Computação)—Universidade de Brasília, Brasília, 2018.
url https://bdm.unb.br/handle/10483/27264
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Biblioteca Digital de Monografias da UnB
instname:Universidade de Brasília (UnB)
instacron:UNB
instname_str Universidade de Brasília (UnB)
instacron_str UNB
institution UNB
reponame_str Biblioteca Digital de Monografias da UnB
collection Biblioteca Digital de Monografias da UnB
bitstream.url.fl_str_mv http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/27264/2/license.txt
http://bdm.unb.br/xmlui/bitstream/10483/27264/1/2018_IngridSantanaLopes_tcc.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 21554873e56ad8ddc69c092699b98f95
bcaa4e9880273dd6fa140f3a05164221
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Monografias da UnB - Universidade de Brasília (UnB)
repository.mail.fl_str_mv bdm@bce.unb.br||patricia@bce.unb.br
_version_ 1813908040314781696

Registros relacionados